More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0667 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0667  pantoate--beta-alanine ligase  100 
 
 		 283 aa  580  1e-164  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0600  pantoate--beta-alanine ligase  71.94 
 
 		 283 aa  404  1.0000000000000001e-112  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0553  pantoate--beta-alanine ligase  68.79 
 
 		 283 aa  399  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1707  pantoate--beta-alanine ligase  65.11 
 
 		 290 aa  379  1e-104  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1634  pantoate--beta-alanine ligase  60.14 
 
 		 283 aa  359  3e-98  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0507  pantoate--beta-alanine ligase  58.57 
 
 		 288 aa  342  2.9999999999999997e-93  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0553  pantoate--beta-alanine ligase  55.2 
 
 		 288 aa  305  4.0000000000000004e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.716348  normal  0.840113 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  47.84 
 
 		 282 aa  268  8e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1740  pantoate--beta-alanine ligase  46.04 
 
 		 280 aa  251  1e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1667  pantoate--beta-alanine ligase  46.04 
 
 		 280 aa  251  1e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1610  pantoate--beta-alanine ligase  45.68 
 
 		 280 aa  246  3e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.228935  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1571  pantoate--beta-alanine ligase  46.21 
 
 		 280 aa  242  5e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0901  pantoate--beta-alanine ligase  45.32 
 
 		 281 aa  241  1e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163902  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1706  pantoate--beta-alanine ligase  44.6 
 
 		 283 aa  237  1e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260086  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4743  pantoate--beta-alanine ligase  44.24 
 
 		 291 aa  237  2e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.16561 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0749  pantoate/beta-alanine ligase  44.84 
 
 		 289 aa  234  9e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0722466  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1524  pantoate--beta-alanine ligase  42.65 
 
 		 280 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2430  pantoate/beta-alanine ligase  44.6 
 
 		 288 aa  233  4.0000000000000004e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.680362  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0102  pantoate--beta-alanine ligase  43.37 
 
 		 282 aa  232  5e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.346263  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4981  pantoate/beta-alanine ligase  45.53 
 
 		 289 aa  231  8.000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0199543  normal  0.96569 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0426  pantoate--beta-alanine ligase  42.45 
 
 		 283 aa  230  2e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2060  pantoate--beta-alanine ligase  46.07 
 
 		 291 aa  230  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.047141 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3535  pantoate--beta-alanine ligase  43.17 
 
 		 284 aa  229  5e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000260902  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0670  pantoate--beta-alanine ligase  47.06 
 
 		 296 aa  228  6e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0369  pantoate--beta-alanine ligase  44.24 
 
 		 283 aa  228  6e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.397358 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1643  pantoate--beta-alanine ligase  43.88 
 
 		 283 aa  228  8e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.966928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0958  pantoate--beta-alanine ligase  43.88 
 
 		 283 aa  228  8e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0333  pantoate--beta-alanine ligase  46.27 
 
 		 278 aa  228  1e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2606  pantoate/beta-alanine ligase  45.22 
 
 		 288 aa  228  1e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_708  pantothenate synthetase  43.43 
 
 		 277 aa  226  2e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1876  pantoate/beta-alanine ligase  43.77 
 
 		 288 aa  227  2e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4487  pantoate/beta-alanine ligase  48.26 
 
 		 287 aa  227  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0744  pantoate--beta-alanine ligase  45.82 
 
 		 278 aa  226  2e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.809915  hitchhiker  0.00112992 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0426  pantoate--beta-alanine ligase  43.88 
 
 		 289 aa  227  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188172  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1789  pantoate--beta-alanine ligase  43.17 
 
 		 281 aa  226  3e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0042  pantoate--beta-alanine ligase  43.59 
 
 		 273 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000112642  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0161  pantoate--beta-alanine ligase  43.01 
 
 		 281 aa  225  6e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.253183  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3426  pantoate/beta-alanine ligase  45.95 
 
 		 294 aa  225  7e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0666  pantoate--beta-alanine ligase  42.76 
 
 		 282 aa  224  8e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232247  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1239  pantoate--beta-alanine ligase  46.34 
 
 		 279 aa  224  9e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000121643 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3011  pantoate--beta-alanine ligase  44.6 
 
 		 279 aa  224  1e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0830  pantoate/beta-alanine ligase  41.64 
 
 		 279 aa  223  3e-57  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0787  pantoate--beta-alanine ligase  43.37 
 
 		 283 aa  222  4.9999999999999996e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.232916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0320  pantoate--beta-alanine ligase  42.09 
 
 		 282 aa  222  4.9999999999999996e-57  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  44.24 
 
 		 283 aa  222  6e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2079  pantoate--beta-alanine ligase  44.76 
 
 		 282 aa  221  8e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0111678  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0241  pantoate--beta-alanine ligase  42.09 
 
 		 281 aa  221  9e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139282  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_004310  BR0329  pantoate--beta-alanine ligase  42.45 
 
 		 293 aa  221  9.999999999999999e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384164  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3014  pantoate/beta-alanine ligase  42.09 
 
