More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4718 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4718  pantoate--beta-alanine ligase  100 
 
 		 282 aa  559  1e-158  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4283  pantoate--beta-alanine ligase  87.14 
 
 		 282 aa  435  1e-121  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8383  pantoate/beta-alanine ligase  61.11 
 
 		 288 aa  311  7.999999999999999e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.857994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0090  pantoate/beta-alanine ligase  60.36 
 
 		 273 aa  301  7.000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8293  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3426  pantoate/beta-alanine ligase  56.45 
 
 		 294 aa  281  1e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0460  pantothenate synthetase  56.25 
 
 		 334 aa  276  2e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4487  pantoate/beta-alanine ligase  56.18 
 
 		 287 aa  275  7e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4981  pantoate/beta-alanine ligase  57.5 
 
 		 289 aa  269  4e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0199543  normal  0.96569 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9160  Pantoate--beta-alanine ligase  53.17 
 
 		 285 aa  262  4.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0632  pantoate/beta-alanine ligase  60.36 
 
 		 276 aa  261  1e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2884  pantothenate synthetase  54.2 
 
 		 296 aa  259  3e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.411032  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32010  pantothenate synthetase  63.32 
 
 		 321 aa  258  9e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0325  pantoate--beta-alanine ligase  54.68 
 
 		 296 aa  256  3e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.668173  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0575  pantoate--beta-alanine ligase  61.99 
 
 		 288 aa  255  7e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.447307  normal  0.0256844 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0200  pantoate--beta-alanine ligase  57.69 
 
 		 360 aa  250  2e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266201  normal  0.726246 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2096  pantoate/beta-alanine ligase  58.59 
 
 		 302 aa  249  4e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.985614 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  49.47 
 
 		 283 aa  248  7e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0211  pantothenate synthetase  51.77 
 
 		 303 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.120689 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1424  pantoate--beta-alanine ligase  53.57 
 
 		 314 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.172502 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  48.75 
 
 		 527 aa  240  2e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35550  pantoate--beta-alanine ligase  55.98 
 
 		 302 aa  240  2e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0479281  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0567  pantoate/beta-alanine ligase  53.99 
 
 		 308 aa  239  2.9999999999999997e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.566443  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4762  pantoate--beta-alanine ligase  58.53 
 
 		 313 aa  239  4e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4848  pantoate--beta-alanine ligase  58.53 
 
 		 313 aa  239  4e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0717789  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0716  pantoate/beta-alanine ligase  52.7 
 
 		 618 aa  238  8e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.34765 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5148  pantoate--beta-alanine ligase  58.53 
 
 		 313 aa  237  2e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4007  pantoate/beta-alanine ligase  52.49 
 
 		 318 aa  235  6e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4375  pantoate--beta-alanine ligase  57.03 
 
 		 381 aa  235  7e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.303399 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0369  pantoate--beta-alanine ligase  49.21 
 
 		 283 aa  233  2.0000000000000002e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.397358 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0744  pantoate--beta-alanine ligase  49.64 
 
 		 278 aa  233  3e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.809915  hitchhiker  0.00112992 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0635  pantoate/beta-alanine ligase  58.02 
 
 		 324 aa  230  2e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.53875  normal  0.326208 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62590  pantoate--beta-alanine ligase  51.26 
 
 		 283 aa  230  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5447  pantoate--beta-alanine ligase  51.26 
 
 		 283 aa  229  5e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1014  pantoate--beta-alanine ligase  53.49 
 
 		 290 aa  228  6e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_708  pantothenate synthetase  45.42 
 
 		 277 aa  228  7e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4700  pantoate--beta-alanine ligase  47.89 
 
 		 287 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3011  pantoate--beta-alanine ligase  45.96 
 
 		 279 aa  226  2e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0323  pantoate--beta-alanine ligase  51.25 
 
 		 301 aa  227  2e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5364  pantoate--beta-alanine ligase  52.69 
 
 		 311 aa  226  2e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00859126 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2430  pantoate/beta-alanine ligase  52.49 
 
 		 288 aa  226  3e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.680362  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  49.42 
 
 		 283 aa  226  4e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0333  pantoate--beta-alanine ligase  48.19 
 
 		 278 aa  226  4e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0464  pantoate/beta-alanine ligase  48.89 
 
 		 281 aa  226  4e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0670  pantoate--beta-alanine ligase  52.43 
 
 		 296 aa  224  1e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4699  pantoate--beta-alanine ligase  47.18 
 
 		 287 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.021644  hitchhiker  0.00466856 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2606  pantoate/beta-alanine ligase  50.37 
 
 		 288 aa  223  2e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0600  pantoate--beta-alanine ligase  48.44 
 
 		 283 aa  223  2e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0426  pantoate--beta-alanine ligase  44.92 
 
 		 283 aa  223  2e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1667  pantoate--beta-alanine ligase  44.75 
 
