More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2171 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2171  cytidylate kinase  100 
 
 		 224 aa  447  1e-125  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000313487  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0453  cytidylate kinase  80.36 
 
 		 224 aa  340  1e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1552  cytidylate kinase  68.64 
 
 		 225 aa  311  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1623  cytidylate kinase  68.18 
 
 		 225 aa  310  7.999999999999999e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000468562  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1420  cytidylate kinase  68.18 
 
 		 225 aa  310  9e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000147531  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3792  cytidylate kinase  68.18 
 
 		 225 aa  309  2e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157235  hitchhiker  0.0000757077 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1407  cytidylate kinase  68.49 
 
 		 225 aa  309  2e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000164884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1379  cytidylate kinase  68.18 
 
 		 225 aa  310  2e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000311756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1378  cytidylate kinase  68.18 
 
 		 225 aa  310  2e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000246043  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1659  cytidylate kinase  68.18 
 
 		 225 aa  310  2e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000228259  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1518  cytidylate kinase  68.49 
 
 		 225 aa  309  2e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000739284  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1591  cytidylate kinase  68.18 
 
 		 225 aa  310  2e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1931099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1220  cytidylate kinase  67.42 
 
 		 225 aa  304  6e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000130808  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1385  cytidylate kinase  59.26 
 
 		 227 aa  242  3e-63  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000116404  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1293  cytidylate kinase  54.75 
 
 		 224 aa  242  3.9999999999999997e-63  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00871161  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1090  cytidylate kinase  56.74 
 
 		 226 aa  239  2e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000570118  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1860  cytidylate kinase  55.4 
 
 		 220 aa  229  3e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.10096  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0891  cytidylate kinase  54.13 
 
 		 230 aa  227  1e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00236441  decreased coverage  0.00000000000000152921 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1331  cytidylate kinase  55.45 
 
 		 229 aa  226  2e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282811  decreased coverage  0.00883322 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1008  cytidylate kinase  51.83 
 
 		 219 aa  226  2e-58  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3387  cytidylate kinase  51.57 
 
 		 232 aa  225  4e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000123016  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1346  cytidylate kinase  51.61 
 
 		 219 aa  224  8e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0048747  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10390  cytidylate kinase  51.6 
 
 		 228 aa  221  4.9999999999999996e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000240582  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0712  cytidylate kinase  55.61 
 
 		 227 aa  221  7e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000327752  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1152  cytidylate kinase  57.28 
 
 		 222 aa  221  7e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1325  cytidylate kinase  53.74 
 
 		 226 aa  221  9e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0964  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  51.13 
 
 		 534 aa  214  5.9999999999999996e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1565  cytidylate kinase  50.46 
 
 		 219 aa  214  7e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.464485  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1534  cytidylate kinase  50.46 
 
 		 219 aa  214  7e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1045  cytidylate kinase  51.83 
 
 		 215 aa  211  1e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.117203  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1148  cytidylate kinase  53.59 
 
 		 218 aa  210  1e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1604  cytidylate kinase  52.29 
 
 		 221 aa  210  1e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2799  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  50.23 
 
 		 528 aa  209  2e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2147  cytidylate kinase  48.15 
 
 		 232 aa  209  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0902079  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17111  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  49.32 
 
 		 517 aa  207  8e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0762  cytidylate kinase  50.9 
 
 		 228 aa  207  1e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000614962  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1165  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  49.32 
 
 		 516 aa  206  2e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.841072  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4282  pantoate/beta-alanine ligase  50.46 
 
 		 539 aa  206  2e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20401  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  49.32 
 
 		 516 aa  206  3e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.523642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0416  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  46.9 
 
 		 480 aa  204  7e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130302  normal  0.171776 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1640  cytidylate kinase  44.84 
 
 		 231 aa  203  1e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.302898 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2816  cytidylate kinase  46.19 
 
 		 244 aa  203  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0539109  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2100  cytidylate kinase  49.32 
 
 		 229 aa  201  6e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.578851 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  50.45 
 
 		 527 aa  201  7e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22471  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  50.93 
 
 		 488 aa  201  8e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0993  cytidylate kinase  46.15 
 
 		 233 aa  200  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  48.58 
 
 		 511 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2605  cytidylate kinase  45.7 
 
 		 233 aa  199  3e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3221  cytidylate kinase  46.76 
 
 		 227 aa  199  3e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529092  normal  0.197926 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  48.58 
 
