More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0632 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0632  pantoate/beta-alanine ligase  100 
 
 		 276 aa  530  1e-149  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0460  pantothenate synthetase  65.28 
 
 		 334 aa  311  5.999999999999999e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0090  pantoate/beta-alanine ligase  61.85 
 
 		 273 aa  298  6e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8293  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3426  pantoate/beta-alanine ligase  60.23 
 
 		 294 aa  282  3.0000000000000004e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1424  pantoate--beta-alanine ligase  61.33 
 
 		 314 aa  280  1e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.172502 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4487  pantoate/beta-alanine ligase  58.66 
 
 		 287 aa  280  2e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35550  pantoate--beta-alanine ligase  64.45 
 
 		 302 aa  279  3e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0479281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8383  pantoate/beta-alanine ligase  59.53 
 
 		 288 aa  275  8e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.857994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4762  pantoate--beta-alanine ligase  62.5 
 
 		 313 aa  271  1e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4848  pantoate--beta-alanine ligase  62.5 
 
 		 313 aa  271  1e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0717789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0325  pantoate--beta-alanine ligase  60.55 
 
 		 296 aa  270  2e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.668173  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5148  pantoate--beta-alanine ligase  62.5 
 
 		 313 aa  269  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4981  pantoate/beta-alanine ligase  61.74 
 
 		 289 aa  268  5e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0199543  normal  0.96569 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4283  pantoate--beta-alanine ligase  59.64 
 
 		 282 aa  263  2e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4718  pantoate--beta-alanine ligase  59.27 
 
 		 282 aa  263  3e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0575  pantoate--beta-alanine ligase  60.07 
 
 		 288 aa  259  3e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.447307  normal  0.0256844 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9160  Pantoate--beta-alanine ligase  58.14 
 
 		 285 aa  259  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2884  pantothenate synthetase  55.79 
 
 		 296 aa  257  1e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.411032  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0567  pantoate/beta-alanine ligase  57.65 
 
 		 308 aa  256  2e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.566443  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0200  pantoate--beta-alanine ligase  57.6 
 
 		 360 aa  253  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266201  normal  0.726246 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5364  pantoate--beta-alanine ligase  58.53 
 
 		 311 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00859126 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13634  pantoate--beta-alanine ligase  61.72 
 
 		 309 aa  249  3e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.55171e-34  normal  0.0118376 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4007  pantoate/beta-alanine ligase  57.81 
 
 		 318 aa  248  7e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0728  pantoate--beta-alanine ligase  49.44 
 
 		 277 aa  248  1e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.41941  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4783  pantoate--beta-alanine ligase  54.26 
 
 		 283 aa  247  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2096  pantoate/beta-alanine ligase  58.89 
 
 		 302 aa  247  2e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.985614 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2423  pantoate--beta-alanine ligase  53.31 
 
 		 283 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3564  pantoate--beta-alanine ligase  51.8 
 
 		 283 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.358639  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3332  pantoate--beta-alanine ligase  52.92 
 
 		 311 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.475559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0211  pantothenate synthetase  51.77 
 
 		 303 aa  243  3e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.120689 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_708  pantothenate synthetase  48.33 
 
 		 277 aa  242  3.9999999999999997e-63  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0830  pantoate/beta-alanine ligase  45.91 
 
 		 279 aa  242  5e-63  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1266  pantoate/beta-alanine ligase  46.49 
 
 		 289 aa  241  9e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3063  pantoate--beta-alanine ligase  51.44 
 
 		 283 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.217741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  47.87 
 
 		 283 aa  240  2e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2788  pantothenate synthetase  54.18 
 
 		 282 aa  240  2e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1518  pantoate--beta-alanine ligase  51.43 
 
 		 279 aa  239  2.9999999999999997e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.317394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1702  pantoate--beta-alanine ligase  52.9 
 
 		 283 aa  239  4e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.238045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0426  pantoate--beta-alanine ligase  44.36 
 
 		 283 aa  236  3e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0804  pantoate--beta-alanine ligase  49.06 
 
 		 268 aa  236  4e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0135127  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1740  pantoate--beta-alanine ligase  43.48 
 
 		 280 aa  235  8e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2388  pantoate--beta-alanine ligase  52.73 
 
 		 283 aa  234  9e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0472601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1667  pantoate--beta-alanine ligase  43.48 
 
 		 280 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0039  pantothenate synthetase  51.97 
 
 		 289 aa  234  1.0000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0744  pantoate--beta-alanine ligase  51.11 
 
 		 278 aa  234  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.809915  hitchhiker  0.00112992 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4743  pantoate--beta-alanine ligase  49.28 
 
 		 291 aa  233  3e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.16561 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 		 283 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0733  pantoate--beta-alanine ligase  50.53 
 
 		 287 aa  232  5e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.536898  hitchhiker  0.0000595497 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0960  pantoate--beta-alanine ligase  49.64 
 
