More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4700 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4700  pantoate--beta-alanine ligase  100 
 
 		 287 aa  583  1e-166  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4565  pantoate--beta-alanine ligase  98.26 
 
 		 287 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650903 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4699  pantoate--beta-alanine ligase  97.56 
 
 		 287 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.021644  hitchhiker  0.00466856 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0733  pantoate--beta-alanine ligase  89.9 
 
 		 287 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.536898  hitchhiker  0.0000595497 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4812  pantoate--beta-alanine ligase  79.86 
 
 		 286 aa  477  1e-133  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257734  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  77.5 
 
 		 283 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0960  pantoate--beta-alanine ligase  77.5 
 
 		 283 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5447  pantoate--beta-alanine ligase  75.97 
 
 		 283 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3593  pantoate--beta-alanine ligase  76.95 
 
 		 285 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62590  pantoate--beta-alanine ligase  75.97 
 
 		 283 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42720  pantoate--beta-alanine ligase  75.53 
 
 		 283 aa  435  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0666  pantoate--beta-alanine ligase  60.36 
 
 		 282 aa  363  2e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232247  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3904  pantoate--beta-alanine ligase  58.63 
 
 		 281 aa  335  5.999999999999999e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0693  pantoate--beta-alanine ligase  57.45 
 
 		 283 aa  333  2e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.001104  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0867  pantoate--beta-alanine ligase  58.63 
 
 		 281 aa  323  3e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.712584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0844  pantoate--beta-alanine ligase  58.63 
 
 		 281 aa  320  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.126376  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0879  pantoate--beta-alanine ligase  58.63 
 
 		 281 aa  320  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00646372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3133  pantoate--beta-alanine ligase  60.07 
 
 		 281 aa  320  9.999999999999999e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0731299  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0775  pantoate--beta-alanine ligase  59.35 
 
 		 281 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1061  pantoate--beta-alanine ligase  53.55 
 
 		 284 aa  318  5e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03551  pantothenate synthetase  53.93 
 
 		 282 aa  318  9e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3066  pantothenate synthetase  57.09 
 
 		 283 aa  317  1e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3495  pantoate--beta-alanine ligase  57.91 
 
 		 281 aa  317  1e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3281  pantoate--beta-alanine ligase  54.68 
 
 		 284 aa  317  2e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0869  pantoate--beta-alanine ligase  58.27 
 
 		 281 aa  316  3e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3803  pantoate--beta-alanine ligase  54.84 
 
 		 281 aa  316  3e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0604878  hitchhiker  0.00446449 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4313  pantoate--beta-alanine ligase  53.66 
 
 		 288 aa  313  1.9999999999999998e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0565  pantothenate synthetase  58.51 
 
 		 286 aa  313  2.9999999999999996e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.194299  hitchhiker  0.0000000964689 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3409  pantoate--beta-alanine ligase  58.27 
 
 		 281 aa  312  3.9999999999999997e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.545812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0725  pantoate--beta-alanine ligase  57.91 
 
 		 281 aa  310  2e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.278718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3134  pantoate--beta-alanine ligase  58.63 
 
 		 282 aa  310  2e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.504396  normal  0.398811 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3297  pantoate--beta-alanine ligase  57.91 
 
 		 281 aa  309  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.749755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3344  pantoate--beta-alanine ligase  54.26 
 
 		 284 aa  307  1.0000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000501191  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3473  pantoate--beta-alanine ligase  54.26 
 
 		 284 aa  307  1.0000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.623251  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4017  pantoate--beta-alanine ligase  52.84 
 
 		 282 aa  307  1.0000000000000001e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.43915  normal  0.63382 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1012  pantoate--beta-alanine ligase  54.26 
 
 		 284 aa  307  1.0000000000000001e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0272809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0144  pantoate--beta-alanine ligase  53.55 
 
 		 283 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0142  pantoate--beta-alanine ligase  53.19 
 
 		 283 aa  305  6e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0126  pantoate--beta-alanine ligase  53.19 
 
 		 283 aa  305  7e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00132  pantoate-beta-alanine ligase  52.84 
 
 		 283 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3469  pantoate/beta-alanine ligase  52.84 
 
 		 283 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0137  pantoate--beta-alanine ligase  52.84 
 
 		 283 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00131  hypothetical protein  52.84 
 
 		 283 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3526  pantoate--beta-alanine ligase  52.84 
 
 		 283 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0136  pantoate--beta-alanine ligase  52.84 
 
 		 283 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3175  pantoate--beta-alanine ligase  56.12 
 
 		 281 aa  300  1e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3992  pantoate--beta-alanine ligase  53.9 
 
 		 284 aa  299  3e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0197  pantoate--beta-alanine ligase  52.35 
 
 		 284 aa  299  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.742862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0215  pantoate--beta-alanine ligase  52.35 
 
 		 284 aa  299  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0414083  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0213  pantoate--beta-alanine ligase  52.35 
 
