More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0361 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0361  pantoate--beta-alanine ligase  100 
 
 
273 aa  555  1e-157  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0436  pantoate/beta-alanine ligase  53.48 
 
 
273 aa  315  3e-85  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1370  pantoate--beta-alanine ligase  51.28 
 
 
273 aa  296  2e-79  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0252  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 
273 aa  296  3e-79  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.460228  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0583  pantoate--beta-alanine ligase  48.72 
 
 
273 aa  285  8e-76  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0501  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 
273 aa  283  1.0000000000000001e-75  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1740  pantoate--beta-alanine ligase  44.8 
 
 
280 aa  236  3e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1667  pantoate--beta-alanine ligase  44.8 
 
 
280 aa  236  3e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  44.57 
 
 
282 aa  225  7e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4487  pantoate/beta-alanine ligase  45.56 
 
 
287 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3426  pantoate/beta-alanine ligase  46.18 
 
 
294 aa  219  3e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2117  pantoate--beta-alanine ligase  44.66 
 
 
282 aa  219  5e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3339  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.06 
 
 
529 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1571  pantoate--beta-alanine ligase  43.16 
 
 
280 aa  217  2e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0901  pantoate--beta-alanine ligase  41.88 
 
 
281 aa  215  5e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163902  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1524  pantoate--beta-alanine ligase  43.97 
 
 
280 aa  214  9.999999999999999e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5340  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.29 
 
 
526 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1596  pantoate--beta-alanine ligase  42.5 
 
 
282 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0472681  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0460  pantothenate synthetase  46.99 
 
 
334 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2314  pantoate/beta-alanine ligase  41.84 
 
 
284 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000496833  hitchhiker  0.000102893 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3749  pantoate--beta-alanine ligase  42.5 
 
 
282 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.94763  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1707  pantoate--beta-alanine ligase  41.94 
 
 
282 aa  212  7e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000103153  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0830  pantoate/beta-alanine ligase  43.63 
 
 
279 aa  211  7.999999999999999e-54  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4981  pantoate/beta-alanine ligase  40.94 
 
 
289 aa  211  9e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0199543  normal  0.96569 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1669  pantoate--beta-alanine ligase  41.94 
 
 
282 aa  211  1e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  41.99 
 
 
283 aa  210  2e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2469  pantothenate synthetase  42.36 
 
 
291 aa  210  2e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163424  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0102  pantoate--beta-alanine ligase  41.99 
 
 
282 aa  210  2e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.346263  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1423  pantoate--beta-alanine ligase  41.58 
 
 
282 aa  209  3e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1634  pantoate--beta-alanine ligase  41.58 
 
 
282 aa  208  6e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0402516 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1450  pantoate--beta-alanine ligase  41.58 
 
 
282 aa  208  6e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1422  pantoate--beta-alanine ligase  41.58 
 
 
282 aa  208  6e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1563  pantoate--beta-alanine ligase  41.58 
 
 
282 aa  208  6e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.371985  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2674  pantoate--beta-alanine ligase  42.96 
 
 
283 aa  207  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0567  pantoate/beta-alanine ligase  45.49 
 
 
308 aa  207  1e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.566443  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2620  pantoate--beta-alanine ligase  42.96 
 
 
283 aa  207  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0502  pantoate--beta-alanine ligase  42.75 
 
 
300 aa  207  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2254  pantoate/beta-alanine ligase  40.86 
 
 
289 aa  207  2e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1465  pantoate--beta-alanine ligase  41.94 
 
 
282 aa  207  2e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_708  pantothenate synthetase  41.16 
 
 
277 aa  206  3e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0728  pantoate--beta-alanine ligase  41.16 
 
 
277 aa  206  3e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.41941  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4683  pantoate--beta-alanine ligase  42.96 
 
 
300 aa  206  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1610  pantoate--beta-alanine ligase  42.19 
 
 
280 aa  206  4e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.228935  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2916  pantoate--beta-alanine ligase  43.58 
 
 
277 aa  206  4e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011824  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2884  pantothenate synthetase  41.13 
 
 
296 aa  205  5e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.411032  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8383  pantoate/beta-alanine ligase  42.41 
 
 
288 aa  206  5e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.857994  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0464  pantoate/beta-alanine ligase  40.29 
 
 
281 aa  205  6e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4723  pantoate--beta-alanine ligase  42.39 
 
 
309 aa  205  7e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0200  pantoate--beta-alanine ligase  45.16 
 
 
360 aa  204  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266201  normal  0.726246 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1786  pantoate/beta-alanine ligase  42.76 
 
 
281 aa  204  1e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.300346  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9160  Pantoate--beta-alanine ligase  41.73 
 
