More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3643 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_3643  cytidylate kinase  100 
 
 		 229 aa  455  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000551434  normal  0.674927 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1749  cytidylate kinase  96.94 
 
 		 229 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00238031  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4073  cytidylate kinase  83.84 
 
 		 229 aa  372  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293328  normal  0.11895 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1771  cytidylate kinase  83.11 
 
 		 228 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00506628  normal  0.0452484 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1853  cytidylate kinase  82.82 
 
 		 221 aa  365  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0179513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1378  cytidylate kinase  82.82 
 
 		 228 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.925348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1362  cytidylate kinase  82.46 
 
 		 228 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0105821  normal  0.0198977 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3943  cytidylate kinase  84.16 
 
 		 225 aa  363  1e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.302806  normal  0.232418 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1966  cytidylate kinase  79.2 
 
 		 229 aa  347  7e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23320  cytidylate kinase  78.76 
 
 		 229 aa  346  2e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000301501  normal  0.0247908 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15860  cytidylate kinase  80.35 
 
 		 229 aa  339  2e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1752  cytidylate kinase  61.71 
 
 		 227 aa  279  2e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000925539  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2310  cytidylate kinase  59.91 
 
 		 230 aa  273  1.0000000000000001e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000698578  hitchhiker  0.000000443143 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2299  cytidylate kinase  60.36 
 
 		 230 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000399193  unclonable  0.0000000000955893 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2072  cytidylate kinase  59.91 
 
 		 230 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000270816  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2124  cytidylate kinase  61.71 
 
 		 229 aa  272  4.0000000000000004e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109139  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1734  cytidylate kinase  62.73 
 
 		 225 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000603603  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1026  cytidylate kinase  65.9 
 
 		 226 aa  271  5.000000000000001e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000434199  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2002  cytidylate kinase  62.9 
 
 		 225 aa  270  9e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0311014  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2334  cytidylate kinase  62.56 
 
 		 226 aa  269  2.9999999999999997e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000116453  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2340  cytidylate kinase  61.26 
 
 		 229 aa  269  2.9999999999999997e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000158492  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1708  cytidylate kinase  63.64 
 
 		 229 aa  268  5.9999999999999995e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000112654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1735  cytidylate kinase  60.36 
 
 		 231 aa  267  1e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610181  decreased coverage  0.000087686 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1429  cytidylate kinase  63.47 
 
 		 227 aa  267  1e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000204841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1954  cytidylate kinase  62.73 
 
 		 230 aa  266  2.9999999999999995e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000903512  normal  0.349566 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2581  cytidylate kinase  62.73 
 
 		 230 aa  266  2.9999999999999995e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000568011  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2669  cytidylate kinase  62.73 
 
 		 230 aa  266  2.9999999999999995e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000410063  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1923  cytidylate kinase  59.91 
 
 		 230 aa  264  7e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000722421  unclonable  0.0000000000403388 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1976  cytidylate kinase  59.91 
 
 		 230 aa  264  8e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000166074  hitchhiker  0.00000000164919 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2043  cytidylate kinase  60.36 
 
 		 230 aa  264  1e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000246913  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1953  cytidylate kinase  61.71 
 
 		 230 aa  263  1e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000156815  hitchhiker  0.0000548451 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2467  cytidylate kinase  62.91 
 
 		 225 aa  264  1e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000550284  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2055  cytidylate kinase  59.91 
 
 		 230 aa  263  1e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000628627  unclonable  0.0000241467 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00914  cytidylate kinase  63.01 
 
 		 227 aa  263  2e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.42509  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2733  cytidylate kinase  63.01 
 
 		 227 aa  263  2e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000397985  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1007  cytidylate kinase  63.01 
 
 		 227 aa  263  2e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000820305  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2210  cytidylate kinase  63.01 
 
 		 227 aa  263  2e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000277871  normal  0.370624 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1071  cytidylate kinase  63.01 
 
 		 227 aa  263  2e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000134482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1016  cytidylate kinase  63.01 
 
 		 227 aa  263  2e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000287427  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00921  hypothetical protein  63.01 
 
 		 227 aa  263  2e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.411433  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2856  cytidylate kinase  61.67 
 
 		 227 aa  263  2e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000021992  hitchhiker  0.0000000124191 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2418  cytidylate kinase  63.01 
 
 		 227 aa  263  2e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000459306  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2686  cytidylate kinase  63.01 
 
 		 227 aa  263  2e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000200966  normal  0.762789 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1078  cytidylate kinase  63.01 
 
 		 227 aa  262  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0687941 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0986  cytidylate kinase  63.01 
 
 		 227 aa  262  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000706228  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1013  cytidylate kinase  63.01 
 
 		 227 aa  262  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0567176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1045  cytidylate kinase  63.01 
 
