More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0716 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0716  pantoate/beta-alanine ligase  100 
 
 
618 aa  1161    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.34765 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0159  hypothetical protein  61.78 
 
 
311 aa  338  1.9999999999999998e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32020  hypothetical protein  67.45 
 
 
312 aa  332  2e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0322  hypothetical protein  68.02 
 
 
297 aa  323  5e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01320  hypothetical protein  59.32 
 
 
316 aa  310  5.9999999999999995e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3427  putative cytoplasmic protein  56.76 
 
 
296 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2097  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  57.19 
 
 
327 aa  282  2e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12870  hypothetical protein  61.79 
 
 
301 aa  279  1e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.0057272  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4487  pantoate/beta-alanine ligase  57.34 
 
 
287 aa  278  2e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8384  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  57.76 
 
 
295 aa  274  4.0000000000000004e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.841409  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0631  Domain of unknown function DUF2520  55.33 
 
 
319 aa  273  8.000000000000001e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2885  hypothetical protein  53.58 
 
 
296 aa  270  4e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4980  Putative oxidoreductase/dehydrogenase, Rossmann-like domain protein  55.14 
 
 
294 aa  271  4e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0411301  normal  0.921394 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0634  Putative oxidoreductase/dehydrogenase, Rossmann- like domain protein  63.7 
 
 
344 aa  270  5e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.165538  normal  0.317687 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0091  putative cytoplasmic protein  52.35 
 
 
308 aa  270  7e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0575  pantoate--beta-alanine ligase  59.44 
 
 
288 aa  253  7e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.447307  normal  0.0256844 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2978  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  69 
 
 
242 aa  253  7e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4488  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  54.42 
 
 
303 aa  252  2e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3426  pantoate/beta-alanine ligase  53.72 
 
 
294 aa  249  9e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8383  pantoate/beta-alanine ligase  52.25 
 
 
288 aa  249  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.857994  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0210  hypothetical protein  54.55 
 
 
312 aa  248  2e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.163931 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0211  pantothenate synthetase  54.61 
 
 
303 aa  245  1.9999999999999999e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.120689 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0090  pantoate/beta-alanine ligase  54.09 
 
 
273 aa  244  3e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8293  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9160  Pantoate--beta-alanine ligase  55.64 
 
 
285 aa  243  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0324  putative cytoplasmic protein  54.36 
 
 
297 aa  240  4e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.471831  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4981  pantoate/beta-alanine ligase  55.32 
 
 
289 aa  240  5e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0199543  normal  0.96569 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0323  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 
301 aa  237  6e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4718  pantoate--beta-alanine ligase  54.67 
 
 
282 aa  236  7e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5365  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase-like protein  49.04 
 
 
315 aa  236  9e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.937795  hitchhiker  0.00190793 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4719  hypothetical protein  53.54 
 
 
313 aa  236  1.0000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000278675 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9161  putative cytoplasmic protein  53.21 
 
 
296 aa  236  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2096  pantoate/beta-alanine ligase  53.9 
 
 
302 aa  236  1.0000000000000001e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.985614 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4283  pantoate--beta-alanine ligase  55.94 
 
 
282 aa  235  2.0000000000000002e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32010  pantothenate synthetase  62.6 
 
 
321 aa  234  3e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0574  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  54.36 
 
 
304 aa  234  4.0000000000000004e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0437245  normal  0.0561371 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0160  pantoate--beta-alanine ligase  48.04 
 
 
304 aa  230  5e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2884  pantothenate synthetase  49.84 
 
 
296 aa  229  9e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.411032  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0460  pantothenate synthetase  52.31 
 
 
334 aa  225  2e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0635  pantoate/beta-alanine ligase  60.29 
 
 
324 aa  224  4e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.53875  normal  0.326208 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0333  pantoate--beta-alanine ligase  46.93 
 
 
278 aa  221  5e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0567  pantoate/beta-alanine ligase  55.98 
 
 
308 aa  220  7.999999999999999e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.566443  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1707  pantoate--beta-alanine ligase  45.17 
 
 
290 aa  219  8.999999999999998e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0744  pantoate--beta-alanine ligase  46.43 
 
 
278 aa  219  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.809915  hitchhiker  0.00112992 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12880  pantothenate synthetase  49.1 
 
 
291 aa  219  1e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00593935  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0200  pantoate--beta-alanine ligase  57.25 
 
 
360 aa  218  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266201  normal  0.726246 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5148  pantoate--beta-alanine ligase  56.06 
 
 
313 aa  217  5e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35560  hypothetical protein  54.33 
 
 
298 aa  217  5.9999999999999996e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0380353  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2606  pantoate/beta-alanine ligase  47.18 
 
 
288 aa  216  8e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0670  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 
296 aa  216  8e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4762  pantoate--beta-alanine ligase  55.68 
 
