More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_57860 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009043  PICST_57860  pantothenate synthase  100 
 
 
312 aa  644    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.355698 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00205  conserved hypothetical protein: pantothenate synthetase (Eurofung)  44.21 
 
 
364 aa  249  3e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.448 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3460  pantoate--beta-alanine ligase  40.98 
 
 
276 aa  233  2.0000000000000002e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2916  pantoate--beta-alanine ligase  43.51 
 
 
277 aa  228  8e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011824  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_22955  predicted protein  40.13 
 
 
311 aa  224  2e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.271201  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1266  pantoate/beta-alanine ligase  40.98 
 
 
289 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1667  pantoate--beta-alanine ligase  39.34 
 
 
280 aa  220  3e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1740  pantoate--beta-alanine ligase  39.34 
 
 
280 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0901  pantoate--beta-alanine ligase  41.84 
 
 
281 aa  219  5e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163902  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  39.81 
 
 
283 aa  218  1e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1610  pantoate--beta-alanine ligase  39.34 
 
 
280 aa  218  1e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.228935  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_708  pantothenate synthetase  39.81 
 
 
277 aa  217  2e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03551  pantothenate synthetase  50.45 
 
 
282 aa  214  1.9999999999999998e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  40.79 
 
 
282 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0333  pantoate--beta-alanine ligase  39.07 
 
 
278 aa  213  3.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2674  pantoate--beta-alanine ligase  39.87 
 
 
283 aa  211  2e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2620  pantoate--beta-alanine ligase  39.87 
 
 
283 aa  211  2e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1571  pantoate--beta-alanine ligase  38.24 
 
 
280 aa  210  2e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0728  pantoate--beta-alanine ligase  38.83 
 
 
277 aa  211  2e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.41941  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0744  pantoate--beta-alanine ligase  39.02 
 
 
278 aa  210  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.809915  hitchhiker  0.00112992 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2151  pantoate--beta-alanine ligase  38.69 
 
 
286 aa  207  2e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1667  pantoate--beta-alanine ligase  36.33 
 
 
282 aa  206  3e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4743  pantoate--beta-alanine ligase  38.69 
 
 
291 aa  206  4e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.16561 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0426  pantoate--beta-alanine ligase  39.93 
 
 
283 aa  205  1e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0102  pantoate--beta-alanine ligase  36.27 
 
 
282 aa  204  1e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.346263  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0161  pantoate--beta-alanine ligase  38.36 
 
 
281 aa  203  3e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.253183  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1876  pantoate/beta-alanine ligase  37.34 
 
 
288 aa  201  9e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4462  pantoate/beta-alanine ligase  39.6 
 
 
280 aa  199  3.9999999999999996e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2799  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  38.46 
 
 
528 aa  199  5e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_002936  DET0804  pantoate--beta-alanine ligase  38.62 
 
 
268 aa  199  7e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0135127  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0342  pantoate--beta-alanine ligase  35.05 
 
 
282 aa  199  7e-50  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2952  pantothenate synthase  39.2 
 
 
281 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.215567  normal  0.0184604 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0320  pantoate--beta-alanine ligase  34.73 
 
 
282 aa  196  3e-49  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2096  pantoate/beta-alanine ligase  39.12 
 
 
302 aa  196  4.0000000000000005e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.985614 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0101  pantoate--beta-alanine ligase  41.05 
 
 
327 aa  196  4.0000000000000005e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4282  pantoate/beta-alanine ligase  36.53 
 
 
539 aa  195  7e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2117  pantoate--beta-alanine ligase  37.94 
 
 
282 aa  195  8.000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0830  pantoate/beta-alanine ligase  38.49 
 
 
279 aa  194  2e-48  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0117  pantoate/beta-alanine ligase  36.84 
 
 
279 aa  193  3e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2314  pantoate/beta-alanine ligase  40.39 
 
 
284 aa  192  4e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000496833  hitchhiker  0.000102893 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0155  pantoate--beta-alanine ligase  39.79 
 
 
282 aa  192  5e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243441  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0725  pantoate--beta-alanine ligase  40.45 
 
 
281 aa  192  5e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.278718  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND05630  pantoate-beta-alanine ligase, putative  34.78 
 
 
411 aa  192  6e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.191225  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0426  pantoate--beta-alanine ligase  37.58 
 
 
289 aa  192  6e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188172  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4557  pantoate/beta-alanine ligase  40.66 
 
 
280 aa  192  7e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.146553  normal  0.699914 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1789  pantoate--beta-alanine ligase  37.46 
 
 
281 aa  192  7e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2254  pantoate/beta-alanine ligase  39.5 
 
 
289 aa  192  9e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2891  pantoate/beta-alanine ligase  48.1 
 
