More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2824 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_2824  pantoate--beta-alanine ligase  100 
 
 		 284 aa  578  1e-164  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0816624  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1027  pantoate--beta-alanine ligase  87.63 
 
 		 284 aa  489  1e-137  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3119  pantoate--beta-alanine ligase  82.33 
 
 		 284 aa  486  1e-136  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.620137  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1159  pantoate--beta-alanine ligase  81.63 
 
 		 284 aa  483  1e-135  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0480021  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3992  pantoate--beta-alanine ligase  79.15 
 
 		 284 aa  471  1e-132  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3344  pantoate--beta-alanine ligase  76.6 
 
 		 284 aa  446  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000501191  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3473  pantoate--beta-alanine ligase  76.6 
 
 		 284 aa  446  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.623251  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1012  pantoate--beta-alanine ligase  76.24 
 
 		 284 aa  446  1.0000000000000001e-124  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0272809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0215  pantoate--beta-alanine ligase  69.26 
 
 		 284 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0414083  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3469  pantoate/beta-alanine ligase  68.2 
 
 		 283 aa  407  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0144  pantoate--beta-alanine ligase  68.55 
 
 		 283 aa  409  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0213  pantoate--beta-alanine ligase  68.9 
 
 		 284 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0142  pantoate--beta-alanine ligase  68.55 
 
 		 283 aa  409  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0197  pantoate--beta-alanine ligase  68.9 
 
 		 284 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.742862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0137  pantoate--beta-alanine ligase  68.2 
 
 		 283 aa  407  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0136  pantoate--beta-alanine ligase  68.2 
 
 		 283 aa  407  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0126  pantoate--beta-alanine ligase  68.55 
 
 		 283 aa  408  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00132  pantoate-beta-alanine ligase  68.2 
 
 		 283 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3526  pantoate--beta-alanine ligase  68.2 
 
 		 283 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0201  pantoate--beta-alanine ligase  68.55 
 
 		 284 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.17692  normal  0.688359 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00131  hypothetical protein  68.2 
 
 		 283 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0198  pantoate--beta-alanine ligase  68.55 
 
 		 284 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.518661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0680  pantoate--beta-alanine ligase  69.26 
 
 		 284 aa  406  1.0000000000000001e-112  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.337976  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002560  pantoate--beta-alanine ligase  63.37 
 
 		 301 aa  368  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0445865  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03451  pantoate--beta-alanine ligase  62.27 
 
 		 300 aa  364  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0122  pantoate--beta-alanine ligase  63.04 
 
 		 293 aa  358  6e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0223415  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2610  pantoate--beta-alanine ligase  61.82 
 
 		 298 aa  358  8e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.205281  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0231  pantoate--beta-alanine ligase  58.51 
 
 		 285 aa  349  3e-95  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0579  pantoate--beta-alanine ligase  53 
 
 		 289 aa  325  7e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42720  pantoate--beta-alanine ligase  57.6 
 
 		 283 aa  313  2.9999999999999996e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3281  pantoate--beta-alanine ligase  53.73 
 
 		 284 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4313  pantoate--beta-alanine ligase  55.76 
 
 		 288 aa  306  3e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0869  pantoate--beta-alanine ligase  54.18 
 
 		 281 aa  302  5.000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3409  pantoate--beta-alanine ligase  55.64 
 
 		 281 aa  300  2e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.545812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0775  pantoate--beta-alanine ligase  57.84 
 
 		 281 aa  300  2e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3133  pantoate--beta-alanine ligase  56.62 
 
 		 281 aa  298  5e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0731299  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0879  pantoate--beta-alanine ligase  54.78 
 
 		 281 aa  297  1e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00646372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0844  pantoate--beta-alanine ligase  54.78 
 
 		 281 aa  297  1e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.126376  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3495  pantoate--beta-alanine ligase  54.78 
 
 		 281 aa  297  1e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3904  pantoate--beta-alanine ligase  52.79 
 
 		 281 aa  295  5e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0867  pantoate--beta-alanine ligase  54.78 
 
 		 281 aa  295  5e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.712584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  55.97 
 
 		 283 aa  295  8e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0960  pantoate--beta-alanine ligase  54.51 
 
 		 283 aa  294  9e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4812  pantoate--beta-alanine ligase  53.87 
 
 		 286 aa  294  1e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257734  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3932  pantoate--beta-alanine ligase  51.77 
 
 		 283 aa  294  1e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.341637  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0725  pantoate--beta-alanine ligase  54.18 
 
 		 281 aa  293  2e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.278718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3297  pantoate--beta-alanine ligase  54.18 
 
 		 281 aa  293  2e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.749755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0733  pantoate--beta-alanine ligase  54.61 
 
 		 287 aa  292  5e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.536898  hitchhiker  0.0000595497 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3066  pantothenate synthetase  55.8 
 
 		 283 aa  290  1e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0693  pantoate--beta-alanine ligase  51.65 
 
 		 283 aa  291  1e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.001104  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4700  pantoate--beta-alanine ligase  53.55 
 
