More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1821 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1821  pantoate--beta-alanine ligase  100 
 
 		 283 aa  575  1.0000000000000001e-163  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0333652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3853  pantoate--beta-alanine ligase  74.48 
 
 		 282 aa  412  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2823  pantoate--beta-alanine ligase  73.63 
 
 		 290 aa  393  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0933  pantoate--beta-alanine ligase  69.12 
 
 		 283 aa  393  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0895  pantoate--beta-alanine ligase  67.96 
 
 		 282 aa  387  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.136564  normal  0.419976 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3500  pantoate--beta-alanine ligase  73.54 
 
 		 289 aa  390  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4094  pantoate--beta-alanine ligase  67.49 
 
 		 283 aa  382  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0029  pantoate--beta-alanine ligase  69.96 
 
 		 280 aa  382  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1177  pantoate--beta-alanine ligase  67.47 
 
 		 286 aa  370  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3034  pantoate--beta-alanine ligase  64.56 
 
 		 282 aa  359  2e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2387  pantoate--beta-alanine ligase  60.28 
 
 		 283 aa  347  9e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513339 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0644  pantoate--beta-alanine ligase  59.93 
 
 		 283 aa  339  4e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1155  pantothenate synthetase  60.76 
 
 		 281 aa  337  9.999999999999999e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.914913 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2196  pantoate--beta-alanine ligase  59.23 
 
 		 283 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2600  pantoate--beta-alanine ligase  59.23 
 
 		 283 aa  336  2.9999999999999997e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.174782  normal  0.673257 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1212  pantoate--beta-alanine ligase  59.23 
 
 		 283 aa  335  5.999999999999999e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0119566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2197  pantoate--beta-alanine ligase  60.42 
 
 		 277 aa  334  1e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347128  normal  0.875229 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1049  pantoate--beta-alanine ligase  59.01 
 
 		 279 aa  332  4e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0701  pantoate--beta-alanine ligase  59.01 
 
 		 279 aa  332  4e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.307086  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1204  pantoate--beta-alanine ligase  59.01 
 
 		 279 aa  332  4e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2312  pantoate--beta-alanine ligase  59.01 
 
 		 279 aa  332  4e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0189212  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1624  pantoate--beta-alanine ligase  59.01 
 
 		 279 aa  332  4e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00769335  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2975  pantoate--beta-alanine ligase  59.01 
 
 		 279 aa  332  4e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00455305  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1043  pantoate--beta-alanine ligase  59.01 
 
 		 279 aa  332  4e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0848  pantoate--beta-alanine ligase  58.66 
 
 		 279 aa  331  8e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.889171  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0668  pantoate--beta-alanine ligase  58.89 
 
 		 282 aa  330  2e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2774  pantoate--beta-alanine ligase  58.45 
 
 		 280 aa  328  6e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.8833 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1010  pantoate--beta-alanine ligase  60.78 
 
 		 277 aa  328  6e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2357  pantoate--beta-alanine ligase  57.24 
 
 		 279 aa  326  3e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.705598  normal  0.238844 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0852  pantoate--beta-alanine ligase  58.3 
 
 		 279 aa  326  3e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3488  pantoate--beta-alanine ligase  60.42 
 
 		 277 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.529268 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2489  pantoate--beta-alanine ligase  57.24 
 
 		 279 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3186  pantoate--beta-alanine ligase  59.01 
 
 		 274 aa  325  5e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.722916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5773  pantoate--beta-alanine ligase  57.75 
 
 		 279 aa  323  2e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.417001  normal  0.370966 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2447  pantoate--beta-alanine ligase  56.89 
 
 		 279 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.124687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1831  pantoate--beta-alanine ligase  56.89 
 
 		 279 aa  322  3e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.686834  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2442  pantoate--beta-alanine ligase  56.89 
 
 		 279 aa  322  3e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0290531  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0878  pantoate--beta-alanine ligase  54.42 
 
 		 279 aa  300  2e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.3427  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2767  pantoate--beta-alanine ligase  55.83 
 
 		 275 aa  291  8e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.1934  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2054  pantoate--beta-alanine ligase  54.96 
 
 		 283 aa  271  1e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.183406 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0596  pantoate--beta-alanine ligase  49.12 
 
 		 278 aa  255  6e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.242968 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3066  pantothenate synthetase  51.74 
 
 		 283 aa  238  6.999999999999999e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0198  pantoate--beta-alanine ligase  50.94 
 
 		 281 aa  237  2e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.795684  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4017  pantoate--beta-alanine ligase  45.45 
 
 		 282 aa  234  1.0000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.43915  normal  0.63382 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0174  pantoate--beta-alanine ligase  50.56 
 
 		 281 aa  233  2.0000000000000002e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1061  pantoate--beta-alanine ligase  45.36 
 
 		 284 aa  231  8.000000000000001e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4565  pantoate--beta-alanine ligase  47.55 
 
 		 287 aa  228  7e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650903 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4700  pantoate--beta-alanine ligase  47.9 
 
 		 287 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  48.62 
 
 		 283 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0733  pantoate--beta-alanine ligase  48.6 
 
