More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0869 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0869  pantoate--beta-alanine ligase  100 
 
 		 281 aa  577  1e-164  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0725  pantoate--beta-alanine ligase  95.37 
 
 		 281 aa  534  1e-151  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.278718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3297  pantoate--beta-alanine ligase  95.02 
 
 		 281 aa  532  1e-150  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.749755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3409  pantoate--beta-alanine ligase  94.31 
 
 		 281 aa  530  1e-150  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.545812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0867  pantoate--beta-alanine ligase  90.39 
 
 		 281 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.712584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3133  pantoate--beta-alanine ligase  91.1 
 
 		 281 aa  512  1e-144  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0731299  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0879  pantoate--beta-alanine ligase  89.68 
 
 		 281 aa  511  1e-144  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00646372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3495  pantoate--beta-alanine ligase  89.64 
 
 		 281 aa  509  1e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0844  pantoate--beta-alanine ligase  89.32 
 
 		 281 aa  510  1e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.126376  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3904  pantoate--beta-alanine ligase  72.6 
 
 		 281 aa  432  1e-120  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3803  pantoate--beta-alanine ligase  70.82 
 
 		 281 aa  424  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0604878  hitchhiker  0.00446449 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3281  pantoate--beta-alanine ligase  69.4 
 
 		 284 aa  418  1e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0775  pantoate--beta-alanine ligase  76.51 
 
 		 281 aa  420  1e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0693  pantoate--beta-alanine ligase  72.56 
 
 		 283 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.001104  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3134  pantoate--beta-alanine ligase  71.17 
 
 		 282 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.504396  normal  0.398811 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3175  pantoate--beta-alanine ligase  70.82 
 
 		 281 aa  391  1e-108  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4313  pantoate--beta-alanine ligase  62.59 
 
 		 288 aa  362  5.0000000000000005e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3932  pantoate--beta-alanine ligase  57.09 
 
 		 283 aa  330  1e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.341637  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4700  pantoate--beta-alanine ligase  58.27 
 
 		 287 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4565  pantoate--beta-alanine ligase  57.91 
 
 		 287 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650903 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03551  pantothenate synthetase  57.61 
 
 		 282 aa  326  2.0000000000000001e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4699  pantoate--beta-alanine ligase  57.55 
 
 		 287 aa  325  6e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.021644  hitchhiker  0.00466856 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3992  pantoate--beta-alanine ligase  56.62 
 
 		 284 aa  324  8.000000000000001e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4812  pantoate--beta-alanine ligase  55.16 
 
 		 286 aa  322  3e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257734  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0733  pantoate--beta-alanine ligase  56.83 
 
 		 287 aa  322  3e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.536898  hitchhiker  0.0000595497 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3593  pantoate--beta-alanine ligase  56.47 
 
 		 285 aa  322  3e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03451  pantoate--beta-alanine ligase  56.58 
 
 		 300 aa  318  7e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0960  pantoate--beta-alanine ligase  56.74 
 
 		 283 aa  317  1e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2824  pantoate--beta-alanine ligase  54.91 
 
 		 284 aa  313  2.9999999999999996e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0816624  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  56.03 
 
 		 283 aa  312  4.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002560  pantoate--beta-alanine ligase  54.45 
 
 		 301 aa  310  1e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0445865  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62590  pantoate--beta-alanine ligase  54.32 
 
 		 283 aa  310  1e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3119  pantoate--beta-alanine ligase  55.15 
 
 		 284 aa  311  1e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.620137  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3344  pantoate--beta-alanine ligase  55.51 
 
 		 284 aa  308  5.9999999999999995e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000501191  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1012  pantoate--beta-alanine ligase  55.51 
 
 		 284 aa  308  5.9999999999999995e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0272809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3473  pantoate--beta-alanine ligase  55.51 
 
 		 284 aa  308  5.9999999999999995e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.623251  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0666  pantoate--beta-alanine ligase  54.04 
 
 		 282 aa  308  5.9999999999999995e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232247  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5447  pantoate--beta-alanine ligase  53.96 
 
 		 283 aa  308  9e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1159  pantoate--beta-alanine ligase  53.68 
 
 		 284 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0480021  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42720  pantoate--beta-alanine ligase  53.74 
 
 		 283 aa  304  1.0000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4017  pantoate--beta-alanine ligase  52.67 
 
 		 282 aa  304  1.0000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.43915  normal  0.63382 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0122  pantoate--beta-alanine ligase  54.45 
 
 		 293 aa  303  2.0000000000000002e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0223415  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0886  cytidyltransferase-related  53.7 
 
 		 286 aa  302  5.000000000000001e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000710708  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1061  pantoate--beta-alanine ligase  53.48 
 
 		 284 aa  298  6e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2610  pantoate--beta-alanine ligase  50.36 
 
 		 298 aa  296  2e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.205281  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1027  pantoate--beta-alanine ligase  55.17 
 
 		 284 aa  296  3e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3066  pantothenate synthetase  51.26 
 
 		 283 aa  293  1e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0565  pantothenate synthetase  51.65 
 
