More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1335 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1335  cytidylate kinase  100 
 
 		 220 aa  444  1.0000000000000001e-124  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.059192  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1351  cytidylate kinase  96.82 
 
 		 220 aa  432  1e-120  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0401638  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1622  cytidylate kinase  54.84 
 
 		 217 aa  236  1e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1232  cytidylate kinase  49.31 
 
 		 219 aa  220  9.999999999999999e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1620  cytidylate kinase  47.2 
 
 		 226 aa  201  8e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.433409  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1325  cytidylate kinase  46.01 
 
 		 226 aa  194  1e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2690  cytidylate kinase  46.01 
 
 		 218 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495966  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1148  cytidylate kinase  47.25 
 
 		 218 aa  184  8e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2605  cytidylate kinase  44.09 
 
 		 233 aa  184  9e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3387  cytidylate kinase  43.89 
 
 		 232 aa  179  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000123016  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1165  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  43.18 
 
 		 516 aa  179  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.841072  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0695  cytidylate kinase  43.6 
 
 		 223 aa  177  8e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20401  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  43.18 
 
 		 516 aa  177  1e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.523642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0865  cytidylate kinase  41.82 
 
 		 232 aa  177  1e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.054851  normal  0.903587 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1351  cytidylate kinase  43.13 
 
 		 214 aa  176  2e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00022877  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1623  cytidylate kinase  42.99 
 
 		 225 aa  176  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000468562  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10390  cytidylate kinase  42.53 
 
 		 228 aa  175  4e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000240582  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1659  cytidylate kinase  42.99 
 
 		 225 aa  175  5e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000228259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1407  cytidylate kinase  42.99 
 
 		 225 aa  175  5e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000164884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1379  cytidylate kinase  42.99 
 
 		 225 aa  175  5e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000311756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1378  cytidylate kinase  42.99 
 
 		 225 aa  175  5e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000246043  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1591  cytidylate kinase  42.99 
 
 		 225 aa  175  5e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1931099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1518  cytidylate kinase  42.99 
 
 		 225 aa  175  5e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000739284  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2117  cytidylate kinase  41.94 
 
 		 225 aa  175  6e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000190032  unclonable  0.00000899897 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1220  cytidylate kinase  41.55 
 
 		 225 aa  174  9e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000130808  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1180  cytidylate kinase  42.99 
 
 		 232 aa  173  1.9999999999999998e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.848672  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1640  cytidylate kinase  44.09 
 
 		 231 aa  173  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.302898 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2450  cytidylate kinase  41.28 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000180887  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1293  cytidylate kinase  40.55 
 
 		 224 aa  172  2.9999999999999996e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00871161  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2171  cytidylate kinase  44.09 
 
 		 224 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000313487  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1348  cytidylate kinase  42.01 
 
 		 233 aa  171  5.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000802306  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2140  cytidylate kinase  41.44 
 
 		 224 aa  171  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1465  cytidylate kinase  41.89 
 
 		 240 aa  170  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00293534  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0712  cytidylate kinase  40.18 
 
 		 227 aa  169  2e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000327752  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0993  cytidylate kinase  41.18 
 
 		 233 aa  169  3e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1021  cytidylate kinase  40.19 
 
 		 216 aa  169  3e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1604  cytidylate kinase  41.2 
 
 		 221 aa  169  4e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1884  cytidylate kinase  41.01 
 
 		 235 aa  169  4e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000963447  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1008  cytidylate kinase  39.27 
 
 		 219 aa  168  5e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2147  cytidylate kinase  39.73 
 
 		 232 aa  168  5e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0902079  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3257  cytidylate kinase  41.18 
 
 		 233 aa  168  6e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0255416  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0331  cytidylate kinase  41.2 
 
 		 227 aa  168  6e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1552  cytidylate kinase  41.59 
 
 		 225 aa  168  7e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0780  cytidylate kinase  43.32 
 
 		 223 aa  167  8e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0405191  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1853  cytidylate kinase  39.91 
 
 		 221 aa  167  9e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0179513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2100  cytidylate kinase  43.52 
 
 		 229 aa  167  9e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.578851 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1420  cytidylate kinase  41.2 
 
 		 225 aa  166  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000147531  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0762  cytidylate kinase  40 
 
 		 228 aa  166  2.9999999999999998e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000614962  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3792  cytidylate kinase  40.65 
 
 		 225 aa  165  4e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157235  hitchhiker  0.0000757077 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0891  cytidylate kinase  36.53 
 
