More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1212 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_1212  pantoate--beta-alanine ligase  100 
 
 		 283 aa  580  1e-164  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0119566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0644  pantoate--beta-alanine ligase  89.75 
 
 		 283 aa  523  1e-147  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2387  pantoate--beta-alanine ligase  75.97 
 
 		 283 aa  464  9.999999999999999e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513339 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2196  pantoate--beta-alanine ligase  73.85 
 
 		 283 aa  449  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2600  pantoate--beta-alanine ligase  73.85 
 
 		 283 aa  449  1e-125  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.174782  normal  0.673257 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0668  pantoate--beta-alanine ligase  74.2 
 
 		 282 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2774  pantoate--beta-alanine ligase  75.62 
 
 		 280 aa  442  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.8833 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0848  pantoate--beta-alanine ligase  73.5 
 
 		 279 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.889171  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0701  pantoate--beta-alanine ligase  72.79 
 
 		 279 aa  433  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.307086  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2312  pantoate--beta-alanine ligase  72.79 
 
 		 279 aa  433  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0189212  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1204  pantoate--beta-alanine ligase  72.79 
 
 		 279 aa  433  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1043  pantoate--beta-alanine ligase  72.79 
 
 		 279 aa  433  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1049  pantoate--beta-alanine ligase  72.79 
 
 		 279 aa  433  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2975  pantoate--beta-alanine ligase  72.79 
 
 		 279 aa  433  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00455305  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1624  pantoate--beta-alanine ligase  72.79 
 
 		 279 aa  433  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00769335  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2197  pantoate--beta-alanine ligase  73.14 
 
 		 277 aa  430  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347128  normal  0.875229 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5773  pantoate--beta-alanine ligase  71.38 
 
 		 279 aa  424  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.417001  normal  0.370966 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0852  pantoate--beta-alanine ligase  71.02 
 
 		 279 aa  422  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2357  pantoate--beta-alanine ligase  71.73 
 
 		 279 aa  421  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.705598  normal  0.238844 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2489  pantoate--beta-alanine ligase  72.08 
 
 		 279 aa  423  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2447  pantoate--beta-alanine ligase  72.08 
 
 		 279 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.124687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1831  pantoate--beta-alanine ligase  72.08 
 
 		 279 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.686834  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2442  pantoate--beta-alanine ligase  72.08 
 
 		 279 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0290531  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3488  pantoate--beta-alanine ligase  71.73 
 
 		 277 aa  410  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.529268 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1010  pantoate--beta-alanine ligase  72.08 
 
 		 277 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3186  pantoate--beta-alanine ligase  62.68 
 
 		 274 aa  358  8e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.722916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1155  pantothenate synthetase  58.95 
 
 		 281 aa  345  6e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.914913 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4094  pantoate--beta-alanine ligase  61.48 
 
 		 283 aa  341  7e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1821  pantoate--beta-alanine ligase  59.23 
 
 		 283 aa  335  5.999999999999999e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0333652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3034  pantoate--beta-alanine ligase  57.34 
 
 		 282 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0933  pantoate--beta-alanine ligase  57.59 
 
 		 283 aa  322  5e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0878  pantoate--beta-alanine ligase  56.54 
 
 		 279 aa  321  7e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.3427  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0895  pantoate--beta-alanine ligase  56.79 
 
 		 282 aa  318  7e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.136564  normal  0.419976 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2767  pantoate--beta-alanine ligase  56.89 
 
 		 275 aa  315  6e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.1934  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1177  pantoate--beta-alanine ligase  53.63 
 
 		 286 aa  309  2.9999999999999997e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3853  pantoate--beta-alanine ligase  54.79 
 
 		 282 aa  297  1e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0029  pantoate--beta-alanine ligase  55.4 
 
 		 280 aa  296  2e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2054  pantoate--beta-alanine ligase  51.94 
 
 		 283 aa  295  7e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.183406 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2823  pantoate--beta-alanine ligase  56.62 
 
 		 290 aa  282  6.000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3500  pantoate--beta-alanine ligase  53.74 
 
 		 289 aa  279  3e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0596  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 		 278 aa  264  1e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.242968 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0733  pantoate--beta-alanine ligase  48.44 
 
 		 287 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.536898  hitchhiker  0.0000595497 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4565  pantoate--beta-alanine ligase  47.04 
 
 		 287 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650903 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4700  pantoate--beta-alanine ligase  47.57 
 
 		 287 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0174  pantoate--beta-alanine ligase  46.32 
 
 		 281 aa  239  4e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0198  pantoate--beta-alanine ligase  46.32 
 
 		 281 aa  239  4e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.795684  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3066  pantothenate synthetase  47.06 
 
 		 283 aa  238  6.999999999999999e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4313  pantoate--beta-alanine ligase  45.52 
 
 		 288 aa  238  1e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1061  pantoate--beta-alanine ligase  44.48 
 
 		 284 aa  236  4e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3593  pantoate--beta-alanine ligase  48.26 
 
 		 285 aa  235  7e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4699  pantoate--beta-alanine ligase  46.69 
 
