More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1151 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_1151  cytidylate kinase  100 
 
 		 217 aa  432  1e-120  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1340  cytidylate kinase  98.62 
 
 		 217 aa  427  1e-119  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0841827  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1623  cytidylate kinase  47 
 
 		 225 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000468562  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1420  cytidylate kinase  47.44 
 
 		 225 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000147531  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0891  cytidylate kinase  47.06 
 
 		 230 aa  200  9.999999999999999e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00236441  decreased coverage  0.00000000000000152921 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1379  cytidylate kinase  46.98 
 
 		 225 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000311756  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1659  cytidylate kinase  46.98 
 
 		 225 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000228259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1378  cytidylate kinase  46.98 
 
 		 225 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000246043  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1591  cytidylate kinase  46.98 
 
 		 225 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1931099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0712  cytidylate kinase  51.63 
 
 		 227 aa  199  3e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000327752  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1385  cytidylate kinase  48.17 
 
 		 227 aa  199  3e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000116404  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1407  cytidylate kinase  46.98 
 
 		 225 aa  199  3e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000164884  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1518  cytidylate kinase  46.98 
 
 		 225 aa  199  3e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000739284  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1552  cytidylate kinase  46.08 
 
 		 225 aa  197  7e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1604  cytidylate kinase  49.76 
 
 		 221 aa  198  7e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3792  cytidylate kinase  46.08 
 
 		 225 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157235  hitchhiker  0.0000757077 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1220  cytidylate kinase  45.58 
 
 		 225 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000130808  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1325  cytidylate kinase  47.89 
 
 		 226 aa  195  5.000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2100  cytidylate kinase  45.5 
 
 		 229 aa  193  1e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.578851 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1152  cytidylate kinase  47.56 
 
 		 222 aa  193  1e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10390  cytidylate kinase  46.92 
 
 		 228 aa  191  1e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000240582  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1622  cytidylate kinase  48.54 
 
 		 217 aa  187  7e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3387  cytidylate kinase  45.83 
 
 		 232 aa  187  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000123016  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2450  cytidylate kinase  46.48 
 
 		 227 aa  186  2e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000180887  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10343  putative cytidylate kinase  45 
 
 		 232 aa  186  2e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1090  cytidylate kinase  45.91 
 
 		 226 aa  186  3e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000570118  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1331  cytidylate kinase  45.75 
 
 		 229 aa  184  1.0000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282811  decreased coverage  0.00883322 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1293  cytidylate kinase  46.26 
 
 		 224 aa  182  2.0000000000000003e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00871161  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2147  cytidylate kinase  40.55 
 
 		 232 aa  177  8e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0902079  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1640  cytidylate kinase  43.78 
 
 		 231 aa  177  9e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.302898 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1008  cytidylate kinase  44.98 
 
 		 219 aa  177  1e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1180  cytidylate kinase  42.86 
 
 		 232 aa  174  7e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.848672  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2605  cytidylate kinase  41.94 
 
 		 233 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2171  cytidylate kinase  43.26 
 
 		 224 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000313487  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1346  cytidylate kinase  42.92 
 
 		 219 aa  172  2.9999999999999996e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0048747  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1565  cytidylate kinase  43.4 
 
 		 219 aa  172  3.9999999999999995e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.464485  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1534  cytidylate kinase  43.4 
 
 		 219 aa  172  3.9999999999999995e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1465  cytidylate kinase  43.96 
 
 		 240 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00293534  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1729  cytidylate kinase  44.76 
 
 		 223 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2690  cytidylate kinase  40.48 
 
 		 218 aa  172  5e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495966  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1705  cytidylate kinase  45.16 
 
 		 234 aa  169  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000535126  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1021  cytidylate kinase  42.38 
 
 		 216 aa  169  3e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1232  cytidylate kinase  44.39 
 
 		 219 aa  169  3e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1860  cytidylate kinase  42.92 
 
 		 220 aa  168  6e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.10096  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0993  cytidylate kinase  40.67 
 
 		 233 aa  167  8e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3257  cytidylate kinase  39.17 
 
 		 233 aa  167  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0255416  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1045  cytidylate kinase  42.13 
 
 		 215 aa  166  2e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.117203  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00890  cytidylate kinase  38.94 
 
 		 227 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.007598  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5340  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  40.57 
 
 		 526 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2943  cytidylate kinase  40.49 
 
 		 228 aa  165  4e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.142488 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2928  cytidylate kinase  40.49 
 