 		 280 aa  223  3e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1740  pantoate--beta-alanine ligase  42.18 
 
 		 280 aa  223  3e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0901  pantoate--beta-alanine ligase  42.7 
 
 		 281 aa  223  3e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163902  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0728  pantoate--beta-alanine ligase  44.32 
 
 		 277 aa  223  4e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.41941  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4565  pantoate--beta-alanine ligase  47 
 
 		 287 aa  222  4e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650903 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4743  pantoate--beta-alanine ligase  46.29 
 
 		 291 aa  222  4e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.16561 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0160  pantoate--beta-alanine ligase  49.17 
 
 		 304 aa  223  4e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0960  pantoate--beta-alanine ligase  46.57 
 
 		 283 aa  222  6e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1706  pantoate--beta-alanine ligase  47.84 
 
 		 283 aa  221  8e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260086  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1524  pantoate--beta-alanine ligase  42.8 
 
 		 280 aa  221  8e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1786  pantoate/beta-alanine ligase  47.08 
 
 		 281 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.300346  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2952  pantothenate synthase  51.74 
 
 		 281 aa  221  9.999999999999999e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.215567  normal  0.0184604 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0733  pantoate--beta-alanine ligase  48.55 
 
 		 287 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.536898  hitchhiker  0.0000595497 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13634  pantoate--beta-alanine ligase  55.06 
 
 		 309 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.55171e-34  normal  0.0118376 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3904  pantoate--beta-alanine ligase  45.74 
 
 		 281 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0667  pantoate--beta-alanine ligase  46.3 
 
 		 283 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0749  pantoate/beta-alanine ligase  45.42 
 
 		 289 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0722466  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1239  pantoate--beta-alanine ligase  44.85 
 
 		 279 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000121643 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2788  pantothenate synthetase  49.46 
 
 		 282 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0039  pantothenate synthetase  46.26 
 
 		 289 aa  220  1.9999999999999999e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1634  pantoate--beta-alanine ligase  44.52 
 
 		 283 aa  219  3e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3808  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 		 289 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0471604 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1266  pantoate/beta-alanine ligase  45.02 
 
 		 289 aa  219  5e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1707  pantoate--beta-alanine ligase  46.3 
 
 		 290 aa  218  8.999999999999998e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00132  pantoate-beta-alanine ligase  48.09 
 
 		 283 aa  218  1e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00131  hypothetical protein  48.09 
 
 		 283 aa  218  1e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4812  pantoate--beta-alanine ligase  47.46 
 
 		 286 aa  217  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257734  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2791  pantoate--beta-alanine ligase  51.53 
 
 		 288 aa  218  1e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363963 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3526  pantoate--beta-alanine ligase  48.09 
 
 		 283 aa  218  1e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3535  pantoate--beta-alanine ligase  46.67 
 
 		 284 aa  218  1e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000260902  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1876  pantoate/beta-alanine ligase  47.73 
 
 		 288 aa  218  1e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2387  pantoate--beta-alanine ligase  46.43 
 
 		 283 aa  217  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513339 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1155  pantothenate synthetase  46.83 
 
 		 281 aa  216  2e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.914913 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0201  pantoate--beta-alanine ligase  46.95 
 
 		 284 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.17692  normal  0.688359 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0668  pantoate--beta-alanine ligase  47.33 
 
 		 282 aa  217  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4542  pantoate--beta-alanine ligase  49.04 
 
 		 285 aa  216  2e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.246095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1829  pantoate--beta-alanine ligase  45.53 
 
 		 283 aa  216  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0142  pantoate--beta-alanine ligase  48.09 
 
 		 283 aa  217  2e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0126  pantoate--beta-alanine ligase  48.09 
 
 		 283 aa  217  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1010  pantoate--beta-alanine ligase  47.01 
 
 		 277 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3469  pantoate/beta-alanine ligase  47.71 
 
 		 283 aa  216  4e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0137  pantoate--beta-alanine ligase  47.71 
 
 		 283 aa  216  4e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3149  pantoate--beta-alanine ligase  47.39 
 
 		 290 aa  216  4e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0136  pantoate--beta-alanine ligase  47.71 
 
 		 283 aa  216  4e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3488  pantoate--beta-alanine ligase  45.15 
 
 		 277 aa  215  5e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.529268 
 
 
-
 
NC_002936  DET0804  pantoate--beta-alanine ligase  45.95 
 
 		 268 aa  215  5.9999999999999996e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0135127  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1043  pantoate--beta-alanine ligase  45.93 
 
 		 279 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1204  pantoate--beta-alanine ligase  45.93 
 
 		 279 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0144  pantoate--beta-alanine ligase  47.71 
 
 		 283 aa  215  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2312  pantoate--beta-alanine ligase  45.93 
 
 		 279 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0189212  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  40 
 
 		 282 aa  215  5.9999999999999996e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2975  pantoate--beta-alanine ligase  45.93 
 
 		 279 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00455305  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>