More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1165 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1165  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  100 
 
 
516 aa  1053    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.841072  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20401  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  98.06 
 
 
516 aa  1036    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.523642  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17111  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  58.24 
 
 
517 aa  626  1e-178  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22471  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  54.71 
 
 
488 aa  576  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1914  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  49.08 
 
 
483 aa  515  1.0000000000000001e-145  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.650764  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0416  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  50.1 
 
 
480 aa  490  1e-137  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130302  normal  0.171776 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17771  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  49.12 
 
 
509 aa  480  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17821  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  48.53 
 
 
510 aa  467  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1682  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  48.92 
 
 
510 aa  464  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17991  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  49.31 
 
 
509 aa  453  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0964  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  45.35 
 
 
534 aa  444  1e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955795  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5340  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  46.78 
 
 
526 aa  443  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  43.16 
 
 
527 aa  439  9.999999999999999e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  45.49 
 
 
511 aa  435  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  45.49 
 
 
511 aa  436  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4282  pantoate/beta-alanine ligase  44.71 
 
 
539 aa  432  1e-120  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3339  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  41.11 
 
 
529 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2799  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  43.57 
 
 
528 aa  420  1e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1623  cytidylate kinase  47.51 
 
 
225 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000468562  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1659  cytidylate kinase  47.51 
 
 
225 aa  216  9e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000228259  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1379  cytidylate kinase  47.51 
 
 
225 aa  216  9e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000311756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1378  cytidylate kinase  47.51 
 
 
225 aa  216  9e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000246043  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1591  cytidylate kinase  47.51 
 
 
225 aa  216  9e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1931099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1407  cytidylate kinase  47.51 
 
 
225 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000164884  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1518  cytidylate kinase  47.51 
 
 
225 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000739284  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1220  cytidylate kinase  47.27 
 
 
225 aa  213  7e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000130808  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1420  cytidylate kinase  47.06 
 
 
225 aa  211  4e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000147531  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1552  cytidylate kinase  46.61 
 
 
225 aa  210  4e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3792  cytidylate kinase  46.15 
 
 
225 aa  209  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157235  hitchhiker  0.0000757077 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2171  cytidylate kinase  49.32 
 
 
224 aa  206  1e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000313487  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  37.54 
 
 
283 aa  204  4e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3460  pantoate--beta-alanine ligase  37.06 
 
 
276 aa  204  5e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1640  cytidylate kinase  45 
 
 
231 aa  202  9.999999999999999e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.302898 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1325  cytidylate kinase  46.19 
 
 
226 aa  201  3e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0155  pantoate--beta-alanine ligase  38.43 
 
 
282 aa  197  3e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243441  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1293  cytidylate kinase  47.03 
 
 
224 aa  197  5.000000000000001e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00871161  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1706  pantoate--beta-alanine ligase  39.92 
 
 
283 aa  196  7e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260086  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1524  pantoate--beta-alanine ligase  40.07 
 
 
280 aa  196  1e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_708  pantothenate synthetase  39.01 
 
 
277 aa  196  1e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3387  cytidylate kinase  44.89 
 
 
232 aa  196  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000123016  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62590  pantoate--beta-alanine ligase  39 
 
 
283 aa  195  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1266  pantoate/beta-alanine ligase  36.52 
 
 
289 aa  195  1e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03551  pantothenate synthetase  38.7 
 
 
282 aa  195  2e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5447  pantoate--beta-alanine ligase  39 
 
 
283 aa  195  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2054  pantoate--beta-alanine ligase  36.92 
 
 
283 aa  194  3e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.183406 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3011  pantoate--beta-alanine ligase  37.72 
 
 
279 aa  194  3e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0891  cytidylate kinase  45.13 
 
 
230 aa  194  3e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00236441  decreased coverage  0.00000000000000152921 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0901  pantoate--beta-alanine ligase  37.19 
 
 
281 aa  194  3e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163902  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4723  pantoate--beta-alanine ligase  37.23 
 
 
309 aa  194  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2147  cytidylate kinase  40.89 
 
 
232 aa  194  4e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0902079  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3593  pantoate--beta-alanine ligase  37.5 
 
 
285 aa  194  4e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0762  cytidylate kinase  47.22 
 
 
228 aa  194  5e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000614962  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1786  pantoate/beta-alanine ligase  38.08 
 
 
281 aa  193  5e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.300346  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1498  pantoate--beta-alanine ligase  36.86 
 
