More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_4017 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_4017  pantoate--beta-alanine ligase  100 
 
 
282 aa  583  1e-166  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.43915  normal  0.63382 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3593  pantoate--beta-alanine ligase  54.26 
 
 
285 aa  315  5e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4812  pantoate--beta-alanine ligase  53.9 
 
 
286 aa  311  1e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257734  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0733  pantoate--beta-alanine ligase  53.55 
 
 
287 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.536898  hitchhiker  0.0000595497 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42720  pantoate--beta-alanine ligase  52.13 
 
 
283 aa  308  8e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4699  pantoate--beta-alanine ligase  52.84 
 
 
287 aa  308  9e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.021644  hitchhiker  0.00466856 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4700  pantoate--beta-alanine ligase  52.84 
 
 
287 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0960  pantoate--beta-alanine ligase  53.21 
 
 
283 aa  306  3e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5447  pantoate--beta-alanine ligase  55.94 
 
 
283 aa  305  6e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62590  pantoate--beta-alanine ligase  55.94 
 
 
283 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4565  pantoate--beta-alanine ligase  52.52 
 
 
287 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0650903 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  51.07 
 
 
283 aa  300  1e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0867  pantoate--beta-alanine ligase  54.45 
 
 
281 aa  301  1e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.712584  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0666  pantoate--beta-alanine ligase  52.14 
 
 
282 aa  300  1e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232247  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3495  pantoate--beta-alanine ligase  54.09 
 
 
281 aa  298  5e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0844  pantoate--beta-alanine ligase  53.74 
 
 
281 aa  295  6e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.126376  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0879  pantoate--beta-alanine ligase  53.74 
 
 
281 aa  295  6e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00646372  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0869  pantoate--beta-alanine ligase  52.67 
 
 
281 aa  295  7e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002560  pantoate--beta-alanine ligase  52.48 
 
 
301 aa  295  8e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0445865  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3932  pantoate--beta-alanine ligase  51.06 
 
 
283 aa  292  3e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.341637  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03451  pantoate--beta-alanine ligase  51.06 
 
 
300 aa  292  5e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3133  pantoate--beta-alanine ligase  53.74 
 
 
281 aa  292  5e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0731299  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0725  pantoate--beta-alanine ligase  52.67 
 
 
281 aa  290  1e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.278718  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2610  pantoate--beta-alanine ligase  51.06 
 
 
298 aa  290  2e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.205281  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4313  pantoate--beta-alanine ligase  50.52 
 
 
288 aa  289  3e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3297  pantoate--beta-alanine ligase  52.31 
 
 
281 aa  289  4e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.749755  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0775  pantoate--beta-alanine ligase  52.88 
 
 
281 aa  288  8e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0213  pantoate--beta-alanine ligase  50.35 
 
 
284 aa  286  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0197  pantoate--beta-alanine ligase  50.35 
 
 
284 aa  286  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.742862  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0215  pantoate--beta-alanine ligase  50.35 
 
 
284 aa  286  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0414083  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3409  pantoate--beta-alanine ligase  52.31 
 
 
281 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.545812  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3469  pantoate/beta-alanine ligase  50.71 
 
 
283 aa  285  4e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0136  pantoate--beta-alanine ligase  50.71 
 
 
283 aa  285  4e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0137  pantoate--beta-alanine ligase  50.71 
 
 
283 aa  285  4e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0142  pantoate--beta-alanine ligase  50.71 
 
 
283 aa  285  4e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00132  pantoate-beta-alanine ligase  50.71 
 
 
283 aa  285  5.999999999999999e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00131  hypothetical protein  50.71 
 
 
283 aa  285  5.999999999999999e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0144  pantoate--beta-alanine ligase  50.71 
 
 
283 aa  285  5.999999999999999e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3526  pantoate--beta-alanine ligase  50.71 
 
 
283 aa  285  5.999999999999999e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0126  pantoate--beta-alanine ligase  50.71 
 
 
283 aa  285  7e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03551  pantothenate synthetase  49.64 
 
 
282 aa  284  9e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0198  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 
284 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.518661  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0693  pantoate--beta-alanine ligase  50.35 
 
 
283 aa  282  4.0000000000000003e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.001104  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3119  pantoate--beta-alanine ligase  50.88 
 
 
284 aa  281  8.000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.620137  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1061  pantoate--beta-alanine ligase  46.45 
 
 
284 aa  281  8.000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3904  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 
281 aa  281  8.000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0122  pantoate--beta-alanine ligase  50.71 
 
 
293 aa  280  1e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0223415  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1159  pantoate--beta-alanine ligase  50.88 
 
 
284 aa  280  1e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0480021  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0201  pantoate--beta-alanine ligase  49.65 
 
 
284 aa  280  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.17692  normal  0.688359 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0886  cytidyltransferase-related  48.58 
 
