More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1620 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1620  cytidylate kinase  100 
 
 
226 aa  438  9.999999999999999e-123  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.433409  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1232  cytidylate kinase  52.58 
 
 
219 aa  215  5.9999999999999996e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1622  cytidylate kinase  51.64 
 
 
217 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1604  cytidylate kinase  50.23 
 
 
221 aa  206  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1351  cytidylate kinase  47.66 
 
 
220 aa  201  8e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0401638  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1335  cytidylate kinase  47.2 
 
 
220 aa  201  8e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.059192  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1325  cytidylate kinase  47.22 
 
 
226 aa  194  1e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2690  cytidylate kinase  45.97 
 
 
218 aa  190  2e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495966  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0564  cytidylate kinase  40.36 
 
 
227 aa  185  5e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1853  cytidylate kinase  40.28 
 
 
221 aa  185  6e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0179513  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1640  cytidylate kinase  45.02 
 
 
231 aa  182  5.0000000000000004e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.302898 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1623  cytidylate kinase  41.96 
 
 
225 aa  181  7e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000468562  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1379  cytidylate kinase  41.96 
 
 
225 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000311756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1378  cytidylate kinase  41.96 
 
 
225 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000246043  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1591  cytidylate kinase  41.96 
 
 
225 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1931099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1659  cytidylate kinase  41.96 
 
 
225 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000228259  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1552  cytidylate kinase  41.52 
 
 
225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1420  cytidylate kinase  41.96 
 
 
225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000147531  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1407  cytidylate kinase  42.4 
 
 
225 aa  178  5.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000164884  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1518  cytidylate kinase  42.4 
 
 
225 aa  178  5.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000739284  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3792  cytidylate kinase  41.52 
 
 
225 aa  178  7e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157235  hitchhiker  0.0000757077 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0934  cytidylate kinase  44.98 
 
 
213 aa  177  1e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1536  cytidylate kinase  40.91 
 
 
237 aa  176  3e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000588366  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0641  cytidylate kinase  40.91 
 
 
237 aa  176  3e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000272482  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3643  cytidylate kinase  39.91 
 
 
229 aa  176  4e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000551434  normal  0.674927 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3387  cytidylate kinase  40.93 
 
 
232 aa  175  6e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000123016  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1982  cytidylate kinase  38.81 
 
 
222 aa  174  7e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000405125  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1966  cytidylate kinase  39.27 
 
 
229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23320  cytidylate kinase  39.27 
 
 
229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000301501  normal  0.0247908 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1749  cytidylate kinase  40.37 
 
 
229 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00238031  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1331  cytidylate kinase  39.82 
 
 
229 aa  171  5.999999999999999e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282811  decreased coverage  0.00883322 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0331  cytidylate kinase  39.62 
 
 
227 aa  170  1e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1220  cytidylate kinase  39.55 
 
 
225 aa  170  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000130808  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0712  cytidylate kinase  43.56 
 
 
227 aa  171  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000327752  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3014  cytidylate kinase  38.79 
 
 
228 aa  170  1e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000196489  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2450  cytidylate kinase  41.12 
 
 
227 aa  170  1e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000180887  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2467  cytidylate kinase  39.71 
 
 
225 aa  170  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000550284  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1378  cytidylate kinase  39.81 
 
 
228 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.925348  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0891  cytidylate kinase  40.74 
 
 
230 aa  170  2e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00236441  decreased coverage  0.00000000000000152921 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4073  cytidylate kinase  39.62 
 
 
229 aa  169  5e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293328  normal  0.11895 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0695  cytidylate kinase  43.33 
 
 
223 aa  168  6e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1148  cytidylate kinase  41.47 
 
 
218 aa  167  1e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2171  cytidylate kinase  42.4 
 
 
224 aa  167  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000313487  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1026  cytidylate kinase  40.37 
 
 
226 aa  166  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000434199  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0780  cytidylate kinase  38.1 
 
 
223 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0405191  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0930  cytidylate kinase  37.67 
 
 
234 aa  166  2.9999999999999998e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0179  cytidylate kinase  40.09 
 
 
227 aa  165  4e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000847233  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2816  cytidylate kinase  38.43 
 
 
244 aa  166  4e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0539109  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1771  cytidylate kinase  38.86 
 
 
228 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00506628  normal  0.0452484 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3943  cytidylate kinase  38.86 
 
