More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1446 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1770  pantoate--beta-alanine ligase  100 
 
 		 278 aa  565  1e-160  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1446  pantoate--beta-alanine ligase  100 
 
 		 278 aa  565  1e-160  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0960  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 		 283 aa  243  3e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  50.39 
 
 		 283 aa  242  6e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3593  pantoate--beta-alanine ligase  48.84 
 
 		 285 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42720  pantoate--beta-alanine ligase  49.22 
 
 		 283 aa  238  8e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62590  pantoate--beta-alanine ligase  50.57 
 
 		 283 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5447  pantoate--beta-alanine ligase  50.57 
 
 		 283 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3932  pantoate--beta-alanine ligase  44.68 
 
 		 283 aa  233  3e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.341637  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2824  pantoate--beta-alanine ligase  48.12 
 
 		 284 aa  232  4.0000000000000004e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0816624  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1027  pantoate--beta-alanine ligase  49.02 
 
 		 284 aa  232  6e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3473  pantoate--beta-alanine ligase  46.72 
 
 		 284 aa  232  7.000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.623251  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3344  pantoate--beta-alanine ligase  46.72 
 
 		 284 aa  232  7.000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000501191  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3904  pantoate--beta-alanine ligase  42.35 
 
 		 281 aa  231  8.000000000000001e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2240  pantoate--beta-alanine ligase  48.12 
 
 		 285 aa  231  1e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.496301 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4700  pantoate--beta-alanine ligase  49.62 
 
 		 287 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1014  pantoate--beta-alanine ligase  48.71 
 
 		 290 aa  229  3e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1012  pantoate--beta-alanine ligase  45.56 
 
 		 284 aa  229  3e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0272809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3803  pantoate--beta-alanine ligase  45.19 
 
 		 281 aa  229  3e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0604878  hitchhiker  0.00446449 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4565  pantoate--beta-alanine ligase  49.23 
 
 		 287 aa  229  4e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650903 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2515  pantoate--beta-alanine ligase  47.74 
 
 		 285 aa  229  5e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03451  pantoate--beta-alanine ligase  44.09 
 
 		 300 aa  228  7e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4699  pantoate--beta-alanine ligase  49.62 
 
 		 287 aa  228  7e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.021644  hitchhiker  0.00466856 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3281  pantoate--beta-alanine ligase  44.24 
 
 		 284 aa  228  8e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3119  pantoate--beta-alanine ligase  45.86 
 
 		 284 aa  228  8e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.620137  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2196  pantoate--beta-alanine ligase  48.5 
 
 		 285 aa  228  9e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.941779  normal  0.927137 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2610  pantoate--beta-alanine ligase  43.51 
 
 		 298 aa  228  1e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.205281  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0733  pantoate--beta-alanine ligase  48.85 
 
 		 287 aa  227  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.536898  hitchhiker  0.0000595497 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1159  pantoate--beta-alanine ligase  45.86 
 
 		 284 aa  226  2e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0480021  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3066  pantothenate synthetase  46.83 
 
 		 283 aa  227  2e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002560  pantoate--beta-alanine ligase  44.44 
 
 		 301 aa  226  2e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0445865  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3992  pantoate--beta-alanine ligase  46.24 
 
 		 284 aa  226  3e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4812  pantoate--beta-alanine ligase  47.66 
 
 		 286 aa  225  6e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257734  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2952  pantothenate synthase  44.29 
 
 		 281 aa  224  1e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.215567  normal  0.0184604 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0869  pantoate--beta-alanine ligase  45.11 
 
 		 281 aa  224  2e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1525  pantoate-beta-alanine ligase  43.06 
 
 		 283 aa  223  3e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.102611  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0830  pantoate/beta-alanine ligase  41.07 
 
 		 279 aa  223  4e-57  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0725  pantoate--beta-alanine ligase  46.44 
 
 		 281 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.278718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0775  pantoate--beta-alanine ligase  45.29 
 
 		 281 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0122  pantoate--beta-alanine ligase  44.52 
 
 		 293 aa  222  6e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0223415  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3297  pantoate--beta-alanine ligase  46.44 
 
 		 281 aa  222  6e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.749755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3134  pantoate--beta-alanine ligase  44.09 
 
 		 282 aa  222  6e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.504396  normal  0.398811 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0117  pantoate--beta-alanine ligase  43.06 
 
 		 288 aa  221  9e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2130  pantoate--beta-alanine ligase  43.31 
 
 		 286 aa  221  9e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000332887 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3564  pantoate--beta-alanine ligase  44.27 
 
 		 283 aa  221  9e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.358639  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3409  pantoate--beta-alanine ligase  45.11 
 
 		 281 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.545812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0867  pantoate--beta-alanine ligase  44.36 
 
 		 281 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.712584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2042  pantoate/beta-alanine ligase  44.64 
 
 		 293 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4017  pantoate--beta-alanine ligase  40.99 
 
 		 282 aa  219  3.9999999999999997e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.43915  normal  0.63382 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0674  pantoate--beta-alanine ligase  47.21 
 
