More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2042 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_2042  pantoate/beta-alanine ligase  100 
 
 		 293 aa  589  1e-167  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3992  pantoate--beta-alanine ligase  51.57 
 
 		 284 aa  269  4e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1027  pantoate--beta-alanine ligase  53.05 
 
 		 284 aa  265  7e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3473  pantoate--beta-alanine ligase  50.17 
 
 		 284 aa  259  3e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.623251  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3344  pantoate--beta-alanine ligase  50.17 
 
 		 284 aa  259  3e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000501191  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0231  pantoate--beta-alanine ligase  48.73 
 
 		 285 aa  259  3e-68  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1012  pantoate--beta-alanine ligase  48.6 
 
 		 284 aa  258  8e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0272809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0886  cytidyltransferase-related  50.86 
 
 		 286 aa  258  9e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000710708  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2824  pantoate--beta-alanine ligase  52.38 
 
 		 284 aa  256  4e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0816624  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0126  pantoate--beta-alanine ligase  49.48 
 
 		 283 aa  255  6e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0142  pantoate--beta-alanine ligase  49.48 
 
 		 283 aa  255  6e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3469  pantoate/beta-alanine ligase  49.65 
 
 		 283 aa  255  7e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0136  pantoate--beta-alanine ligase  49.65 
 
 		 283 aa  255  7e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0137  pantoate--beta-alanine ligase  49.65 
 
 		 283 aa  255  7e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1159  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 		 284 aa  255  8e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0480021  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0144  pantoate--beta-alanine ligase  49.48 
 
 		 283 aa  254  9e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42720  pantoate--beta-alanine ligase  50.57 
 
 		 283 aa  254  1.0000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00132  pantoate-beta-alanine ligase  49.3 
 
 		 283 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3526  pantoate--beta-alanine ligase  49.3 
 
 		 283 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0867  pantoate--beta-alanine ligase  48.18 
 
 		 281 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.712584  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00131  hypothetical protein  49.3 
 
 		 283 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3119  pantoate--beta-alanine ligase  50.55 
 
 		 284 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.620137  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3134  pantoate--beta-alanine ligase  49.64 
 
 		 282 aa  251  8.000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.504396  normal  0.398811 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0879  pantoate--beta-alanine ligase  48.18 
 
 		 281 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00646372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0844  pantoate--beta-alanine ligase  48.18 
 
 		 281 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.126376  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0215  pantoate--beta-alanine ligase  47.2 
 
 		 284 aa  249  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0414083  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1525  pantoate-beta-alanine ligase  46.91 
 
 		 283 aa  249  3e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.102611  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0197  pantoate--beta-alanine ligase  47.2 
 
 		 284 aa  249  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.742862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0213  pantoate--beta-alanine ligase  47.2 
 
 		 284 aa  249  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0201  pantoate--beta-alanine ligase  47.2 
 
 		 284 aa  248  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.17692  normal  0.688359 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3495  pantoate--beta-alanine ligase  47.45 
 
 		 281 aa  248  7e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2315  pantoate--beta-alanine ligase  48.96 
 
 		 286 aa  248  8e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.303459  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0198  pantoate--beta-alanine ligase  47.2 
 
 		 284 aa  248  8e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.518661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3904  pantoate--beta-alanine ligase  47.99 
 
 		 281 aa  248  1e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3409  pantoate--beta-alanine ligase  48.91 
 
 		 281 aa  248  1e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.545812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3133  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 		 281 aa  247  2e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0731299  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1014  pantoate--beta-alanine ligase  53.15 
 
 		 290 aa  247  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002560  pantoate--beta-alanine ligase  50.73 
 
 		 301 aa  246  3e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0445865  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0122  pantoate--beta-alanine ligase  47.9 
 
 		 293 aa  246  3e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0223415  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4700  pantoate--beta-alanine ligase  51.29 
 
 		 287 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0869  pantoate--beta-alanine ligase  48.54 
 
 		 281 aa  246  4e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3932  pantoate--beta-alanine ligase  45.14 
 
 		 283 aa  246  4e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.341637  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0725  pantoate--beta-alanine ligase  48.91 
 
 		 281 aa  246  4e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.278718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0565  pantothenate synthetase  50.17 
 
 		 286 aa  245  4.9999999999999997e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.194299  hitchhiker  0.0000000964689 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3297  pantoate--beta-alanine ligase  48.91 
 
 		 281 aa  245  6e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.749755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3593  pantoate--beta-alanine ligase  48.26 
 
 		 285 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3281  pantoate--beta-alanine ligase  47.45 
 
 		 284 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4565  pantoate--beta-alanine ligase  50.92 
 
 		 287 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650903 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03451  pantoate--beta-alanine ligase  48.9 
 
 		 300 aa  243  3e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4699  pantoate--beta-alanine ligase  50.92 
 
 		 287 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.021644  hitchhiker  0.00466856 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0680  pantoate--beta-alanine ligase  46.85 
 