 
285 aa  204  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0670  pantoate--beta-alanine ligase  42.03 
 
 
296 aa  203  2e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  38.71 
 
 
527 aa  202  4e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0426  pantoate--beta-alanine ligase  41.52 
 
 
289 aa  202  5e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188172  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0039  pantothenate synthetase  42.05 
 
 
289 aa  202  6e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0329  pantoate--beta-alanine ligase  42.81 
 
 
293 aa  201  9.999999999999999e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384164  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0090  pantoate/beta-alanine ligase  41.39 
 
 
273 aa  201  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8293  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0155  pantoate--beta-alanine ligase  44.06 
 
 
282 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243441  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0117  pantoate/beta-alanine ligase  42.39 
 
 
279 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2610  pantoate--beta-alanine ligase  42.09 
 
 
298 aa  199  3e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.205281  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0346  pantoate--beta-alanine ligase  42.45 
 
 
293 aa  199  3e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.900978  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3535  pantoate--beta-alanine ligase  40.14 
 
 
284 aa  200  3e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000260902  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2060  pantoate--beta-alanine ligase  42.81 
 
 
291 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.047141 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2151  pantoate--beta-alanine ligase  45.89 
 
 
286 aa  199  3.9999999999999996e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002560  pantoate--beta-alanine ligase  43.66 
 
 
301 aa  199  3.9999999999999996e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0445865  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2846  pantoate--beta-alanine ligase  42.03 
 
 
289 aa  199  3.9999999999999996e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1263  pantoate--beta-alanine ligase  39.3 
 
 
282 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.933341  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4700  pantoate--beta-alanine ligase  42.8 
 
 
287 aa  198  6e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3460  pantoate--beta-alanine ligase  38.99 
 
 
276 aa  198  6e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1706  pantoate--beta-alanine ligase  39.79 
 
 
283 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260086  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3014  pantoate/beta-alanine ligase  41.73 
 
 
281 aa  197  1.0000000000000001e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.207166 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0964  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  41.6 
 
 
534 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955795  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4375  pantoate--beta-alanine ligase  43.43 
 
 
381 aa  197  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.303399 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0122  pantoate--beta-alanine ligase  42.6 
 
 
293 aa  197  1.0000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0223415  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4007  pantoate/beta-alanine ligase  42.64 
 
 
318 aa  197  1.0000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3932  pantoate--beta-alanine ligase  41.37 
 
 
283 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.341637  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0084  pantoate--beta-alanine ligase  44.14 
 
 
287 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.458072 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1829  pantoate--beta-alanine ligase  41.25 
 
 
283 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1525  pantoate-beta-alanine ligase  39.5 
 
 
283 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.102611  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4699  pantoate--beta-alanine ligase  42.8 
 
 
287 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.021644  hitchhiker  0.00466856 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_22955  predicted protein  39.93 
 
 
311 aa  196  3e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.271201  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4565  pantoate--beta-alanine ligase  42.42 
 
 
287 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0650903 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4743  pantoate--beta-alanine ligase  40.71 
 
 
291 aa  196  3e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.16561 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0426  pantoate--beta-alanine ligase  40.22 
 
 
283 aa  196  3e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03451  pantoate--beta-alanine ligase  42.44 
 
 
300 aa  196  4.0000000000000005e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4462  pantoate/beta-alanine ligase  41.22 
 
 
280 aa  196  4.0000000000000005e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5364  pantoate--beta-alanine ligase  44.4 
 
 
311 aa  195  6e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00859126 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2952  pantothenate synthase  40.65 
 
 
281 aa  195  7e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.215567  normal  0.0184604 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4282  pantoate/beta-alanine ligase  41.06 
 
 
539 aa  194  9e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2799  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  40.56 
 
 
528 aa  194  9e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0848  pantoate--beta-alanine ligase  42.2 
 
 
279 aa  194  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.889171  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4762  pantoate--beta-alanine ligase  43.56 
 
 
313 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4848  pantoate--beta-alanine ligase  43.56 
 
 
313 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0717789  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0804  pantoate--beta-alanine ligase  41.63 
 
 
268 aa  193  2e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0135127  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4812  pantoate--beta-alanine ligase  44.36 
 
 
286 aa  193  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257734  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5148  pantoate--beta-alanine ligase  43.56 
 
 
313 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0749  pantoate/beta-alanine ligase  38.73 
 
 
289 aa  194  2e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0722466  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0632  pantoate/beta-alanine ligase  42.59 
 
 
276 aa  193  3e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1239  pantoate--beta-alanine ligase  40.43 
 
 
279 aa  193  3e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000121643 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3803  pantoate--beta-alanine ligase  43.61 
 
 
281 aa  192  4e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0604878  hitchhiker  0.00446449 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>