 		 511 aa  199  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1914  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  46.46 
 
 		 483 aa  198  5e-50  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.650764  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1351  cytidylate kinase  48.17 
 
 		 214 aa  198  7e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00022877  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2827  cytidylate kinase  46.98 
 
 		 223 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300632  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1884  cytidylate kinase  44.59 
 
 		 235 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000963447  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3643  cytidylate kinase  46.23 
 
 		 229 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000551434  normal  0.674927 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3257  cytidylate kinase  44.34 
 
 		 233 aa  195  4.0000000000000005e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0255416  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09660  cytidylate kinase  46.36 
 
 		 223 aa  195  4.0000000000000005e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1749  cytidylate kinase  45.75 
 
 		 229 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00238031  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1234  cytidylate kinase  46.82 
 
 		 255 aa  194  1e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17821  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  50.23 
 
 		 510 aa  193  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1465  cytidylate kinase  44.34 
 
 		 240 aa  193  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00293534  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2164  cytidylate kinase  44.91 
 
 		 232 aa  192  4e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00199731  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2450  cytidylate kinase  44.59 
 
 		 227 aa  192  5e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000180887  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1348  cytidylate kinase  46.12 
 
 		 233 aa  191  7e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000802306  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1409  cytidylate kinase  47.79 
 
 		 224 aa  191  8e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0393534  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3339  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  46.61 
 
 		 529 aa  191  9e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1291  cytidylate kinase  52.02 
 
 		 228 aa  191  9e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1180  cytidylate kinase  48.84 
 
 		 232 aa  191  1e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.848672  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0451  cytidylate kinase  47.39 
 
 		 231 aa  190  1e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.001027  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5340  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  47.69 
 
 		 526 aa  189  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3014  cytidylate kinase  43.95 
 
 		 228 aa  190  2e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000196489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1966  cytidylate kinase  44.95 
 
 		 229 aa  189  4e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23320  cytidylate kinase  46.23 
 
 		 229 aa  189  4e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000301501  normal  0.0247908 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1622  cytidylate kinase  48.86 
 
 		 217 aa  188  5.999999999999999e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1378  cytidylate kinase  44.04 
 
 		 228 aa  187  8e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.925348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17771  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  46.67 
 
 		 509 aa  187  8e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4073  cytidylate kinase  45.87 
 
 		 229 aa  187  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293328  normal  0.11895 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0865  cytidylate kinase  45.37 
 
 		 232 aa  187  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.054851  normal  0.903587 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0695  cytidylate kinase  43.66 
 
 		 223 aa  186  2e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0930  cytidylate kinase  43.6 
 
 		 234 aa  186  3e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2340  cytidylate kinase  44.91 
 
 		 229 aa  185  4e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000158492  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1771  cytidylate kinase  43.58 
 
 		 228 aa  185  5e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00506628  normal  0.0452484 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3943  cytidylate kinase  43.58 
 
 		 225 aa  185  6e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.302806  normal  0.232418 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1705  cytidylate kinase  49.07 
 
 		 234 aa  185  6e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000535126  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1682  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  48 
 
 		 510 aa  184  7e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2334  cytidylate kinase  44.5 
 
 		 226 aa  184  9e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000116453  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1362  cytidylate kinase  43.12 
 
 		 228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0105821  normal  0.0198977 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1429  cytidylate kinase  43.58 
 
 		 227 aa  183  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000204841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2943  cytidylate kinase  42.67 
 
 		 228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.142488 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2928  cytidylate kinase  42.67 
 
 		 228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2072  cytidylate kinase  42.47 
 
 		 230 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000270816  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2972  cytidylate kinase  42.67 
 
 		 228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2756  cytidylate kinase  46.85 
 
 		 230 aa  182  3e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1333  cytidylate kinase  46.54 
 
 		 252 aa  182  3e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.671241 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0544  cytidylate kinase  43.52 
 
 		 220 aa  182  3e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.773366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0725  cytidylate kinase  44.8 
 
 		 514 aa  182  4.0000000000000006e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0311607  normal  0.0975143 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2467  cytidylate kinase  42.4 
 
 		 225 aa  181  6e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000550284  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1542  cytidylate kinase  41.94 
 
 		 225 aa  181  6e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.624713  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3494  cytidylate kinase  47.56 
 
 		 228 aa  180  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.121252  normal  0.220697 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1013  cytidylate kinase  44.04 
 
 		 227 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0567176  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>