More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_32010 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_32010  pantothenate synthetase  100 
 
 		 321 aa  617  1e-175  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8383  pantoate/beta-alanine ligase  61.6 
 
 		 288 aa  303  3.0000000000000004e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.857994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2096  pantoate/beta-alanine ligase  65.23 
 
 		 302 aa  299  5e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.985614 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4487  pantoate/beta-alanine ligase  58.31 
 
 		 287 aa  293  3e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3426  pantoate/beta-alanine ligase  59.33 
 
 		 294 aa  288  8e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0200  pantoate--beta-alanine ligase  59.73 
 
 		 360 aa  286  4e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266201  normal  0.726246 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0635  pantoate/beta-alanine ligase  65.73 
 
 		 324 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.53875  normal  0.326208 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4981  pantoate/beta-alanine ligase  62.6 
 
 		 289 aa  279  6e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0199543  normal  0.96569 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0575  pantoate--beta-alanine ligase  63.6 
 
 		 288 aa  277  2e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.447307  normal  0.0256844 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4718  pantoate--beta-alanine ligase  63.08 
 
 		 282 aa  271  9e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9160  Pantoate--beta-alanine ligase  54.61 
 
 		 285 aa  270  2.9999999999999997e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2884  pantothenate synthetase  55.05 
 
 		 296 aa  270  4e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.411032  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4283  pantoate--beta-alanine ligase  62.69 
 
 		 282 aa  259  5.0000000000000005e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0460  pantothenate synthetase  52.2 
 
 		 334 aa  253  3e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4375  pantoate--beta-alanine ligase  53.87 
 
 		 381 aa  251  1e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.303399 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0090  pantoate/beta-alanine ligase  51.54 
 
 		 273 aa  250  2e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12880  pantothenate synthetase  57.92 
 
 		 291 aa  245  6e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00593935  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1424  pantoate--beta-alanine ligase  56.87 
 
 		 314 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.172502 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0716  pantoate/beta-alanine ligase  62.6 
 
 		 618 aa  242  5e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.34765 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0211  pantothenate synthetase  55.13 
 
 		 303 aa  239  4e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.120689 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3319  pantoate--beta-alanine ligase  52.26 
 
 		 286 aa  239  5.999999999999999e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1266  pantoate/beta-alanine ligase  46.04 
 
 		 289 aa  236  3e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0632  pantoate/beta-alanine ligase  57.79 
 
 		 276 aa  235  7e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1707  pantoate--beta-alanine ligase  49.06 
 
 		 290 aa  235  8e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1525  pantoate-beta-alanine ligase  44.14 
 
 		 283 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.102611  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0102  pantoate--beta-alanine ligase  45.95 
 
 		 282 aa  233  2.0000000000000002e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.346263  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0323  pantoate--beta-alanine ligase  51.29 
 
 		 301 aa  233  3e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3535  pantoate--beta-alanine ligase  49.23 
 
 		 284 aa  233  3e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000260902  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4762  pantoate--beta-alanine ligase  56.65 
 
 		 313 aa  232  6e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4848  pantoate--beta-alanine ligase  56.65 
 
 		 313 aa  232  6e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0717789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0426  pantoate--beta-alanine ligase  45.35 
 
 		 283 aa  232  7.000000000000001e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0901  pantoate--beta-alanine ligase  42.86 
 
 		 281 aa  231  1e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163902  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0749  pantoate/beta-alanine ligase  51.89 
 
 		 289 aa  230  2e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0722466  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  44.71 
 
 		 282 aa  229  5e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5148  pantoate--beta-alanine ligase  56.27 
 
 		 313 aa  229  7e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35550  pantoate--beta-alanine ligase  55 
 
 		 302 aa  228  1e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0479281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0161  pantoate--beta-alanine ligase  46.86 
 
 		 281 aa  227  2e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.253183  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0126  pantoate--beta-alanine ligase  48.48 
 
 		 287 aa  227  2e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0160  pantoate--beta-alanine ligase  48.93 
 
 		 304 aa  227  2e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  48.85 
 
 		 283 aa  226  3e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4743  pantoate--beta-alanine ligase  50.19 
 
 		 291 aa  226  3e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.16561 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0369  pantoate--beta-alanine ligase  50.39 
 
 		 283 aa  225  9e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.397358 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2606  pantoate/beta-alanine ligase  47.64 
 
 		 288 aa  223  2e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0117  pantoate--beta-alanine ligase  49.43 
 
 		 288 aa  224  2e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1014  pantoate--beta-alanine ligase  51.75 
 
 		 290 aa  223  4e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1829  pantoate--beta-alanine ligase  48.46 
 
 		 283 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0174  pantoate--beta-alanine ligase  48.64 
 
 		 281 aa  222  6e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1518  pantoate--beta-alanine ligase  49.03 
 
 		 279 aa  222  6e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.317394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  48.87 
 
 		 283 aa  222  7e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0155  pantoate--beta-alanine ligase  44.83 
 
