More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0325 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0325  pantoate--beta-alanine ligase  100 
 
 		 296 aa  585  1e-166  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.668173  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35550  pantoate--beta-alanine ligase  62.5 
 
 		 302 aa  334  1e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0479281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4762  pantoate--beta-alanine ligase  61.19 
 
 		 313 aa  314  9e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4848  pantoate--beta-alanine ligase  61.19 
 
 		 313 aa  314  9e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0717789  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0567  pantoate/beta-alanine ligase  60.35 
 
 		 308 aa  314  9.999999999999999e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.566443  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5148  pantoate--beta-alanine ligase  61.19 
 
 		 313 aa  313  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1424  pantoate--beta-alanine ligase  57.39 
 
 		 314 aa  305  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.172502 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4007  pantoate/beta-alanine ligase  57.95 
 
 		 318 aa  296  2e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0460  pantothenate synthetase  58.96 
 
 		 334 aa  282  4.0000000000000003e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5364  pantoate--beta-alanine ligase  56.54 
 
 		 311 aa  281  6.000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00859126 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0090  pantoate/beta-alanine ligase  58.98 
 
 		 273 aa  280  3e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13634  pantoate--beta-alanine ligase  55.9 
 
 		 309 aa  278  1e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.55171e-34  normal  0.0118376 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0632  pantoate/beta-alanine ligase  62.11 
 
 		 276 aa  261  6.999999999999999e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4487  pantoate/beta-alanine ligase  57.79 
 
 		 287 aa  260  2e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4981  pantoate/beta-alanine ligase  57.24 
 
 		 289 aa  258  1e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0199543  normal  0.96569 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3426  pantoate/beta-alanine ligase  56.18 
 
 		 294 aa  252  7e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4283  pantoate--beta-alanine ligase  56.04 
 
 		 282 aa  248  9e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9160  Pantoate--beta-alanine ligase  54.26 
 
 		 285 aa  243  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0958  pantoate--beta-alanine ligase  48.53 
 
 		 283 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4718  pantoate--beta-alanine ligase  53.85 
 
 		 282 aa  240  2e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8383  pantoate/beta-alanine ligase  51.35 
 
 		 288 aa  239  4e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.857994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2884  pantothenate synthetase  50.51 
 
 		 296 aa  238  1e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.411032  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1829  pantoate--beta-alanine ligase  49.24 
 
 		 283 aa  236  3e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0830  pantoate/beta-alanine ligase  40.94 
 
 		 279 aa  234  1.0000000000000001e-60  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3535  pantoate--beta-alanine ligase  47.76 
 
 		 284 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000260902  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  50.19 
 
 		 283 aa  232  7.000000000000001e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1012  pantoate--beta-alanine ligase  51.85 
 
 		 284 aa  231  1e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0272809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1014  pantoate--beta-alanine ligase  51.23 
 
 		 290 aa  231  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1524  pantoate--beta-alanine ligase  44.16 
 
 		 280 aa  229  3e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3473  pantoate--beta-alanine ligase  51.48 
 
 		 284 aa  229  4e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.623251  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3344  pantoate--beta-alanine ligase  51.48 
 
 		 284 aa  229  4e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000501191  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1786  pantoate/beta-alanine ligase  42.25 
 
 		 281 aa  229  5e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.300346  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0155  pantoate--beta-alanine ligase  47.39 
 
 		 282 aa  228  7e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243441  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0670  pantoate--beta-alanine ligase  52.36 
 
 		 296 aa  227  1e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1706  pantoate--beta-alanine ligase  46.1 
 
 		 283 aa  226  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260086  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2952  pantothenate synthase  48.23 
 
 		 281 aa  226  2e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.215567  normal  0.0184604 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1321  pantoate--beta-alanine ligase  47.14 
 
 		 284 aa  226  3e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0313852  normal  0.753592 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1134  pantoate/beta-alanine ligase  45.58 
 
 		 283 aa  225  6e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0160  pantoate--beta-alanine ligase  48.59 
 
 		 304 aa  225  7e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2079  pantoate--beta-alanine ligase  47.89 
 
 		 282 aa  225  8e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0111678  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2846  pantoate--beta-alanine ligase  46.4 
 
 		 289 aa  224  1e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3003  pantoate--beta-alanine ligase  49.1 
 
 		 279 aa  224  1e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0849834 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2196  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 		 285 aa  224  2e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.941779  normal  0.927137 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  48.72 
 
 		 283 aa  223  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2240  pantoate--beta-alanine ligase  49.45 
 
 		 285 aa  224  2e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.496301 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0211  pantothenate synthetase  50.57 
 
 		 303 aa  224  2e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.120689 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0575  pantoate--beta-alanine ligase  53.67 
 
 		 288 aa  223  4e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.447307  normal  0.0256844 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2606  pantoate/beta-alanine ligase  49.44 
 
 		 288 aa  223  4e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  42.12 
 
 		 282 aa  222  4.9999999999999996e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2515  pantoate--beta-alanine ligase  48.72 
 
