More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2450 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2450  cytidylate kinase  100 
 
 		 227 aa  460  1e-129  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000180887  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1325  cytidylate kinase  49.32 
 
 		 226 aa  218  5e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1729  cytidylate kinase  48.61 
 
 		 223 aa  211  5.999999999999999e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3387  cytidylate kinase  48.86 
 
 		 232 aa  210  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000123016  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1220  cytidylate kinase  47.06 
 
 		 225 aa  206  2e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000130808  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0712  cytidylate kinase  48.61 
 
 		 227 aa  204  1e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000327752  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2690  cytidylate kinase  48.33 
 
 		 218 aa  202  2e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495966  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.09 
 
 		 511 aa  200  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1348  cytidylate kinase  47.66 
 
 		 233 aa  200  9.999999999999999e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000802306  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.09 
 
 		 511 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2100  cytidylate kinase  47.69 
 
 		 229 aa  198  7e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.578851 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1623  cytidylate kinase  45.54 
 
 		 225 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000468562  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1379  cytidylate kinase  45.54 
 
 		 225 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000311756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1378  cytidylate kinase  45.54 
 
 		 225 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000246043  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1591  cytidylate kinase  45.54 
 
 		 225 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1931099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0891  cytidylate kinase  48.79 
 
 		 230 aa  196  2.0000000000000003e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00236441  decreased coverage  0.00000000000000152921 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1659  cytidylate kinase  45.54 
 
 		 225 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000228259  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1552  cytidylate kinase  44.64 
 
 		 225 aa  195  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1190  cytidylate kinase  43.44 
 
 		 225 aa  195  6e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.988165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1420  cytidylate kinase  45.09 
 
 		 225 aa  194  7e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000147531  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3792  cytidylate kinase  44.64 
 
 		 225 aa  194  7e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157235  hitchhiker  0.0000757077 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1465  cytidylate kinase  45.24 
 
 		 240 aa  194  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00293534  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1407  cytidylate kinase  45.09 
 
 		 225 aa  194  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000164884  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1518  cytidylate kinase  45.09 
 
 		 225 aa  194  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000739284  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0993  cytidylate kinase  45.85 
 
 		 233 aa  192  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3257  cytidylate kinase  45.37 
 
 		 233 aa  191  5e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0255416  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2171  cytidylate kinase  44.59 
 
 		 224 aa  192  5e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000313487  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1008  cytidylate kinase  44.81 
 
 		 219 aa  191  7e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2756  cytidylate kinase  43.61 
 
 		 230 aa  191  9e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1152  cytidylate kinase  50 
 
 		 222 aa  191  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5340  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  43.12 
 
 		 526 aa  190  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3589  cytidylate kinase  46.7 
 
 		 233 aa  188  5e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.577192  normal  0.0958027 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1293  cytidylate kinase  45.5 
 
 		 224 aa  188  7e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00871161  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10343  putative cytidylate kinase  44.81 
 
 		 232 aa  187  9e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0964  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  42.92 
 
 		 534 aa  186  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1622  cytidylate kinase  45.5 
 
 		 217 aa  186  2e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1340  cytidylate kinase  46.48 
 
 		 217 aa  186  2e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0841827  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1151  cytidylate kinase  46.48 
 
 		 217 aa  186  2e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2147  cytidylate kinase  44.39 
 
 		 232 aa  185  4e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0902079  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0865  cytidylate kinase  42.45 
 
 		 232 aa  185  4e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.054851  normal  0.903587 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2605  cytidylate kinase  43.46 
 
 		 233 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4282  pantoate/beta-alanine ligase  41.89 
 
 		 539 aa  183  2.0000000000000003e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1232  cytidylate kinase  46.26 
 
 		 219 aa  183  2.0000000000000003e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0086  cytidylate kinase  43.98 
 
 		 234 aa  182  3e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0568049 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6626  cytidylate kinase  42.03 
 
 		 228 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.422792 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0695  cytidylate kinase  45.45 
 
 		 223 aa  182  5.0000000000000004e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2380  cytidylate kinase  44.49 
 
 		 243 aa  181  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.042532  normal  0.287603 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1534  cytidylate kinase  43.44 
 
 		 219 aa  179  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1565  cytidylate kinase  43.44 
 
 		 219 aa  179  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.464485  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1331  cytidylate kinase  44.84 
 
