More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1757 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1757  pantoate--beta-alanine ligase  100 
 
 		 279 aa  553  1e-156  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0403  pantoate--beta-alanine ligase  97.49 
 
 		 279 aa  503  1e-141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2495  pantoate--beta-alanine ligase  89.21 
 
 		 280 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1658  pantoate--beta-alanine ligase  64.62 
 
 		 282 aa  328  5.0000000000000004e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.752293 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2560  pantoate--beta-alanine ligase  62.82 
 
 		 284 aa  325  5e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3439  pantoate--beta-alanine ligase  56.83 
 
 		 280 aa  319  3e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.32888  normal  0.795034 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2251  pantoate--beta-alanine ligase  57.91 
 
 		 307 aa  299  3e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1014  pantoate--beta-alanine ligase  56.36 
 
 		 290 aa  285  4e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3149  pantoate--beta-alanine ligase  55.87 
 
 		 290 aa  275  6e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2791  pantoate--beta-alanine ligase  54.48 
 
 		 288 aa  274  1.0000000000000001e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363963 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2952  pantothenate synthase  52.5 
 
 		 281 aa  271  8.000000000000001e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.215567  normal  0.0184604 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1396  pantoate--beta-alanine ligase  56 
 
 		 288 aa  268  5e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.262573  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2314  pantoate/beta-alanine ligase  55.6 
 
 		 284 aa  264  1e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000496833  hitchhiker  0.000102893 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3320  pantothenate synthetase  53.02 
 
 		 290 aa  262  4e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1321  pantoate--beta-alanine ligase  51.25 
 
 		 284 aa  254  8e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0313852  normal  0.753592 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3319  pantoate--beta-alanine ligase  53.45 
 
 		 286 aa  251  7e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0161  pantoate--beta-alanine ligase  48.18 
 
 		 281 aa  251  1e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.253183  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  48.73 
 
 		 283 aa  250  2e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4542  pantoate--beta-alanine ligase  50.88 
 
 		 285 aa  248  7e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.246095  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0869  pantoate--beta-alanine ligase  48.53 
 
 		 281 aa  247  1e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3409  pantoate--beta-alanine ligase  49.26 
 
 		 281 aa  248  1e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.545812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2788  pantothenate synthetase  51.81 
 
 		 282 aa  246  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2891  pantoate/beta-alanine ligase  54.95 
 
 		 290 aa  246  4e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.150324  normal  0.438724 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0886  cytidyltransferase-related  51.07 
 
 		 286 aa  245  6e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000710708  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3281  pantoate--beta-alanine ligase  44.12 
 
 		 284 aa  245  6e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0725  pantoate--beta-alanine ligase  48.9 
 
 		 281 aa  244  8e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.278718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3297  pantoate--beta-alanine ligase  48.9 
 
 		 281 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.749755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3133  pantoate--beta-alanine ligase  48.9 
 
 		 281 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0731299  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0670  pantoate--beta-alanine ligase  53.85 
 
 		 296 aa  243  3e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3003  pantoate--beta-alanine ligase  49.64 
 
 		 279 aa  242  5e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0849834 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5447  pantoate--beta-alanine ligase  50.9 
 
 		 283 aa  242  5e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3932  pantoate--beta-alanine ligase  45.52 
 
 		 283 aa  242  5e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.341637  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0122  pantoate--beta-alanine ligase  48.55 
 
 		 293 aa  242  6e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0223415  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0830  pantoate/beta-alanine ligase  42.75 
 
 		 279 aa  241  1e-62  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2824  pantoate--beta-alanine ligase  48.91 
 
 		 284 aa  240  2e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0816624  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  43.32 
 
 		 282 aa  239  4e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2240  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 		 285 aa  239  4e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.496301 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3593  pantoate--beta-alanine ligase  50.54 
 
 		 285 aa  239  5e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0867  pantoate--beta-alanine ligase  46.18 
 
 		 281 aa  238  5.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.712584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3495  pantoate--beta-alanine ligase  45.59 
 
 		 281 aa  238  5.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4812  pantoate--beta-alanine ligase  50.36 
 
 		 286 aa  238  5.999999999999999e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257734  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0844  pantoate--beta-alanine ligase  45.96 
 
 		 281 aa  238  6.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.126376  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0879  pantoate--beta-alanine ligase  45.96 
 
 		 281 aa  238  8e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00646372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1789  pantoate--beta-alanine ligase  46.18 
 
 		 281 aa  238  9e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4557  pantoate/beta-alanine ligase  47.86 
 
 		 280 aa  237  1e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.146553  normal  0.699914 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3992  pantoate--beta-alanine ligase  47.46 
 
 		 284 aa  238  1e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2196  pantoate--beta-alanine ligase  49.08 
 
 		 285 aa  238  1e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.941779  normal  0.927137 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3904  pantoate--beta-alanine ligase  44.89 
 
 		 281 aa  237  1e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2042  pantoate/beta-alanine ligase  48.95 
 
 		 293 aa  237  2e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3066  pantothenate synthetase  49.64 
 