 
225 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.302806  normal  0.232418 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2147  cytidylate kinase  36.49 
 
 
232 aa  164  6.9999999999999995e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0902079  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1008  cytidylate kinase  41.2 
 
 
219 aa  164  6.9999999999999995e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1045  cytidylate kinase  43.4 
 
 
215 aa  164  8e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.117203  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1362  cytidylate kinase  38.86 
 
 
228 aa  164  8e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0105821  normal  0.0198977 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  38.07 
 
 
511 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10390  cytidylate kinase  39.27 
 
 
228 aa  163  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000240582  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0762  cytidylate kinase  40.99 
 
 
228 aa  163  2.0000000000000002e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000614962  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  39.15 
 
 
511 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2605  cytidylate kinase  38.6 
 
 
233 aa  163  3e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  33.62 
 
 
527 aa  162  4.0000000000000004e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2100  cytidylate kinase  41.4 
 
 
229 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.578851 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1351  cytidylate kinase  43.84 
 
 
214 aa  162  6e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00022877  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2072  cytidylate kinase  37.17 
 
 
230 aa  161  7e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000270816  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0778  cytidylate kinase  34.95 
 
 
231 aa  161  8.000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00825892 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0908  cytidylate kinase  34.47 
 
 
230 aa  160  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1165  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  42.59 
 
 
516 aa  160  1e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.841072  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2196  cytidylate kinase  35.32 
 
 
233 aa  160  2e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0849  cytidylate kinase  34.47 
 
 
231 aa  159  3e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.744629  normal  0.265979 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20401  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  42.59 
 
 
516 aa  159  4e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.523642  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2340  cytidylate kinase  36.11 
 
 
229 aa  159  5e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000158492  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1429  cytidylate kinase  35.81 
 
 
227 aa  158  5e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000204841  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1151  cytidylate kinase  40.19 
 
 
217 aa  158  5e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2140  cytidylate kinase  39.19 
 
 
224 aa  158  7e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2164  cytidylate kinase  36.24 
 
 
232 aa  158  7e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00199731  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1375  cytidylate kinase  37.5 
 
 
230 aa  157  9e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1371  cytidylate kinase  37.5 
 
 
230 aa  157  9e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1152  cytidylate kinase  38.97 
 
 
222 aa  157  9e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0544  cytidylate kinase  36.92 
 
 
220 aa  157  1e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.773366  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1542  cytidylate kinase  36.11 
 
 
225 aa  157  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.624713  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1645  cytidylate kinase  35.68 
 
 
225 aa  157  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.170178 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1346  cytidylate kinase  37.79 
 
 
219 aa  157  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0048747  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1180  cytidylate kinase  40.28 
 
 
232 aa  157  1e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.848672  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1708  cytidylate kinase  37.21 
 
 
229 aa  157  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000112654  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2733  cytidylate kinase  36.28 
 
 
227 aa  156  3e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000397985  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00921  hypothetical protein  36.28 
 
 
227 aa  156  3e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.411433  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2669  cytidylate kinase  36.19 
 
 
230 aa  156  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000410063  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0865  cytidylate kinase  35.81 
 
 
232 aa  156  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.054851  normal  0.903587 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1045  cytidylate kinase  36.28 
 
 
227 aa  155  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.185526  normal  0.763998 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1007  cytidylate kinase  36.28 
 
 
227 aa  156  3e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000820305  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1013  cytidylate kinase  36.28 
 
 
227 aa  155  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0567176  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1078  cytidylate kinase  36.28 
 
 
227 aa  155  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0687941 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2418  cytidylate kinase  36.28 
 
 
227 aa  156  3e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000459306  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1093  cytidylate kinase  36.28 
 
 
227 aa  155  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0104083  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2581  cytidylate kinase  36.19 
 
 
230 aa  156  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000568011  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1016  cytidylate kinase  36.28 
 
 
227 aa  156  3e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000287427  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2210  cytidylate kinase  36.28 
 
 
227 aa  156  3e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000277871  normal  0.370624 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1340  cytidylate kinase  39.71 
 
 
217 aa  156  3e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0841827  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1071  cytidylate kinase  36.28 
 
 
227 aa  156  3e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000134482  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0986  cytidylate kinase  36.28 
 
 
227 aa  155  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000706228  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1954  cytidylate kinase  36.19 
 
 
230 aa  156  3e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000903512  normal  0.349566 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>