 		 283 aa  232  6e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2952  pantothenate synthase  52.14 
 
 		 281 aa  231  8.000000000000001e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.215567  normal  0.0184604 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4700  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 		 287 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1525  pantoate-beta-alanine ligase  45.21 
 
 		 283 aa  231  1e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.102611  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4375  pantoate--beta-alanine ligase  58.1 
 
 		 381 aa  231  1e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.303399 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0670  pantoate--beta-alanine ligase  53.1 
 
 		 296 aa  231  1e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4699  pantoate--beta-alanine ligase  50.71 
 
 		 287 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.021644  hitchhiker  0.00466856 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2196  pantoate--beta-alanine ligase  53.52 
 
 		 285 aa  229  3e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.941779  normal  0.927137 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0958  pantoate--beta-alanine ligase  49.81 
 
 		 283 aa  229  3e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32010  pantothenate synthetase  58.56 
 
 		 321 aa  229  4e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4565  pantoate--beta-alanine ligase  51.64 
 
 		 287 aa  229  4e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650903 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0901  pantoate--beta-alanine ligase  43.17 
 
 		 281 aa  229  5e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163902  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3593  pantoate--beta-alanine ligase  50.53 
 
 		 285 aa  228  7e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0749  pantoate/beta-alanine ligase  51.15 
 
 		 289 aa  228  7e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0722466  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0333  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 		 278 aa  228  1e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0198  pantoate--beta-alanine ligase  52.33 
 
 		 281 aa  228  1e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.795684  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4812  pantoate--beta-alanine ligase  48.58 
 
 		 286 aa  227  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257734  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2430  pantoate/beta-alanine ligase  53.33 
 
 		 288 aa  228  1e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.680362  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1239  pantoate--beta-alanine ligase  47.83 
 
 		 279 aa  227  1e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000121643 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62590  pantoate--beta-alanine ligase  50.54 
 
 		 283 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5447  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 		 283 aa  226  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1014  pantoate--beta-alanine ligase  55.08 
 
 		 290 aa  226  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42720  pantoate--beta-alanine ligase  49.1 
 
 		 283 aa  226  3e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2240  pantoate--beta-alanine ligase  51.34 
 
 		 285 aa  226  3e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.496301 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4094  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 		 283 aa  225  5.0000000000000005e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0174  pantoate--beta-alanine ligase  52.31 
 
 		 281 aa  225  5.0000000000000005e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00689  pantoate--beta-alanine ligase  49.11 
 
 		 280 aa  224  1e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.591476  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0155  pantoate--beta-alanine ligase  45 
 
 		 282 aa  224  1e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243441  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1155  pantothenate synthetase  49.82 
 
 		 281 aa  224  2e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.914913 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1829  pantoate--beta-alanine ligase  47.01 
 
 		 283 aa  223  2e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3808  pantoate--beta-alanine ligase  56.32 
 
 		 289 aa  223  2e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0471604 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3535  pantoate--beta-alanine ligase  47.45 
 
 		 284 aa  223  2e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000260902  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  40.14 
 
 		 282 aa  223  3e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2515  pantoate--beta-alanine ligase  50.19 
 
 		 285 aa  223  3e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0464  pantoate/beta-alanine ligase  49.24 
 
 		 281 aa  223  4e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0102  pantoate--beta-alanine ligase  44.4 
 
 		 282 aa  221  7e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.346263  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0126  pantoate--beta-alanine ligase  46.09 
 
 		 287 aa  221  8e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0144  pantoate--beta-alanine ligase  48.85 
 
 		 283 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3011  pantoate--beta-alanine ligase  47.04 
 
 		 279 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0142  pantoate--beta-alanine ligase  48.85 
 
 		 283 aa  220  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0126  pantoate--beta-alanine ligase  48.85 
 
 		 283 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0084  pantoate--beta-alanine ligase  50.19 
 
 		 287 aa  219  3e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.458072 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2916  pantoate--beta-alanine ligase  50.99 
 
 		 277 aa  220  3e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011824  normal  0.110502 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3469  pantoate/beta-alanine ligase  48.46 
 
 		 283 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0137  pantoate--beta-alanine ligase  48.46 
 
 		 283 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1571  pantoate--beta-alanine ligase  42.7 
 
 		 280 aa  219  3.9999999999999997e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002560  pantoate--beta-alanine ligase  46.21 
 
 		 301 aa  219  3.9999999999999997e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0445865  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0136  pantoate--beta-alanine ligase  48.46 
 
 		 283 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2469  pantothenate synthetase  52.29 
 
 		 291 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163424  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0693  pantoate--beta-alanine ligase  45.68 
 
 		 283 aa  219  5e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.001104  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0555  pantoate--beta-alanine ligase  54.9 
 
 		 278 aa  219  5e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3320  pantothenate synthetase  50.9 
 
 		 290 aa  218  6e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>