More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1644 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1644  pantoate/beta-alanine ligase  100 
 
 
295 aa  558  1e-158  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.742057  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2314  pantoate/beta-alanine ligase  57.14 
 
 
284 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000496833  hitchhiker  0.000102893 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2891  pantoate/beta-alanine ligase  62.28 
 
 
290 aa  273  2.0000000000000002e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.150324  normal  0.438724 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2560  pantoate--beta-alanine ligase  54.8 
 
 
284 aa  258  6e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4743  pantoate--beta-alanine ligase  48.95 
 
 
291 aa  258  1e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.16561 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0161  pantoate--beta-alanine ligase  48.56 
 
 
281 aa  253  3e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.253183  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2251  pantoate--beta-alanine ligase  52.81 
 
 
307 aa  253  3e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1876  pantoate/beta-alanine ligase  51.7 
 
 
288 aa  251  1e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0403  pantoate--beta-alanine ligase  55.76 
 
 
279 aa  250  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0901  pantoate--beta-alanine ligase  45.2 
 
 
281 aa  248  1e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163902  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1757  pantoate--beta-alanine ligase  55.4 
 
 
279 aa  246  3e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2495  pantoate--beta-alanine ligase  55.4 
 
 
280 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0333  pantoate--beta-alanine ligase  51.25 
 
 
278 aa  243  3e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1658  pantoate--beta-alanine ligase  53.21 
 
 
282 aa  242  3.9999999999999997e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.752293 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0744  pantoate--beta-alanine ligase  50.53 
 
 
278 aa  242  5e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.809915  hitchhiker  0.00112992 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3460  pantoate--beta-alanine ligase  48.94 
 
 
276 aa  241  9e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0134  pantoate/beta-alanine ligase  44.84 
 
 
279 aa  241  1e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  49.82 
 
 
283 aa  241  2e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3689  pantoate/beta-alanine ligase  46.88 
 
 
285 aa  240  2e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.141413 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2788  pantothenate synthetase  51.59 
 
 
282 aa  239  5e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0426  pantoate--beta-alanine ligase  45.16 
 
 
283 aa  239  5e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0670  pantoate--beta-alanine ligase  54.93 
 
 
296 aa  236  3e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1789  pantoate--beta-alanine ligase  45.71 
 
 
281 aa  235  6e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0555  pantoate--beta-alanine ligase  54.29 
 
 
278 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0666  pantoate--beta-alanine ligase  47.55 
 
 
282 aa  234  1.0000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232247  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1829  pantoate--beta-alanine ligase  48.94 
 
 
283 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0958  pantoate--beta-alanine ligase  47.33 
 
 
283 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2791  pantoate--beta-alanine ligase  50.53 
 
 
288 aa  233  3e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.363963 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_708  pantothenate synthetase  46.81 
 
 
277 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1786  pantoate/beta-alanine ligase  44.76 
 
 
281 aa  233  4.0000000000000004e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.300346  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0369  pantoate--beta-alanine ligase  48.94 
 
 
283 aa  232  6e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.397358 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1740  pantoate--beta-alanine ligase  44.24 
 
 
280 aa  231  8.000000000000001e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4565  pantoate--beta-alanine ligase  47.69 
 
 
287 aa  231  8.000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0650903 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  41.64 
 
 
282 aa  231  8.000000000000001e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3320  pantothenate synthetase  51.97 
 
 
290 aa  231  1e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1667  pantoate--beta-alanine ligase  44.24 
 
 
280 aa  231  1e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4699  pantoate--beta-alanine ligase  47.33 
 
 
287 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.021644  hitchhiker  0.00466856 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4700  pantoate--beta-alanine ligase  46.98 
 
 
287 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0733  pantoate--beta-alanine ligase  48.04 
 
 
287 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.536898  hitchhiker  0.0000595497 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0830  pantoate/beta-alanine ligase  41.11 
 
 
279 aa  229  3e-59  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1266  pantoate/beta-alanine ligase  46.1 
 
 
289 aa  229  3e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1014  pantoate--beta-alanine ligase  51.82 
 
 
290 aa  229  3e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0728  pantoate--beta-alanine ligase  45.52 
 
 
277 aa  229  5e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.41941  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0460  pantothenate synthetase  55.26 
 
 
334 aa  228  7e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4812  pantoate--beta-alanine ligase  47.39 
 
 
286 aa  227  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257734  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03551  pantothenate synthetase  44.68 
 
 
282 aa  227  2e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62590  pantoate--beta-alanine ligase  48.58 
 
 
283 aa  226  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4487  pantoate/beta-alanine ligase  54.58 
 
 
287 aa  226  3e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1706  pantoate--beta-alanine ligase  46.62 
 
 
283 aa  226  4e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260086  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3149  pantoate--beta-alanine ligase  51.06 
 
 
290 aa  226  4e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0084  pantoate--beta-alanine ligase  48.2 
 
