More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6626 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6626  cytidylate kinase  100 
 
 		 228 aa  468  1.0000000000000001e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.422792 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5748  cytidylate kinase  58.11 
 
 		 236 aa  258  8e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0113044 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1190  cytidylate kinase  59.55 
 
 		 225 aa  257  9e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.988165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2756  cytidylate kinase  57.33 
 
 		 230 aa  246  2e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0086  cytidylate kinase  56.22 
 
 		 234 aa  245  4e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0568049 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3589  cytidylate kinase  54.13 
 
 		 233 aa  237  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.577192  normal  0.0958027 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10343  putative cytidylate kinase  50.45 
 
 		 232 aa  226  2e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1409  cytidylate kinase  53.18 
 
 		 224 aa  219  1.9999999999999999e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0393534  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0603  cytidylate kinase  49.12 
 
 		 231 aa  216  2.9999999999999998e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.794292 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2450  cytidylate kinase  42.03 
 
 		 227 aa  182  4.0000000000000006e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000180887  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3221  cytidylate kinase  43.18 
 
 		 227 aa  182  5.0000000000000004e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529092  normal  0.197926 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1623  cytidylate kinase  44.29 
 
 		 225 aa  179  4e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000468562  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1552  cytidylate kinase  43.84 
 
 		 225 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1604  cytidylate kinase  46.15 
 
 		 221 aa  178  4.999999999999999e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1220  cytidylate kinase  43.69 
 
 		 225 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000130808  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1407  cytidylate kinase  44.29 
 
 		 225 aa  178  5.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000164884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1379  cytidylate kinase  44.29 
 
 		 225 aa  178  5.999999999999999e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000311756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1378  cytidylate kinase  44.29 
 
 		 225 aa  178  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000246043  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1518  cytidylate kinase  44.29 
 
 		 225 aa  178  5.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000739284  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1591  cytidylate kinase  44.29 
 
 		 225 aa  178  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1931099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1659  cytidylate kinase  44.29 
 
 		 225 aa  178  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000228259  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3792  cytidylate kinase  43.84 
 
 		 225 aa  178  7e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157235  hitchhiker  0.0000757077 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1325  cytidylate kinase  42.92 
 
 		 226 aa  178  7e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1420  cytidylate kinase  43.84 
 
 		 225 aa  177  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000147531  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0891  cytidylate kinase  45.15 
 
 		 230 aa  176  2e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00236441  decreased coverage  0.00000000000000152921 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1045  cytidylate kinase  45.97 
 
 		 215 aa  174  9.999999999999999e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.117203  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10390  cytidylate kinase  43.06 
 
 		 228 aa  174  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000240582  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1640  cytidylate kinase  42.92 
 
 		 231 aa  171  5.999999999999999e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.302898 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1293  cytidylate kinase  40.09 
 
 		 224 aa  170  2e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00871161  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1733  cytidylate kinase  43.24 
 
 		 238 aa  169  3e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000909322  hitchhiker  0.0092352 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1090  cytidylate kinase  44.39 
 
 		 226 aa  169  4e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000570118  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2147  cytidylate kinase  40.55 
 
 		 232 aa  168  8e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0902079  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1008  cytidylate kinase  40.28 
 
 		 219 aa  167  1e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2799  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  45.02 
 
 		 528 aa  166  2.9999999999999998e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1348  cytidylate kinase  40 
 
 		 233 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000802306  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3643  cytidylate kinase  40.09 
 
 		 229 aa  165  4e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000551434  normal  0.674927 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0417  cytidylate kinase  42.98 
 
 		 237 aa  165  5e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000354402  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5340  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  42 
 
 		 526 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0451  cytidylate kinase  41.33 
 
 		 231 aa  162  3e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.001027  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0348  cytidylate kinase  40.99 
 
 		 237 aa  163  3e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000112286  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0865  cytidylate kinase  37.67 
 
 		 232 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.054851  normal  0.903587 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1749  cytidylate kinase  38.71 
 
 		 229 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00238031  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1152  cytidylate kinase  40.55 
 
 		 222 aa  161  7e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1340  cytidylate kinase  39.61 
 
 		 217 aa  161  8.000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0841827  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1565  cytidylate kinase  40.09 
 
 		 219 aa  160  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.464485  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2171  cytidylate kinase  41.1 
 
 		 224 aa  161  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000313487  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  42.08 
 
