More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2100 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_2100  cytidylate kinase  100 
 
 
229 aa  456  1e-127  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.578851 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1331  cytidylate kinase  53.28 
 
 
229 aa  230  1e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282811  decreased coverage  0.00883322 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1152  cytidylate kinase  51.34 
 
 
222 aa  223  1e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1180  cytidylate kinase  51.66 
 
 
232 aa  215  4e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.848672  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3387  cytidylate kinase  49.77 
 
 
232 aa  215  4e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000123016  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0712  cytidylate kinase  50 
 
 
227 aa  211  4.9999999999999996e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000327752  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1604  cytidylate kinase  49.32 
 
 
221 aa  210  2e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10390  cytidylate kinase  49.32 
 
 
228 aa  207  9e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000240582  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1148  cytidylate kinase  50.23 
 
 
218 aa  207  1e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1623  cytidylate kinase  47.75 
 
 
225 aa  206  3e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000468562  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1659  cytidylate kinase  47.75 
 
 
225 aa  205  5e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000228259  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1379  cytidylate kinase  47.75 
 
 
225 aa  205  5e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000311756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1378  cytidylate kinase  47.75 
 
 
225 aa  205  5e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000246043  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1325  cytidylate kinase  48.61 
 
 
226 aa  205  5e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1591  cytidylate kinase  47.75 
 
 
225 aa  205  5e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1931099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1220  cytidylate kinase  45.91 
 
 
225 aa  204  6e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000130808  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1407  cytidylate kinase  47.96 
 
 
225 aa  204  8e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000164884  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1518  cytidylate kinase  47.96 
 
 
225 aa  204  8e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000739284  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1552  cytidylate kinase  46.36 
 
 
225 aa  204  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3792  cytidylate kinase  46.36 
 
 
225 aa  203  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157235  hitchhiker  0.0000757077 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1420  cytidylate kinase  46.15 
 
 
225 aa  202  3e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000147531  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2171  cytidylate kinase  49.32 
 
 
224 aa  201  6e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000313487  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1346  cytidylate kinase  47.44 
 
 
219 aa  198  5e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0048747  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2450  cytidylate kinase  47.69 
 
 
227 aa  198  7e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000180887  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1351  cytidylate kinase  48.61 
 
 
214 aa  195  5.000000000000001e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00022877  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1151  cytidylate kinase  45.5 
 
 
217 aa  193  1e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2799  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  45.74 
 
 
528 aa  192  3e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1884  cytidylate kinase  45.33 
 
 
235 aa  192  4e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000963447  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0891  cytidylate kinase  45.58 
 
 
230 aa  191  6e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00236441  decreased coverage  0.00000000000000152921 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17111  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  45.7 
 
 
517 aa  189  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5340  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  49.3 
 
 
526 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1293  cytidylate kinase  45.83 
 
 
224 aa  189  2.9999999999999997e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00871161  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1340  cytidylate kinase  44.55 
 
 
217 aa  189  4e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0841827  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2690  cytidylate kinase  44.19 
 
 
218 aa  188  7e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495966  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3339  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  47.16 
 
 
529 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1348  cytidylate kinase  46.15 
 
 
233 aa  185  4e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000802306  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4282  pantoate/beta-alanine ligase  48.13 
 
 
539 aa  184  1.0000000000000001e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1640  cytidylate kinase  43.32 
 
 
231 aa  183  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.302898 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1008  cytidylate kinase  45.62 
 
 
219 aa  183  2.0000000000000003e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0762  cytidylate kinase  47.27 
 
 
228 aa  182  3e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000614962  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2943  cytidylate kinase  43.64 
 
 
228 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.142488 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2928  cytidylate kinase  43.64 
 
 
228 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2972  cytidylate kinase  43.64 
 
 
228 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0964  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  47.66 
 
 
534 aa  180  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955795  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0695  cytidylate kinase  42.25 
 
 
223 aa  179  2.9999999999999997e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1465  cytidylate kinase  45.85 
 
 
240 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00293534  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0725  cytidylate kinase  44.44 
 
 
514 aa  179  2.9999999999999997e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0311607  normal  0.0975143 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2605  cytidylate kinase  43.66 
 
 
233 aa  178  4.999999999999999e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2334  cytidylate kinase  44.08 
 
 
226 aa  178  4.999999999999999e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000116453  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  43.91 
 
 
527 aa  178  4.999999999999999e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1333  cytidylate kinase  43.58 
 
