More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_09660 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_09660  cytidylate kinase  100 
 
 		 223 aa  439  9.999999999999999e-123  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1333  cytidylate kinase  69.72 
 
 		 252 aa  296  2e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.671241 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06850  cytidylate kinase  68.18 
 
 		 223 aa  273  1.0000000000000001e-72  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.734775  normal  0.308288 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10390  cytidylate kinase  48.34 
 
 		 228 aa  204  1e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000240582  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2140  cytidylate kinase  47.75 
 
 		 224 aa  203  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2171  cytidylate kinase  46.36 
 
 		 224 aa  195  4.0000000000000005e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000313487  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2943  cytidylate kinase  50.22 
 
 		 228 aa  192  3e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.142488 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2928  cytidylate kinase  50.22 
 
 		 228 aa  192  3e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2972  cytidylate kinase  50.22 
 
 		 228 aa  192  3e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11727  cytidylate kinase  49.78 
 
 		 230 aa  191  7e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.808416  normal  0.551451 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3387  cytidylate kinase  47.22 
 
 		 232 aa  191  9e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000123016  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2309  cytidylate kinase  50.67 
 
 		 237 aa  187  8e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.6369 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2799  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.39 
 
 		 528 aa  187  9e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1604  cytidylate kinase  44.44 
 
 		 221 aa  187  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3494  cytidylate kinase  50 
 
 		 228 aa  184  9e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.121252  normal  0.220697 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2439  cytidylate kinase  49.32 
 
 		 251 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2351  cytidylate kinase  49.32 
 
 		 251 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0725  cytidylate kinase  48.67 
 
 		 514 aa  183  2.0000000000000003e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0311607  normal  0.0975143 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23320  cytidylate kinase  46.73 
 
 		 229 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000301501  normal  0.0247908 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1966  cytidylate kinase  46.73 
 
 		 229 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1623  cytidylate kinase  42.59 
 
 		 225 aa  181  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000468562  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2467  cytidylate kinase  46.15 
 
 		 225 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000550284  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3257  cytidylate kinase  46.51 
 
 		 233 aa  181  6e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0255416  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1407  cytidylate kinase  42.59 
 
 		 225 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000164884  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2147  cytidylate kinase  45.28 
 
 		 232 aa  181  8.000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0902079  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1518  cytidylate kinase  42.59 
 
 		 225 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000739284  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1379  cytidylate kinase  42.59 
 
 		 225 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000311756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1378  cytidylate kinase  42.59 
 
 		 225 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000246043  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1465  cytidylate kinase  47.17 
 
 		 240 aa  181  9.000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00293534  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1591  cytidylate kinase  42.59 
 
 		 225 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1931099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1659  cytidylate kinase  42.59 
 
 		 225 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000228259  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0993  cytidylate kinase  46.98 
 
 		 233 aa  181  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2827  cytidylate kinase  47.98 
 
 		 223 aa  180  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300632  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1914  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  45.25 
 
 		 483 aa  179  2e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.650764  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0416  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  46.61 
 
 		 480 aa  180  2e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130302  normal  0.171776 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1515  cytidylate kinase  48.86 
 
 		 250 aa  179  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0453  cytidylate kinase  48.18 
 
 		 224 aa  179  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2380  cytidylate kinase  49.54 
 
 		 243 aa  179  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.042532  normal  0.287603 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0712  cytidylate kinase  43.78 
 
 		 227 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000327752  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1351  cytidylate kinase  40.72 
 
 		 214 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00022877  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2100  cytidylate kinase  41.74 
 
 		 229 aa  178  4e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.578851 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1705  cytidylate kinase  50 
 
 		 234 aa  179  4e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000535126  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1420  cytidylate kinase  42.13 
 
 		 225 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000147531  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2370  cytidylate kinase  48.62 
 
 		 230 aa  178  4.999999999999999e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2816  cytidylate kinase  48.87 
 
 		 244 aa  178  4.999999999999999e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0539109  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1152  cytidylate kinase  46.33 
 
 		 222 aa  177  8e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1552  cytidylate kinase  41.2 
 
 		 225 aa  176  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1220  cytidylate kinase  41.67 
 
 		 225 aa  176  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000130808  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22471  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  49.07 
 
 		 488 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5340  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  45.62 
 
 		 526 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0695  cytidylate kinase  40.93 
 
