More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0134 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0134  pantoate/beta-alanine ligase  100 
 
 		 279 aa  577  1e-164  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0901  pantoate--beta-alanine ligase  46.43 
 
 		 281 aa  246  3e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163902  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1643  pantoate--beta-alanine ligase  45.2 
 
 		 283 aa  245  4.9999999999999997e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.966928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4462  pantoate/beta-alanine ligase  45 
 
 		 280 aa  244  8e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1706  pantoate--beta-alanine ligase  44.13 
 
 		 283 aa  242  5e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260086  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3689  pantoate/beta-alanine ligase  48.21 
 
 		 285 aa  242  6e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.141413 
 
 
-
 
NC_002950  PG0477  pantoate--beta-alanine ligase  44.96 
 
 		 281 aa  241  7.999999999999999e-63  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0426  pantoate--beta-alanine ligase  44.84 
 
 		 283 aa  241  1e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  45.36 
 
 		 283 aa  237  1e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4557  pantoate/beta-alanine ligase  45 
 
 		 280 aa  237  2e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.146553  normal  0.699914 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0155  pantoate--beta-alanine ligase  44.88 
 
 		 282 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243441  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0744  pantoate--beta-alanine ligase  46.43 
 
 		 278 aa  234  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.809915  hitchhiker  0.00112992 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0161  pantoate--beta-alanine ligase  44.29 
 
 		 281 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.253183  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2254  pantoate/beta-alanine ligase  44.48 
 
 		 289 aa  233  3e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4743  pantoate--beta-alanine ligase  45.55 
 
 		 291 aa  233  3e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.16561 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1829  pantoate--beta-alanine ligase  44.04 
 
 		 283 aa  231  7.000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1239  pantoate--beta-alanine ligase  44.48 
 
 		 279 aa  231  8.000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000121643 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0886  cytidyltransferase-related  43.26 
 
 		 286 aa  231  1e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000710708  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0728  pantoate--beta-alanine ligase  45 
 
 		 277 aa  231  1e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.41941  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1740  pantoate--beta-alanine ligase  44.88 
 
 		 280 aa  231  1e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1667  pantoate--beta-alanine ligase  44.88 
 
 		 280 aa  231  1e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0333  pantoate--beta-alanine ligase  46.07 
 
 		 278 aa  229  4e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_708  pantothenate synthetase  44.29 
 
 		 277 aa  229  5e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0126  pantoate--beta-alanine ligase  45.04 
 
 		 283 aa  228  7e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3535  pantoate--beta-alanine ligase  43.06 
 
 		 284 aa  228  8e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000260902  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0958  pantoate--beta-alanine ligase  43.77 
 
 		 283 aa  228  9e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0804  pantoate--beta-alanine ligase  47.86 
 
 		 268 aa  228  1e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0135127  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1789  pantoate--beta-alanine ligase  44.29 
 
 		 281 aa  228  1e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3469  pantoate/beta-alanine ligase  45.16 
 
 		 283 aa  227  2e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0142  pantoate--beta-alanine ligase  45.16 
 
 		 283 aa  227  2e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0136  pantoate--beta-alanine ligase  45.16 
 
 		 283 aa  227  2e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0137  pantoate--beta-alanine ligase  45.16 
 
 		 283 aa  227  2e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2079  pantoate--beta-alanine ligase  43.77 
 
 		 282 aa  227  2e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0111678  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0144  pantoate--beta-alanine ligase  43.97 
 
 		 283 aa  226  3e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1266  pantoate/beta-alanine ligase  42.7 
 
 		 289 aa  225  5.0000000000000005e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00132  pantoate-beta-alanine ligase  44.8 
 
 		 283 aa  225  6e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3011  pantoate--beta-alanine ligase  43.77 
 
 		 279 aa  225  6e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3526  pantoate--beta-alanine ligase  44.8 
 
 		 283 aa  225  6e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00131  hypothetical protein  44.8 
 
 		 283 aa  225  6e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1707  pantoate--beta-alanine ligase  39.72 
 
 		 290 aa  224  1e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2846  pantoate--beta-alanine ligase  42.76 
 
 		 289 aa  224  1e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2060  pantoate--beta-alanine ligase  41.28 
 
 		 291 aa  223  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.047141 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1177  pantoate--beta-alanine ligase  41.9 
 
 		 286 aa  223  4e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2251  pantoate--beta-alanine ligase  41.9 
 
 		 307 aa  222  4e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3835  pantothenate synthetase  42.46 
 
 		 283 aa  222  4.9999999999999996e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0329  pantoate--beta-alanine ligase  41.99 
 
 		 293 aa  221  8e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384164  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1571  pantoate--beta-alanine ligase  43.57 
 
 		 280 aa  221  8e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4723  pantoate--beta-alanine ligase  39.72 
 
 		 309 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0346  pantoate--beta-alanine ligase  41.64 
 
 		 293 aa  219  3e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.900978  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  40.36 
 