 
252 aa  178  4.999999999999999e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.671241 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09660  cytidylate kinase  41.74 
 
 
223 aa  178  4.999999999999999e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  46.76 
 
 
511 aa  177  8e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1165  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.19 
 
 
516 aa  177  1e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.841072  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0865  cytidylate kinase  44.88 
 
 
232 aa  177  1e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.054851  normal  0.903587 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  46.76 
 
 
511 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1232  cytidylate kinase  44.44 
 
 
219 aa  177  1e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1622  cytidylate kinase  46.48 
 
 
217 aa  177  2e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11727  cytidylate kinase  42.99 
 
 
230 aa  177  2e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.808416  normal  0.551451 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1729  cytidylate kinase  45.07 
 
 
223 aa  176  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2117  cytidylate kinase  42.92 
 
 
225 aa  176  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000190032  unclonable  0.00000899897 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2072  cytidylate kinase  42.03 
 
 
230 aa  176  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000270816  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2310  cytidylate kinase  41.63 
 
 
230 aa  176  3e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000698578  hitchhiker  0.000000443143 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2467  cytidylate kinase  40.47 
 
 
225 aa  175  4e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000550284  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1749  cytidylate kinase  43.06 
 
 
229 aa  175  7e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00238031  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1853  cytidylate kinase  41.12 
 
 
221 aa  174  9e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0179513  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2147  cytidylate kinase  43.41 
 
 
232 aa  174  9e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0902079  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20401  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.19 
 
 
516 aa  174  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.523642  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3643  cytidylate kinase  43.52 
 
 
229 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000551434  normal  0.674927 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0331  cytidylate kinase  43.52 
 
 
227 aa  174  9.999999999999999e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0453  cytidylate kinase  48.4 
 
 
224 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1860  cytidylate kinase  44.81 
 
 
220 aa  174  9.999999999999999e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.10096  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1735  cytidylate kinase  41.86 
 
 
231 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610181  decreased coverage  0.000087686 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1708  cytidylate kinase  42.93 
 
 
229 aa  172  2.9999999999999996e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000112654  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22471  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  47.47 
 
 
488 aa  172  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1705  cytidylate kinase  45.83 
 
 
234 aa  173  2.9999999999999996e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000535126  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1923  cytidylate kinase  42.03 
 
 
230 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000722421  unclonable  0.0000000000403388 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2055  cytidylate kinase  42.03 
 
 
230 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000628627  unclonable  0.0000241467 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2124  cytidylate kinase  40 
 
 
229 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109139  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23320  cytidylate kinase  42.72 
 
 
229 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000301501  normal  0.0247908 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1976  cytidylate kinase  42.03 
 
 
230 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000166074  hitchhiker  0.00000000164919 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1966  cytidylate kinase  42.72 
 
 
229 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2370  cytidylate kinase  42.66 
 
 
230 aa  172  5e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1506  cytidylate kinase  40.85 
 
 
229 aa  172  5e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000236579  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2340  cytidylate kinase  42.13 
 
 
229 aa  171  5.999999999999999e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000158492  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1234  cytidylate kinase  43.84 
 
 
255 aa  172  5.999999999999999e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2669  cytidylate kinase  41.95 
 
 
230 aa  171  7.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000410063  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2581  cytidylate kinase  41.95 
 
 
230 aa  171  7.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000568011  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1954  cytidylate kinase  41.95 
 
 
230 aa  171  7.999999999999999e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000903512  normal  0.349566 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00914  cytidylate kinase  40.28 
 
 
227 aa  170  1e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.42509  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2733  cytidylate kinase  40.28 
 
 
227 aa  170  1e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000397985  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1071  cytidylate kinase  40.28 
 
 
227 aa  170  1e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000134482  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00921  hypothetical protein  40.28 
 
 
227 aa  170  1e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.411433  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2418  cytidylate kinase  40.28 
 
 
227 aa  170  1e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000459306  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2140  cytidylate kinase  40.74 
 
 
224 aa  171  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1007  cytidylate kinase  40.28 
 
 
227 aa  170  1e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000820305  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2210  cytidylate kinase  40.28 
 
 
227 aa  170  1e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000277871  normal  0.370624 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1016  cytidylate kinase  40.28 
 
 
227 aa  170  1e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000287427  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2686  cytidylate kinase  40.28 
 
 
227 aa  170  1e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000200966  normal  0.762789 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3257  cytidylate kinase  39.46 
 
 
233 aa  169  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0255416  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>