More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1525 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1525  pantoate-beta-alanine ligase  100 
 
 		 283 aa  578  1e-164  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.102611  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4700  pantoate--beta-alanine ligase  50.35 
 
 		 287 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4699  pantoate--beta-alanine ligase  50.35 
 
 		 287 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.021644  hitchhiker  0.00466856 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  48.23 
 
 		 282 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3593  pantoate--beta-alanine ligase  51.76 
 
 		 285 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42720  pantoate--beta-alanine ligase  49.3 
 
 		 283 aa  282  4.0000000000000003e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03551  pantothenate synthetase  49.47 
 
 		 282 aa  282  6.000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0733  pantoate--beta-alanine ligase  51.06 
 
 		 287 aa  281  7.000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.536898  hitchhiker  0.0000595497 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4565  pantoate--beta-alanine ligase  49.65 
 
 		 287 aa  281  7.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650903 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4812  pantoate--beta-alanine ligase  49.65 
 
 		 286 aa  280  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257734  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0960  pantoate--beta-alanine ligase  48.75 
 
 		 283 aa  278  1e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5447  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 		 283 aa  275  7e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62590  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 		 283 aa  274  9e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3932  pantoate--beta-alanine ligase  46.29 
 
 		 283 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.341637  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0213  pantoate--beta-alanine ligase  47.18 
 
 		 284 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0197  pantoate--beta-alanine ligase  47.18 
 
 		 284 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.742862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0674  pantoate--beta-alanine ligase  48.19 
 
 		 285 aa  272  4.0000000000000004e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.523643  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1061  pantoate--beta-alanine ligase  48.24 
 
 		 284 aa  272  4.0000000000000004e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0215  pantoate--beta-alanine ligase  47.18 
 
 		 284 aa  270  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0414083  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3469  pantoate/beta-alanine ligase  47.18 
 
 		 283 aa  270  2e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0137  pantoate--beta-alanine ligase  47.18 
 
 		 283 aa  270  2e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0142  pantoate--beta-alanine ligase  47.18 
 
 		 283 aa  270  2e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0126  pantoate--beta-alanine ligase  47.18 
 
 		 283 aa  270  2e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0136  pantoate--beta-alanine ligase  47.18 
 
 		 283 aa  270  2e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00132  pantoate-beta-alanine ligase  47.18 
 
 		 283 aa  269  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0198  pantoate--beta-alanine ligase  46.83 
 
 		 284 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.518661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  46.95 
 
 		 283 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00131  hypothetical protein  47.18 
 
 		 283 aa  269  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0144  pantoate--beta-alanine ligase  46.83 
 
 		 283 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3526  pantoate--beta-alanine ligase  47.18 
 
 		 283 aa  269  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0565  pantothenate synthetase  46.64 
 
 		 286 aa  268  5.9999999999999995e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.194299  hitchhiker  0.0000000964689 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0201  pantoate--beta-alanine ligase  46.83 
 
 		 284 aa  267  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.17692  normal  0.688359 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0886  cytidyltransferase-related  47 
 
 		 286 aa  267  2e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000710708  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1518  pantoate--beta-alanine ligase  50.36 
 
 		 279 aa  265  8.999999999999999e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.317394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0426  pantoate--beta-alanine ligase  48.75 
 
 		 283 aa  263  2e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4313  pantoate--beta-alanine ligase  44.95 
 
 		 288 aa  261  6.999999999999999e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0666  pantoate--beta-alanine ligase  47.7 
 
 		 282 aa  261  8.999999999999999e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232247  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0901  pantoate--beta-alanine ligase  45.58 
 
 		 281 aa  260  1e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163902  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2315  pantoate--beta-alanine ligase  47.18 
 
 		 286 aa  261  1e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.303459  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2952  pantothenate synthase  46.98 
 
 		 281 aa  261  1e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.215567  normal  0.0184604 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3281  pantoate--beta-alanine ligase  45.39 
 
 		 284 aa  261  1e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0102  pantoate--beta-alanine ligase  45.94 
 
 		 282 aa  261  1e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.346263  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3803  pantoate--beta-alanine ligase  45.74 
 
 		 281 aa  261  1e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0604878  hitchhiker  0.00446449 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2079  pantoate--beta-alanine ligase  43.97 
 
 		 282 aa  259  3e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0111678  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0867  pantoate--beta-alanine ligase  45.16 
 
 		 281 aa  258  9e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.712584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1667  pantoate--beta-alanine ligase  44.52 
 
 		 280 aa  256  2e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0844  pantoate--beta-alanine ligase  44.8 
 
 		 281 aa  257  2e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.126376  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0879  pantoate--beta-alanine ligase  44.8 
 
 		 281 aa  256  3e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00646372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1740  pantoate--beta-alanine ligase  44.52 
 
 		 280 aa  256  3e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2610  pantoate--beta-alanine ligase  44.52 
 
 		 298 aa  256  4e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.205281  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3344  pantoate--beta-alanine ligase  44.37 
 