 		 229 aa  179  4e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282811  decreased coverage  0.00883322 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1860  cytidylate kinase  45.54 
 
 		 220 aa  177  9e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.10096  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2164  cytidylate kinase  39.53 
 
 		 232 aa  177  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00199731  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10390  cytidylate kinase  42.92 
 
 		 228 aa  176  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000240582  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1604  cytidylate kinase  45.97 
 
 		 221 aa  177  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1351  cytidylate kinase  43.06 
 
 		 214 aa  177  2e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00022877  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2799  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  43.26 
 
 		 528 aa  177  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1409  cytidylate kinase  43.52 
 
 		 224 aa  176  3e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0393534  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3339  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  42.86 
 
 		 529 aa  176  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1351  cytidylate kinase  42.2 
 
 		 220 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0401638  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1335  cytidylate kinase  41.28 
 
 		 220 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.059192  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0934  cytidylate kinase  43.26 
 
 		 213 aa  172  2.9999999999999996e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09660  cytidylate kinase  44.91 
 
 		 223 aa  172  3.9999999999999995e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1021  cytidylate kinase  44.76 
 
 		 216 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1982  cytidylate kinase  39.55 
 
 		 222 aa  172  5e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000405125  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0977  cytidylate kinase  39.19 
 
 		 237 aa  172  5e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000004631  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1884  cytidylate kinase  41.12 
 
 		 235 aa  171  5.999999999999999e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000963447  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0762  cytidylate kinase  45.37 
 
 		 228 aa  171  6.999999999999999e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000614962  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2334  cytidylate kinase  40.38 
 
 		 226 aa  171  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000116453  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1620  cytidylate kinase  41.12 
 
 		 226 aa  170  1e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.433409  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2972  cytidylate kinase  43.98 
 
 		 228 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2943  cytidylate kinase  43.98 
 
 		 228 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.142488 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2928  cytidylate kinase  43.98 
 
 		 228 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1090  cytidylate kinase  41.59 
 
 		 226 aa  169  4e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000570118  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0173  cytidylate kinase  40.27 
 
 		 225 aa  169  4e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000480933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3221  cytidylate kinase  40.64 
 
 		 227 aa  169  5e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529092  normal  0.197926 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2351  cytidylate kinase  43.72 
 
 		 251 aa  168  7e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5748  cytidylate kinase  45.15 
 
 		 236 aa  168  7e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0113044 
 
 
-
 
NC_002950  PG0603  cytidylate kinase  41.78 
 
 		 231 aa  167  1e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.794292 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1045  cytidylate kinase  42.13 
 
 		 215 aa  167  1e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.117203  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1705  cytidylate kinase  45.62 
 
 		 234 aa  166  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000535126  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  41.74 
 
 		 527 aa  167  2e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003019  cytidylate kinase  39.17 
 
 		 226 aa  166  2.9999999999999998e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000338917  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1640  cytidylate kinase  40.91 
 
 		 231 aa  166  2.9999999999999998e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.302898 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3494  cytidylate kinase  43.18 
 
 		 228 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.121252  normal  0.220697 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4723  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  40.47 
 
 		 675 aa  165  4e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.86018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0451  cytidylate kinase  45.21 
 
 		 231 aa  165  5e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.001027  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0331  cytidylate kinase  41.67 
 
 		 227 aa  165  5e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1291  cytidylate kinase  45.45 
 
 		 228 aa  165  5e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2439  cytidylate kinase  43.26 
 
 		 251 aa  165  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2570  cytidylate kinase  39.35 
 
 		 221 aa  165  5.9999999999999996e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138254  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17111  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  42.59 
 
 		 517 aa  165  5.9999999999999996e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2055  cytidylate kinase  38.84 
 
 		 230 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000628627  unclonable  0.0000241467 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0453  cytidylate kinase  42.6 
 
 		 224 aa  164  8e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1506  cytidylate kinase  39.09 
 
 		 229 aa  164  8e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000236579  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0908  cytidylate kinase  38.81 
 
 		 230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2309  cytidylate kinase  41.26 
 
 		 237 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.6369 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2299  cytidylate kinase  38.89 
 
 		 230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000399193  unclonable  0.0000000000955893 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1515  cytidylate kinase  42.79 
 
 		 250 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1923  cytidylate kinase  38.39 
 
 		 230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000722421  unclonable  0.0000000000403388 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1346  cytidylate kinase  39.62 
 
 		 219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0048747  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>