More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5364 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_5364  pantoate--beta-alanine ligase  100 
 
 
311 aa  616  1e-175  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00859126 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1424  pantoate--beta-alanine ligase  76.3 
 
 
314 aa  447  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.172502 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4762  pantoate--beta-alanine ligase  74.44 
 
 
313 aa  418  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4848  pantoate--beta-alanine ligase  74.44 
 
 
313 aa  418  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0717789  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5148  pantoate--beta-alanine ligase  74.44 
 
 
313 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13634  pantoate--beta-alanine ligase  68.61 
 
 
309 aa  367  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.55171e-34  normal  0.0118376 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0567  pantoate/beta-alanine ligase  65.38 
 
 
308 aa  340  2.9999999999999998e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.566443  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4007  pantoate/beta-alanine ligase  64.83 
 
 
318 aa  337  1.9999999999999998e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35550  pantoate--beta-alanine ligase  61.38 
 
 
302 aa  326  4.0000000000000003e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0479281  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0325  pantoate--beta-alanine ligase  56.54 
 
 
296 aa  292  5e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.668173  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0460  pantothenate synthetase  57.4 
 
 
334 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0090  pantoate/beta-alanine ligase  56.64 
 
 
273 aa  266  2e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8293  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4487  pantoate/beta-alanine ligase  56.32 
 
 
287 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0632  pantoate/beta-alanine ligase  58.53 
 
 
276 aa  251  2e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0958  pantoate--beta-alanine ligase  52.27 
 
 
283 aa  249  4e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3426  pantoate/beta-alanine ligase  54.51 
 
 
294 aa  246  3e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1524  pantoate--beta-alanine ligase  46.24 
 
 
280 aa  246  3e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4743  pantoate--beta-alanine ligase  48.9 
 
 
291 aa  244  9.999999999999999e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.16561 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2196  pantoate--beta-alanine ligase  54.92 
 
 
285 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.941779  normal  0.927137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9160  Pantoate--beta-alanine ligase  51.92 
 
 
285 aa  240  2.9999999999999997e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0830  pantoate/beta-alanine ligase  46.13 
 
 
279 aa  238  1e-61  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2240  pantoate--beta-alanine ligase  53.03 
 
 
285 aa  236  3e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.496301 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2515  pantoate--beta-alanine ligase  52.27 
 
 
285 aa  236  4e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8383  pantoate/beta-alanine ligase  51.29 
 
 
288 aa  235  7e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.857994  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1706  pantoate--beta-alanine ligase  47.99 
 
 
283 aa  235  9e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260086  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2952  pantothenate synthase  51.33 
 
 
281 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.215567  normal  0.0184604 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0155  pantoate--beta-alanine ligase  47.06 
 
 
282 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243441  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1610  pantoate--beta-alanine ligase  49.04 
 
 
280 aa  233  3e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.228935  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3535  pantoate--beta-alanine ligase  46.81 
 
 
284 aa  232  6e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000260902  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1014  pantoate--beta-alanine ligase  53.07 
 
 
290 aa  232  7.000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1321  pantoate--beta-alanine ligase  47.87 
 
 
284 aa  231  1e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0313852  normal  0.753592 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4981  pantoate/beta-alanine ligase  52.59 
 
 
289 aa  231  1e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0199543  normal  0.96569 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0901  pantoate--beta-alanine ligase  45.65 
 
 
281 aa  231  2e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163902  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1829  pantoate--beta-alanine ligase  49.64 
 
 
283 aa  230  2e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3332  pantoate--beta-alanine ligase  52.45 
 
 
311 aa  229  4e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.475559  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3066  pantothenate synthetase  50 
 
 
283 aa  229  4e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0084  pantoate--beta-alanine ligase  51.89 
 
 
287 aa  229  6e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.458072 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0122  pantoate--beta-alanine ligase  47.72 
 
 
293 aa  229  6e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0223415  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4718  pantoate--beta-alanine ligase  51.25 
 
 
282 aa  228  1e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4283  pantoate--beta-alanine ligase  51.61 
 
 
282 aa  228  1e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  50.92 
 
 
283 aa  227  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0670  pantoate--beta-alanine ligase  53.08 
 
 
296 aa  226  4e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2884  pantothenate synthetase  51.43 
 
 
296 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.411032  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2791  pantoate--beta-alanine ligase  48.95 
 
 
288 aa  224  1e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.363963 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002560  pantoate--beta-alanine ligase  48.19 
 
 
301 aa  224  1e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0445865  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4783  pantoate--beta-alanine ligase  51.88 
 
 
283 aa  224  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4462  pantoate/beta-alanine ligase  47.74 
 
 
280 aa  224  1e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0144  pantoate--beta-alanine ligase  47.31 
 
 
283 aa  223  2e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3564  pantoate--beta-alanine ligase  49.81 
 
 
283 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.358639  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  44.48 
 