 
290 aa  191  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.150324  normal  0.438724 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3297  pantoate--beta-alanine ligase  40.45 
 
 
281 aa  191  1e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.749755  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0329  pantoate--beta-alanine ligase  37.25 
 
 
293 aa  191  2e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384164  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3133  pantoate--beta-alanine ligase  39.87 
 
 
281 aa  190  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0731299  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8383  pantoate/beta-alanine ligase  39.15 
 
 
288 aa  191  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.857994  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0844  pantoate--beta-alanine ligase  39.81 
 
 
281 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.126376  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0869  pantoate--beta-alanine ligase  39.81 
 
 
281 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3495  pantoate--beta-alanine ligase  39.81 
 
 
281 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3134  pantoate--beta-alanine ligase  47.32 
 
 
282 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.504396  normal  0.398811 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2469  pantothenate synthetase  37.7 
 
 
291 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163424  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3281  pantoate--beta-alanine ligase  39.17 
 
 
284 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3014  pantoate/beta-alanine ligase  36.57 
 
 
281 aa  190  2.9999999999999997e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.207166 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  38.03 
 
 
511 aa  189  5e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0879  pantoate--beta-alanine ligase  39.48 
 
 
281 aa  189  5e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00646372  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0867  pantoate--beta-alanine ligase  39.48 
 
 
281 aa  189  5e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.712584  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  38.03 
 
 
511 aa  189  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0346  pantoate--beta-alanine ligase  36.93 
 
 
293 aa  189  5.999999999999999e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.900978  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0042  pantoate--beta-alanine ligase  36.49 
 
 
273 aa  189  7e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000112642  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0241  pantoate--beta-alanine ligase  36.07 
 
 
281 aa  189  7e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139282  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3339  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  38.73 
 
 
529 aa  188  8e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3409  pantoate--beta-alanine ligase  40.45 
 
 
281 aa  189  8e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.545812  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2315  pantoate--beta-alanine ligase  39.45 
 
 
286 aa  188  1e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.303459  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0964  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  35.65 
 
 
534 aa  188  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955795  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2846  pantoate--beta-alanine ligase  37.59 
 
 
289 aa  187  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1786  pantoate/beta-alanine ligase  35.69 
 
 
281 aa  187  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.300346  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2942  pantoate--beta-alanine ligase  36.48 
 
 
283 aa  187  2e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.17212 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  38.85 
 
 
527 aa  187  3e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0502  pantoate--beta-alanine ligase  39.55 
 
 
300 aa  187  3e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4981  pantoate/beta-alanine ligase  39.19 
 
 
289 aa  186  3e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0199543  normal  0.96569 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0039  pantothenate synthetase  37.76 
 
 
289 aa  187  3e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1706  pantoate--beta-alanine ligase  34.75 
 
 
283 aa  186  4e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260086  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3149  pantoate--beta-alanine ligase  39.61 
 
 
290 aa  186  4e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4542  pantoate--beta-alanine ligase  39.74 
 
 
285 aa  186  4e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.246095  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0231  pantoate--beta-alanine ligase  37.99 
 
 
285 aa  186  4e-46  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0565  pantothenate synthetase  39.06 
 
 
286 aa  186  4e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.194299  hitchhiker  0.0000000964689 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1721  pantothenate synthetase  47.91 
 
 
288 aa  186  4e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.308068  normal  0.216295 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1370  pantoate--beta-alanine ligase  36.84 
 
 
273 aa  186  5e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1012  pantoate/beta-alanine ligase  37.67 
 
 
282 aa  186  6e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0464  pantoate/beta-alanine ligase  39.33 
 
 
281 aa  186  6e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1524  pantoate--beta-alanine ligase  39.22 
 
 
280 aa  185  7e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3803  pantoate--beta-alanine ligase  37.3 
 
 
281 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0604878  hitchhiker  0.00446449 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4723  pantoate--beta-alanine ligase  36.39 
 
 
309 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3175  pantoate--beta-alanine ligase  37.62 
 
 
281 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3426  pantoate/beta-alanine ligase  39.16 
 
 
294 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3904  pantoate--beta-alanine ligase  47.42 
 
 
281 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0369  pantoate--beta-alanine ligase  35.28 
 
 
283 aa  184  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.397358 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5340  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  35.44 
 
 
526 aa  183  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3119  pantoate--beta-alanine ligase  37.63 
 
 
284 aa  183  3e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.620137  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2060  pantoate--beta-alanine ligase  37.05 
 
 
291 aa  183  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.047141 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0460  pantothenate synthetase  39.59 
 
 
334 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0775  pantoate--beta-alanine ligase  40.59 
 
 
281 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2606  pantoate/beta-alanine ligase  42.6 
 
 
288 aa  181  2e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3835  pantothenate synthetase  37.79 
 
 
283 aa  180  2e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>