 		 283 aa  236  2e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03551  pantothenate synthetase  47.67 
 
 		 282 aa  236  3e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2515  pantoate--beta-alanine ligase  49.27 
 
 		 285 aa  236  3e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0693  pantoate--beta-alanine ligase  42.03 
 
 		 283 aa  236  4e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.001104  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0333  pantoate--beta-alanine ligase  49.64 
 
 		 278 aa  235  5.0000000000000005e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0775  pantoate--beta-alanine ligase  49.45 
 
 		 281 aa  235  5.0000000000000005e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0958  pantoate--beta-alanine ligase  46.35 
 
 		 283 aa  235  7e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4700  pantoate--beta-alanine ligase  50.36 
 
 		 287 aa  234  8e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0960  pantoate--beta-alanine ligase  49.1 
 
 		 283 aa  234  8e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4699  pantoate--beta-alanine ligase  50.36 
 
 		 287 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.021644  hitchhiker  0.00466856 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1644  pantoate/beta-alanine ligase  55.4 
 
 		 295 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.742057  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0102  pantoate--beta-alanine ligase  43.88 
 
 		 282 aa  234  1.0000000000000001e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.346263  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62590  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 		 283 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0733  pantoate--beta-alanine ligase  48.92 
 
 		 287 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.536898  hitchhiker  0.0000595497 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0084  pantoate--beta-alanine ligase  49.28 
 
 		 287 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.458072 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4462  pantoate/beta-alanine ligase  47.67 
 
 		 280 aa  234  2.0000000000000002e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1525  pantoate-beta-alanine ligase  46.62 
 
 		 283 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.102611  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2610  pantoate--beta-alanine ligase  46.49 
 
 		 298 aa  233  2.0000000000000002e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.205281  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0565  pantothenate synthetase  50.36 
 
 		 286 aa  234  2.0000000000000002e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.194299  hitchhiker  0.0000000964689 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4743  pantoate--beta-alanine ligase  48.55 
 
 		 291 aa  233  3e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.16561 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4565  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 		 287 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650903 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0666  pantoate--beta-alanine ligase  48.2 
 
 		 282 aa  233  3e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232247  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1012  pantoate--beta-alanine ligase  47.1 
 
 		 284 aa  231  8.000000000000001e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0272809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1524  pantoate--beta-alanine ligase  42.39 
 
 		 280 aa  231  8.000000000000001e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3344  pantoate--beta-alanine ligase  47.1 
 
 		 284 aa  231  8.000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000501191  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3473  pantoate--beta-alanine ligase  47.1 
 
 		 284 aa  231  8.000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.623251  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0744  pantoate--beta-alanine ligase  49.27 
 
 		 278 aa  231  1e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.809915  hitchhiker  0.00112992 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03451  pantoate--beta-alanine ligase  46.62 
 
 		 300 aa  231  1e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3803  pantoate--beta-alanine ligase  43.01 
 
 		 281 aa  231  1e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0604878  hitchhiker  0.00446449 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3063  pantoate--beta-alanine ligase  47.69 
 
 		 283 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.217741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3564  pantoate--beta-alanine ligase  47.33 
 
 		 283 aa  229  3e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.358639  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002560  pantoate--beta-alanine ligase  46.21 
 
 		 301 aa  229  3e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0445865  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1721  pantothenate synthetase  45.91 
 
 		 288 aa  229  3e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.308068  normal  0.216295 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4313  pantoate--beta-alanine ligase  44.29 
 
 		 288 aa  229  4e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3134  pantoate--beta-alanine ligase  46.72 
 
 		 282 aa  229  4e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.504396  normal  0.398811 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0198  pantoate--beta-alanine ligase  45.52 
 
 		 284 aa  229  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.518661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  48.38 
 
 		 283 aa  229  5e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3119  pantoate--beta-alanine ligase  47.1 
 
 		 284 aa  229  5e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.620137  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0201  pantoate--beta-alanine ligase  45.16 
 
 		 284 aa  228  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.17692  normal  0.688359 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42720  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 		 283 aa  228  7e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0197  pantoate--beta-alanine ligase  45.16 
 
 		 284 aa  228  8e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.742862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0901  pantoate--beta-alanine ligase  41.55 
 
 		 281 aa  228  8e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163902  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3535  pantoate--beta-alanine ligase  45.62 
 
 		 284 aa  228  9e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000260902  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4282  pantoate/beta-alanine ligase  47.31 
 
 		 539 aa  228  1e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0213  pantoate--beta-alanine ligase  45.16 
 
 		 284 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0215  pantoate--beta-alanine ligase  45.16 
 
 		 284 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0414083  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4783  pantoate--beta-alanine ligase  46.79 
 
 		 283 aa  227  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1027  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 		 284 aa  227  2e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1876  pantoate/beta-alanine ligase  49.13 
 
 		 288 aa  226  4e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1634  pantoate--beta-alanine ligase  46.49 
 
 		 283 aa  225  5.0000000000000005e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3332  pantoate--beta-alanine ligase  47.14 
 
 		 311 aa  225  8e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.475559  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>