More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1348 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1348  cytidylate kinase  100 
 
 		 233 aa  462  1e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000802306  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2147  cytidylate kinase  59.74 
 
 		 232 aa  274  8e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0902079  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1465  cytidylate kinase  59.48 
 
 		 240 aa  267  1e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00293534  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0865  cytidylate kinase  60.45 
 
 		 232 aa  262  3e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.054851  normal  0.903587 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0993  cytidylate kinase  57.59 
 
 		 233 aa  258  6e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3257  cytidylate kinase  55.8 
 
 		 233 aa  258  7e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0255416  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2605  cytidylate kinase  60 
 
 		 233 aa  258  8e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1884  cytidylate kinase  53.42 
 
 		 235 aa  226  2e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000963447  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2450  cytidylate kinase  47.66 
 
 		 227 aa  200  9.999999999999999e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000180887  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0712  cytidylate kinase  44.1 
 
 		 227 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000327752  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2380  cytidylate kinase  50 
 
 		 243 aa  192  4e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.042532  normal  0.287603 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2171  cytidylate kinase  46.12 
 
 		 224 aa  191  7e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000313487  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1325  cytidylate kinase  44.29 
 
 		 226 aa  190  1e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  45.98 
 
 		 511 aa  189  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  45.98 
 
 		 511 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1291  cytidylate kinase  49.78 
 
 		 228 aa  188  7e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1293  cytidylate kinase  43.06 
 
 		 224 aa  187  9e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00871161  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2351  cytidylate kinase  48.4 
 
 		 251 aa  186  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2100  cytidylate kinase  46.15 
 
 		 229 aa  185  4e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.578851 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2439  cytidylate kinase  48.4 
 
 		 251 aa  185  5e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0891  cytidylate kinase  41.2 
 
 		 230 aa  185  5e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00236441  decreased coverage  0.00000000000000152921 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1165  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  42.29 
 
 		 516 aa  185  6e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.841072  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20401  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  42.29 
 
 		 516 aa  184  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.523642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1515  cytidylate kinase  47.95 
 
 		 250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10390  cytidylate kinase  42.86 
 
 		 228 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000240582  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1640  cytidylate kinase  42.47 
 
 		 231 aa  183  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.302898 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1749  cytidylate kinase  45.93 
 
 		 229 aa  182  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00238031  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1351  cytidylate kinase  41.28 
 
 		 214 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00022877  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1331  cytidylate kinase  46.98 
 
 		 229 aa  182  4.0000000000000006e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282811  decreased coverage  0.00883322 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1622  cytidylate kinase  41.67 
 
 		 217 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2690  cytidylate kinase  39.45 
 
 		 218 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495966  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3221  cytidylate kinase  44.09 
 
 		 227 aa  181  7e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529092  normal  0.197926 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0416  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  47.47 
 
 		 480 aa  181  8.000000000000001e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130302  normal  0.171776 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1914  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  48 
 
 		 483 aa  181  9.000000000000001e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.650764  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1148  cytidylate kinase  46.41 
 
 		 218 aa  181  1e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17111  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  42.67 
 
 		 517 aa  180  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2309  cytidylate kinase  48.88 
 
 		 237 aa  180  2e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.6369 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06850  cytidylate kinase  49.32 
 
 		 223 aa  180  2e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.734775  normal  0.308288 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3643  cytidylate kinase  45.45 
 
 		 229 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000551434  normal  0.674927 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1220  cytidylate kinase  40.47 
 
 		 225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000130808  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0695  cytidylate kinase  39.63 
 
 		 223 aa  179  2.9999999999999997e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1008  cytidylate kinase  41.12 
 
 		 219 aa  179  2.9999999999999997e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1623  cytidylate kinase  40.38 
 
 		 225 aa  179  4e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000468562  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2816  cytidylate kinase  44.5 
 
 		 244 aa  179  4e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0539109  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2756  cytidylate kinase  41.74 
 
 		 230 aa  178  5.999999999999999e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1379  cytidylate kinase  41.26 
 
 		 225 aa  178  7e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000311756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1378  cytidylate kinase  41.26 
 
 		 225 aa  178  7e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000246043  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1659  cytidylate kinase  41.26 
 
 		 225 aa  178  7e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000228259  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1591  cytidylate kinase  41.26 
 
 		 225 aa  178  7e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1931099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1407  cytidylate kinase  41.26 
 
 		 225 aa  178  8e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000164884  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1518  cytidylate kinase  41.26 
 
 		 225 aa  178  8e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000739284  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1552  cytidylate kinase  39.91 
 