 		 223 aa  176  3e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  48.15 
 
 		 527 aa  176  3e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1429  cytidylate kinase  44.81 
 
 		 227 aa  176  3e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000204841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0964  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  45.7 
 
 		 534 aa  176  4e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1923  cytidylate kinase  44.13 
 
 		 230 aa  176  4e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000722421  unclonable  0.0000000000403388 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1976  cytidylate kinase  44.13 
 
 		 230 aa  175  4e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000166074  hitchhiker  0.00000000164919 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1093  cytidylate kinase  45.75 
 
 		 227 aa  175  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0104083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0986  cytidylate kinase  45.75 
 
 		 227 aa  175  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000706228  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1013  cytidylate kinase  45.75 
 
 		 227 aa  175  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0567176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1045  cytidylate kinase  45.75 
 
 		 227 aa  175  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.185526  normal  0.763998 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1078  cytidylate kinase  45.75 
 
 		 227 aa  175  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0687941 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2055  cytidylate kinase  44.13 
 
 		 230 aa  175  5e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000628627  unclonable  0.0000241467 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3792  cytidylate kinase  41.2 
 
 		 225 aa  175  5e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157235  hitchhiker  0.0000757077 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1456  cytidylate kinase  46.82 
 
 		 268 aa  175  6e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00727375 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1148  cytidylate kinase  45.83 
 
 		 218 aa  175  6e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00914  cytidylate kinase  45.28 
 
 		 227 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.42509  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2733  cytidylate kinase  45.28 
 
 		 227 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000397985  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2210  cytidylate kinase  45.28 
 
 		 227 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000277871  normal  0.370624 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1016  cytidylate kinase  45.28 
 
 		 227 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000287427  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2418  cytidylate kinase  45.28 
 
 		 227 aa  174  9.999999999999999e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000459306  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1007  cytidylate kinase  45.28 
 
 		 227 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000820305  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3339  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.34 
 
 		 529 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00921  hypothetical protein  45.28 
 
 		 227 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.411433  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2686  cytidylate kinase  45.28 
 
 		 227 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000200966  normal  0.762789 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1071  cytidylate kinase  45.28 
 
 		 227 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000134482  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2403  cytidylate kinase  43.19 
 
 		 230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0928  cytidylate kinase  43.26 
 
 		 226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497834  normal  0.452756 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1072  cytidylate kinase  43.26 
 
 		 226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000346962  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4282  pantoate/beta-alanine ligase  48.1 
 
 		 539 aa  173  1.9999999999999998e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1021  cytidylate kinase  43.84 
 
 		 216 aa  172  2.9999999999999996e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  47.44 
 
 		 511 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  47.44 
 
 		 511 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2450  cytidylate kinase  44.91 
 
 		 227 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000180887  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0977  cytidylate kinase  41.98 
 
 		 237 aa  172  3.9999999999999995e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000004631  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1884  cytidylate kinase  45.07 
 
 		 235 aa  172  5e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000963447  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2043  cytidylate kinase  42.92 
 
 		 230 aa  170  1e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000246913  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2069  cytidylate kinase  42.65 
 
 		 230 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000019021  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2280  cytidylate kinase  42.65 
 
 		 230 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000793863  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1752  cytidylate kinase  41.86 
 
 		 227 aa  171  1e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000925539  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2164  cytidylate kinase  44.39 
 
 		 232 aa  171  1e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00199731  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1234  cytidylate kinase  48.88 
 
 		 255 aa  170  1e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2397  cytidylate kinase  42.65 
 
 		 230 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000169082  unclonable  0.00000986897 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2065  cytidylate kinase  42.65 
 
 		 230 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000105966  unclonable  0.00000000000213103 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17111  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  40.09 
 
 		 517 aa  170  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1749  cytidylate kinase  43.98 
 
 		 229 aa  169  3e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00238031  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0865  cytidylate kinase  46.23 
 
 		 232 aa  169  3e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.054851  normal  0.903587 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0891  cytidylate kinase  43.58 
 
 		 230 aa  169  3e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00236441  decreased coverage  0.00000000000000152921 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1506  cytidylate kinase  44.34 
 
 		 229 aa  169  4e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000236579  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1708  cytidylate kinase  43.13 
 
 		 229 aa  169  4e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000112654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4073  cytidylate kinase  43.52 
 
 		 229 aa  169  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293328  normal  0.11895 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>