More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4007 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4007  pantoate/beta-alanine ligase  100 
 
 		 318 aa  634    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0567  pantoate/beta-alanine ligase  71.73 
 
 		 308 aa  374  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.566443  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1424  pantoate--beta-alanine ligase  68.2 
 
 		 314 aa  360  2e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.172502 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4762  pantoate--beta-alanine ligase  64.83 
 
 		 313 aa  330  2e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4848  pantoate--beta-alanine ligase  64.83 
 
 		 313 aa  330  2e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0717789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5364  pantoate--beta-alanine ligase  64.83 
 
 		 311 aa  330  2e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00859126 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5148  pantoate--beta-alanine ligase  64.83 
 
 		 313 aa  328  7e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35550  pantoate--beta-alanine ligase  61.17 
 
 		 302 aa  321  9.999999999999999e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0479281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13634  pantoate--beta-alanine ligase  65.61 
 
 		 309 aa  319  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.55171e-34  normal  0.0118376 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0325  pantoate--beta-alanine ligase  57.95 
 
 		 296 aa  304  1.0000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.668173  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0090  pantoate/beta-alanine ligase  55.69 
 
 		 273 aa  258  1e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0460  pantothenate synthetase  52.61 
 
 		 334 aa  251  1e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3426  pantoate/beta-alanine ligase  54.89 
 
 		 294 aa  249  4e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0958  pantoate--beta-alanine ligase  48.33 
 
 		 283 aa  247  2e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8383  pantoate/beta-alanine ligase  53.05 
 
 		 288 aa  244  9e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.857994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4487  pantoate/beta-alanine ligase  55.29 
 
 		 287 aa  242  7e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  44.29 
 
 		 282 aa  240  2.9999999999999997e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2240  pantoate--beta-alanine ligase  51.66 
 
 		 285 aa  238  9e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.496301 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2515  pantoate--beta-alanine ligase  51.84 
 
 		 285 aa  238  1e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0464  pantoate/beta-alanine ligase  50.54 
 
 		 281 aa  237  2e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0830  pantoate/beta-alanine ligase  44.48 
 
 		 279 aa  237  2e-61  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0632  pantoate/beta-alanine ligase  57.81 
 
 		 276 aa  235  7e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2196  pantoate--beta-alanine ligase  52.17 
 
 		 285 aa  235  7e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.941779  normal  0.927137 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0901  pantoate--beta-alanine ligase  45.09 
 
 		 281 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163902  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4743  pantoate--beta-alanine ligase  47.54 
 
 		 291 aa  233  3e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.16561 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2788  pantothenate synthetase  50.18 
 
 		 282 aa  232  6e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4981  pantoate/beta-alanine ligase  51.42 
 
 		 289 aa  232  6e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0199543  normal  0.96569 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1571  pantoate--beta-alanine ligase  43.12 
 
 		 280 aa  231  1e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3319  pantoate--beta-alanine ligase  51.45 
 
 		 286 aa  231  1e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1321  pantoate--beta-alanine ligase  48.24 
 
 		 284 aa  230  2e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0313852  normal  0.753592 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2952  pantothenate synthase  49.29 
 
 		 281 aa  229  3e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.215567  normal  0.0184604 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3469  pantoate/beta-alanine ligase  50 
 
 		 283 aa  227  2e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0144  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 		 283 aa  227  2e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0136  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 		 283 aa  227  2e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1740  pantoate--beta-alanine ligase  44.61 
 
 		 280 aa  227  2e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0142  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 		 283 aa  227  2e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9160  Pantoate--beta-alanine ligase  53.54 
 
 		 285 aa  227  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0126  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 		 283 aa  227  2e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0137  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 		 283 aa  227  2e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00132  pantoate-beta-alanine ligase  50 
 
 		 283 aa  226  3e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1667  pantoate--beta-alanine ligase  44.61 
 
 		 280 aa  226  3e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00131  hypothetical protein  50 
 
 		 283 aa  226  3e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3526  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 		 283 aa  226  3e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4718  pantoate--beta-alanine ligase  52.11 
 
 		 282 aa  226  4e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1610  pantoate--beta-alanine ligase  45.25 
 
 		 280 aa  226  4e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.228935  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1786  pantoate/beta-alanine ligase  42.86 
 
 		 281 aa  226  4e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.300346  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2884  pantothenate synthetase  50.17 
 
 		 296 aa  225  6e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.411032  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0426  pantoate--beta-alanine ligase  48.2 
 
 		 289 aa  226  6e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188172  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1706  pantoate--beta-alanine ligase  45.02 
 
 		 283 aa  225  7e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260086  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0426  pantoate--beta-alanine ligase  44.96 
 
 		 283 aa  225  8e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1524  pantoate--beta-alanine ligase  42.65 
 
 		 280 aa  225  8e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1829  pantoate--beta-alanine ligase  46.54 
 