 		 281 aa  221  9.999999999999999e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.207166 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1667  pantoate--beta-alanine ligase  41.94 
 
 		 282 aa  221  9.999999999999999e-57  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1786  pantoate/beta-alanine ligase  41.37 
 
 		 281 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.300346  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2788  pantothenate synthetase  43.73 
 
 		 282 aa  221  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0346  pantoate--beta-alanine ligase  42.45 
 
 		 293 aa  220  1.9999999999999999e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.900978  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0126  pantoate--beta-alanine ligase  44.79 
 
 		 287 aa  220  1.9999999999999999e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0733  pantoate--beta-alanine ligase  42.14 
 
 		 287 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.536898  hitchhiker  0.0000595497 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8383  pantoate/beta-alanine ligase  47.45 
 
 		 288 aa  220  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.857994  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4700  pantoate--beta-alanine ligase  42.86 
 
 		 287 aa  220  3e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4699  pantoate--beta-alanine ligase  42.5 
 
 		 287 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.021644  hitchhiker  0.00466856 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2942  pantoate--beta-alanine ligase  41.22 
 
 		 283 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.17212 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4565  pantoate--beta-alanine ligase  42.7 
 
 		 287 aa  219  5e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650903 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0575  pantoate--beta-alanine ligase  44.32 
 
 		 288 aa  219  6e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.447307  normal  0.0256844 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0342  pantoate--beta-alanine ligase  41.37 
 
 		 282 aa  218  7e-56  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1061  pantoate--beta-alanine ligase  43.77 
 
 		 284 aa  218  7.999999999999999e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1498  pantoate--beta-alanine ligase  41.58 
 
 		 281 aa  217  1e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00126611  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0464  pantoate/beta-alanine ligase  45.21 
 
 		 281 aa  217  2e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1669  pantoate--beta-alanine ligase  43.21 
 
 		 282 aa  217  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1423  pantoate--beta-alanine ligase  42.86 
 
 		 282 aa  216  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4282  pantoate/beta-alanine ligase  47.91 
 
 		 539 aa  217  2e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1634  pantoate--beta-alanine ligase  42.86 
 
 		 282 aa  216  4e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0402516 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3739  pantoate--beta-alanine ligase  43.9 
 
 		 289 aa  216  4e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.28887  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1450  pantoate--beta-alanine ligase  42.86 
 
 		 282 aa  216  4e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1422  pantoate--beta-alanine ligase  42.86 
 
 		 282 aa  216  4e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2884  pantothenate synthetase  43.64 
 
 		 296 aa  216  4e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.411032  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1563  pantoate--beta-alanine ligase  42.86 
 
 		 282 aa  216  4e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.371985  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3822  pantoate--beta-alanine ligase  43.9 
 
 		 289 aa  216  4e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4683  pantoate--beta-alanine ligase  39.93 
 
 		 300 aa  215  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3003  pantoate--beta-alanine ligase  44.24 
 
 		 279 aa  215  5e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0849834 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1596  pantoate--beta-alanine ligase  43.21 
 
 		 282 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0472681  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2130  pantoate--beta-alanine ligase  41.84 
 
 		 286 aa  215  7e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000332887 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0211  pantothenate synthetase  45.14 
 
 		 303 aa  215  8e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.120689 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0090  pantoate/beta-alanine ligase  43.63 
 
 		 273 aa  214  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8293  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0804  pantoate--beta-alanine ligase  43.92 
 
 		 268 aa  214  9.999999999999999e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0135127  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0155  pantoate--beta-alanine ligase  42.45 
 
 		 282 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243441  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4812  pantoate--beta-alanine ligase  42.35 
 
 		 286 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257734  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3320  pantothenate synthetase  42.8 
 
 		 290 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3749  pantoate--beta-alanine ligase  42.86 
 
 		 282 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.94763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1829  pantoate--beta-alanine ligase  40.78 
 
 		 283 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0084  pantoate--beta-alanine ligase  46.59 
 
 		 287 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.458072 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0460  pantothenate synthetase  44.27 
 
 		 334 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1683  pantoate--beta-alanine ligase  41.4 
 
 		 287 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.708165  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  41.79 
 
 		 283 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3339  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  45.35 
 
 		 529 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0728  pantoate--beta-alanine ligase  41.97 
 
 		 277 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.41941  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4718  pantoate--beta-alanine ligase  45.56 
 
 		 282 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3808  pantoate--beta-alanine ligase  41.9 
 
 		 289 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0471604 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1707  pantoate--beta-alanine ligase  42.5 
 
 		 282 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000103153  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2846  pantoate--beta-alanine ligase  39.93 
 
 		 289 aa  212  4.9999999999999996e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0117  pantoate--beta-alanine ligase  43.19 
 
 		 288 aa  211  7.999999999999999e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3681  pantoate--beta-alanine ligase  43.55 
 
 		 289 aa  211  7.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.963286  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2952  pantothenate synthase  41.94 
 
 		 281 aa  211  1e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.215567  normal  0.0184604 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>