More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0865 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0865  cytidylate kinase  100 
 
 		 232 aa  463  1e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.054851  normal  0.903587 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2605  cytidylate kinase  76.44 
 
 		 233 aa  343  1e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1465  cytidylate kinase  72.65 
 
 		 240 aa  328  6e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00293534  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3257  cytidylate kinase  65.3 
 
 		 233 aa  297  1e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0255416  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0993  cytidylate kinase  63.47 
 
 		 233 aa  290  1e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2147  cytidylate kinase  60 
 
 		 232 aa  275  4e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0902079  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1884  cytidylate kinase  58.95 
 
 		 235 aa  272  3e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000963447  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1348  cytidylate kinase  60.45 
 
 		 233 aa  262  3e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000802306  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1982  cytidylate kinase  51.14 
 
 		 222 aa  215  4e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000405125  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0891  cytidylate kinase  44.1 
 
 		 230 aa  203  2e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00236441  decreased coverage  0.00000000000000152921 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  47.39 
 
 		 511 aa  202  3e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  47.39 
 
 		 511 aa  202  5e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1407  cytidylate kinase  44.13 
 
 		 225 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000164884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1379  cytidylate kinase  44.13 
 
 		 225 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000311756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1378  cytidylate kinase  44.13 
 
 		 225 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000246043  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1659  cytidylate kinase  44.13 
 
 		 225 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000228259  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1518  cytidylate kinase  44.13 
 
 		 225 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000739284  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1591  cytidylate kinase  44.13 
 
 		 225 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1931099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1220  cytidylate kinase  44.65 
 
 		 225 aa  198  5e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000130808  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1623  cytidylate kinase  44.66 
 
 		 225 aa  198  7e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000468562  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1420  cytidylate kinase  44.6 
 
 		 225 aa  198  7e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000147531  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1552  cytidylate kinase  45.15 
 
 		 225 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3792  cytidylate kinase  45.63 
 
 		 225 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157235  hitchhiker  0.0000757077 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1914  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  45.95 
 
 		 483 aa  196  2.0000000000000003e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.650764  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0712  cytidylate kinase  46.79 
 
 		 227 aa  196  3e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000327752  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1325  cytidylate kinase  47.57 
 
 		 226 aa  196  3e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2309  cytidylate kinase  50.67 
 
 		 237 aa  192  3e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.6369 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1622  cytidylate kinase  46.3 
 
 		 217 aa  192  4e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1148  cytidylate kinase  46.89 
 
 		 218 aa  191  6e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1515  cytidylate kinase  50.46 
 
 		 250 aa  190  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1008  cytidylate kinase  43.46 
 
 		 219 aa  190  1e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1640  cytidylate kinase  42.92 
 
 		 231 aa  189  2e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.302898 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  47 
 
 		 527 aa  190  2e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2351  cytidylate kinase  50 
 
 		 251 aa  189  2e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10390  cytidylate kinase  46.08 
 
 		 228 aa  190  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000240582  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0416  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.59 
 
 		 480 aa  189  2.9999999999999997e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130302  normal  0.171776 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1293  cytidylate kinase  45.54 
 
 		 224 aa  189  2.9999999999999997e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00871161  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1291  cytidylate kinase  50.22 
 
 		 228 aa  189  4e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1180  cytidylate kinase  46.51 
 
 		 232 aa  188  5e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.848672  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2439  cytidylate kinase  50 
 
 		 251 aa  188  5e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2171  cytidylate kinase  45.37 
 
 		 224 aa  187  1e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000313487  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1165  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  41.59 
 
 		 516 aa  186  2e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.841072  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0762  cytidylate kinase  43.24 
 
 		 228 aa  186  2e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000614962  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3387  cytidylate kinase  46.45 
 
 		 232 aa  186  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000123016  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2799  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  43.87 
 
 		 528 aa  186  2e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3339  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  43.35 
 
 		 529 aa  186  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2380  cytidylate kinase  50.45 
 
 		 243 aa  186  3e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.042532  normal  0.287603 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2450  cytidylate kinase  42.45 
 
 		 227 aa  185  5e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000180887  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5340  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.34 
 
 		 526 aa  185  5e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20401  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  41.33 
 
 		 516 aa  185  5e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.523642  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1749  cytidylate kinase  44.19 
 
 		 229 aa  181  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00238031  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22471  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  45 
 
 		 488 aa  181  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3643  cytidylate kinase  43.72 
 