 		 283 aa  225  9e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1707  pantoate--beta-alanine ligase  45.07 
 
 		 290 aa  225  9e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3320  pantothenate synthetase  50.18 
 
 		 290 aa  224  2e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0575  pantoate--beta-alanine ligase  51.23 
 
 		 288 aa  224  2e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.447307  normal  0.0256844 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0674  pantoate--beta-alanine ligase  50.36 
 
 		 285 aa  223  3e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.523643  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  47.6 
 
 		 283 aa  223  3e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1643  pantoate--beta-alanine ligase  46.13 
 
 		 283 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.966928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4283  pantoate--beta-alanine ligase  53.49 
 
 		 282 aa  222  6e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3992  pantoate--beta-alanine ligase  48.19 
 
 		 284 aa  222  6e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2824  pantoate--beta-alanine ligase  49.1 
 
 		 284 aa  222  7e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0816624  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1012  pantoate--beta-alanine ligase  49.08 
 
 		 284 aa  221  9e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0272809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3932  pantoate--beta-alanine ligase  44.53 
 
 		 283 aa  221  9e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.341637  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1027  pantoate--beta-alanine ligase  50.94 
 
 		 284 aa  221  9.999999999999999e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3473  pantoate--beta-alanine ligase  49.08 
 
 		 284 aa  221  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.623251  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4783  pantoate--beta-alanine ligase  49.1 
 
 		 283 aa  221  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0039  pantothenate synthetase  48.53 
 
 		 289 aa  221  9.999999999999999e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3535  pantoate--beta-alanine ligase  44.61 
 
 		 284 aa  221  9.999999999999999e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000260902  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0155  pantoate--beta-alanine ligase  43.32 
 
 		 282 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243441  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3344  pantoate--beta-alanine ligase  49.08 
 
 		 284 aa  221  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000501191  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0329  pantoate--beta-alanine ligase  47.41 
 
 		 293 aa  221  1.9999999999999999e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384164  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0869  pantoate--beta-alanine ligase  49.08 
 
 		 281 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3119  pantoate--beta-alanine ligase  46.01 
 
 		 284 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.620137  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4017  pantoate--beta-alanine ligase  44.73 
 
 		 282 aa  220  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.43915  normal  0.63382 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1014  pantoate--beta-alanine ligase  51.48 
 
 		 290 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0084  pantoate--beta-alanine ligase  48.21 
 
 		 287 aa  220  3e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.458072 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1239  pantoate--beta-alanine ligase  47.24 
 
 		 279 aa  220  3e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000121643 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0346  pantoate--beta-alanine ligase  47.41 
 
 		 293 aa  219  3e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.900978  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0670  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 		 296 aa  219  3.9999999999999997e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0369  pantoate--beta-alanine ligase  49.62 
 
 		 283 aa  219  5e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.397358 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3495  pantoate--beta-alanine ligase  49.64 
 
 		 281 aa  219  6e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2791  pantoate--beta-alanine ligase  48.95 
 
 		 288 aa  219  6e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363963 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0725  pantoate--beta-alanine ligase  49.64 
 
 		 281 aa  219  6e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.278718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0879  pantoate--beta-alanine ligase  49.08 
 
 		 281 aa  219  7e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00646372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3803  pantoate--beta-alanine ligase  46.04 
 
 		 281 aa  219  7e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0604878  hitchhiker  0.00446449 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0867  pantoate--beta-alanine ligase  49.64 
 
 		 281 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.712584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3011  pantoate--beta-alanine ligase  46.85 
 
 		 279 aa  218  7.999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3133  pantoate--beta-alanine ligase  50.36 
 
 		 281 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0731299  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3297  pantoate--beta-alanine ligase  49.64 
 
 		 281 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.749755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002560  pantoate--beta-alanine ligase  43.05 
 
 		 301 aa  218  1e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0445865  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0749  pantoate/beta-alanine ligase  49.26 
 
 		 289 aa  218  1e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0722466  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0197  pantoate--beta-alanine ligase  46.91 
 
 		 284 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.742862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1159  pantoate--beta-alanine ligase  46.01 
 
 		 284 aa  217  2e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0480021  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0213  pantoate--beta-alanine ligase  46.91 
 
 		 284 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0878  pantoate--beta-alanine ligase  46.09 
 
 		 279 aa  217  2e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.3427  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0200  pantoate--beta-alanine ligase  52.87 
 
 		 360 aa  218  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266201  normal  0.726246 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0215  pantoate--beta-alanine ligase  46.32 
 
 		 284 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0414083  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0844  pantoate--beta-alanine ligase  48.71 
 
 		 281 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.126376  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0680  pantoate--beta-alanine ligase  47.78 
 
 		 284 aa  216  2.9999999999999998e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.337976  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3409  pantoate--beta-alanine ligase  49.27 
 
 		 281 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.545812  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>