 		 287 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.021644  hitchhiker  0.00466856 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1525  pantoate-beta-alanine ligase  44.44 
 
 		 283 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.102611  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0869  pantoate--beta-alanine ligase  47.86 
 
 		 281 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3904  pantoate--beta-alanine ligase  45.39 
 
 		 281 aa  232  4.0000000000000004e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3495  pantoate--beta-alanine ligase  47.14 
 
 		 281 aa  231  9e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3409  pantoate--beta-alanine ligase  49.08 
 
 		 281 aa  231  9e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.545812  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0960  pantoate--beta-alanine ligase  45.52 
 
 		 283 aa  231  1e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  44.98 
 
 		 283 aa  231  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00689  pantoate--beta-alanine ligase  45.67 
 
 		 280 aa  230  2e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.591476  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4812  pantoate--beta-alanine ligase  46.71 
 
 		 286 aa  230  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257734  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3803  pantoate--beta-alanine ligase  44.71 
 
 		 281 aa  230  2e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0604878  hitchhiker  0.00446449 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3281  pantoate--beta-alanine ligase  43.94 
 
 		 284 aa  229  4e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0867  pantoate--beta-alanine ligase  46.79 
 
 		 281 aa  229  5e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.712584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4783  pantoate--beta-alanine ligase  43.82 
 
 		 283 aa  228  6e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3564  pantoate--beta-alanine ligase  46.49 
 
 		 283 aa  228  6e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.358639  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3063  pantoate--beta-alanine ligase  47.48 
 
 		 283 aa  228  8e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.217741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3133  pantoate--beta-alanine ligase  46.43 
 
 		 281 aa  228  8e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0731299  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3932  pantoate--beta-alanine ligase  44.64 
 
 		 283 aa  228  9e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.341637  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1518  pantoate--beta-alanine ligase  47.19 
 
 		 279 aa  227  1e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.317394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2130  pantoate--beta-alanine ligase  43.86 
 
 		 286 aa  226  2e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000332887 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0879  pantoate--beta-alanine ligase  46.43 
 
 		 281 aa  227  2e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00646372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0725  pantoate--beta-alanine ligase  48.57 
 
 		 281 aa  226  2e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.278718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0844  pantoate--beta-alanine ligase  46.43 
 
 		 281 aa  227  2e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.126376  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42720  pantoate--beta-alanine ligase  44.29 
 
 		 283 aa  226  3e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3297  pantoate--beta-alanine ligase  48.57 
 
 		 281 aa  226  4e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.749755  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4981  pantoate/beta-alanine ligase  47.1 
 
 		 289 aa  226  4e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0199543  normal  0.96569 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2060  pantoate--beta-alanine ligase  47.02 
 
 		 291 aa  226  4e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.047141 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0775  pantoate--beta-alanine ligase  47.22 
 
 		 281 aa  224  9e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0886  cytidyltransferase-related  44.48 
 
 		 286 aa  223  2e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000710708  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4017  pantoate--beta-alanine ligase  44.1 
 
 		 282 aa  223  2e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.43915  normal  0.63382 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002560  pantoate--beta-alanine ligase  45.64 
 
 		 301 aa  223  3e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0445865  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0666  pantoate--beta-alanine ligase  44.83 
 
 		 282 aa  223  3e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232247  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0693  pantoate--beta-alanine ligase  44.01 
 
 		 283 aa  223  4e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.001104  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3426  pantoate/beta-alanine ligase  47.33 
 
 		 294 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0122  pantoate--beta-alanine ligase  45.64 
 
 		 293 aa  221  9.999999999999999e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0223415  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62590  pantoate--beta-alanine ligase  43.94 
 
 		 283 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2610  pantoate--beta-alanine ligase  44.86 
 
 		 298 aa  220  1.9999999999999999e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.205281  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03451  pantoate--beta-alanine ligase  45.14 
 
 		 300 aa  219  3e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3992  pantoate--beta-alanine ligase  44.29 
 
 		 284 aa  219  3e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1027  pantoate--beta-alanine ligase  46.44 
 
 		 284 aa  219  3e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2846  pantoate--beta-alanine ligase  45.45 
 
 		 289 aa  219  5e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03551  pantothenate synthetase  43.25 
 
 		 282 aa  219  6e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2884  pantothenate synthetase  45.77 
 
 		 296 aa  217  1e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.411032  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3175  pantoate--beta-alanine ligase  42.86 
 
 		 281 aa  217  1e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5447  pantoate--beta-alanine ligase  43.6 
 
 		 283 aa  217  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0426  pantoate--beta-alanine ligase  44.41 
 
 		 283 aa  217  2e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0126  pantoate--beta-alanine ligase  44.21 
 
 		 287 aa  216  2e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0426  pantoate--beta-alanine ligase  45.83 
 
 		 289 aa  217  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188172  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3134  pantoate--beta-alanine ligase  45.3 
 
 		 282 aa  216  2e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.504396  normal  0.398811 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3332  pantoate--beta-alanine ligase  41.46 
 
 		 311 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.475559  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>