 		 282 aa  219  3e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0102  pantoate--beta-alanine ligase  41.49 
 
 		 282 aa  220  3e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.346263  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3426  pantoate/beta-alanine ligase  43.98 
 
 		 294 aa  219  5e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2314  pantoate/beta-alanine ligase  43.66 
 
 		 284 aa  219  5e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000496833  hitchhiker  0.000102893 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1786  pantoate/beta-alanine ligase  43.32 
 
 		 281 aa  217  1e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.300346  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3014  pantoate/beta-alanine ligase  42.29 
 
 		 281 aa  216  2.9999999999999998e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.207166 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0668  pantoate--beta-alanine ligase  42.01 
 
 		 282 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0117  pantoate--beta-alanine ligase  42.24 
 
 		 288 aa  216  5e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0596  pantoate--beta-alanine ligase  42.45 
 
 		 278 aa  215  5e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.242968 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4017  pantoate--beta-alanine ligase  42.4 
 
 		 282 aa  215  5.9999999999999996e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.43915  normal  0.63382 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3460  pantoate--beta-alanine ligase  40.64 
 
 		 276 aa  214  9.999999999999999e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1644  pantoate/beta-alanine ligase  44.52 
 
 		 295 aa  214  9.999999999999999e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.742057  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0460  pantothenate synthetase  45.28 
 
 		 334 aa  214  9.999999999999999e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0733  pantoate--beta-alanine ligase  41.81 
 
 		 287 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.536898  hitchhiker  0.0000595497 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2054  pantoate--beta-alanine ligase  42.29 
 
 		 283 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.183406 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0090  pantoate/beta-alanine ligase  44.44 
 
 		 273 aa  213  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1155  pantothenate synthetase  41.55 
 
 		 281 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.914913 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1524  pantoate--beta-alanine ligase  41.22 
 
 		 280 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0960  pantoate--beta-alanine ligase  42.21 
 
 		 283 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2774  pantoate--beta-alanine ligase  41.75 
 
 		 280 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.8833 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0198  pantoate--beta-alanine ligase  43.01 
 
 		 284 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.518661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3564  pantoate--beta-alanine ligase  41.67 
 
 		 283 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.358639  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3593  pantoate--beta-alanine ligase  41.46 
 
 		 285 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9160  Pantoate--beta-alanine ligase  43.4 
 
 		 285 aa  212  3.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4812  pantoate--beta-alanine ligase  42.07 
 
 		 286 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257734  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0201  pantoate--beta-alanine ligase  43.01 
 
 		 284 aa  212  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.17692  normal  0.688359 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2606  pantoate/beta-alanine ligase  42.45 
 
 		 288 aa  212  7e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0197  pantoate--beta-alanine ligase  42.65 
 
 		 284 aa  211  7.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.742862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1518  pantoate--beta-alanine ligase  42.5 
 
 		 279 aa  211  7.999999999999999e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.317394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4683  pantoate--beta-alanine ligase  40.35 
 
 		 300 aa  211  7.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3992  pantoate--beta-alanine ligase  41.22 
 
 		 284 aa  211  1e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3063  pantoate--beta-alanine ligase  41.09 
 
 		 283 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.217741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3066  pantothenate synthetase  41.28 
 
 		 283 aa  211  1e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0215  pantoate--beta-alanine ligase  42.65 
 
 		 284 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0414083  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0213  pantoate--beta-alanine ligase  42.65 
 
 		 284 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0825  pantoate--beta-alanine ligase  42.34 
 
 		 292 aa  210  2e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4981  pantoate/beta-alanine ligase  44.91 
 
 		 289 aa  210  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0199543  normal  0.96569 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0680  pantoate--beta-alanine ligase  42.4 
 
 		 284 aa  210  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.337976  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0323  pantoate--beta-alanine ligase  42.19 
 
 		 301 aa  210  2e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2884  pantothenate synthetase  43.17 
 
 		 296 aa  209  3e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.411032  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  42.66 
 
 		 527 aa  209  3e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0198  pantoate--beta-alanine ligase  39.93 
 
 		 281 aa  209  3e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.795684  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0241  pantoate--beta-alanine ligase  42.5 
 
 		 281 aa  209  3e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139282  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0426  pantoate--beta-alanine ligase  38.93 
 
 		 289 aa  209  3e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188172  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4700  pantoate--beta-alanine ligase  41.36 
 
 		 287 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0122  pantoate--beta-alanine ligase  40.28 
 
 		 293 aa  209  4e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0223415  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  41.11 
 
 		 283 aa  209  4e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4699  pantoate--beta-alanine ligase  41.36 
 
 		 287 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.021644  hitchhiker  0.00466856 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1507  pantoate/beta-alanine ligase  42.12 
 
 		 280 aa  209  4e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00689  pantoate--beta-alanine ligase  40.65 
 
 		 280 aa  209  5e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.591476  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4282  pantoate/beta-alanine ligase  39.34 
 
 		 539 aa  208  6e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>