More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3593 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009439  Pmen_3593  pantoate--beta-alanine ligase  100 
 
 
285 aa  577  1e-164  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0733  pantoate--beta-alanine ligase  77.3 
 
 
287 aa  450  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.536898  hitchhiker  0.0000595497 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4700  pantoate--beta-alanine ligase  76.95 
 
 
287 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4699  pantoate--beta-alanine ligase  76.95 
 
 
287 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.021644  hitchhiker  0.00466856 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4565  pantoate--beta-alanine ligase  76.24 
 
 
287 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0650903 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4812  pantoate--beta-alanine ligase  74.82 
 
 
286 aa  435  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257734  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5447  pantoate--beta-alanine ligase  72.34 
 
 
283 aa  418  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62590  pantoate--beta-alanine ligase  72.34 
 
 
283 aa  418  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  71.22 
 
 
283 aa  411  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0960  pantoate--beta-alanine ligase  71.58 
 
 
283 aa  410  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42720  pantoate--beta-alanine ligase  71.73 
 
 
283 aa  408  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0666  pantoate--beta-alanine ligase  61.79 
 
 
282 aa  358  5e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232247  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3066  pantothenate synthetase  58.13 
 
 
283 aa  318  6e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3904  pantoate--beta-alanine ligase  55.76 
 
 
281 aa  317  2e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0693  pantoate--beta-alanine ligase  55.12 
 
 
283 aa  315  4e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.001104  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4017  pantoate--beta-alanine ligase  54.26 
 
 
282 aa  315  5e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.43915  normal  0.63382 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0867  pantoate--beta-alanine ligase  57.55 
 
 
281 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.712584  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4313  pantoate--beta-alanine ligase  54.51 
 
 
288 aa  311  7.999999999999999e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3495  pantoate--beta-alanine ligase  57.55 
 
 
281 aa  310  1e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0879  pantoate--beta-alanine ligase  57.55 
 
 
281 aa  310  1e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00646372  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03551  pantothenate synthetase  52.86 
 
 
282 aa  310  2e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0844  pantoate--beta-alanine ligase  57.19 
 
 
281 aa  309  4e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.126376  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3133  pantoate--beta-alanine ligase  57.91 
 
 
281 aa  309  4e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0731299  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3992  pantoate--beta-alanine ligase  55.12 
 
 
284 aa  308  5e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0869  pantoate--beta-alanine ligase  56.47 
 
 
281 aa  308  9e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3134  pantoate--beta-alanine ligase  58.3 
 
 
282 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.504396  normal  0.398811 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1061  pantoate--beta-alanine ligase  54.78 
 
 
284 aa  307  1.0000000000000001e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3281  pantoate--beta-alanine ligase  53.24 
 
 
284 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3803  pantoate--beta-alanine ligase  54.48 
 
 
281 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0604878  hitchhiker  0.00446449 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0144  pantoate--beta-alanine ligase  54.06 
 
 
283 aa  305  6e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00132  pantoate-beta-alanine ligase  54.06 
 
 
283 aa  305  8.000000000000001e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3469  pantoate/beta-alanine ligase  54.06 
 
 
283 aa  305  8.000000000000001e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3526  pantoate--beta-alanine ligase  54.06 
 
 
283 aa  305  8.000000000000001e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0136  pantoate--beta-alanine ligase  54.06 
 
 
283 aa  305  8.000000000000001e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00131  hypothetical protein  54.06 
 
 
283 aa  305  8.000000000000001e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0137  pantoate--beta-alanine ligase  54.06 
 
 
283 aa  305  8.000000000000001e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0142  pantoate--beta-alanine ligase  54.06 
 
 
283 aa  304  9.000000000000001e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3344  pantoate--beta-alanine ligase  54.96 
 
 
284 aa  304  1.0000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000501191  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3473  pantoate--beta-alanine ligase  54.96 
 
 
284 aa  304  1.0000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.623251  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0126  pantoate--beta-alanine ligase  54.06 
 
 
283 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0775  pantoate--beta-alanine ligase  57.35 
 
 
281 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3932  pantoate--beta-alanine ligase  53 
 
 
283 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.341637  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1012  pantoate--beta-alanine ligase  54.61 
 
 
284 aa  303  3.0000000000000004e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0272809  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0725  pantoate--beta-alanine ligase  55.76 
 
 
281 aa  301  6.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.278718  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3297  pantoate--beta-alanine ligase  55.4 
 
 
281 aa  300  2e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.749755  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3119  pantoate--beta-alanine ligase  54.77 
 
 
284 aa  299  3e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.620137  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3409  pantoate--beta-alanine ligase  55.4 
 
 
281 aa  299  4e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.545812  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1027  pantoate--beta-alanine ligase  57.63 
 
 
284 aa  296  4e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2315  pantoate--beta-alanine ligase  54.96 
 