 
313 aa  216  8e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4848  pantoate--beta-alanine ligase  55.68 
 
 
313 aa  216  8e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0717789  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1424  pantoate--beta-alanine ligase  54.17 
 
 
314 aa  216  9e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.172502 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2560  pantoate--beta-alanine ligase  49.47 
 
 
284 aa  213  5.999999999999999e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1134  pantoate/beta-alanine ligase  45.45 
 
 
283 aa  213  9e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2952  pantothenate synthase  49.81 
 
 
281 aa  211  3e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.215567  normal  0.0184604 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1266  pantoate/beta-alanine ligase  41.58 
 
 
289 aa  211  4e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4007  pantoate/beta-alanine ligase  54.05 
 
 
318 aa  210  7e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0325  pantoate--beta-alanine ligase  51.58 
 
 
296 aa  209  9e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.668173  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4763  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase-like protein  47.24 
 
 
313 aa  209  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0102  pantoate--beta-alanine ligase  42.21 
 
 
282 aa  209  1e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.346263  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2314  pantoate/beta-alanine ligase  49.64 
 
 
284 aa  209  1e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000496833  hitchhiker  0.000102893 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4849  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase domain-containing protein  47.24 
 
 
313 aa  209  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.300668  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0632  pantoate/beta-alanine ligase  51.25 
 
 
276 aa  209  1e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  46.67 
 
 
283 aa  207  4e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4743  pantoate--beta-alanine ligase  44.17 
 
 
291 aa  207  5e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.16561 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4462  pantoate/beta-alanine ligase  45.17 
 
 
280 aa  207  7e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5149  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase domain-containing protein  46.9 
 
 
313 aa  206  8e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1027  pantoate--beta-alanine ligase  49.06 
 
 
284 aa  206  9e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5447  pantoate--beta-alanine ligase  47.74 
 
 
283 aa  205  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1829  pantoate--beta-alanine ligase  43.68 
 
 
283 aa  205  2e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1634  pantoate--beta-alanine ligase  43.88 
 
 
283 aa  205  2e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  45.08 
 
 
283 aa  205  2e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0749  pantoate/beta-alanine ligase  46.53 
 
 
289 aa  205  2e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0722466  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0426  pantoate--beta-alanine ligase  40.93 
 
 
283 aa  205  2e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0459  hypothetical protein  49.4 
 
 
272 aa  205  2e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0667  pantoate--beta-alanine ligase  42.69 
 
 
283 aa  204  3e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62590  pantoate--beta-alanine ligase  47.39 
 
 
283 aa  204  3e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0122  pantoate--beta-alanine ligase  46.15 
 
 
293 aa  204  5e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0223415  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3011  pantoate--beta-alanine ligase  42.86 
 
 
279 aa  203  6e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0958  pantoate--beta-alanine ligase  44.83 
 
 
283 aa  203  7e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4284  hypothetical protein  49.4 
 
 
314 aa  203  8e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.396799 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2610  pantoate--beta-alanine ligase  44.53 
 
 
298 aa  203  8e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.205281  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1571  pantoate--beta-alanine ligase  41.31 
 
 
280 aa  203  9e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0553  pantoate--beta-alanine ligase  42.31 
 
 
283 aa  202  9.999999999999999e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2916  pantoate--beta-alanine ligase  45.95 
 
 
277 aa  202  1.9999999999999998e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011824  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0960  pantoate--beta-alanine ligase  45.26 
 
 
283 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3339  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.21 
 
 
529 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4557  pantoate/beta-alanine ligase  43.63 
 
 
280 aa  200  5e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.146553  normal  0.699914 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1423  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase-like protein  50 
 
 
314 aa  200  6e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.170532 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002560  pantoate--beta-alanine ligase  43 
 
 
301 aa  200  7e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0445865  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4375  pantoate--beta-alanine ligase  54.51 
 
 
381 aa  200  7e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.303399 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42720  pantoate--beta-alanine ligase  45.45 
 
 
283 aa  200  7.999999999999999e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1239  pantoate--beta-alanine ligase  40.86 
 
 
279 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000121643 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3460  pantoate--beta-alanine ligase  44.8 
 
 
276 aa  198  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03451  pantoate--beta-alanine ligase  43 
 
 
300 aa  199  2.0000000000000003e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4282  pantoate/beta-alanine ligase  41.67 
 
 
539 aa  198  3e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01440  pantothenate synthetase  48.57 
 
 
343 aa  198  3e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0501  pantoate--beta-alanine ligase  41.07 
 
 
273 aa  197  4.0000000000000005e-49  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1876  pantoate/beta-alanine ligase  44.98 
 
 
288 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1012  pantoate--beta-alanine ligase  47.19 
 
 
284 aa  197  5.000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0272809  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>