 
287 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.458072 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3593  pantoate--beta-alanine ligase  46.85 
 
 
285 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5447  pantoate--beta-alanine ligase  48.58 
 
 
283 aa  225  6e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1239  pantoate--beta-alanine ligase  47.16 
 
 
279 aa  225  8e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000121643 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0960  pantoate--beta-alanine ligase  45.74 
 
 
283 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3066  pantothenate synthetase  46.98 
 
 
283 aa  224  2e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3011  pantoate--beta-alanine ligase  48.58 
 
 
279 aa  224  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3535  pantoate--beta-alanine ligase  46.45 
 
 
284 aa  223  2e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000260902  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3439  pantoate--beta-alanine ligase  47.14 
 
 
280 aa  223  3e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.32888  normal  0.795034 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1610  pantoate--beta-alanine ligase  41.79 
 
 
280 aa  223  4e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.228935  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0426  pantoate--beta-alanine ligase  45.88 
 
 
289 aa  223  4e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188172  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4462  pantoate/beta-alanine ligase  46.18 
 
 
280 aa  222  4.9999999999999996e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8383  pantoate/beta-alanine ligase  50.87 
 
 
288 aa  222  7e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.857994  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1524  pantoate--beta-alanine ligase  41.43 
 
 
280 aa  221  9.999999999999999e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1012  pantoate--beta-alanine ligase  45.77 
 
 
284 aa  221  9.999999999999999e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0272809  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2060  pantoate--beta-alanine ligase  46.48 
 
 
291 aa  221  9.999999999999999e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.047141 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1571  pantoate--beta-alanine ligase  40.57 
 
 
280 aa  221  1.9999999999999999e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1643  pantoate--beta-alanine ligase  47.35 
 
 
283 aa  220  3e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.966928  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3473  pantoate--beta-alanine ligase  45.42 
 
 
284 aa  220  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.623251  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3344  pantoate--beta-alanine ligase  45.42 
 
 
284 aa  220  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000501191  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0320  pantoate--beta-alanine ligase  39.15 
 
 
282 aa  219  3.9999999999999997e-56  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0749  pantoate/beta-alanine ligase  46.05 
 
 
289 aa  219  5e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0722466  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0342  pantoate--beta-alanine ligase  38.79 
 
 
282 aa  219  6e-56  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0042  pantoate--beta-alanine ligase  47.58 
 
 
273 aa  219  6e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000112642  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0804  pantoate--beta-alanine ligase  46.9 
 
 
268 aa  218  1e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0135127  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0329  pantoate--beta-alanine ligase  43.97 
 
 
293 aa  218  1e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384164  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0346  pantoate--beta-alanine ligase  44.76 
 
 
293 aa  218  1e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.900978  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3063  pantoate--beta-alanine ligase  45.52 
 
 
283 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.217741  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03451  pantoate--beta-alanine ligase  44.33 
 
 
300 aa  217  2e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002560  pantoate--beta-alanine ligase  43.97 
 
 
301 aa  216  2.9999999999999998e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0445865  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0102  pantoate--beta-alanine ligase  39.86 
 
 
282 aa  216  2.9999999999999998e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.346263  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1012  pantoate/beta-alanine ligase  47.27 
 
 
282 aa  216  4e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42720  pantoate--beta-alanine ligase  45.91 
 
 
283 aa  216  4e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0101  pantoate--beta-alanine ligase  52.11 
 
 
327 aa  216  5e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4783  pantoate--beta-alanine ligase  47.14 
 
 
283 aa  215  7e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1061  pantoate--beta-alanine ligase  42.2 
 
 
284 aa  215  7e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  48.6 
 
 
527 aa  215  8e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1683  pantoate--beta-alanine ligase  45.23 
 
 
287 aa  215  8e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.708165  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3992  pantoate--beta-alanine ligase  44.91 
 
 
284 aa  215  9e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  44.68 
 
 
283 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2079  pantoate--beta-alanine ligase  44.13 
 
 
282 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0111678  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2240  pantoate--beta-alanine ligase  48.54 
 
 
285 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.496301 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0667  pantoate--beta-alanine ligase  41.81 
 
 
283 aa  214  9.999999999999999e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2254  pantoate/beta-alanine ligase  43.01 
 
 
289 aa  214  1.9999999999999998e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1707  pantoate--beta-alanine ligase  44.17 
 
 
290 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2610  pantoate--beta-alanine ligase  42.55 
 
 
298 aa  214  1.9999999999999998e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.205281  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3904  pantoate--beta-alanine ligase  43.06 
 
 
281 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2196  pantoate--beta-alanine ligase  49.45 
 
 
285 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.941779  normal  0.927137 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3835  pantothenate synthetase  40.36 
 
 
283 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3119  pantoate--beta-alanine ligase  44.13 
 
 
284 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.620137  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>