More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0762 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0762  cytidylate kinase  100 
 
 		 228 aa  462  1e-129  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000614962  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1293  cytidylate kinase  57.53 
 
 		 224 aa  249  2e-65  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00871161  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1623  cytidylate kinase  55 
 
 		 225 aa  244  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000468562  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1407  cytidylate kinase  55 
 
 		 225 aa  243  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000164884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1379  cytidylate kinase  55 
 
 		 225 aa  243  9.999999999999999e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000311756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1378  cytidylate kinase  55 
 
 		 225 aa  243  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000246043  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1591  cytidylate kinase  55 
 
 		 225 aa  243  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1931099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1518  cytidylate kinase  55 
 
 		 225 aa  243  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000739284  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1659  cytidylate kinase  55 
 
 		 225 aa  243  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000228259  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1220  cytidylate kinase  55 
 
 		 225 aa  241  9e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000130808  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1420  cytidylate kinase  54.55 
 
 		 225 aa  238  4e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000147531  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3792  cytidylate kinase  54.09 
 
 		 225 aa  237  1e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157235  hitchhiker  0.0000757077 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1552  cytidylate kinase  53.64 
 
 		 225 aa  237  1e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0891  cytidylate kinase  52.27 
 
 		 230 aa  236  3e-61  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00236441  decreased coverage  0.00000000000000152921 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1008  cytidylate kinase  54.13 
 
 		 219 aa  231  7.000000000000001e-60  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2171  cytidylate kinase  50.9 
 
 		 224 aa  221  6e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000313487  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0712  cytidylate kinase  50.47 
 
 		 227 aa  219  3.9999999999999997e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000327752  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1385  cytidylate kinase  51.8 
 
 		 227 aa  213  1.9999999999999998e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000116404  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1152  cytidylate kinase  53.7 
 
 		 222 aa  212  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0964  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  53.99 
 
 		 534 aa  212  3.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10390  cytidylate kinase  47.98 
 
 		 228 aa  208  6e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000240582  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3387  cytidylate kinase  50.45 
 
 		 232 aa  207  8e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000123016  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1090  cytidylate kinase  50.67 
 
 		 226 aa  207  9e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000570118  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1331  cytidylate kinase  50.46 
 
 		 229 aa  206  3e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282811  decreased coverage  0.00883322 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20401  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  47.69 
 
 		 516 aa  206  3e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.523642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1165  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  47.22 
 
 		 516 aa  204  7e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.841072  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2799  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  49.77 
 
 		 528 aa  202  3e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2100  cytidylate kinase  47.27 
 
 		 229 aa  202  5e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.578851 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1604  cytidylate kinase  49.54 
 
 		 221 aa  200  9.999999999999999e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17111  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.59 
 
 		 517 aa  199  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0453  cytidylate kinase  50.45 
 
 		 224 aa  199  3e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1860  cytidylate kinase  50.68 
 
 		 220 aa  199  3e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.10096  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1325  cytidylate kinase  45.5 
 
 		 226 aa  198  3.9999999999999996e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4282  pantoate/beta-alanine ligase  48.21 
 
 		 539 aa  198  5e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0865  cytidylate kinase  43.24 
 
 		 232 aa  198  7e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.054851  normal  0.903587 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1180  cytidylate kinase  48.62 
 
 		 232 aa  197  9e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.848672  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1232  cytidylate kinase  49.32 
 
 		 219 aa  197  2.0000000000000003e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1346  cytidylate kinase  44.95 
 
 		 219 aa  196  3e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0048747  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1148  cytidylate kinase  49.76 
 
 		 218 aa  194  1e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0695  cytidylate kinase  45.87 
 
 		 223 aa  192  3e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2605  cytidylate kinase  43.24 
 
 		 233 aa  190  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.95 
 
 		 511 aa  190  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0725  cytidylate kinase  44.95 
 
 		 514 aa  190  2e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0311607  normal  0.0975143 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.95 
 
 		 511 aa  189  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2147  cytidylate kinase  40.91 
 
 		 232 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0902079  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  45.45 
 
 		 527 aa  189  2.9999999999999997e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14810  cytidylate kinase  47.71 
 
 		 269 aa  189  2.9999999999999997e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1190  cytidylate kinase  47.12 
 
 		 225 aa  188  5e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.988165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1465  cytidylate kinase  42.99 
 
 		 240 aa  188  5e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00293534  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5340  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  43.98 
 
