More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1351 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_1351  cytidylate kinase  100 
 
 		 220 aa  444  1.0000000000000001e-124  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0401638  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1335  cytidylate kinase  96.82 
 
 		 220 aa  432  1e-120  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.059192  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1622  cytidylate kinase  54.38 
 
 		 217 aa  233  1.0000000000000001e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1232  cytidylate kinase  48.85 
 
 		 219 aa  216  2.9999999999999998e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1620  cytidylate kinase  47.66 
 
 		 226 aa  201  8e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.433409  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1325  cytidylate kinase  46.95 
 
 		 226 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2690  cytidylate kinase  46.95 
 
 		 218 aa  190  2e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495966  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2605  cytidylate kinase  45 
 
 		 233 aa  186  3e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1148  cytidylate kinase  47.64 
 
 		 218 aa  182  3e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3387  cytidylate kinase  43.89 
 
 		 232 aa  178  5.999999999999999e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000123016  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1165  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  43.18 
 
 		 516 aa  177  8e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.841072  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20401  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  43.18 
 
 		 516 aa  176  3e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.523642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1220  cytidylate kinase  42.01 
 
 		 225 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000130808  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0695  cytidylate kinase  42.65 
 
 		 223 aa  173  9.999999999999999e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1351  cytidylate kinase  42.18 
 
 		 214 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00022877  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10390  cytidylate kinase  42.53 
 
 		 228 aa  173  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000240582  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2450  cytidylate kinase  42.2 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000180887  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2117  cytidylate kinase  41.01 
 
 		 225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000190032  unclonable  0.00000899897 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0865  cytidylate kinase  40.91 
 
 		 232 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.054851  normal  0.903587 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1623  cytidylate kinase  42.06 
 
 		 225 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000468562  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1293  cytidylate kinase  40.09 
 
 		 224 aa  172  3.9999999999999995e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00871161  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2171  cytidylate kinase  44.09 
 
 		 224 aa  172  5e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000313487  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1591  cytidylate kinase  42.06 
 
 		 225 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1931099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1407  cytidylate kinase  42.06 
 
 		 225 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000164884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1379  cytidylate kinase  42.06 
 
 		 225 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000311756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1378  cytidylate kinase  42.06 
 
 		 225 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000246043  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1659  cytidylate kinase  42.06 
 
 		 225 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000228259  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1884  cytidylate kinase  41.47 
 
 		 235 aa  171  6.999999999999999e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000963447  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1518  cytidylate kinase  42.06 
 
 		 225 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000739284  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0712  cytidylate kinase  41.82 
 
 		 227 aa  171  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000327752  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1180  cytidylate kinase  42.52 
 
 		 232 aa  169  3e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.848672  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1021  cytidylate kinase  39.72 
 
 		 216 aa  169  4e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2100  cytidylate kinase  43.52 
 
 		 229 aa  168  5e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.578851 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2147  cytidylate kinase  39.29 
 
 		 232 aa  168  5e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0902079  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1008  cytidylate kinase  38.81 
 
 		 219 aa  168  6e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1465  cytidylate kinase  41.89 
 
 		 240 aa  168  7e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00293534  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1640  cytidylate kinase  43.18 
 
 		 231 aa  167  1e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.302898 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1348  cytidylate kinase  41.1 
 
 		 233 aa  167  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000802306  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0331  cytidylate kinase  40.74 
 
 		 227 aa  166  2e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1853  cytidylate kinase  39.91 
 
 		 221 aa  166  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0179513  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0993  cytidylate kinase  40.72 
 
 		 233 aa  166  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1604  cytidylate kinase  39.91 
 
 		 221 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2140  cytidylate kinase  40.54 
 
 		 224 aa  165  4e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3257  cytidylate kinase  40.72 
 
 		 233 aa  165  5e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0255416  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0780  cytidylate kinase  42.86 
 
 		 223 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0405191  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0891  cytidylate kinase  36.07 
 
 		 230 aa  164  6.9999999999999995e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00236441  decreased coverage  0.00000000000000152921 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1552  cytidylate kinase  40.65 
 
 		 225 aa  164  8e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1420  cytidylate kinase  41.2 
 
 		 225 aa  164  9e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000147531  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0762  cytidylate kinase  39.55 
 
 		 228 aa  163  2.0000000000000002e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000614962  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1331  cytidylate kinase  43.18 
 