 
282 aa  223  3e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0126  pantoate--beta-alanine ligase  47.31 
 
 
283 aa  223  3e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0749  pantoate/beta-alanine ligase  49.82 
 
 
289 aa  223  3e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0722466  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0142  pantoate--beta-alanine ligase  47.31 
 
 
283 aa  223  3e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2060  pantoate--beta-alanine ligase  51.32 
 
 
291 aa  223  4e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.047141 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0426  pantoate--beta-alanine ligase  44.57 
 
 
283 aa  223  4e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1643  pantoate--beta-alanine ligase  47.43 
 
 
283 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.966928  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0464  pantoate/beta-alanine ligase  49.81 
 
 
281 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1786  pantoate/beta-alanine ligase  43.38 
 
 
281 aa  222  6e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.300346  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0039  pantothenate synthetase  50.38 
 
 
289 aa  222  6e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3469  pantoate/beta-alanine ligase  46.95 
 
 
283 aa  222  7e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0137  pantoate--beta-alanine ligase  46.95 
 
 
283 aa  222  7e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0136  pantoate--beta-alanine ligase  46.95 
 
 
283 aa  222  7e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0804  pantoate--beta-alanine ligase  47.45 
 
 
268 aa  221  9.999999999999999e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0135127  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0329  pantoate--beta-alanine ligase  51.11 
 
 
293 aa  221  9.999999999999999e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384164  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03451  pantoate--beta-alanine ligase  45.91 
 
 
300 aa  221  9.999999999999999e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1667  pantoate--beta-alanine ligase  44.98 
 
 
280 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0507  pantoate--beta-alanine ligase  42.91 
 
 
288 aa  221  9.999999999999999e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1740  pantoate--beta-alanine ligase  44.98 
 
 
280 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00132  pantoate-beta-alanine ligase  46.59 
 
 
283 aa  220  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0346  pantoate--beta-alanine ligase  51.11 
 
 
293 aa  220  1.9999999999999999e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.900978  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3803  pantoate--beta-alanine ligase  48.33 
 
 
281 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0604878  hitchhiker  0.00446449 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0333  pantoate--beta-alanine ligase  51.56 
 
 
278 aa  220  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  48.71 
 
 
283 aa  221  1.9999999999999999e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0744  pantoate--beta-alanine ligase  51.95 
 
 
278 aa  221  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.809915  hitchhiker  0.00112992 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0728  pantoate--beta-alanine ligase  46.64 
 
 
277 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.41941  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3932  pantoate--beta-alanine ligase  43.21 
 
 
283 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.341637  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00131  hypothetical protein  46.59 
 
 
283 aa  220  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3526  pantoate--beta-alanine ligase  46.59 
 
 
283 aa  220  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0960  pantoate--beta-alanine ligase  49.28 
 
 
283 aa  220  3e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_708  pantothenate synthetase  46.25 
 
 
277 aa  219  3.9999999999999997e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2610  pantoate--beta-alanine ligase  45.26 
 
 
298 aa  219  5e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.205281  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3281  pantoate--beta-alanine ligase  45.9 
 
 
284 aa  219  5e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2620  pantoate--beta-alanine ligase  43.71 
 
 
283 aa  218  7e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1571  pantoate--beta-alanine ligase  44.83 
 
 
280 aa  218  7e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2674  pantoate--beta-alanine ligase  43.71 
 
 
283 aa  218  7e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0680  pantoate--beta-alanine ligase  47.79 
 
 
284 aa  218  8.999999999999998e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.337976  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1702  pantoate--beta-alanine ligase  50.97 
 
 
283 aa  218  1e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.238045  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0042  pantoate--beta-alanine ligase  47.04 
 
 
273 aa  218  1e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000112642  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1027  pantoate--beta-alanine ligase  49.26 
 
 
284 aa  218  1e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3011  pantoate--beta-alanine ligase  47.39 
 
 
279 aa  217  2e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2254  pantoate/beta-alanine ligase  48.47 
 
 
289 aa  217  2e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0575  pantoate--beta-alanine ligase  54.41 
 
 
288 aa  216  2.9999999999999998e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.447307  normal  0.0256844 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4812  pantoate--beta-alanine ligase  48.75 
 
 
286 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257734  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62590  pantoate--beta-alanine ligase  49.45 
 
 
283 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2388  pantoate--beta-alanine ligase  50.78 
 
 
283 aa  215  7e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0472601  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3063  pantoate--beta-alanine ligase  48.68 
 
 
283 aa  215  7e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.217741  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1239  pantoate--beta-alanine ligase  48.82 
 
 
279 aa  215  8e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000121643 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3319  pantoate--beta-alanine ligase  47.74 
 
 
286 aa  215  9e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0674  pantoate--beta-alanine ligase  51.11 
 
 
285 aa  214  9.999999999999999e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.523643  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0211  pantothenate synthetase  51.55 
 
 
303 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.120689 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>