 		 286 aa  292  5e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.194299  hitchhiker  0.0000000964689 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2315  pantoate--beta-alanine ligase  53.82 
 
 		 286 aa  290  1e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.303459  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0680  pantoate--beta-alanine ligase  52.61 
 
 		 284 aa  290  2e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.337976  normal  0.689217 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3469  pantoate/beta-alanine ligase  52.61 
 
 		 283 aa  288  9e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0136  pantoate--beta-alanine ligase  52.61 
 
 		 283 aa  288  9e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0137  pantoate--beta-alanine ligase  52.61 
 
 		 283 aa  288  9e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00132  pantoate-beta-alanine ligase  52.61 
 
 		 283 aa  287  1e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00131  hypothetical protein  52.61 
 
 		 283 aa  287  1e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0144  pantoate--beta-alanine ligase  52.61 
 
 		 283 aa  288  1e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0142  pantoate--beta-alanine ligase  52.61 
 
 		 283 aa  288  1e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3526  pantoate--beta-alanine ligase  52.61 
 
 		 283 aa  287  1e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0126  pantoate--beta-alanine ligase  52.61 
 
 		 283 aa  287  1e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0215  pantoate--beta-alanine ligase  52.24 
 
 		 284 aa  287  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0414083  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0197  pantoate--beta-alanine ligase  51.87 
 
 		 284 aa  284  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.742862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0201  pantoate--beta-alanine ligase  51.87 
 
 		 284 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.17692  normal  0.688359 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0213  pantoate--beta-alanine ligase  51.87 
 
 		 284 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0198  pantoate--beta-alanine ligase  51.87 
 
 		 284 aa  282  5.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.518661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0579  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 		 289 aa  278  5e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1014  pantoate--beta-alanine ligase  51.61 
 
 		 290 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0674  pantoate--beta-alanine ligase  50.74 
 
 		 285 aa  273  3e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.523643  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3186  pantoate--beta-alanine ligase  51.44 
 
 		 274 aa  269  4e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.722916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2054  pantoate--beta-alanine ligase  51.88 
 
 		 283 aa  268  1e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.183406 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1829  pantoate--beta-alanine ligase  49.29 
 
 		 283 aa  267  2e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3319  pantoate--beta-alanine ligase  51.24 
 
 		 286 aa  267  2e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0231  pantoate--beta-alanine ligase  44.04 
 
 		 285 aa  265  4e-70  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1321  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 		 284 aa  264  1e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0313852  normal  0.753592 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00689  pantoate--beta-alanine ligase  51.11 
 
 		 280 aa  262  4e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.591476  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2952  pantothenate synthase  51.33 
 
 		 281 aa  260  2e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.215567  normal  0.0184604 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0155  pantoate--beta-alanine ligase  47.69 
 
 		 282 aa  260  2e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243441  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0039  pantothenate synthetase  50 
 
 		 289 aa  260  2e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1396  pantoate--beta-alanine ligase  51.09 
 
 		 288 aa  260  2e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.262573  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1525  pantoate-beta-alanine ligase  45.52 
 
 		 283 aa  259  4e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.102611  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2042  pantoate/beta-alanine ligase  48.54 
 
 		 293 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3320  pantothenate synthetase  49.08 
 
 		 290 aa  258  7e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0596  pantoate--beta-alanine ligase  50.37 
 
 		 278 aa  258  8e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.242968 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2846  pantoate--beta-alanine ligase  48.33 
 
 		 289 aa  256  2e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0878  Pantoate--beta-alanine ligase  53.58 
 
 		 286 aa  256  2e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1518  pantoate--beta-alanine ligase  49.63 
 
 		 279 aa  256  3e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.317394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  49.63 
 
 		 283 aa  255  5e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2767  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 		 275 aa  253  3e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.1934  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2130  pantoate--beta-alanine ligase  49.65 
 
 		 286 aa  252  6e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000332887 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0102  pantoate--beta-alanine ligase  46.76 
 
 		 282 aa  250  2e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.346263  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0161  pantoate--beta-alanine ligase  45.22 
 
 		 281 aa  249  3e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.253183  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0198  pantoate--beta-alanine ligase  47.69 
 
 		 281 aa  249  5e-65  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.795684  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1876  pantoate/beta-alanine ligase  47.9 
 
 		 288 aa  248  7e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0174  pantoate--beta-alanine ligase  47.69 
 
 		 281 aa  248  7e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3439  pantoate--beta-alanine ligase  46.89 
 
 		 280 aa  248  9e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.32888  normal  0.795034 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0403  pantoate--beta-alanine ligase  48.53 
 
 		 279 aa  248  9e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2387  pantoate--beta-alanine ligase  46.69 
 
 		 283 aa  247  1e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513339 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0084  pantoate--beta-alanine ligase  47.06 
 
 		 287 aa  248  1e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.458072 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2196  pantoate--beta-alanine ligase  48.16 
 
 		 285 aa  247  1e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.941779  normal  0.927137 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1789  pantoate--beta-alanine ligase  46.91 
 
 		 281 aa  247  2e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0126  pantoate--beta-alanine ligase  48 
 
 		 287 aa  246  2e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>