 		 287 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3593  pantoate--beta-alanine ligase  54.42 
 
 		 285 aa  289  3e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3134  pantoate--beta-alanine ligase  53.36 
 
 		 282 aa  289  4e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.504396  normal  0.398811 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4565  pantoate--beta-alanine ligase  53.79 
 
 		 287 aa  289  4e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650903 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4699  pantoate--beta-alanine ligase  53.55 
 
 		 287 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.021644  hitchhiker  0.00466856 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3803  pantoate--beta-alanine ligase  52.24 
 
 		 281 aa  287  1e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0604878  hitchhiker  0.00446449 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0886  cytidyltransferase-related  52.82 
 
 		 286 aa  285  5.999999999999999e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000710708  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5447  pantoate--beta-alanine ligase  52.48 
 
 		 283 aa  279  5e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62590  pantoate--beta-alanine ligase  52.48 
 
 		 283 aa  278  5e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0666  pantoate--beta-alanine ligase  53.51 
 
 		 282 aa  276  2e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232247  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03551  pantothenate synthetase  49.29 
 
 		 282 aa  273  2.0000000000000002e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3175  pantoate--beta-alanine ligase  51.49 
 
 		 281 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4017  pantoate--beta-alanine ligase  49.29 
 
 		 282 aa  271  7e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.43915  normal  0.63382 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0565  pantothenate synthetase  51.09 
 
 		 286 aa  265  7e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.194299  hitchhiker  0.0000000964689 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2315  pantoate--beta-alanine ligase  48.24 
 
 		 286 aa  261  1e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.303459  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2130  pantoate--beta-alanine ligase  50.54 
 
 		 286 aa  256  3e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000332887 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2042  pantoate/beta-alanine ligase  52.38 
 
 		 293 aa  256  3e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1061  pantoate--beta-alanine ligase  47.76 
 
 		 284 aa  255  6e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0674  pantoate--beta-alanine ligase  50.73 
 
 		 285 aa  251  7e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.523643  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0117  pantoate--beta-alanine ligase  50.9 
 
 		 288 aa  251  1e-65  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0878  Pantoate--beta-alanine ligase  50.71 
 
 		 286 aa  249  2e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2054  pantoate--beta-alanine ligase  51.85 
 
 		 283 aa  248  7e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.183406 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0126  pantoate--beta-alanine ligase  48.38 
 
 		 287 aa  248  9e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0958  pantoate--beta-alanine ligase  47.97 
 
 		 283 aa  247  2e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  47.86 
 
 		 283 aa  246  2e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3535  pantoate--beta-alanine ligase  49.24 
 
 		 284 aa  246  4e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000260902  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1829  pantoate--beta-alanine ligase  47.73 
 
 		 283 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2240  pantoate--beta-alanine ligase  49.26 
 
 		 285 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.496301 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1525  pantoate-beta-alanine ligase  43.46 
 
 		 283 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.102611  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00689  pantoate--beta-alanine ligase  48.52 
 
 		 280 aa  243  1.9999999999999999e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.591476  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2196  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 		 285 aa  242  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.941779  normal  0.927137 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1518  pantoate--beta-alanine ligase  49.25 
 
 		 279 aa  240  1e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.317394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1643  pantoate--beta-alanine ligase  46.4 
 
 		 283 aa  240  2e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.966928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1321  pantoate--beta-alanine ligase  46.95 
 
 		 284 aa  239  4e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0313852  normal  0.753592 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2515  pantoate--beta-alanine ligase  48.53 
 
 		 285 aa  239  5e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2060  pantoate--beta-alanine ligase  46.18 
 
 		 291 aa  238  8e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.047141 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4743  pantoate--beta-alanine ligase  47.31 
 
 		 291 aa  238  9e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.16561 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1706  pantoate--beta-alanine ligase  45.68 
 
 		 283 aa  237  1e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260086  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1014  pantoate--beta-alanine ligase  49.26 
 
 		 290 aa  238  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4723  pantoate--beta-alanine ligase  46.69 
 
 		 309 aa  237  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3186  pantoate--beta-alanine ligase  47.01 
 
 		 274 aa  236  3e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.722916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2846  pantoate--beta-alanine ligase  44.91 
 
 		 289 aa  236  4e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0102  pantoate--beta-alanine ligase  44.01 
 
 		 282 aa  236  4e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.346263  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4683  pantoate--beta-alanine ligase  46.32 
 
 		 300 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1134  pantoate/beta-alanine ligase  50 
 
 		 283 aa  235  5.0000000000000005e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1396  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 		 288 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.262573  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1498  pantoate--beta-alanine ligase  48.4 
 
 		 281 aa  235  6e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00126611  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1667  pantoate--beta-alanine ligase  46.59 
 
 		 280 aa  235  7e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3822  pantoate--beta-alanine ligase  50.37 
 
 		 289 aa  234  9e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3739  pantoate--beta-alanine ligase  50.37 
 
 		 289 aa  234  9e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.28887  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>