 		 229 aa  162  4.0000000000000004e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282811  decreased coverage  0.00883322 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3792  cytidylate kinase  39.72 
 
 		 225 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157235  hitchhiker  0.0000757077 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  41.31 
 
 		 511 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0179  cytidylate kinase  37.96 
 
 		 227 aa  161  6e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000847233  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  41.31 
 
 		 511 aa  161  7e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1291  cytidylate kinase  44.59 
 
 		 228 aa  160  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1729  cytidylate kinase  40.36 
 
 		 223 aa  160  1e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1645  cytidylate kinase  37.85 
 
 		 225 aa  159  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.170178 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0564  cytidylate kinase  37.16 
 
 		 227 aa  159  2e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2380  cytidylate kinase  42.4 
 
 		 243 aa  159  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.042532  normal  0.287603 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1045  cytidylate kinase  40.19 
 
 		 215 aa  159  4e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.117203  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2219  cytidylate kinase  39.01 
 
 		 224 aa  159  4e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000392774  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1409  cytidylate kinase  39.64 
 
 		 224 aa  159  5e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0393534  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0934  cytidylate kinase  40.09 
 
 		 213 aa  158  5e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1914  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  41.82 
 
 		 483 aa  158  7e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.650764  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1542  cytidylate kinase  40.37 
 
 		 225 aa  158  8e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.624713  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3284  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  39.72 
 
 		 679 aa  158  8e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.185076  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1749  cytidylate kinase  41.31 
 
 		 229 aa  157  9e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00238031  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  42.08 
 
 		 527 aa  157  9e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3643  cytidylate kinase  41.78 
 
 		 229 aa  157  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000551434  normal  0.674927 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003019  cytidylate kinase  38.74 
 
 		 226 aa  157  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000338917  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2799  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  40.93 
 
 		 528 aa  157  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1090  cytidylate kinase  41.31 
 
 		 226 aa  157  1e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000570118  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23320  cytidylate kinase  40.19 
 
 		 229 aa  156  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000301501  normal  0.0247908 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1966  cytidylate kinase  40.38 
 
 		 229 aa  155  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00890  cytidylate kinase  38.07 
 
 		 227 aa  155  5.0000000000000005e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.007598  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1152  cytidylate kinase  42.72 
 
 		 222 aa  155  7e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1565  cytidylate kinase  40.09 
 
 		 219 aa  154  8e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.464485  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1534  cytidylate kinase  40.09 
 
 		 219 aa  154  8e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1346  cytidylate kinase  36.7 
 
 		 219 aa  154  1e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0048747  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2164  cytidylate kinase  38.25 
 
 		 232 aa  153  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00199731  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0567  cytidylate kinase  41.59 
 
 		 228 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1005  cytidylate kinase  41.59 
 
 		 228 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1615  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  37.38 
 
 		 670 aa  153  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1046  cytidylate kinase  41.59 
 
 		 228 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2351  cytidylate kinase  40.37 
 
 		 251 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0508  cytidylate kinase  38.18 
 
 		 221 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4073  cytidylate kinase  38.79 
 
 		 229 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293328  normal  0.11895 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1506  cytidylate kinase  37.16 
 
 		 229 aa  152  2.9999999999999998e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000236579  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2299  cytidylate kinase  38.22 
 
 		 230 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000399193  unclonable  0.0000000000955893 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02861  cytidylate kinase  38.74 
 
 		 226 aa  152  2.9999999999999998e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0928  cytidylate kinase  38.39 
 
 		 226 aa  152  4e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497834  normal  0.452756 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1072  cytidylate kinase  38.39 
 
 		 226 aa  152  4e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000346962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0745  cytidylate kinase  40.28 
 
 		 228 aa  152  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.804624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1234  cytidylate kinase  40.99 
 
 		 255 aa  152  4e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2243  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  38.65 
 
 		 674 aa  152  5e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2334  cytidylate kinase  37.67 
 
 		 226 aa  152  5.9999999999999996e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000116453  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2439  cytidylate kinase  40.37 
 
 		 251 aa  151  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09660  cytidylate kinase  42.08 
 
 		 223 aa  151  5.9999999999999996e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2309  cytidylate kinase  38.67 
 
 		 237 aa  151  7e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.6369 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1515  cytidylate kinase  39.91 
 
 		 250 aa  151  8e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>