More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0555 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0555  pantoate--beta-alanine ligase  100 
 
 		 278 aa  543  1e-154  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1014  pantoate--beta-alanine ligase  62.04 
 
 		 290 aa  296  2e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1396  pantoate--beta-alanine ligase  62.41 
 
 		 288 aa  281  9e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.262573  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2196  pantoate--beta-alanine ligase  58.89 
 
 		 285 aa  271  1e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.941779  normal  0.927137 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2240  pantoate--beta-alanine ligase  58.52 
 
 		 285 aa  270  1e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.496301 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2515  pantoate--beta-alanine ligase  57.78 
 
 		 285 aa  267  1e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2788  pantothenate synthetase  57.71 
 
 		 282 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4085  pantoate--beta-alanine ligase  59.71 
 
 		 282 aa  263  2e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0133419 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3003  pantoate--beta-alanine ligase  54.84 
 
 		 279 aa  260  1e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0849834 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3460  pantoate--beta-alanine ligase  49.12 
 
 		 276 aa  259  5.0000000000000005e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0830  pantoate/beta-alanine ligase  43.17 
 
 		 279 aa  254  1.0000000000000001e-66  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3564  pantoate--beta-alanine ligase  49.64 
 
 		 283 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.358639  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0084  pantoate--beta-alanine ligase  53.24 
 
 		 287 aa  253  3e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.458072 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3320  pantothenate synthetase  52.65 
 
 		 290 aa  253  3e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4743  pantoate--beta-alanine ligase  48.93 
 
 		 291 aa  253  3e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.16561 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3319  pantoate--beta-alanine ligase  54.74 
 
 		 286 aa  252  4.0000000000000004e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0901  pantoate--beta-alanine ligase  46.07 
 
 		 281 aa  252  5.000000000000001e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163902  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3066  pantothenate synthetase  56.03 
 
 		 283 aa  252  6e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2423  pantoate--beta-alanine ligase  51.08 
 
 		 283 aa  251  1e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3063  pantoate--beta-alanine ligase  51.08 
 
 		 283 aa  250  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.217741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0744  pantoate--beta-alanine ligase  51.43 
 
 		 278 aa  249  5e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.809915  hitchhiker  0.00112992 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  50.36 
 
 		 283 aa  248  6e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00689  pantoate--beta-alanine ligase  49.65 
 
 		 280 aa  248  1e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.591476  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2791  pantoate--beta-alanine ligase  51.6 
 
 		 288 aa  247  2e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363963 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0960  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 		 283 aa  246  3e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1321  pantoate--beta-alanine ligase  49.64 
 
 		 284 aa  245  6e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0313852  normal  0.753592 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0426  pantoate--beta-alanine ligase  46.76 
 
 		 283 aa  244  8e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4487  pantoate/beta-alanine ligase  52.5 
 
 		 287 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1829  pantoate--beta-alanine ligase  48.4 
 
 		 283 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0333  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 		 278 aa  242  5e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2251  pantoate--beta-alanine ligase  52.48 
 
 		 307 aa  242  6e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1702  pantoate--beta-alanine ligase  52.34 
 
 		 283 aa  241  7e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.238045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0878  pantoate--beta-alanine ligase  47.25 
 
 		 279 aa  241  7e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.3427  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1610  pantoate--beta-alanine ligase  43.73 
 
 		 280 aa  241  7.999999999999999e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.228935  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2952  pantothenate synthase  48.92 
 
 		 281 aa  241  9e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.215567  normal  0.0184604 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  49.46 
 
 		 283 aa  241  1e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1740  pantoate--beta-alanine ligase  45.49 
 
 		 280 aa  240  1e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0161  pantoate--beta-alanine ligase  45.49 
 
 		 281 aa  240  2e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.253183  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1667  pantoate--beta-alanine ligase  45.49 
 
 		 280 aa  240  2e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1571  pantoate--beta-alanine ligase  42.29 
 
 		 280 aa  239  2.9999999999999997e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2388  pantoate--beta-alanine ligase  53.88 
 
 		 283 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0472601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3332  pantoate--beta-alanine ligase  51.25 
 
 		 311 aa  239  5e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.475559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0958  pantoate--beta-alanine ligase  46.1 
 
 		 283 aa  238  6.999999999999999e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0198  pantoate--beta-alanine ligase  48.41 
 
 		 281 aa  236  3e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.795684  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4783  pantoate--beta-alanine ligase  50.58 
 
 		 283 aa  236  4e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62590  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 		 283 aa  236  4e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0174  pantoate--beta-alanine ligase  48.06 
 
 		 281 aa  235  5.0000000000000005e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1518  pantoate--beta-alanine ligase  49.1 
 
 		 279 aa  235  5.0000000000000005e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.317394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0728  pantoate--beta-alanine ligase  45.04 
 
 		 277 aa  235  7e-61  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.41941  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5447  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 		 283 aa  235  7e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  41.43 
 
