More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0086 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0086  cytidylate kinase  100 
 
 		 234 aa  482  1e-135  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0568049 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3589  cytidylate kinase  63.44 
 
 		 233 aa  306  2.0000000000000002e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.577192  normal  0.0958027 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5748  cytidylate kinase  60 
 
 		 236 aa  276  1e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0113044 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6626  cytidylate kinase  56.22 
 
 		 228 aa  245  4e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.422792 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1190  cytidylate kinase  52.05 
 
 		 225 aa  222  4e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.988165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1409  cytidylate kinase  53 
 
 		 224 aa  221  6e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0393534  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10343  putative cytidylate kinase  48.23 
 
 		 232 aa  216  2e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2756  cytidylate kinase  50 
 
 		 230 aa  213  9.999999999999999e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0603  cytidylate kinase  49.3 
 
 		 231 aa  204  8e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.794292 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0451  cytidylate kinase  47.79 
 
 		 231 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.001027  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1733  cytidylate kinase  48.03 
 
 		 238 aa  192  3e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000909322  hitchhiker  0.0092352 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1407  cytidylate kinase  46.15 
 
 		 225 aa  190  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000164884  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1518  cytidylate kinase  46.15 
 
 		 225 aa  190  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000739284  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1623  cytidylate kinase  46.15 
 
 		 225 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000468562  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1591  cytidylate kinase  46.15 
 
 		 225 aa  189  4e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1931099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1379  cytidylate kinase  46.15 
 
 		 225 aa  189  4e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000311756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1378  cytidylate kinase  46.15 
 
 		 225 aa  189  4e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000246043  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1659  cytidylate kinase  46.15 
 
 		 225 aa  189  4e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000228259  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1420  cytidylate kinase  46.15 
 
 		 225 aa  189  5e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000147531  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1552  cytidylate kinase  45.7 
 
 		 225 aa  188  5e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0348  cytidylate kinase  45.37 
 
 		 237 aa  188  5.999999999999999e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000112286  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3792  cytidylate kinase  45.7 
 
 		 225 aa  188  8e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157235  hitchhiker  0.0000757077 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1220  cytidylate kinase  46.79 
 
 		 225 aa  187  1e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000130808  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1325  cytidylate kinase  45.25 
 
 		 226 aa  186  2e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0891  cytidylate kinase  47.2 
 
 		 230 aa  186  3e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00236441  decreased coverage  0.00000000000000152921 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0417  cytidylate kinase  45.13 
 
 		 237 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000354402  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2450  cytidylate kinase  43.98 
 
 		 227 aa  182  3e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000180887  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0712  cytidylate kinase  45.66 
 
 		 227 aa  182  4.0000000000000006e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000327752  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1090  cytidylate kinase  45 
 
 		 226 aa  182  4.0000000000000006e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000570118  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2605  cytidylate kinase  43.58 
 
 		 233 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3257  cytidylate kinase  43.27 
 
 		 233 aa  176  4e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0255416  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0993  cytidylate kinase  44.23 
 
 		 233 aa  175  4e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2171  cytidylate kinase  44.91 
 
 		 224 aa  175  6e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000313487  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2799  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.75 
 
 		 528 aa  174  8e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0695  cytidylate kinase  42.92 
 
 		 223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1604  cytidylate kinase  44.86 
 
 		 221 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3387  cytidylate kinase  43.12 
 
 		 232 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000123016  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1291  cytidylate kinase  42.99 
 
 		 228 aa  171  1e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4282  pantoate/beta-alanine ligase  40.91 
 
 		 539 aa  170  2e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0964  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  41.04 
 
 		 534 aa  170  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2147  cytidylate kinase  40.69 
 
 		 232 aa  168  8e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0902079  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1729  cytidylate kinase  42.45 
 
 		 223 aa  167  1e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1465  cytidylate kinase  42.31 
 
 		 240 aa  167  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00293534  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1021  cytidylate kinase  40.91 
 
 		 216 aa  167  2e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10390  cytidylate kinase  40.47 
 
 		 228 aa  166  2.9999999999999998e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000240582  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0725  cytidylate kinase  40.35 
 
 		 514 aa  165  5.9999999999999996e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0311607  normal  0.0975143 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1331  cytidylate kinase  42.99 
 