 		 230 aa  165  4e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00236441  decreased coverage  0.00000000000000152921 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1729  cytidylate kinase  40.81 
 
 		 223 aa  166  4e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1291  cytidylate kinase  45.05 
 
 		 228 aa  164  6.9999999999999995e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1645  cytidylate kinase  38.32 
 
 		 225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.170178 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0179  cytidylate kinase  37.96 
 
 		 227 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000847233  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1409  cytidylate kinase  40.99 
 
 		 224 aa  162  4.0000000000000004e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0393534  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1331  cytidylate kinase  43.58 
 
 		 229 aa  162  5.0000000000000005e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282811  decreased coverage  0.00883322 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  41.31 
 
 		 511 aa  161  6e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  41.31 
 
 		 511 aa  161  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  42.53 
 
 		 527 aa  161  9e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3284  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  40.19 
 
 		 679 aa  161  9e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.185076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0934  cytidylate kinase  40.95 
 
 		 213 aa  160  1e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1542  cytidylate kinase  40.37 
 
 		 225 aa  160  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.624713  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1045  cytidylate kinase  40.65 
 
 		 215 aa  159  2e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.117203  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0564  cytidylate kinase  37.16 
 
 		 227 aa  160  2e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1749  cytidylate kinase  41.31 
 
 		 229 aa  159  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00238031  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2380  cytidylate kinase  41.94 
 
 		 243 aa  159  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.042532  normal  0.287603 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1090  cytidylate kinase  41.31 
 
 		 226 aa  159  4e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000570118  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3643  cytidylate kinase  41.78 
 
 		 229 aa  158  5e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000551434  normal  0.674927 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2799  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  41.4 
 
 		 528 aa  158  5e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2219  cytidylate kinase  38.99 
 
 		 224 aa  158  5e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000392774  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003019  cytidylate kinase  38.07 
 
 		 226 aa  158  6e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000338917  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00890  cytidylate kinase  38.53 
 
 		 227 aa  158  7e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.007598  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23320  cytidylate kinase  40.19 
 
 		 229 aa  157  9e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000301501  normal  0.0247908 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1982  cytidylate kinase  38.53 
 
 		 222 aa  156  2e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000405125  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1966  cytidylate kinase  40.38 
 
 		 229 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1152  cytidylate kinase  43.19 
 
 		 222 aa  155  3e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1005  cytidylate kinase  41.59 
 
 		 228 aa  154  7e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0567  cytidylate kinase  41.59 
 
 		 228 aa  154  7e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1615  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  37.38 
 
 		 670 aa  155  7e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1046  cytidylate kinase  41.59 
 
 		 228 aa  154  7e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17111  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  40.09 
 
 		 517 aa  154  8e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1914  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  40 
 
 		 483 aa  154  9e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.650764  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2334  cytidylate kinase  39.55 
 
 		 226 aa  154  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000116453  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0745  cytidylate kinase  40.28 
 
 		 228 aa  154  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.804624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4073  cytidylate kinase  39.25 
 
 		 229 aa  154  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293328  normal  0.11895 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02861  cytidylate kinase  38.07 
 
 		 226 aa  154  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1346  cytidylate kinase  36.87 
 
 		 219 aa  154  1e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0048747  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2043  cytidylate kinase  38.84 
 
 		 230 aa  153  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000246913  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1705  cytidylate kinase  43.26 
 
 		 234 aa  153  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000535126  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1506  cytidylate kinase  37.16 
 
 		 229 aa  153  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000236579  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2299  cytidylate kinase  38.29 
 
 		 230 aa  153  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000399193  unclonable  0.0000000000955893 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2243  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  38.65 
 
 		 674 aa  153  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1860  cytidylate kinase  42.25 
 
 		 220 aa  152  2.9999999999999998e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.10096  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0964  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  40.44 
 
 		 534 aa  152  5e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4159  cytidylate kinase  41.12 
 
 		 228 aa  152  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2164  cytidylate kinase  38.25 
 
 		 232 aa  152  5e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00199731  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1440  cytidylate kinase  43.89 
 
 		 224 aa  152  5e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00955651  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2827  cytidylate kinase  39.91 
 
 		 223 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300632  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1362  cytidylate kinase  39.27 
 
 		 228 aa  151  7e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0105821  normal  0.0198977 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0508  cytidylate kinase  37.27 
 
 		 221 aa  151  7e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>