More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4283 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4283  pantoate--beta-alanine ligase  100 
 
 		 282 aa  557  1e-158  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4718  pantoate--beta-alanine ligase  87.14 
 
 		 282 aa  439  9.999999999999999e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8383  pantoate/beta-alanine ligase  61.46 
 
 		 288 aa  310  2e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.857994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0090  pantoate/beta-alanine ligase  61.45 
 
 		 273 aa  305  6e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0460  pantothenate synthetase  58.89 
 
 		 334 aa  278  9e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4981  pantoate/beta-alanine ligase  59.14 
 
 		 289 aa  276  4e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0199543  normal  0.96569 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3426  pantoate/beta-alanine ligase  56.79 
 
 		 294 aa  275  5e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4487  pantoate/beta-alanine ligase  56.49 
 
 		 287 aa  270  2e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2884  pantothenate synthetase  57.41 
 
 		 296 aa  263  2e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.411032  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9160  Pantoate--beta-alanine ligase  54.39 
 
 		 285 aa  261  8.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0632  pantoate/beta-alanine ligase  59.64 
 
 		 276 aa  261  1e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0325  pantoate--beta-alanine ligase  57.88 
 
 		 296 aa  260  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.668173  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  50.53 
 
 		 283 aa  253  2.0000000000000002e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1424  pantoate--beta-alanine ligase  55 
 
 		 314 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.172502 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32010  pantothenate synthetase  62.93 
 
 		 321 aa  249  4e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4762  pantoate--beta-alanine ligase  59.69 
 
 		 313 aa  247  1e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4848  pantoate--beta-alanine ligase  59.69 
 
 		 313 aa  247  1e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0717789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5148  pantoate--beta-alanine ligase  59.69 
 
 		 313 aa  246  3e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0575  pantoate--beta-alanine ligase  59.78 
 
 		 288 aa  246  3e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.447307  normal  0.0256844 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0200  pantoate--beta-alanine ligase  56.92 
 
 		 360 aa  245  6e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266201  normal  0.726246 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0567  pantoate/beta-alanine ligase  55.07 
 
 		 308 aa  245  6.999999999999999e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.566443  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35550  pantoate--beta-alanine ligase  58.3 
 
 		 302 aa  243  3e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0479281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2096  pantoate/beta-alanine ligase  57.03 
 
 		 302 aa  241  7e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.985614 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0716  pantoate/beta-alanine ligase  55.94 
 
 		 618 aa  240  2e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.34765 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0211  pantothenate synthetase  51.77 
 
 		 303 aa  238  1e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.120689 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0670  pantoate--beta-alanine ligase  53.73 
 
 		 296 aa  235  5.0000000000000005e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  49.47 
 
 		 527 aa  235  6e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0369  pantoate--beta-alanine ligase  51.17 
 
 		 283 aa  232  5e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.397358 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1014  pantoate--beta-alanine ligase  54.65 
 
 		 290 aa  232  5e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4375  pantoate--beta-alanine ligase  57.69 
 
 		 381 aa  230  2e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.303399 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5447  pantoate--beta-alanine ligase  52.52 
 
 		 283 aa  229  5e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62590  pantoate--beta-alanine ligase  52.52 
 
 		 283 aa  229  5e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0744  pantoate--beta-alanine ligase  48.56 
 
 		 278 aa  229  5e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.809915  hitchhiker  0.00112992 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4007  pantoate/beta-alanine ligase  53.88 
 
 		 318 aa  229  6e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1786  pantoate/beta-alanine ligase  47.08 
 
 		 281 aa  228  7e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.300346  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1740  pantoate--beta-alanine ligase  45.88 
 
 		 280 aa  228  9e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0901  pantoate--beta-alanine ligase  43.77 
 
 		 281 aa  227  1e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163902  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13634  pantoate--beta-alanine ligase  57.41 
 
 		 309 aa  227  1e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.55171e-34  normal  0.0118376 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4743  pantoate--beta-alanine ligase  48.28 
 
 		 291 aa  228  1e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.16561 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1667  pantoate--beta-alanine ligase  45.88 
 
 		 280 aa  228  1e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0333  pantoate--beta-alanine ligase  48.19 
 
 		 278 aa  227  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0426  pantoate--beta-alanine ligase  46.09 
 
 		 283 aa  227  2e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5364  pantoate--beta-alanine ligase  52.69 
 
 		 311 aa  227  2e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00859126 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4700  pantoate--beta-alanine ligase  50.36 
 
 		 287 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0464  pantoate/beta-alanine ligase  47.76 
 
 		 281 aa  226  3e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_708  pantothenate synthetase  43.96 
 
 		 277 aa  225  7e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4699  pantoate--beta-alanine ligase  50.36 
 
 		 287 aa  225  7e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.021644  hitchhiker  0.00466856 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2430  pantoate/beta-alanine ligase  53.05 
 
 		 288 aa  224  9e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.680362  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1706  pantoate--beta-alanine ligase  46.74 
 