 		 287 aa  226  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.536898  hitchhiker  0.0000595497 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4699  pantoate--beta-alanine ligase  47.9 
 
 		 287 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.021644  hitchhiker  0.00466856 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42720  pantoate--beta-alanine ligase  48.26 
 
 		 283 aa  224  1e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00689  pantoate--beta-alanine ligase  47.92 
 
 		 280 aa  222  4e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.591476  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0960  pantoate--beta-alanine ligase  47.42 
 
 		 283 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3593  pantoate--beta-alanine ligase  48.26 
 
 		 285 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0565  pantothenate synthetase  47.75 
 
 		 286 aa  219  3.9999999999999997e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.194299  hitchhiker  0.0000000964689 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1518  pantoate--beta-alanine ligase  49.06 
 
 		 279 aa  219  6e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.317394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4812  pantoate--beta-alanine ligase  45.83 
 
 		 286 aa  217  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257734  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03451  pantoate--beta-alanine ligase  45.83 
 
 		 300 aa  217  2e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3803  pantoate--beta-alanine ligase  46.69 
 
 		 281 aa  216  4e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0604878  hitchhiker  0.00446449 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002560  pantoate--beta-alanine ligase  45.99 
 
 		 301 aa  216  4e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0445865  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3063  pantoate--beta-alanine ligase  47.89 
 
 		 283 aa  215  7e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.217741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3495  pantoate--beta-alanine ligase  48.12 
 
 		 281 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0867  pantoate--beta-alanine ligase  48.12 
 
 		 281 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.712584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0879  pantoate--beta-alanine ligase  47.74 
 
 		 281 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00646372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4783  pantoate--beta-alanine ligase  47.04 
 
 		 283 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0725  pantoate--beta-alanine ligase  48.12 
 
 		 281 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.278718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62590  pantoate--beta-alanine ligase  46.15 
 
 		 283 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3281  pantoate--beta-alanine ligase  44.49 
 
 		 284 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0122  pantoate--beta-alanine ligase  45.3 
 
 		 293 aa  212  4.9999999999999996e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0223415  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0844  pantoate--beta-alanine ligase  47.37 
 
 		 281 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.126376  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0666  pantoate--beta-alanine ligase  44.14 
 
 		 282 aa  212  5.999999999999999e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232247  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1012  pantoate--beta-alanine ligase  48.3 
 
 		 284 aa  212  7e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0272809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5447  pantoate--beta-alanine ligase  46.15 
 
 		 283 aa  211  7e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3297  pantoate--beta-alanine ligase  47.74 
 
 		 281 aa  212  7e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.749755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0775  pantoate--beta-alanine ligase  50.38 
 
 		 281 aa  211  7e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0869  pantoate--beta-alanine ligase  49.25 
 
 		 281 aa  211  7.999999999999999e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3473  pantoate--beta-alanine ligase  49.62 
 
 		 284 aa  211  7.999999999999999e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.623251  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3344  pantoate--beta-alanine ligase  49.62 
 
 		 284 aa  211  7.999999999999999e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000501191  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1525  pantoate-beta-alanine ligase  43.94 
 
 		 283 aa  211  1e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.102611  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3564  pantoate--beta-alanine ligase  46.97 
 
 		 283 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.358639  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2315  pantoate--beta-alanine ligase  44.44 
 
 		 286 aa  210  2e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.303459  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3409  pantoate--beta-alanine ligase  48.12 
 
 		 281 aa  210  2e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.545812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3133  pantoate--beta-alanine ligase  48.5 
 
 		 281 aa  209  4e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0731299  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1027  pantoate--beta-alanine ligase  48.68 
 
 		 284 aa  209  5e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2610  pantoate--beta-alanine ligase  43.75 
 
 		 298 aa  207  1e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.205281  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3134  pantoate--beta-alanine ligase  50.38 
 
 		 282 aa  208  1e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.504396  normal  0.398811 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4313  pantoate--beta-alanine ligase  44.56 
 
 		 288 aa  207  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3904  pantoate--beta-alanine ligase  45.49 
 
 		 281 aa  207  2e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3992  pantoate--beta-alanine ligase  47.55 
 
 		 284 aa  207  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4981  pantoate/beta-alanine ligase  46.02 
 
 		 289 aa  206  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0199543  normal  0.96569 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4487  pantoate/beta-alanine ligase  48.88 
 
 		 287 aa  206  3e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0426  pantoate--beta-alanine ligase  44.06 
 
 		 289 aa  204  9e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188172  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0886  cytidyltransferase-related  43.21 
 
 		 286 aa  204  1e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000710708  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3149  pantoate--beta-alanine ligase  47.02 
 
 		 290 aa  204  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0693  pantoate--beta-alanine ligase  44.44 
 
 		 283 aa  203  2e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.001104  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0117  pantoate--beta-alanine ligase  44.88 
 
 		 288 aa  203  3e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2388  pantoate--beta-alanine ligase  45.98 
 
 		 283 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0472601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2791  pantoate--beta-alanine ligase  46.34 
 
 		 288 aa  203  3e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363963 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4542  pantoate--beta-alanine ligase  44.01 
 
 		 285 aa  202  7e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.246095  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>