 		 284 aa  298  6e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3932  pantoate--beta-alanine ligase  52.48 
 
 		 283 aa  298  6e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.341637  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3119  pantoate--beta-alanine ligase  54.15 
 
 		 284 aa  298  7e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.620137  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0198  pantoate--beta-alanine ligase  52.35 
 
 		 284 aa  297  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.518661  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1027  pantoate--beta-alanine ligase  56.87 
 
 		 284 aa  296  2e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002560  pantoate--beta-alanine ligase  52.71 
 
 		 301 aa  295  5e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0445865  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0596  pantoate--beta-alanine ligase  53.99 
 
 		 278 aa  295  5e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.242968 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0231  pantoate--beta-alanine ligase  48.74 
 
 		 285 aa  295  5e-79  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1159  pantoate--beta-alanine ligase  53.07 
 
 		 284 aa  295  7e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0480021  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0201  pantoate--beta-alanine ligase  51.99 
 
 		 284 aa  294  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.17692  normal  0.688359 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03451  pantoate--beta-alanine ligase  52.35 
 
 		 300 aa  293  2e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2054  pantoate--beta-alanine ligase  57.35 
 
 		 283 aa  290  2e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.183406 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0886  cytidyltransferase-related  52.65 
 
 		 286 aa  290  2e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000710708  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2610  pantoate--beta-alanine ligase  51.65 
 
 		 298 aa  290  2e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.205281  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0122  pantoate--beta-alanine ligase  52.71 
 
 		 293 aa  290  2e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0223415  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2824  pantoate--beta-alanine ligase  53.55 
 
 		 284 aa  290  3e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0816624  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2315  pantoate--beta-alanine ligase  52.65 
 
 		 286 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.303459  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1525  pantoate-beta-alanine ligase  50.35 
 
 		 283 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.102611  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0680  pantoate--beta-alanine ligase  49.3 
 
 		 284 aa  276  2e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.337976  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2767  pantoate--beta-alanine ligase  57.71 
 
 		 275 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.1934  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3186  pantoate--beta-alanine ligase  54.84 
 
 		 274 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.722916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3320  pantothenate synthetase  54.35 
 
 		 290 aa  271  7e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2130  pantoate--beta-alanine ligase  51.07 
 
 		 286 aa  271  1e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000332887 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  52.45 
 
 		 283 aa  270  2e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2240  pantoate--beta-alanine ligase  54.01 
 
 		 285 aa  269  4e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.496301 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0674  pantoate--beta-alanine ligase  53.57 
 
 		 285 aa  268  5e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.523643  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0878  Pantoate--beta-alanine ligase  55.67 
 
 		 286 aa  268  5.9999999999999995e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0126  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 		 287 aa  268  8e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0426  pantoate--beta-alanine ligase  47.86 
 
 		 283 aa  267  2e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0579  pantoate--beta-alanine ligase  45.19 
 
 		 289 aa  267  2e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2606  pantoate/beta-alanine ligase  51.59 
 
 		 288 aa  266  2.9999999999999995e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1518  pantoate--beta-alanine ligase  53.24 
 
 		 279 aa  265  5.999999999999999e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.317394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2196  pantoate--beta-alanine ligase  54.38 
 
 		 285 aa  264  1e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.941779  normal  0.927137 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1876  pantoate/beta-alanine ligase  50 
 
 		 288 aa  264  1e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0117  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 		 288 aa  264  2e-69  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3535  pantoate--beta-alanine ligase  48.04 
 
 		 284 aa  261  8e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000260902  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2515  pantoate--beta-alanine ligase  52.92 
 
 		 285 aa  261  1e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1740  pantoate--beta-alanine ligase  47.69 
 
 		 280 aa  261  1e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1667  pantoate--beta-alanine ligase  47.69 
 
 		 280 aa  260  2e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  45.52 
 
 		 282 aa  260  2e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0958  pantoate--beta-alanine ligase  48.4 
 
 		 283 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2788  pantothenate synthetase  54.96 
 
 		 282 aa  258  8e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2060  pantoate--beta-alanine ligase  50.9 
 
 		 291 aa  257  1e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.047141 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2387  pantoate--beta-alanine ligase  50.52 
 
 		 283 aa  256  3e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513339 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0155  pantoate--beta-alanine ligase  49.12 
 
 		 282 aa  256  4e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243441  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3319  pantoate--beta-alanine ligase  51.76 
 
 		 286 aa  256  4e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2079  pantoate--beta-alanine ligase  47.69 
 
 		 282 aa  256  4e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0111678  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2197  pantoate--beta-alanine ligase  51.6 
 
 		 277 aa  255  5e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347128  normal  0.875229 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0901  pantoate--beta-alanine ligase  47.04 
 
 		 281 aa  255  7e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163902  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0161  pantoate--beta-alanine ligase  49.12 
 
 		 281 aa  254  9e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.253183  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0369  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 		 283 aa  253  2.0000000000000002e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.397358 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>