 		 284 aa  241  9e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.337976  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0878  Pantoate--beta-alanine ligase  50.69 
 
 		 286 aa  241  1e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3803  pantoate--beta-alanine ligase  46.15 
 
 		 281 aa  240  2e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0604878  hitchhiker  0.00446449 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0674  pantoate--beta-alanine ligase  48.12 
 
 		 285 aa  239  2.9999999999999997e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.523643  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0693  pantoate--beta-alanine ligase  45.26 
 
 		 283 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.001104  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0733  pantoate--beta-alanine ligase  48.52 
 
 		 287 aa  239  5e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.536898  hitchhiker  0.0000595497 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0666  pantoate--beta-alanine ligase  48.61 
 
 		 282 aa  239  5e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232247  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2610  pantoate--beta-alanine ligase  48.26 
 
 		 298 aa  238  9e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.205281  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4812  pantoate--beta-alanine ligase  48.72 
 
 		 286 aa  238  9e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257734  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5447  pantoate--beta-alanine ligase  48.52 
 
 		 283 aa  237  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62590  pantoate--beta-alanine ligase  48.52 
 
 		 283 aa  237  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0775  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 		 281 aa  237  2e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4017  pantoate--beta-alanine ligase  46.59 
 
 		 282 aa  234  2.0000000000000002e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.43915  normal  0.63382 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1061  pantoate--beta-alanine ligase  46.21 
 
 		 284 aa  233  4.0000000000000004e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3175  pantoate--beta-alanine ligase  45.04 
 
 		 281 aa  231  1e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2196  pantoate--beta-alanine ligase  51.08 
 
 		 285 aa  230  2e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.941779  normal  0.927137 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2846  pantoate--beta-alanine ligase  47.83 
 
 		 289 aa  229  3e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1658  pantoate--beta-alanine ligase  46.85 
 
 		 282 aa  229  3e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.752293 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2240  pantoate--beta-alanine ligase  51.25 
 
 		 285 aa  229  4e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.496301 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2130  pantoate--beta-alanine ligase  45.04 
 
 		 286 aa  229  4e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000332887 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2515  pantoate--beta-alanine ligase  49.64 
 
 		 285 aa  228  7e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  46.37 
 
 		 283 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0960  pantoate--beta-alanine ligase  46.86 
 
 		 283 aa  227  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2495  pantoate--beta-alanine ligase  48.6 
 
 		 280 aa  227  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3066  pantothenate synthetase  46.72 
 
 		 283 aa  226  2e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0579  pantoate--beta-alanine ligase  40.49 
 
 		 289 aa  227  2e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4313  pantoate--beta-alanine ligase  42.27 
 
 		 288 aa  226  3e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03551  pantothenate synthetase  41.32 
 
 		 282 aa  226  3e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2387  pantoate--beta-alanine ligase  46.1 
 
 		 283 aa  224  2e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513339 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0848  pantoate--beta-alanine ligase  47.97 
 
 		 279 aa  223  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.889171  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1757  pantoate--beta-alanine ligase  48.95 
 
 		 279 aa  223  4e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1177  pantoate--beta-alanine ligase  46.32 
 
 		 286 aa  221  9.999999999999999e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3186  pantoate--beta-alanine ligase  44.85 
 
 		 274 aa  221  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.722916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0403  pantoate--beta-alanine ligase  48.25 
 
 		 279 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0668  pantoate--beta-alanine ligase  46.47 
 
 		 282 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1770  pantoate--beta-alanine ligase  44.64 
 
 		 278 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1446  pantoate--beta-alanine ligase  44.64 
 
 		 278 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0701  pantoate--beta-alanine ligase  46.67 
 
 		 279 aa  219  3e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.307086  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1204  pantoate--beta-alanine ligase  46.67 
 
 		 279 aa  219  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1049  pantoate--beta-alanine ligase  46.67 
 
 		 279 aa  219  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1321  pantoate--beta-alanine ligase  44.79 
 
 		 284 aa  219  3e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0313852  normal  0.753592 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1043  pantoate--beta-alanine ligase  46.67 
 
 		 279 aa  219  3e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2975  pantoate--beta-alanine ligase  46.67 
 
 		 279 aa  219  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00455305  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0198  pantoate--beta-alanine ligase  45.39 
 
 		 281 aa  220  3e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.795684  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1624  pantoate--beta-alanine ligase  46.67 
 
 		 279 aa  219  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00769335  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2312  pantoate--beta-alanine ligase  46.67 
 
 		 279 aa  219  3e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0189212  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2600  pantoate--beta-alanine ligase  46.35 
 
 		 283 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.174782  normal  0.673257 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3439  pantoate--beta-alanine ligase  44.41 
 
 		 280 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.32888  normal  0.795034 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4723  pantoate--beta-alanine ligase  47.22 
 
 		 309 aa  219  5e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2196  pantoate--beta-alanine ligase  46.35 
 
 		 283 aa  219  5e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.150585 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>