 		 283 aa  224  1e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260086  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  49.62 
 
 		 283 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1266  pantoate/beta-alanine ligase  44.16 
 
 		 289 aa  223  2e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0635  pantoate/beta-alanine ligase  58.02 
 
 		 324 aa  223  2e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.53875  normal  0.326208 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3011  pantoate--beta-alanine ligase  46.32 
 
 		 279 aa  223  3e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0600  pantoate--beta-alanine ligase  49.42 
 
 		 283 aa  222  4e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4565  pantoate--beta-alanine ligase  49.64 
 
 		 287 aa  222  6e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650903 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0323  pantoate--beta-alanine ligase  50.54 
 
 		 301 aa  222  7e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0728  pantoate--beta-alanine ligase  43.59 
 
 		 277 aa  221  9.999999999999999e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.41941  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0160  pantoate--beta-alanine ligase  48.84 
 
 		 304 aa  221  9.999999999999999e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1524  pantoate--beta-alanine ligase  42.58 
 
 		 280 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0667  pantoate--beta-alanine ligase  45.7 
 
 		 283 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1876  pantoate/beta-alanine ligase  48.67 
 
 		 288 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0830  pantoate/beta-alanine ligase  43.82 
 
 		 279 aa  219  3e-56  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3014  pantoate/beta-alanine ligase  46.74 
 
 		 281 aa  219  3.9999999999999997e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.207166 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2606  pantoate/beta-alanine ligase  51.33 
 
 		 288 aa  219  3.9999999999999997e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2952  pantothenate synthase  50.96 
 
 		 281 aa  219  3.9999999999999997e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.215567  normal  0.0184604 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5340  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  43.93 
 
 		 526 aa  219  5e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1707  pantoate--beta-alanine ligase  45.91 
 
 		 290 aa  218  7e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0733  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 		 287 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.536898  hitchhiker  0.0000595497 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1634  pantoate--beta-alanine ligase  46.95 
 
 		 283 aa  217  1e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3339  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  48.06 
 
 		 529 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2469  pantothenate synthetase  50.19 
 
 		 291 aa  218  1e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163424  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1239  pantoate--beta-alanine ligase  45.59 
 
 		 279 aa  218  1e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000121643 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2315  pantoate--beta-alanine ligase  48.09 
 
 		 286 aa  217  2e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.303459  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  41.7 
 
 		 282 aa  217  2e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0749  pantoate/beta-alanine ligase  47.33 
 
 		 289 aa  216  2e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0722466  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1571  pantoate--beta-alanine ligase  43.85 
 
 		 280 aa  217  2e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2447  pantoate--beta-alanine ligase  46.07 
 
 		 279 aa  216  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.124687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1831  pantoate--beta-alanine ligase  46.07 
 
 		 279 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.686834  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2799  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  42.91 
 
 		 528 aa  216  2.9999999999999998e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2442  pantoate--beta-alanine ligase  46.07 
 
 		 279 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0290531  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2788  pantothenate synthetase  51.53 
 
 		 282 aa  216  5e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2060  pantoate--beta-alanine ligase  47.12 
 
 		 291 aa  215  7e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.047141 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3822  pantoate--beta-alanine ligase  50.52 
 
 		 289 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3739  pantoate--beta-alanine ligase  50.52 
 
 		 289 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.28887  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0960  pantoate--beta-alanine ligase  47.49 
 
 		 283 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4462  pantoate/beta-alanine ligase  46.56 
 
 		 280 aa  213  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2489  pantoate--beta-alanine ligase  46.72 
 
 		 279 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1370  pantoate--beta-alanine ligase  40.36 
 
 		 273 aa  213  2.9999999999999995e-54  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42720  pantoate--beta-alanine ligase  48.2 
 
 		 283 aa  213  2.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0848  pantoate--beta-alanine ligase  47.6 
 
 		 279 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.889171  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1155  pantothenate synthetase  46.13 
 
 		 281 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.914913 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2620  pantoate--beta-alanine ligase  43.11 
 
 		 283 aa  213  3.9999999999999995e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3003  pantoate--beta-alanine ligase  50.78 
 
 		 279 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0849834 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2674  pantoate--beta-alanine ligase  43.11 
 
 		 283 aa  213  3.9999999999999995e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0102  pantoate--beta-alanine ligase  42.15 
 
 		 282 aa  213  3.9999999999999995e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.346263  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3808  pantoate--beta-alanine ligase  48.94 
 
 		 289 aa  212  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0471604 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2357  pantoate--beta-alanine ligase  45.36 
 
 		 279 aa  212  7e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.705598  normal  0.238844 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0201  pantoate--beta-alanine ligase  46.56 
 
 		 284 aa  212  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.17692  normal  0.688359 
 
 
-
 
NC_002936  DET0804  pantoate--beta-alanine ligase  44.79 
 
 		 268 aa  211  9e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0135127  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1829  pantoate--beta-alanine ligase  45.88 
 
 		 283 aa  211  1e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>