 		 285 aa  219  5e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.523643  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3320  pantothenate synthetase  46.3 
 
 		 290 aa  219  5e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0879  pantoate--beta-alanine ligase  44.36 
 
 		 281 aa  218  7e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00646372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0693  pantoate--beta-alanine ligase  41.34 
 
 		 283 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.001104  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3495  pantoate--beta-alanine ligase  43.98 
 
 		 281 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2791  pantoate--beta-alanine ligase  45.86 
 
 		 288 aa  218  1e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363963 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0464  pantoate/beta-alanine ligase  46.39 
 
 		 281 aa  218  1e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0844  pantoate--beta-alanine ligase  44.36 
 
 		 281 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.126376  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1396  pantoate--beta-alanine ligase  48.71 
 
 		 288 aa  218  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.262573  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3133  pantoate--beta-alanine ligase  45.49 
 
 		 281 aa  217  2e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0731299  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0231  pantoate--beta-alanine ligase  40.64 
 
 		 285 aa  216  2e-55  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0555  pantoate--beta-alanine ligase  46.62 
 
 		 278 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2054  pantoate--beta-alanine ligase  47.51 
 
 		 283 aa  216  4e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.183406 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0144  pantoate--beta-alanine ligase  42.55 
 
 		 283 aa  216  4e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0126  pantoate--beta-alanine ligase  42.55 
 
 		 283 aa  216  4e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1702  pantoate--beta-alanine ligase  47.49 
 
 		 283 aa  215  5e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.238045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0126  pantoate--beta-alanine ligase  42.7 
 
 		 287 aa  216  5e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0886  cytidyltransferase-related  45.02 
 
 		 286 aa  214  8e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000710708  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0197  pantoate--beta-alanine ligase  43.23 
 
 		 284 aa  215  8e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.742862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1321  pantoate--beta-alanine ligase  43.77 
 
 		 284 aa  214  9e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0313852  normal  0.753592 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0142  pantoate--beta-alanine ligase  42.2 
 
 		 283 aa  214  9e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0213  pantoate--beta-alanine ligase  43.23 
 
 		 284 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1061  pantoate--beta-alanine ligase  42.4 
 
 		 284 aa  214  9.999999999999999e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3003  pantoate--beta-alanine ligase  45.88 
 
 		 279 aa  214  9.999999999999999e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0849834 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0090  pantoate/beta-alanine ligase  44.81 
 
 		 273 aa  214  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0565  pantothenate synthetase  45.91 
 
 		 286 aa  214  9.999999999999999e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.194299  hitchhiker  0.0000000964689 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00132  pantoate-beta-alanine ligase  41.84 
 
 		 283 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00131  hypothetical protein  41.84 
 
 		 283 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0215  pantoate--beta-alanine ligase  43.23 
 
 		 284 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0414083  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3526  pantoate--beta-alanine ligase  41.84 
 
 		 283 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0901  pantoate--beta-alanine ligase  39.49 
 
 		 281 aa  213  1.9999999999999998e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163902  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4783  pantoate--beta-alanine ligase  43.73 
 
 		 283 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3469  pantoate/beta-alanine ligase  41.84 
 
 		 283 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0136  pantoate--beta-alanine ligase  41.84 
 
 		 283 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0137  pantoate--beta-alanine ligase  41.84 
 
 		 283 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0666  pantoate--beta-alanine ligase  44.07 
 
 		 282 aa  213  3.9999999999999995e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232247  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0680  pantoate--beta-alanine ligase  41.85 
 
 		 284 aa  213  3.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.337976  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1571  pantoate--beta-alanine ligase  43.46 
 
 		 280 aa  212  4.9999999999999996e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3426  pantoate/beta-alanine ligase  46.24 
 
 		 294 aa  211  9e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0579  pantoate--beta-alanine ligase  42.75 
 
 		 289 aa  211  9e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0201  pantoate--beta-alanine ligase  42.86 
 
 		 284 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.17692  normal  0.688359 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4313  pantoate--beta-alanine ligase  42.09 
 
 		 288 aa  210  2e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0596  pantoate--beta-alanine ligase  43.77 
 
 		 278 aa  210  2e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.242968 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3175  pantoate--beta-alanine ligase  43.17 
 
 		 281 aa  210  2e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0198  pantoate--beta-alanine ligase  42.86 
 
 		 284 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.518661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1610  pantoate--beta-alanine ligase  42.05 
 
 		 280 aa  210  2e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.228935  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2315  pantoate--beta-alanine ligase  44.53 
 
 		 286 aa  209  3e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.303459  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0668  pantoate--beta-alanine ligase  43.45 
 
 		 282 aa  209  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1266  pantoate/beta-alanine ligase  38.57 
 
 		 289 aa  209  3e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0426  pantoate--beta-alanine ligase  40 
 
 		 283 aa  209  5e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0848  pantoate--beta-alanine ligase  42.96 
 
 		 279 aa  208  6e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.889171  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>