More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0567 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0567  pantoate/beta-alanine ligase  100 
 
 		 308 aa  612  9.999999999999999e-175  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.566443  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4007  pantoate/beta-alanine ligase  71.73 
 
 		 318 aa  372  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1424  pantoate--beta-alanine ligase  66.08 
 
 		 314 aa  346  3e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.172502 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4762  pantoate--beta-alanine ligase  66.55 
 
 		 313 aa  344  8.999999999999999e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4848  pantoate--beta-alanine ligase  66.55 
 
 		 313 aa  344  8.999999999999999e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0717789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5148  pantoate--beta-alanine ligase  66.2 
 
 		 313 aa  342  5e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5364  pantoate--beta-alanine ligase  65.38 
 
 		 311 aa  333  3e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00859126 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35550  pantoate--beta-alanine ligase  60.62 
 
 		 302 aa  328  5.0000000000000004e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0479281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13634  pantoate--beta-alanine ligase  65.14 
 
 		 309 aa  323  2e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.55171e-34  normal  0.0118376 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0325  pantoate--beta-alanine ligase  60.35 
 
 		 296 aa  319  5e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.668173  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0090  pantoate/beta-alanine ligase  57.48 
 
 		 273 aa  269  4e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0958  pantoate--beta-alanine ligase  48.53 
 
 		 283 aa  250  2e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0460  pantothenate synthetase  53.7 
 
 		 334 aa  249  3e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1321  pantoate--beta-alanine ligase  50.88 
 
 		 284 aa  246  4e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0313852  normal  0.753592 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0632  pantoate/beta-alanine ligase  57.65 
 
 		 276 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0084  pantoate--beta-alanine ligase  50.35 
 
 		 287 aa  241  1e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.458072 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2846  pantoate--beta-alanine ligase  50.9 
 
 		 289 aa  240  2e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4283  pantoate--beta-alanine ligase  55.64 
 
 		 282 aa  239  5e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4718  pantoate--beta-alanine ligase  52.17 
 
 		 282 aa  235  5.0000000000000005e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0830  pantoate/beta-alanine ligase  45 
 
 		 279 aa  235  9e-61  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0901  pantoate--beta-alanine ligase  44.16 
 
 		 281 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163902  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3426  pantoate/beta-alanine ligase  52.71 
 
 		 294 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4981  pantoate/beta-alanine ligase  51.42 
 
 		 289 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0199543  normal  0.96569 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4487  pantoate/beta-alanine ligase  53.7 
 
 		 287 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0426  pantoate--beta-alanine ligase  49.08 
 
 		 289 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188172  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1829  pantoate--beta-alanine ligase  46.72 
 
 		 283 aa  232  6e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8383  pantoate/beta-alanine ligase  52.17 
 
 		 288 aa  231  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.857994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3332  pantoate--beta-alanine ligase  46.13 
 
 		 311 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.475559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0575  pantoate--beta-alanine ligase  51.06 
 
 		 288 aa  230  2e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.447307  normal  0.0256844 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4812  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 		 286 aa  229  4e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257734  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  42.29 
 
 		 282 aa  229  4e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0126  pantoate--beta-alanine ligase  46.67 
 
 		 287 aa  229  5e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2952  pantothenate synthase  47.65 
 
 		 281 aa  228  7e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.215567  normal  0.0184604 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1524  pantoate--beta-alanine ligase  41.73 
 
 		 280 aa  228  8e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62590  pantoate--beta-alanine ligase  52.24 
 
 		 283 aa  228  8e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0600  pantoate--beta-alanine ligase  44.2 
 
 		 283 aa  228  9e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0200  pantoate--beta-alanine ligase  55.82 
 
 		 360 aa  228  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266201  normal  0.726246 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2884  pantothenate synthetase  50.92 
 
 		 296 aa  228  1e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.411032  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0155  pantoate--beta-alanine ligase  44.7 
 
 		 282 aa  228  1e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243441  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0670  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 		 296 aa  228  1e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42720  pantoate--beta-alanine ligase  51.5 
 
 		 283 aa  227  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4783  pantoate--beta-alanine ligase  50.55 
 
 		 283 aa  227  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3535  pantoate--beta-alanine ligase  47.51 
 
 		 284 aa  227  2e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000260902  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0579  pantoate--beta-alanine ligase  44.85 
 
 		 289 aa  227  2e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0329  pantoate--beta-alanine ligase  48.01 
 
 		 293 aa  226  3e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384164  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2196  pantoate--beta-alanine ligase  52.65 
 
 		 285 aa  226  3e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.941779  normal  0.927137 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3066  pantothenate synthetase  49.11 
 
 		 283 aa  226  3e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3593  pantoate--beta-alanine ligase  50.75 
 
 		 285 aa  226  4e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5447  pantoate--beta-alanine ligase  52.24 
 
 		 283 aa  226  4e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2240  pantoate--beta-alanine ligase  51.71 
 