 
286 aa  295  5e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.303459  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0565  pantothenate synthetase  54.26 
 
 
286 aa  295  5e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.194299  hitchhiker  0.0000000964689 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1159  pantoate--beta-alanine ligase  53.71 
 
 
284 aa  295  8e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0480021  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0213  pantoate--beta-alanine ligase  52.3 
 
 
284 aa  293  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03451  pantoate--beta-alanine ligase  51.06 
 
 
300 aa  290  1e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0215  pantoate--beta-alanine ligase  51.94 
 
 
284 aa  290  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0414083  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0197  pantoate--beta-alanine ligase  51.94 
 
 
284 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.742862  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0198  pantoate--beta-alanine ligase  51.94 
 
 
284 aa  290  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.518661  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2824  pantoate--beta-alanine ligase  54.42 
 
 
284 aa  289  3e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0816624  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0122  pantoate--beta-alanine ligase  52.38 
 
 
293 aa  288  9e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0223415  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0596  pantoate--beta-alanine ligase  53.62 
 
 
278 aa  287  1e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.242968 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3175  pantoate--beta-alanine ligase  55.91 
 
 
281 aa  288  1e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002560  pantoate--beta-alanine ligase  51.06 
 
 
301 aa  287  1e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0445865  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0201  pantoate--beta-alanine ligase  51.59 
 
 
284 aa  286  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.17692  normal  0.688359 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2054  pantoate--beta-alanine ligase  56.23 
 
 
283 aa  285  5e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.183406 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1525  pantoate-beta-alanine ligase  51.76 
 
 
283 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.102611  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2610  pantoate--beta-alanine ligase  50.73 
 
 
298 aa  282  4.0000000000000003e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.205281  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3320  pantothenate synthetase  54.64 
 
 
290 aa  281  7.000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0680  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 
284 aa  278  7e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.337976  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0886  cytidyltransferase-related  49.65 
 
 
286 aa  271  1e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000710708  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0674  pantoate--beta-alanine ligase  52.33 
 
 
285 aa  271  1e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.523643  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0231  pantoate--beta-alanine ligase  45.26 
 
 
285 aa  270  2.9999999999999997e-71  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0579  pantoate--beta-alanine ligase  46.55 
 
 
289 aa  265  5e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2767  pantoate--beta-alanine ligase  56.13 
 
 
275 aa  264  1e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.1934  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2130  pantoate--beta-alanine ligase  50.71 
 
 
286 aa  263  2e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000332887 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0901  pantoate--beta-alanine ligase  48.43 
 
 
281 aa  262  4e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163902  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2788  pantothenate synthetase  53.52 
 
 
282 aa  262  4e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0117  pantoate--beta-alanine ligase  50.71 
 
 
288 aa  261  1e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0161  pantoate--beta-alanine ligase  49.29 
 
 
281 aa  260  1e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.253183  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1518  pantoate--beta-alanine ligase  52.16 
 
 
279 aa  259  5.0000000000000005e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.317394  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  43.97 
 
 
282 aa  258  6e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1829  pantoate--beta-alanine ligase  48.56 
 
 
283 aa  258  7e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2079  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 
282 aa  258  9e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0111678  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0039  pantothenate synthetase  50.9 
 
 
289 aa  257  1e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1876  pantoate/beta-alanine ligase  51.2 
 
 
288 aa  256  2e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1789  pantoate--beta-alanine ligase  50.53 
 
 
281 aa  256  2e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0155  pantoate--beta-alanine ligase  48.58 
 
 
282 aa  256  3e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243441  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0126  pantoate--beta-alanine ligase  48.94 
 
 
287 aa  255  7e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0426  pantoate--beta-alanine ligase  45.83 
 
 
283 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3535  pantoate--beta-alanine ligase  48.04 
 
 
284 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000260902  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3186  pantoate--beta-alanine ligase  52.01 
 
 
274 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.722916  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  49.12 
 
 
283 aa  253  3e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2060  pantoate--beta-alanine ligase  46.88 
 
 
291 aa  252  6e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.047141 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0958  pantoate--beta-alanine ligase  48.57 
 
 
283 aa  251  7e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2560  pantoate--beta-alanine ligase  51.62 
 
 
284 aa  251  9.000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2387  pantoate--beta-alanine ligase  49.48 
 
 
283 aa  251  1e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00513339 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1740  pantoate--beta-alanine ligase  46.81 
 
 
280 aa  251  1e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1667  pantoate--beta-alanine ligase  46.81 
 
 
280 aa  250  2e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2357  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 
279 aa  250  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.705598  normal  0.238844 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0878  Pantoate--beta-alanine ligase  53.55 
 
 
286 aa  249  3e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2846  pantoate--beta-alanine ligase  47.9 
 
 
289 aa  249  3e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2489  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 
279 aa  248  8e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>