 		 229 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000551434  normal  0.674927 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1333  cytidylate kinase  49.53 
 
 		 252 aa  178  5.999999999999999e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.671241 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17111  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  40.91 
 
 		 517 aa  178  5.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2690  cytidylate kinase  44.04 
 
 		 218 aa  178  5.999999999999999e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495966  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2756  cytidylate kinase  43.64 
 
 		 230 aa  177  9e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1335  cytidylate kinase  41.82 
 
 		 220 aa  177  1e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.059192  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2100  cytidylate kinase  44.88 
 
 		 229 aa  177  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.578851 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1190  cytidylate kinase  41.63 
 
 		 225 aa  177  1e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.988165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1152  cytidylate kinase  45.63 
 
 		 222 aa  176  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0780  cytidylate kinase  45.29 
 
 		 223 aa  175  4e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0405191  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4073  cytidylate kinase  44.02 
 
 		 229 aa  175  5e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293328  normal  0.11895 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0964  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  45.07 
 
 		 534 aa  174  7e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0725  cytidylate kinase  43.58 
 
 		 514 aa  174  8e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0311607  normal  0.0975143 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0977  cytidylate kinase  43.33 
 
 		 237 aa  174  9e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000004631  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4282  pantoate/beta-alanine ligase  44.19 
 
 		 539 aa  174  9.999999999999999e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1331  cytidylate kinase  46.15 
 
 		 229 aa  174  9.999999999999999e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282811  decreased coverage  0.00883322 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23320  cytidylate kinase  43.44 
 
 		 229 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000301501  normal  0.0247908 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1409  cytidylate kinase  40.65 
 
 		 224 aa  174  1.9999999999999998e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0393534  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1351  cytidylate kinase  40.91 
 
 		 220 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0401638  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10343  putative cytidylate kinase  40.71 
 
 		 232 aa  172  2.9999999999999996e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1966  cytidylate kinase  42.99 
 
 		 229 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2065  cytidylate kinase  40.89 
 
 		 230 aa  172  5e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000105966  unclonable  0.00000000000213103 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2069  cytidylate kinase  40.89 
 
 		 230 aa  172  5e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000019021  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2397  cytidylate kinase  40.89 
 
 		 230 aa  172  5e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000169082  unclonable  0.00000986897 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2280  cytidylate kinase  40.89 
 
 		 230 aa  172  5e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000793863  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1362  cytidylate kinase  42.79 
 
 		 228 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0105821  normal  0.0198977 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1853  cytidylate kinase  42.13 
 
 		 221 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0179513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0453  cytidylate kinase  45.7 
 
 		 224 aa  171  6.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2002  cytidylate kinase  43.52 
 
 		 225 aa  171  9e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0311014  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1729  cytidylate kinase  42.44 
 
 		 223 aa  171  9e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1771  cytidylate kinase  42.33 
 
 		 228 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00506628  normal  0.0452484 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1734  cytidylate kinase  43.52 
 
 		 225 aa  170  1e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000603603  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1708  cytidylate kinase  43.56 
 
 		 229 aa  171  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000112654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1429  cytidylate kinase  43.32 
 
 		 227 aa  170  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000204841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2299  cytidylate kinase  40 
 
 		 230 aa  171  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000399193  unclonable  0.0000000000955893 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1604  cytidylate kinase  39.53 
 
 		 221 aa  171  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2467  cytidylate kinase  42.03 
 
 		 225 aa  171  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000550284  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06850  cytidylate kinase  49.29 
 
 		 223 aa  170  2e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.734775  normal  0.308288 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0695  cytidylate kinase  38.07 
 
 		 223 aa  170  2e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1378  cytidylate kinase  42.33 
 
 		 228 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.925348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3943  cytidylate kinase  43.06 
 
 		 225 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.302806  normal  0.232418 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00914  cytidylate kinase  43.78 
 
 		 227 aa  169  3e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.42509  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2733  cytidylate kinase  43.78 
 
 		 227 aa  169  3e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000397985  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1016  cytidylate kinase  43.78 
 
 		 227 aa  169  3e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000287427  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1071  cytidylate kinase  43.78 
 
 		 227 aa  169  3e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000134482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2686  cytidylate kinase  43.78 
 
 		 227 aa  169  3e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000200966  normal  0.762789 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09660  cytidylate kinase  46.23 
 
 		 223 aa  169  3e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1007  cytidylate kinase  43.78 
 
 		 227 aa  169  3e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000820305  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>