 		 282 aa  222  7e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243441  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1876  pantoate/beta-alanine ligase  49.81 
 
 		 288 aa  222  8e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0198  pantoate--beta-alanine ligase  48.64 
 
 		 281 aa  221  9.999999999999999e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.795684  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0958  pantoate--beta-alanine ligase  48.25 
 
 		 283 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0325  pantoate--beta-alanine ligase  55 
 
 		 296 aa  221  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.668173  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3066  pantothenate synthetase  51.7 
 
 		 283 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0667  pantoate--beta-alanine ligase  46.06 
 
 		 283 aa  220  3e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0117  pantoate/beta-alanine ligase  42.5 
 
 		 279 aa  219  5e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0733  pantoate--beta-alanine ligase  47.6 
 
 		 287 aa  219  6e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.536898  hitchhiker  0.0000595497 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1321  pantoate--beta-alanine ligase  47.69 
 
 		 284 aa  218  7.999999999999999e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0313852  normal  0.753592 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4812  pantoate--beta-alanine ligase  46.49 
 
 		 286 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257734  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0600  pantoate--beta-alanine ligase  47.66 
 
 		 283 aa  218  1e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1239  pantoate--beta-alanine ligase  49.41 
 
 		 279 aa  217  2e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000121643 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0567  pantoate/beta-alanine ligase  54.02 
 
 		 308 aa  217  2e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.566443  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1789  pantoate--beta-alanine ligase  45.79 
 
 		 281 aa  217  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1012  pantoate/beta-alanine ligase  46.86 
 
 		 282 aa  217  2e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4007  pantoate/beta-alanine ligase  51.53 
 
 		 318 aa  217  2e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2430  pantoate/beta-alanine ligase  51.56 
 
 		 288 aa  217  2.9999999999999998e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.680362  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1134  pantoate/beta-alanine ligase  47.21 
 
 		 283 aa  216  2.9999999999999998e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2788  pantothenate synthetase  52.31 
 
 		 282 aa  216  4e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62590  pantoate--beta-alanine ligase  48.86 
 
 		 283 aa  216  4e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3011  pantoate--beta-alanine ligase  48.63 
 
 		 279 aa  216  5e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0333  pantoate--beta-alanine ligase  50.58 
 
 		 278 aa  216  5e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0674  pantoate--beta-alanine ligase  51.15 
 
 		 285 aa  216  5e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.523643  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4783  pantoate--beta-alanine ligase  50.95 
 
 		 283 aa  216  5e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0404  pantoate/beta-alanine ligase  45.74 
 
 		 281 aa  215  5.9999999999999996e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.302391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2791  pantoate--beta-alanine ligase  47.28 
 
 		 288 aa  216  5.9999999999999996e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363963 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2952  pantothenate synthase  50.97 
 
 		 281 aa  214  9.999999999999999e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.215567  normal  0.0184604 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002560  pantoate--beta-alanine ligase  46.86 
 
 		 301 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0445865  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1634  pantoate--beta-alanine ligase  46.74 
 
 		 283 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0744  pantoate--beta-alanine ligase  49.81 
 
 		 278 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.809915  hitchhiker  0.00112992 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1524  pantoate--beta-alanine ligase  43.46 
 
 		 280 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1740  pantoate--beta-alanine ligase  46.03 
 
 		 280 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2079  pantoate--beta-alanine ligase  45.91 
 
 		 282 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0111678  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03451  pantoate--beta-alanine ligase  44.68 
 
 		 300 aa  213  2.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4565  pantoate--beta-alanine ligase  47.08 
 
 		 287 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650903 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0787  pantoate--beta-alanine ligase  46.84 
 
 		 283 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.232916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5364  pantoate--beta-alanine ligase  51.88 
 
 		 311 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00859126 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1667  pantoate--beta-alanine ligase  46.03 
 
 		 280 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4700  pantoate--beta-alanine ligase  46.72 
 
 		 287 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2151  pantoate--beta-alanine ligase  47.37 
 
 		 286 aa  213  4.9999999999999996e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5447  pantoate--beta-alanine ligase  48.48 
 
 		 283 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1706  pantoate--beta-alanine ligase  46.3 
 
 		 283 aa  212  7e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260086  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00689  pantoate--beta-alanine ligase  47.29 
 
 		 280 aa  212  7e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.591476  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01440  pantothenate synthetase  51.13 
 
 		 343 aa  212  7e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4699  pantoate--beta-alanine ligase  47.08 
 
 		 287 aa  212  7e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.021644  hitchhiker  0.00466856 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0039  pantothenate synthetase  47.47 
 
 		 289 aa  212  7.999999999999999e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42720  pantoate--beta-alanine ligase  46.39 
 
 		 283 aa  212  7.999999999999999e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0960  pantoate--beta-alanine ligase  46.42 
 
 		 283 aa  211  9e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1786  pantoate/beta-alanine ligase  44.84 
 
 		 281 aa  212  9e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.300346  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3564  pantoate--beta-alanine ligase  49.22 
 
 		 283 aa  212  9e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.358639  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>