 		 284 aa  255  4e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000501191  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3473  pantoate--beta-alanine ligase  44.37 
 
 		 284 aa  255  4e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.623251  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1012  pantoate--beta-alanine ligase  44.37 
 
 		 284 aa  255  6e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0272809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0693  pantoate--beta-alanine ligase  45.42 
 
 		 283 aa  255  6e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.001104  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4282  pantoate/beta-alanine ligase  48.86 
 
 		 539 aa  254  8e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3495  pantoate--beta-alanine ligase  44.44 
 
 		 281 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0231  pantoate--beta-alanine ligase  44.01 
 
 		 285 aa  254  1.0000000000000001e-66  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  45.58 
 
 		 283 aa  253  2.0000000000000002e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2197  pantoate--beta-alanine ligase  47.33 
 
 		 277 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347128  normal  0.875229 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3119  pantoate--beta-alanine ligase  44.01 
 
 		 284 aa  253  3e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.620137  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3409  pantoate--beta-alanine ligase  45.88 
 
 		 281 aa  253  3e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.545812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3133  pantoate--beta-alanine ligase  45.88 
 
 		 281 aa  252  4.0000000000000004e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0731299  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0775  pantoate--beta-alanine ligase  46.21 
 
 		 281 aa  252  4.0000000000000004e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0117  pantoate--beta-alanine ligase  48.93 
 
 		 288 aa  252  6e-66  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0725  pantoate--beta-alanine ligase  45.88 
 
 		 281 aa  251  7e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.278718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0680  pantoate--beta-alanine ligase  43.82 
 
 		 284 aa  251  1e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.337976  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4017  pantoate--beta-alanine ligase  43.82 
 
 		 282 aa  251  1e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.43915  normal  0.63382 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3297  pantoate--beta-alanine ligase  45.88 
 
 		 281 aa  251  1e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.749755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002560  pantoate--beta-alanine ligase  46.13 
 
 		 301 aa  250  2e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0445865  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3904  pantoate--beta-alanine ligase  43.26 
 
 		 281 aa  250  2e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1571  pantoate--beta-alanine ligase  46.89 
 
 		 280 aa  250  2e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03451  pantoate--beta-alanine ligase  45.42 
 
 		 300 aa  249  3e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2042  pantoate/beta-alanine ligase  46.91 
 
 		 293 aa  249  3e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1876  pantoate/beta-alanine ligase  46.34 
 
 		 288 aa  249  5e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3175  pantoate--beta-alanine ligase  46.64 
 
 		 281 aa  249  5e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0869  pantoate--beta-alanine ligase  45.52 
 
 		 281 aa  248  6e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1321  pantoate--beta-alanine ligase  47.69 
 
 		 284 aa  248  6e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0313852  normal  0.753592 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5773  pantoate--beta-alanine ligase  46.29 
 
 		 279 aa  248  7e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.417001  normal  0.370966 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0126  pantoate--beta-alanine ligase  49.47 
 
 		 287 aa  248  7e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0039  pantothenate synthetase  46.35 
 
 		 289 aa  248  8e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2117  pantoate--beta-alanine ligase  41.34 
 
 		 282 aa  248  9e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2447  pantoate--beta-alanine ligase  46.29 
 
 		 279 aa  247  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.124687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2357  pantoate--beta-alanine ligase  45.94 
 
 		 279 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.705598  normal  0.238844 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1159  pantoate--beta-alanine ligase  42.96 
 
 		 284 aa  247  1e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0480021  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1831  pantoate--beta-alanine ligase  46.29 
 
 		 279 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.686834  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2489  pantoate--beta-alanine ligase  45.94 
 
 		 279 aa  247  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2442  pantoate--beta-alanine ligase  46.29 
 
 		 279 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0290531  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3134  pantoate--beta-alanine ligase  45.52 
 
 		 282 aa  247  1e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.504396  normal  0.398811 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0596  pantoate--beta-alanine ligase  47.16 
 
 		 278 aa  246  3e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.242968 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3066  pantothenate synthetase  45.02 
 
 		 283 aa  246  3e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0830  pantoate/beta-alanine ligase  45.04 
 
 		 279 aa  245  4.9999999999999997e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00689  pantoate--beta-alanine ligase  46.93 
 
 		 280 aa  245  4.9999999999999997e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.591476  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3460  pantoate--beta-alanine ligase  45.04 
 
 		 276 aa  245  4.9999999999999997e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2515  pantoate--beta-alanine ligase  46.4 
 
 		 285 aa  245  6.999999999999999e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1014  pantoate--beta-alanine ligase  45.68 
 
 		 290 aa  244  8e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0852  pantoate--beta-alanine ligase  45.58 
 
 		 279 aa  244  8e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0174  pantoate--beta-alanine ligase  47.1 
 
 		 281 aa  243  1.9999999999999999e-63  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3186  pantoate--beta-alanine ligase  45.52 
 
 		 274 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.722916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3320  pantothenate synthetase  46.57 
 
 		 290 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2824  pantoate--beta-alanine ligase  43.46 
 
 		 284 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0816624  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>