 		 527 aa  160  1e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2690  cytidylate kinase  38.01 
 
 		 218 aa  160  1e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495966  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1534  cytidylate kinase  40.09 
 
 		 219 aa  160  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1151  cytidylate kinase  39.61 
 
 		 217 aa  160  1e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1860  cytidylate kinase  42.54 
 
 		 220 aa  160  1e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.10096  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14810  cytidylate kinase  39.04 
 
 		 269 aa  160  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  38.5 
 
 		 511 aa  159  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  38.5 
 
 		 511 aa  159  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1180  cytidylate kinase  38.01 
 
 		 232 aa  158  6e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.848672  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0762  cytidylate kinase  46.45 
 
 		 228 aa  158  6e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000614962  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2370  cytidylate kinase  40 
 
 		 230 aa  158  7e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0695  cytidylate kinase  40.1 
 
 		 223 aa  158  8e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0453  cytidylate kinase  41.18 
 
 		 224 aa  157  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0712  cytidylate kinase  39.37 
 
 		 227 aa  157  1e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000327752  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17111  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  40.57 
 
 		 517 aa  157  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1853  cytidylate kinase  39.11 
 
 		 221 aa  156  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0179513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1884  cytidylate kinase  38.36 
 
 		 235 aa  156  3e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000963447  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2816  cytidylate kinase  39.01 
 
 		 244 aa  155  4e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0539109  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1021  cytidylate kinase  37.79 
 
 		 216 aa  155  4e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1234  cytidylate kinase  38.29 
 
 		 255 aa  155  4e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0993  cytidylate kinase  36.99 
 
 		 233 aa  155  7e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20401  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  40.55 
 
 		 516 aa  154  8e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.523642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1165  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  40.55 
 
 		 516 aa  154  9e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.841072  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1331  cytidylate kinase  41.38 
 
 		 229 aa  154  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282811  decreased coverage  0.00883322 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1506  cytidylate kinase  37.79 
 
 		 229 aa  154  1e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000236579  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22471  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  42.2 
 
 		 488 aa  154  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3257  cytidylate kinase  36.99 
 
 		 233 aa  153  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0255416  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3387  cytidylate kinase  38.91 
 
 		 232 aa  153  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000123016  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3284  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  37.79 
 
 		 679 aa  153  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.185076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1378  cytidylate kinase  38.73 
 
 		 228 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.925348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0934  cytidylate kinase  39.17 
 
 		 213 aa  153  2e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3339  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  37.67 
 
 		 529 aa  153  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4073  cytidylate kinase  38.97 
 
 		 229 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293328  normal  0.11895 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4282  pantoate/beta-alanine ligase  39.44 
 
 		 539 aa  152  2.9999999999999998e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003019  cytidylate kinase  36.87 
 
 		 226 aa  152  4e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000338917  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4159  cytidylate kinase  39.07 
 
 		 228 aa  152  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0331  cytidylate kinase  40.87 
 
 		 227 aa  152  5e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0964  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  38.76 
 
 		 534 aa  151  7e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955795  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2605  cytidylate kinase  37.26 
 
 		 233 aa  150  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1362  cytidylate kinase  37.14 
 
 		 228 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0105821  normal  0.0198977 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1966  cytidylate kinase  38.81 
 
 		 229 aa  150  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2468  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  38.25 
 
 		 673 aa  150  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.835531  normal  0.361895 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23320  cytidylate kinase  37.79 
 
 		 229 aa  150  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000301501  normal  0.0247908 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3014  cytidylate kinase  35.29 
 
 		 228 aa  150  1e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000196489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1465  cytidylate kinase  39.91 
 
 		 240 aa  150  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00293534  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1392  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  38.25 
 
 		 673 aa  150  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.121243  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0567  cytidylate kinase  39.07 
 
 		 228 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1005  cytidylate kinase  39.07 
 
 		 228 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1046  cytidylate kinase  39.07 
 
 		 228 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1771  cytidylate kinase  36.67 
 
 		 228 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00506628  normal  0.0452484 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3943  cytidylate kinase  36.67 
 
 		 225 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.302806  normal  0.232418 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2243  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  38.14 
 
 		 674 aa  149  4e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1385  cytidylate kinase  42.58 
 
 		 227 aa  149  4e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000116404  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0416  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  37.98 
 
 		 480 aa  149  5e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130302  normal  0.171776 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>