 		 285 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0200  pantoate--beta-alanine ligase  55.81 
 
 		 360 aa  222  6e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266201  normal  0.726246 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0426  pantoate--beta-alanine ligase  42.38 
 
 		 283 aa  222  7e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0323  pantoate--beta-alanine ligase  47.62 
 
 		 301 aa  221  9.999999999999999e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1571  pantoate--beta-alanine ligase  42.96 
 
 		 280 aa  221  9.999999999999999e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0680  pantoate--beta-alanine ligase  46.38 
 
 		 284 aa  220  1.9999999999999999e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.337976  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3011  pantoate--beta-alanine ligase  49.22 
 
 		 279 aa  219  3e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4723  pantoate--beta-alanine ligase  49.09 
 
 		 309 aa  219  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1789  pantoate--beta-alanine ligase  44.44 
 
 		 281 aa  219  3e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2060  pantoate--beta-alanine ligase  49.81 
 
 		 291 aa  220  3e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.047141 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0161  pantoate--beta-alanine ligase  45.19 
 
 		 281 aa  220  3e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.253183  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3319  pantoate--beta-alanine ligase  48 
 
 		 286 aa  219  3.9999999999999997e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00132  pantoate-beta-alanine ligase  46.01 
 
 		 283 aa  219  5e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3526  pantoate--beta-alanine ligase  46.01 
 
 		 283 aa  219  5e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00131  hypothetical protein  46.01 
 
 		 283 aa  219  5e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4462  pantoate/beta-alanine ligase  46.35 
 
 		 280 aa  219  6e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0102  pantoate--beta-alanine ligase  42.7 
 
 		 282 aa  218  7e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.346263  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0329  pantoate--beta-alanine ligase  46.13 
 
 		 293 aa  218  7.999999999999999e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384164  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3469  pantoate/beta-alanine ligase  46.01 
 
 		 283 aa  218  8.999999999999998e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0136  pantoate--beta-alanine ligase  46.01 
 
 		 283 aa  218  8.999999999999998e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0137  pantoate--beta-alanine ligase  46.01 
 
 		 283 aa  218  8.999999999999998e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0960  pantoate--beta-alanine ligase  49.08 
 
 		 283 aa  218  1e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3014  pantoate/beta-alanine ligase  44.81 
 
 		 281 aa  218  1e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.207166 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0142  pantoate--beta-alanine ligase  46.01 
 
 		 283 aa  218  1e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0126  pantoate--beta-alanine ligase  46.01 
 
 		 283 aa  218  1e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0346  pantoate--beta-alanine ligase  46.13 
 
 		 293 aa  218  1e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.900978  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2824  pantoate--beta-alanine ligase  48.93 
 
 		 284 aa  217  2e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0816624  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2251  pantoate--beta-alanine ligase  48.39 
 
 		 307 aa  217  2e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3332  pantoate--beta-alanine ligase  49.63 
 
 		 311 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.475559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62590  pantoate--beta-alanine ligase  51.09 
 
 		 283 aa  217  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0333  pantoate--beta-alanine ligase  47.94 
 
 		 278 aa  217  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5447  pantoate--beta-alanine ligase  50.73 
 
 		 283 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0144  pantoate--beta-alanine ligase  46.01 
 
 		 283 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1643  pantoate--beta-alanine ligase  45.19 
 
 		 283 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.966928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0198  pantoate--beta-alanine ligase  44.64 
 
 		 284 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.518661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2788  pantothenate synthetase  48.03 
 
 		 282 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0201  pantoate--beta-alanine ligase  44.29 
 
 		 284 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.17692  normal  0.688359 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4812  pantoate--beta-alanine ligase  50.37 
 
 		 286 aa  216  4e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257734  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1239  pantoate--beta-alanine ligase  49.22 
 
 		 279 aa  216  4e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000121643 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0197  pantoate--beta-alanine ligase  43.93 
 
 		 284 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.742862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0117  pantoate/beta-alanine ligase  43.32 
 
 		 279 aa  215  5.9999999999999996e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0744  pantoate--beta-alanine ligase  48.63 
 
 		 278 aa  215  5.9999999999999996e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.809915  hitchhiker  0.00112992 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0215  pantoate--beta-alanine ligase  43.93 
 
 		 284 aa  215  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0414083  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0213  pantoate--beta-alanine ligase  43.93 
 
 		 284 aa  215  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4683  pantoate--beta-alanine ligase  47.78 
 
 		 300 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1610  pantoate--beta-alanine ligase  42.14 
 
 		 280 aa  215  7e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.228935  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0464  pantoate/beta-alanine ligase  46.21 
 
 		 281 aa  215  7e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1667  pantoate--beta-alanine ligase  42.59 
 
 		 280 aa  215  8e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1740  pantoate--beta-alanine ligase  42.59 
 
 		 280 aa  215  9e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2791  pantoate--beta-alanine ligase  47.04 
 
 		 288 aa  214  9.999999999999999e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363963 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3119  pantoate--beta-alanine ligase  48.35 
 
 		 284 aa  214  9.999999999999999e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.620137  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>