 		 229 aa  164  6.9999999999999995e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282811  decreased coverage  0.00883322 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1008  cytidylate kinase  42.99 
 
 		 219 aa  164  9e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  39.17 
 
 		 511 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1884  cytidylate kinase  41.74 
 
 		 235 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000963447  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  39.17 
 
 		 511 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  39.82 
 
 		 527 aa  164  2.0000000000000002e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1152  cytidylate kinase  43.66 
 
 		 222 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1293  cytidylate kinase  42.01 
 
 		 224 aa  164  2.0000000000000002e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00871161  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5340  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  41.23 
 
 		 526 aa  162  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2370  cytidylate kinase  38.53 
 
 		 230 aa  162  4.0000000000000004e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0865  cytidylate kinase  39.81 
 
 		 232 aa  161  9e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.054851  normal  0.903587 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1348  cytidylate kinase  38.6 
 
 		 233 aa  161  9e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000802306  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1232  cytidylate kinase  41.67 
 
 		 219 aa  160  1e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2816  cytidylate kinase  40.1 
 
 		 244 aa  160  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0539109  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1640  cytidylate kinase  40.87 
 
 		 231 aa  160  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.302898 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1385  cytidylate kinase  43.12 
 
 		 227 aa  159  5e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000116404  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1637  cytidylate kinase  35.21 
 
 		 228 aa  158  9e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11727  cytidylate kinase  39.09 
 
 		 230 aa  158  9e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.808416  normal  0.551451 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2573  cytidylate kinase  35.21 
 
 		 228 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0883038  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3339  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  37.73 
 
 		 529 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0429  cytidylate kinase  35.21 
 
 		 228 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0948  cytidylate kinase  35.21 
 
 		 228 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0200  cytidylate kinase  35.21 
 
 		 228 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1340  cytidylate kinase  43.27 
 
 		 217 aa  157  1e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0841827  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1151  cytidylate kinase  43.27 
 
 		 217 aa  157  1e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22471  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  39.73 
 
 		 488 aa  157  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2946  cytidylate kinase  35.21 
 
 		 228 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2883  cytidylate kinase  35.21 
 
 		 228 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0880838  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2690  cytidylate kinase  37.96 
 
 		 218 aa  157  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495966  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2995  cytidylate kinase  35.21 
 
 		 255 aa  156  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1180  cytidylate kinase  41.28 
 
 		 232 aa  156  3e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.848672  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14810  cytidylate kinase  40.09 
 
 		 269 aa  156  3e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2351  cytidylate kinase  39.73 
 
 		 251 aa  155  4e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1351  cytidylate kinase  40.55 
 
 		 214 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00022877  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0453  cytidylate kinase  44.04 
 
 		 224 aa  155  6e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2100  cytidylate kinase  39.45 
 
 		 229 aa  155  6e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.578851 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4159  cytidylate kinase  35.05 
 
 		 228 aa  155  7e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17111  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  38.67 
 
 		 517 aa  155  7e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1005  cytidylate kinase  35.05 
 
 		 228 aa  154  8e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0567  cytidylate kinase  35.05 
 
 		 228 aa  154  8e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1046  cytidylate kinase  35.05 
 
 		 228 aa  154  8e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1333  cytidylate kinase  38.53 
 
 		 252 aa  153  2e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.671241 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2827  cytidylate kinase  38.36 
 
 		 223 aa  153  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300632  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0934  cytidylate kinase  41.2 
 
 		 213 aa  153  2e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1622  cytidylate kinase  38.32 
 
 		 217 aa  153  2e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1860  cytidylate kinase  42.86 
 
 		 220 aa  153  2e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.10096  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00890  cytidylate kinase  36.28 
 
 		 227 aa  154  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.007598  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1234  cytidylate kinase  36.99 
 
 		 255 aa  153  2e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0594  cytidylate kinase  40.65 
 
 		 213 aa  152  2.9999999999999998e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2439  cytidylate kinase  39.27 
 
 		 251 aa  152  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1515  cytidylate kinase  38.81 
 
 		 250 aa  152  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2943  cytidylate kinase  40.1 
 
 		 228 aa  151  7e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.142488 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2972  cytidylate kinase  40.1 
 
 		 228 aa  151  7e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2928  cytidylate kinase  40.1 
 
 		 228 aa  151  7e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>