 		 225 aa  177  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2117  cytidylate kinase  44.24 
 
 		 225 aa  177  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000190032  unclonable  0.00000899897 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1982  cytidylate kinase  44.75 
 
 		 222 aa  177  1e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000405125  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4073  cytidylate kinase  45.45 
 
 		 229 aa  176  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293328  normal  0.11895 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1190  cytidylate kinase  42.44 
 
 		 225 aa  176  3e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.988165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3339  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.3 
 
 		 529 aa  176  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1966  cytidylate kinase  45.66 
 
 		 229 aa  175  6e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5340  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  41.78 
 
 		 526 aa  175  7e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2069  cytidylate kinase  41.89 
 
 		 230 aa  174  9e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000019021  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2280  cytidylate kinase  41.89 
 
 		 230 aa  174  9e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000793863  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2065  cytidylate kinase  41.89 
 
 		 230 aa  174  9e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000105966  unclonable  0.00000000000213103 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2397  cytidylate kinase  41.89 
 
 		 230 aa  174  9e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000169082  unclonable  0.00000986897 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23320  cytidylate kinase  46.7 
 
 		 229 aa  174  9e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000301501  normal  0.0247908 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3792  cytidylate kinase  39.44 
 
 		 225 aa  174  9e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157235  hitchhiker  0.0000757077 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1152  cytidylate kinase  45.12 
 
 		 222 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22471  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  47.73 
 
 		 488 aa  174  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0780  cytidylate kinase  44.14 
 
 		 223 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0405191  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0725  cytidylate kinase  42.15 
 
 		 514 aa  174  9.999999999999999e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0311607  normal  0.0975143 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1923  cytidylate kinase  41.89 
 
 		 230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000722421  unclonable  0.0000000000403388 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2055  cytidylate kinase  41.89 
 
 		 230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000628627  unclonable  0.0000241467 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1976  cytidylate kinase  41.89 
 
 		 230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000166074  hitchhiker  0.00000000164919 
 
 
-
 
NC_002950  PG0603  cytidylate kinase  42.86 
 
 		 231 aa  172  2.9999999999999996e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.794292 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1542  cytidylate kinase  45.19 
 
 		 225 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.624713  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2799  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  41.59 
 
 		 528 aa  172  5e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1335  cytidylate kinase  42.01 
 
 		 220 aa  171  6.999999999999999e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.059192  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1771  cytidylate kinase  42.01 
 
 		 228 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00506628  normal  0.0452484 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1420  cytidylate kinase  38.97 
 
 		 225 aa  171  7.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000147531  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1409  cytidylate kinase  39.19 
 
 		 224 aa  171  7.999999999999999e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0393534  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  47.49 
 
 		 527 aa  171  7.999999999999999e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1362  cytidylate kinase  42.47 
 
 		 228 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0105821  normal  0.0198977 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1645  cytidylate kinase  41.31 
 
 		 225 aa  171  9e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.170178 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0762  cytidylate kinase  42.27 
 
 		 228 aa  171  1e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000614962  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3943  cytidylate kinase  42.01 
 
 		 225 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.302806  normal  0.232418 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2219  cytidylate kinase  41.47 
 
 		 224 aa  169  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000392774  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2403  cytidylate kinase  40.54 
 
 		 230 aa  170  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0348  cytidylate kinase  45.58 
 
 		 237 aa  169  3e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000112286  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2334  cytidylate kinase  43.58 
 
 		 226 aa  169  3e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000116453  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2299  cytidylate kinase  40.09 
 
 		 230 aa  169  3e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000399193  unclonable  0.0000000000955893 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2043  cytidylate kinase  40.99 
 
 		 230 aa  169  4e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000246913  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1604  cytidylate kinase  41.4 
 
 		 221 aa  169  4e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1180  cytidylate kinase  45.12 
 
 		 232 aa  169  4e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.848672  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1346  cytidylate kinase  37.79 
 
 		 219 aa  168  6e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0048747  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09660  cytidylate kinase  47.64 
 
 		 223 aa  168  8e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14810  cytidylate kinase  43.86 
 
 		 269 aa  168  8e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0934  cytidylate kinase  38.01 
 
 		 213 aa  167  9e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1378  cytidylate kinase  41.41 
 
 		 228 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.925348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2795  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  46.41 
 
 		 667 aa  167  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233138 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0930  cytidylate kinase  42.6 
 
 		 234 aa  167  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1351  cytidylate kinase  41.1 
 
 		 220 aa  167  1e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0401638  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>