 		 282 aa  234  8e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1706  pantoate--beta-alanine ligase  46.79 
 
 		 283 aa  234  9e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260086  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3426  pantoate/beta-alanine ligase  50.95 
 
 		 294 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1524  pantoate--beta-alanine ligase  42.29 
 
 		 280 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2054  pantoate--beta-alanine ligase  51.43 
 
 		 283 aa  233  3e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.183406 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1876  pantoate/beta-alanine ligase  49.82 
 
 		 288 aa  233  3e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0155  pantoate--beta-alanine ligase  46.21 
 
 		 282 aa  233  3e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243441  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0666  pantoate--beta-alanine ligase  46.98 
 
 		 282 aa  232  4.0000000000000004e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232247  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_708  pantothenate synthetase  44.48 
 
 		 277 aa  231  9e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4700  pantoate--beta-alanine ligase  48.39 
 
 		 287 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3186  pantoate--beta-alanine ligase  45.45 
 
 		 274 aa  231  1e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.722916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0464  pantoate/beta-alanine ligase  49.03 
 
 		 281 aa  231  1e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4542  pantoate--beta-alanine ligase  49.47 
 
 		 285 aa  230  1e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.246095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2314  pantoate/beta-alanine ligase  50.36 
 
 		 284 aa  231  1e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000496833  hitchhiker  0.000102893 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0670  pantoate--beta-alanine ligase  50.72 
 
 		 296 aa  230  2e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3932  pantoate--beta-alanine ligase  43.42 
 
 		 283 aa  230  2e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.341637  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3803  pantoate--beta-alanine ligase  48.44 
 
 		 281 aa  229  3e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0604878  hitchhiker  0.00446449 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0733  pantoate--beta-alanine ligase  48.4 
 
 		 287 aa  229  4e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.536898  hitchhiker  0.0000595497 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42720  pantoate--beta-alanine ligase  48.04 
 
 		 283 aa  229  4e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1239  pantoate--beta-alanine ligase  48.83 
 
 		 279 aa  229  4e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000121643 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1789  pantoate--beta-alanine ligase  44.37 
 
 		 281 aa  229  5e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4812  pantoate--beta-alanine ligase  48.03 
 
 		 286 aa  229  5e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257734  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0749  pantoate/beta-alanine ligase  48.42 
 
 		 289 aa  228  6e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0722466  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3149  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 		 290 aa  228  6e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2079  pantoate--beta-alanine ligase  45.04 
 
 		 282 aa  228  8e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0111678  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4699  pantoate--beta-alanine ligase  48.39 
 
 		 287 aa  228  9e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.021644  hitchhiker  0.00466856 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4565  pantoate--beta-alanine ligase  48.03 
 
 		 287 aa  228  9e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650903 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03551  pantothenate synthetase  46.26 
 
 		 282 aa  227  2e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4462  pantoate/beta-alanine ligase  46.86 
 
 		 280 aa  226  5.0000000000000005e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1027  pantoate--beta-alanine ligase  49.22 
 
 		 284 aa  225  7e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4557  pantoate/beta-alanine ligase  44.71 
 
 		 280 aa  225  7e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.146553  normal  0.699914 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4981  pantoate/beta-alanine ligase  51.79 
 
 		 289 aa  225  7e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0199543  normal  0.96569 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1525  pantoate-beta-alanine ligase  42.91 
 
 		 283 aa  224  1e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.102611  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0122  pantoate--beta-alanine ligase  46.76 
 
 		 293 aa  224  1e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0223415  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2560  pantoate--beta-alanine ligase  48.74 
 
 		 284 aa  224  1e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2315  pantoate--beta-alanine ligase  48.04 
 
 		 286 aa  224  2e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.303459  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3593  pantoate--beta-alanine ligase  46.62 
 
 		 285 aa  223  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9160  Pantoate--beta-alanine ligase  47.92 
 
 		 285 aa  224  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1446  pantoate--beta-alanine ligase  47.87 
 
 		 278 aa  223  2e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1770  pantoate--beta-alanine ligase  47.87 
 
 		 278 aa  223  2e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3535  pantoate--beta-alanine ligase  44.64 
 
 		 284 aa  223  2e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000260902  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0579  pantoate--beta-alanine ligase  42.35 
 
 		 289 aa  224  2e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0804  pantoate--beta-alanine ligase  46.9 
 
 		 268 aa  223  3e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0135127  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0201  pantoate--beta-alanine ligase  45.2 
 
 		 284 aa  223  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.17692  normal  0.688359 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3011  pantoate--beta-alanine ligase  48.05 
 
 		 279 aa  223  3e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03451  pantoate--beta-alanine ligase  44.84 
 
 		 300 aa  223  3e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0215  pantoate--beta-alanine ligase  45.2 
 
 		 284 aa  222  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0414083  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2495  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 		 280 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0101  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 		 327 aa  222  4.9999999999999996e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0198  pantoate--beta-alanine ligase  45.2 
 
 		 284 aa  222  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.518661  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>