 		 228 aa  165  4e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2972  cytidylate kinase  40.49 
 
 		 228 aa  165  4e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3494  cytidylate kinase  40.09 
 
 		 228 aa  165  5e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.121252  normal  0.220697 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0865  cytidylate kinase  41.35 
 
 		 232 aa  165  5e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.054851  normal  0.903587 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0348  cytidylate kinase  43.66 
 
 		 237 aa  164  5.9999999999999996e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000112286  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1351  cytidylate kinase  41.51 
 
 		 214 aa  164  5.9999999999999996e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00022877  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2756  cytidylate kinase  41.55 
 
 		 230 aa  164  6.9999999999999995e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1645  cytidylate kinase  39.81 
 
 		 225 aa  163  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.170178 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0451  cytidylate kinase  41.89 
 
 		 231 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.001027  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1884  cytidylate kinase  38.6 
 
 		 235 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000963447  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2799  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  38.79 
 
 		 528 aa  164  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2334  cytidylate kinase  40.95 
 
 		 226 aa  163  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000116453  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0416  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  37.33 
 
 		 480 aa  163  2.0000000000000002e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130302  normal  0.171776 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1348  cytidylate kinase  35.94 
 
 		 233 aa  162  3e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000802306  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1752  cytidylate kinase  37.5 
 
 		 227 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000925539  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1148  cytidylate kinase  40.65 
 
 		 218 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0928  cytidylate kinase  40.87 
 
 		 226 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497834  normal  0.452756 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1072  cytidylate kinase  40.87 
 
 		 226 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000346962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2124  cytidylate kinase  37.67 
 
 		 229 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109139  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0695  cytidylate kinase  40.87 
 
 		 223 aa  161  6e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1914  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  39.17 
 
 		 483 aa  160  1e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.650764  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1515  cytidylate kinase  37.56 
 
 		 250 aa  160  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6626  cytidylate kinase  39.61 
 
 		 228 aa  160  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.422792 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1409  cytidylate kinase  42.73 
 
 		 224 aa  160  2e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0393534  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  37.79 
 
 		 511 aa  159  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0934  cytidylate kinase  42.93 
 
 		 213 aa  160  2e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0762  cytidylate kinase  44.59 
 
 		 228 aa  159  2e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000614962  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  37.79 
 
 		 511 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2351  cytidylate kinase  38.01 
 
 		 251 aa  159  3e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2439  cytidylate kinase  38.01 
 
 		 251 aa  158  5e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1620  cytidylate kinase  40.19 
 
 		 226 aa  158  5e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.433409  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1190  cytidylate kinase  39.02 
 
 		 225 aa  158  7e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.988165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0086  cytidylate kinase  43.27 
 
 		 234 aa  157  8e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0568049 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003019  cytidylate kinase  37.85 
 
 		 226 aa  157  8e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000338917  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2816  cytidylate kinase  37.33 
 
 		 244 aa  157  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0539109  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0725  cytidylate kinase  38.53 
 
 		 514 aa  157  1e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0311607  normal  0.0975143 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2196  cytidylate kinase  38.18 
 
 		 233 aa  157  1e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1735  cytidylate kinase  38.6 
 
 		 231 aa  157  1e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610181  decreased coverage  0.000087686 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2309  cytidylate kinase  37.22 
 
 		 237 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.6369 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02861  cytidylate kinase  38.32 
 
 		 226 aa  156  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1429  cytidylate kinase  38.6 
 
 		 227 aa  156  3e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000204841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1506  cytidylate kinase  38.79 
 
 		 229 aa  155  3e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000236579  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1953  cytidylate kinase  39.35 
 
 		 230 aa  155  3e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000156815  hitchhiker  0.0000548451 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0780  cytidylate kinase  39.6 
 
 		 223 aa  156  3e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0405191  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2299  cytidylate kinase  38.43 
 
 		 230 aa  155  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000399193  unclonable  0.0000000000955893 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2280  cytidylate kinase  40.69 
 
 		 230 aa  155  4e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000793863  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2397  cytidylate kinase  40.69 
 
 		 230 aa  155  4e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000169082  unclonable  0.00000986897 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2065  cytidylate kinase  40.69 
 
 		 230 aa  155  4e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000105966  unclonable  0.00000000000213103 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2069  cytidylate kinase  40.69 
 
 		 230 aa  155  4e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000019021  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2310  cytidylate kinase  38.43 
 
 		 230 aa  155  4e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000698578  hitchhiker  0.000000443143 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>