 
281 aa  192  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00126611  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1239  pantoate--beta-alanine ligase  38.08 
 
 
279 aa  192  1e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000121643 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0042  pantoate--beta-alanine ligase  36.82 
 
 
273 aa  192  2e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000112642  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1829  pantoate--beta-alanine ligase  36.16 
 
 
283 aa  191  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2079  pantoate--beta-alanine ligase  39.16 
 
 
282 aa  192  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0111678  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3535  pantoate--beta-alanine ligase  37.72 
 
 
284 aa  191  2e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000260902  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0666  pantoate--beta-alanine ligase  38.32 
 
 
282 aa  191  2.9999999999999997e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232247  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0733  pantoate--beta-alanine ligase  35.79 
 
 
287 aa  190  4e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.536898  hitchhiker  0.0000595497 
 
 
-
 
NC_004310  BR0329  pantoate--beta-alanine ligase  38.1 
 
 
293 aa  190  5e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384164  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4812  pantoate--beta-alanine ligase  38.72 
 
 
286 aa  190  5e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257734  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0346  pantoate--beta-alanine ligase  37.88 
 
 
293 aa  190  5.999999999999999e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.900978  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0426  pantoate--beta-alanine ligase  37.5 
 
 
289 aa  189  8e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188172  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2846  pantoate--beta-alanine ligase  36.52 
 
 
289 aa  189  9e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2605  cytidylate kinase  41.96 
 
 
233 aa  189  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1643  pantoate--beta-alanine ligase  37.89 
 
 
283 aa  189  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.966928  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10390  cytidylate kinase  44.29 
 
 
228 aa  189  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000240582  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1667  pantoate--beta-alanine ligase  37.06 
 
 
280 aa  189  1e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0161  pantoate--beta-alanine ligase  37.19 
 
 
281 aa  189  1e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.253183  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0464  pantoate/beta-alanine ligase  37.01 
 
 
281 aa  189  1e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1740  pantoate--beta-alanine ligase  37.06 
 
 
280 aa  188  2e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0804  pantoate--beta-alanine ligase  40.61 
 
 
268 aa  188  2e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0135127  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4700  pantoate--beta-alanine ligase  35.79 
 
 
287 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  38.55 
 
 
283 aa  188  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0958  pantoate--beta-alanine ligase  38.38 
 
 
283 aa  188  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4699  pantoate--beta-alanine ligase  35.79 
 
 
287 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.021644  hitchhiker  0.00466856 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0728  pantoate--beta-alanine ligase  37.23 
 
 
277 aa  188  2e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.41941  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4565  pantoate--beta-alanine ligase  35.42 
 
 
287 aa  188  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0650903 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1180  cytidylate kinase  45.62 
 
 
232 aa  187  3e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.848672  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1876  pantoate/beta-alanine ligase  37.28 
 
 
288 aa  187  3e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3003  pantoate--beta-alanine ligase  38.85 
 
 
279 aa  187  3e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0849834 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1346  cytidylate kinase  42.13 
 
 
219 aa  187  3e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0048747  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  39.22 
 
 
282 aa  187  3e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42720  pantoate--beta-alanine ligase  38.11 
 
 
283 aa  187  5e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4683  pantoate--beta-alanine ligase  36.59 
 
 
300 aa  187  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0453  cytidylate kinase  45.33 
 
 
224 aa  186  6e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4487  pantoate/beta-alanine ligase  36.24 
 
 
287 aa  187  6e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0865  cytidylate kinase  41.59 
 
 
232 aa  186  8e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.054851  normal  0.903587 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2117  pantoate--beta-alanine ligase  37.31 
 
 
282 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1571  pantoate--beta-alanine ligase  37.76 
 
 
280 aa  186  1.0000000000000001e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3066  pantothenate synthetase  36.96 
 
 
283 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2942  pantoate--beta-alanine ligase  36.43 
 
 
283 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.17212 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1610  pantoate--beta-alanine ligase  40.08 
 
 
280 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.228935  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2891  pantoate/beta-alanine ligase  36.59 
 
 
290 aa  185  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.150324  normal  0.438724 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0830  pantoate/beta-alanine ligase  40.38 
 
 
279 aa  185  2.0000000000000003e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0102  pantoate--beta-alanine ligase  36.52 
 
 
282 aa  185  2.0000000000000003e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.346263  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1348  cytidylate kinase  42.29 
 
 
233 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000802306  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2060  pantoate--beta-alanine ligase  37.63 
 
 
291 aa  184  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.047141 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>