 		 227 aa  262  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.185526  normal  0.763998 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1506  cytidylate kinase  62.61 
 
 		 229 aa  262  3e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000236579  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1093  cytidylate kinase  63.01 
 
 		 227 aa  262  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0104083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2164  cytidylate kinase  64.86 
 
 		 232 aa  261  4e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00199731  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2280  cytidylate kinase  59.46 
 
 		 230 aa  261  6.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000793863  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2065  cytidylate kinase  59.46 
 
 		 230 aa  261  6.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000105966  unclonable  0.00000000000213103 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2069  cytidylate kinase  59.46 
 
 		 230 aa  261  6.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000019021  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2397  cytidylate kinase  59.46 
 
 		 230 aa  261  6.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000169082  unclonable  0.00000986897 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2403  cytidylate kinase  58.56 
 
 		 230 aa  260  1e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003019  cytidylate kinase  60.36 
 
 		 226 aa  259  3e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000338917  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2219  cytidylate kinase  61.26 
 
 		 224 aa  257  1e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000392774  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02861  cytidylate kinase  60.81 
 
 		 226 aa  256  3e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0930  cytidylate kinase  59.91 
 
 		 234 aa  249  3e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1542  cytidylate kinase  61.93 
 
 		 225 aa  248  4e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.624713  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0564  cytidylate kinase  60.37 
 
 		 227 aa  248  6e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2238  cytidylate kinase  61.71 
 
 		 230 aa  247  1e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000316854  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3014  cytidylate kinase  57.08 
 
 		 228 aa  246  3e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000196489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0254  cytidylate kinase  56 
 
 		 225 aa  244  9.999999999999999e-64  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.13077  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0179  cytidylate kinase  57.08 
 
 		 227 aa  242  3e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000847233  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1211  cytidylate kinase  62.16 
 
 		 235 aa  242  3e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00218748  normal  0.15361 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1375  cytidylate kinase  53.88 
 
 		 230 aa  240  1e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1371  cytidylate kinase  53.88 
 
 		 230 aa  240  1e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1645  cytidylate kinase  53.88 
 
 		 225 aa  228  7e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.170178 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0955  cytidylate kinase  60.49 
 
 		 225 aa  223  3e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000242866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0778  cytidylate kinase  56.07 
 
 		 231 aa  221  8e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00825892 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00890  cytidylate kinase  52.25 
 
 		 227 aa  219  3e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.007598  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0849  cytidylate kinase  55.61 
 
 		 231 aa  219  3e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.744629  normal  0.265979 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1332  cytidylate kinase  55.86 
 
 		 219 aa  218  5e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000433479  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2140  cytidylate kinase  57.48 
 
 		 224 aa  218  6e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4723  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  54.75 
 
 		 675 aa  217  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.86018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0641  cytidylate kinase  47.56 
 
 		 237 aa  216  2e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000272482  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1536  cytidylate kinase  47.56 
 
 		 237 aa  216  2e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000588366  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0977  cytidylate kinase  54.3 
 
 		 237 aa  216  2.9999999999999998e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000004631  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1279  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  56.74 
 
 		 643 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.091835  normal  0.851498 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2468  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  53.21 
 
 		 673 aa  211  7e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.835531  normal  0.361895 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0745  cytidylate kinase  53.7 
 
 		 228 aa  211  9e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.804624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1392  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  52.75 
 
 		 673 aa  211  1e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.121243  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0928  cytidylate kinase  53.74 
 
 		 226 aa  209  2e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497834  normal  0.452756 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1072  cytidylate kinase  53.74 
 
 		 226 aa  209  2e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000346962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0721  cytidylate kinase  52.53 
 
 		 219 aa  209  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0824528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1790  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  53.74 
 
 		 668 aa  209  4e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149687 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2795  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  52.29 
 
 		 667 aa  208  6e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233138 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2570  cytidylate kinase  52.53 
 
 		 221 aa  207  8e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138254  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2883  cytidylate kinase  53.95 
 
 		 228 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0880838  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1637  cytidylate kinase  53.95 
 
 		 228 aa  207  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2946  cytidylate kinase  53.95 
 
 		 228 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0908  cytidylate kinase  52.8 
 
 		 230 aa  206  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2995  cytidylate kinase  53.95 
 
 		 255 aa  206  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1197  cytidylate kinase  49.78 
 
 		 221 aa  206  3e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0429  cytidylate kinase  53.49 
 
 		 228 aa  205  4e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0948  cytidylate kinase  53.49 
 
 		 228 aa  205  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0200  cytidylate kinase  53.49 
 
 		 228 aa  205  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0981  cytidylate kinase  53.7 
 
 		 228 aa  205  4e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.233916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2573  cytidylate kinase  53.49 
 
 		 228 aa  205  4e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0883038  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>