 		 526 aa  188  7e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1622  cytidylate kinase  46.54 
 
 		 217 aa  187  1e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3643  cytidylate kinase  44.13 
 
 		 229 aa  186  3e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000551434  normal  0.674927 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1914  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.04 
 
 		 483 aa  186  3e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.650764  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23320  cytidylate kinase  45.58 
 
 		 229 aa  185  4e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000301501  normal  0.0247908 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2467  cytidylate kinase  41.78 
 
 		 225 aa  185  5e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000550284  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0993  cytidylate kinase  42.47 
 
 		 233 aa  185  5e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1209  cytidylate kinase  47.77 
 
 		 240 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1045  cytidylate kinase  45.62 
 
 		 215 aa  183  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.117203  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1884  cytidylate kinase  41.96 
 
 		 235 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000963447  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1966  cytidylate kinase  45.12 
 
 		 229 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1333  cytidylate kinase  45.37 
 
 		 252 aa  183  2.0000000000000003e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.671241 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1640  cytidylate kinase  43.5 
 
 		 231 aa  182  3e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.302898 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1749  cytidylate kinase  43.19 
 
 		 229 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00238031  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3257  cytidylate kinase  42.01 
 
 		 233 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0255416  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1409  cytidylate kinase  48.37 
 
 		 224 aa  182  5.0000000000000004e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0393534  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1853  cytidylate kinase  42.45 
 
 		 221 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0179513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4073  cytidylate kinase  43.19 
 
 		 229 aa  181  7e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293328  normal  0.11895 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09660  cytidylate kinase  43.98 
 
 		 223 aa  181  7e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2816  cytidylate kinase  44.91 
 
 		 244 aa  181  8.000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0539109  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2943  cytidylate kinase  45.33 
 
 		 228 aa  181  9.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.142488 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2928  cytidylate kinase  45.33 
 
 		 228 aa  181  9.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2972  cytidylate kinase  45.33 
 
 		 228 aa  181  9.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1378  cytidylate kinase  41.78 
 
 		 228 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.925348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3339  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.8 
 
 		 529 aa  180  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1348  cytidylate kinase  42.27 
 
 		 233 aa  181  1e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000802306  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1771  cytidylate kinase  41.31 
 
 		 228 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00506628  normal  0.0452484 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1565  cytidylate kinase  44.8 
 
 		 219 aa  179  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.464485  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1534  cytidylate kinase  44.8 
 
 		 219 aa  179  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3943  cytidylate kinase  41.31 
 
 		 225 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.302806  normal  0.232418 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22471  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.91 
 
 		 488 aa  178  5.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2450  cytidylate kinase  45.37 
 
 		 227 aa  178  7e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000180887  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1729  cytidylate kinase  45.71 
 
 		 223 aa  177  8e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1705  cytidylate kinase  47.51 
 
 		 234 aa  177  9e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000535126  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2340  cytidylate kinase  41.26 
 
 		 229 aa  177  1e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000158492  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11727  cytidylate kinase  46.58 
 
 		 230 aa  177  1e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.808416  normal  0.551451 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1151  cytidylate kinase  44.59 
 
 		 217 aa  177  1e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1362  cytidylate kinase  40.85 
 
 		 228 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0105821  normal  0.0198977 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10343  putative cytidylate kinase  42.92 
 
 		 232 aa  177  2e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1340  cytidylate kinase  44.14 
 
 		 217 aa  176  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0841827  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1234  cytidylate kinase  43.75 
 
 		 255 aa  176  2e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2140  cytidylate kinase  41.74 
 
 		 224 aa  176  3e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6626  cytidylate kinase  46.45 
 
 		 228 aa  176  3e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.422792 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2002  cytidylate kinase  42.31 
 
 		 225 aa  175  5e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0311014  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0564  cytidylate kinase  42.38 
 
 		 227 aa  175  6e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0603  cytidylate kinase  47 
 
 		 231 aa  174  9e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.794292 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0331  cytidylate kinase  42.52 
 
 		 227 aa  174  9e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2999  cytidylate kinase  42.92 
 
 		 218 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.202126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0416  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.34 
 
 		 480 aa  174  9.999999999999999e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130302  normal  0.171776 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1734  cytidylate kinase  42.86 
 
 		 225 aa  174  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000603603  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17821  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  45.5 
 
 		 510 aa  173  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>