 
286 aa  279  3e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000710708  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3281  pantoate--beta-alanine ligase  51.44 
 
 
284 aa  278  7e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3992  pantoate--beta-alanine ligase  49.65 
 
 
284 aa  278  9e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3473  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 
284 aa  276  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.623251  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0680  pantoate--beta-alanine ligase  49.29 
 
 
284 aa  276  2e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.337976  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3344  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 
284 aa  276  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000501191  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1012  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 
284 aa  275  5e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0272809  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2315  pantoate--beta-alanine ligase  50.35 
 
 
286 aa  275  7e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.303459  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3066  pantothenate synthetase  46.1 
 
 
283 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3803  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 
281 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0604878  hitchhiker  0.00446449 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2824  pantoate--beta-alanine ligase  49.29 
 
 
284 aa  271  6e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0816624  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3134  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 
282 aa  268  7e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.504396  normal  0.398811 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1027  pantoate--beta-alanine ligase  51.34 
 
 
284 aa  267  1e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2130  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 
286 aa  265  7e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000332887 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0565  pantothenate synthetase  46.1 
 
 
286 aa  261  8.999999999999999e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.194299  hitchhiker  0.0000000964689 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3175  pantoate--beta-alanine ligase  49.64 
 
 
281 aa  258  6e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2054  pantoate--beta-alanine ligase  47.5 
 
 
283 aa  258  1e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.183406 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0126  pantoate--beta-alanine ligase  46.98 
 
 
287 aa  255  7e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0674  pantoate--beta-alanine ligase  47.45 
 
 
285 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.523643  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2606  pantoate/beta-alanine ligase  46.43 
 
 
288 aa  252  4.0000000000000004e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0878  Pantoate--beta-alanine ligase  48.23 
 
 
286 aa  251  7e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1525  pantoate-beta-alanine ligase  43.82 
 
 
283 aa  251  1e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.102611  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0117  pantoate--beta-alanine ligase  46.38 
 
 
288 aa  249  5e-65  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1155  pantothenate synthetase  45.1 
 
 
281 aa  246  2e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.914913 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3186  pantoate--beta-alanine ligase  45.36 
 
 
274 aa  246  3e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.722916  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0231  pantoate--beta-alanine ligase  43.36 
 
 
285 aa  246  3e-64  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  44.68 
 
 
282 aa  245  4.9999999999999997e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0101  pantoate--beta-alanine ligase  47.89 
 
 
327 aa  244  9.999999999999999e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1571  pantoate--beta-alanine ligase  46.04 
 
 
280 aa  243  3e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2387  pantoate--beta-alanine ligase  44.44 
 
 
283 aa  242  3.9999999999999997e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00513339 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1667  pantoate--beta-alanine ligase  46.04 
 
 
280 aa  242  3.9999999999999997e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2196  pantoate--beta-alanine ligase  44.1 
 
 
283 aa  242  5e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1740  pantoate--beta-alanine ligase  46.04 
 
 
280 aa  242  5e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3034  pantoate--beta-alanine ligase  47.59 
 
 
282 aa  242  6e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1518  pantoate--beta-alanine ligase  45.68 
 
 
279 aa  241  7e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.317394  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2600  pantoate--beta-alanine ligase  44.1 
 
 
283 aa  241  7.999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.174782  normal  0.673257 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1524  pantoate--beta-alanine ligase  46.79 
 
 
280 aa  241  7.999999999999999e-63  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2952  pantothenate synthase  47.14 
 
 
281 aa  241  9e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.215567  normal  0.0184604 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0161  pantoate--beta-alanine ligase  47.67 
 
 
281 aa  241  1e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.253183  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1423  pantoate--beta-alanine ligase  45.52 
 
 
282 aa  240  2e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0901  pantoate--beta-alanine ligase  42.76 
 
 
281 aa  240  2e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163902  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  42.41 
 
 
283 aa  240  2e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1610  pantoate--beta-alanine ligase  47.71 
 
 
280 aa  240  2e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.228935  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3535  pantoate--beta-alanine ligase  46.04 
 
 
284 aa  240  2e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000260902  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0404  pantoate/beta-alanine ligase  46.81 
 
 
281 aa  239  2.9999999999999997e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.302391  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1422  pantoate--beta-alanine ligase  45.52 
 
 
282 aa  239  4e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1634  pantoate--beta-alanine ligase  45.52 
 
 
282 aa  239  4e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0402516 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1450  pantoate--beta-alanine ligase  45.16 
 
 
282 aa  237  1e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1563  pantoate--beta-alanine ligase  45.16 
 
 
282 aa  237  1e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.371985  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0579  pantoate--beta-alanine ligase  43.87 
 
 
289 aa  238  1e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2767  pantoate--beta-alanine ligase  46.27 
 
 
275 aa  237  2e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.1934  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>