 		 285 aa  226  4e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.496301 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3564  pantoate--beta-alanine ligase  48.89 
 
 		 283 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.358639  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0117  pantoate--beta-alanine ligase  45.8 
 
 		 288 aa  226  5.0000000000000005e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0960  pantoate--beta-alanine ligase  49.44 
 
 		 283 aa  225  6e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0346  pantoate--beta-alanine ligase  47.29 
 
 		 293 aa  225  6e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.900978  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  50.76 
 
 		 283 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4375  pantoate--beta-alanine ligase  53.93 
 
 		 381 aa  224  1e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.303399 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9160  Pantoate--beta-alanine ligase  50.97 
 
 		 285 aa  224  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4700  pantoate--beta-alanine ligase  50.57 
 
 		 287 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1789  pantoate--beta-alanine ligase  45.42 
 
 		 281 aa  224  2e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1707  pantoate--beta-alanine ligase  43.43 
 
 		 290 aa  223  2e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0426  pantoate--beta-alanine ligase  46.54 
 
 		 283 aa  223  3e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0144  pantoate--beta-alanine ligase  48.29 
 
 		 283 aa  223  3e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2515  pantoate--beta-alanine ligase  50.95 
 
 		 285 aa  223  3e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0142  pantoate--beta-alanine ligase  47.58 
 
 		 283 aa  223  3e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2423  pantoate--beta-alanine ligase  49.26 
 
 		 283 aa  223  3e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4743  pantoate--beta-alanine ligase  45.56 
 
 		 291 aa  223  4e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.16561 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0126  pantoate--beta-alanine ligase  48.29 
 
 		 283 aa  223  4e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1706  pantoate--beta-alanine ligase  45.38 
 
 		 283 aa  222  4.9999999999999996e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260086  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3808  pantoate--beta-alanine ligase  48.56 
 
 		 289 aa  222  4.9999999999999996e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0471604 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4723  pantoate--beta-alanine ligase  47.01 
 
 		 309 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0101  pantoate--beta-alanine ligase  48.57 
 
 		 327 aa  222  6e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4565  pantoate--beta-alanine ligase  50.75 
 
 		 287 aa  222  6e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650903 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0161  pantoate--beta-alanine ligase  44.66 
 
 		 281 aa  222  6e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.253183  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0464  pantoate/beta-alanine ligase  47.35 
 
 		 281 aa  222  7e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3469  pantoate/beta-alanine ligase  47.39 
 
 		 283 aa  221  9e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0136  pantoate--beta-alanine ligase  47.39 
 
 		 283 aa  221  9e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0137  pantoate--beta-alanine ligase  47.39 
 
 		 283 aa  221  9e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2130  pantoate--beta-alanine ligase  47.92 
 
 		 286 aa  221  9.999999999999999e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000332887 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3063  pantoate--beta-alanine ligase  48.34 
 
 		 283 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.217741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2251  pantoate--beta-alanine ligase  47.04 
 
 		 307 aa  221  9.999999999999999e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4094  pantoate--beta-alanine ligase  51.53 
 
 		 283 aa  221  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2079  pantoate--beta-alanine ligase  45 
 
 		 282 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0111678  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00132  pantoate-beta-alanine ligase  47.39 
 
 		 283 aa  220  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2315  pantoate--beta-alanine ligase  47.02 
 
 		 286 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.303459  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1610  pantoate--beta-alanine ligase  43.41 
 
 		 280 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.228935  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00131  hypothetical protein  47.39 
 
 		 283 aa  220  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2791  pantoate--beta-alanine ligase  48.42 
 
 		 288 aa  220  1.9999999999999999e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363963 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3526  pantoate--beta-alanine ligase  47.39 
 
 		 283 aa  220  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0042  pantoate--beta-alanine ligase  44.83 
 
 		 273 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000112642  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0733  pantoate--beta-alanine ligase  49.24 
 
 		 287 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.536898  hitchhiker  0.0000595497 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2060  pantoate--beta-alanine ligase  47.81 
 
 		 291 aa  220  3e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.047141 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3932  pantoate--beta-alanine ligase  43.66 
 
 		 283 aa  219  3e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.341637  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3011  pantoate--beta-alanine ligase  44.93 
 
 		 279 aa  220  3e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1740  pantoate--beta-alanine ligase  42.91 
 
 		 280 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4699  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 		 287 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.021644  hitchhiker  0.00466856 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1571  pantoate--beta-alanine ligase  41.11 
 
 		 280 aa  219  5e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1667  pantoate--beta-alanine ligase  42.91 
 
 		 280 aa  218  7e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2388  pantoate--beta-alanine ligase  51.56 
 
 		 283 aa  218  7e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0472601  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1239  pantoate--beta-alanine ligase  44.57 
 
 		 279 aa  219  7e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000121643 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1643  pantoate--beta-alanine ligase  44.89 
 
 		 283 aa  218  7.999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.966928  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>