More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11727 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_11727  cytidylate kinase  100 
 
 		 230 aa  443  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.808416  normal  0.551451 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2943  cytidylate kinase  77.63 
 
 		 228 aa  322  4e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.142488 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2928  cytidylate kinase  77.63 
 
 		 228 aa  322  4e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2972  cytidylate kinase  77.63 
 
 		 228 aa  322  4e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3275  cytidylate kinase  72.17 
 
 		 228 aa  290  1e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00480456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3494  cytidylate kinase  68.58 
 
 		 228 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.121252  normal  0.220697 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2370  cytidylate kinase  57.08 
 
 		 230 aa  231  8.000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2816  cytidylate kinase  61.64 
 
 		 244 aa  230  1e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0539109  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14810  cytidylate kinase  55.46 
 
 		 269 aa  218  8.999999999999998e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4053  cytidylate kinase  54.19 
 
 		 237 aa  193  2e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.737669  normal  0.51193 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09660  cytidylate kinase  49.78 
 
 		 223 aa  191  8e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2827  cytidylate kinase  53.74 
 
 		 223 aa  191  9e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300632  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2999  cytidylate kinase  50.67 
 
 		 218 aa  188  5e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.202126  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0979  cytidylate kinase  52.51 
 
 		 231 aa  185  5e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1234  cytidylate kinase  54.02 
 
 		 255 aa  185  5e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1640  cytidylate kinase  42.01 
 
 		 231 aa  181  6e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.302898 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1496  cytidylate kinase  54.05 
 
 		 252 aa  181  6e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1920  cytidylate kinase  53.36 
 
 		 226 aa  178  7e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011282 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2309  cytidylate kinase  51.74 
 
 		 237 aa  177  8e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.6369 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4424  cytidylate kinase  50 
 
 		 225 aa  177  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2171  cytidylate kinase  42.4 
 
 		 224 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000313487  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2100  cytidylate kinase  42.99 
 
 		 229 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.578851 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1456  cytidylate kinase  50.22 
 
 		 268 aa  176  3e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00727375 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1604  cytidylate kinase  42.52 
 
 		 221 aa  175  4e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1409  cytidylate kinase  41.63 
 
 		 224 aa  174  8e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0393534  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10390  cytidylate kinase  43.58 
 
 		 228 aa  174  9e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000240582  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0725  cytidylate kinase  45.29 
 
 		 514 aa  174  9.999999999999999e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0311607  normal  0.0975143 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0695  cytidylate kinase  41.36 
 
 		 223 aa  172  2.9999999999999996e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1209  cytidylate kinase  47.79 
 
 		 240 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1966  cytidylate kinase  45.98 
 
 		 229 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1333  cytidylate kinase  48.17 
 
 		 252 aa  171  6.999999999999999e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.671241 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1152  cytidylate kinase  47 
 
 		 222 aa  170  1e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1331  cytidylate kinase  46.05 
 
 		 229 aa  171  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282811  decreased coverage  0.00883322 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0891  cytidylate kinase  41.1 
 
 		 230 aa  171  1e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00236441  decreased coverage  0.00000000000000152921 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1351  cytidylate kinase  40.09 
 
 		 214 aa  171  1e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00022877  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1325  cytidylate kinase  43.84 
 
 		 226 aa  170  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1385  cytidylate kinase  41.28 
 
 		 227 aa  169  2e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000116404  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2380  cytidylate kinase  47.51 
 
 		 243 aa  169  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.042532  normal  0.287603 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2467  cytidylate kinase  43.18 
 
 		 225 aa  170  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000550284  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0934  cytidylate kinase  39.91 
 
 		 213 aa  170  2e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23320  cytidylate kinase  44.09 
 
 		 229 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000301501  normal  0.0247908 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0453  cytidylate kinase  46.54 
 
 		 224 aa  169  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0977  cytidylate kinase  39.63 
 
 		 237 aa  169  5e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000004631  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2982  cytidylate kinase  51.17 
 
 		 229 aa  168  8e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1929  cytidylate kinase  53.36 
 
 		 227 aa  167  9e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.339445  normal  0.343027 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1884  cytidylate kinase  43.18 
 
 		 235 aa  166  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000963447  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5340  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  45.58 
 
 		 526 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2117  cytidylate kinase  43.75 
 
 		 225 aa  167  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000190032  unclonable  0.00000899897 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.84 
 
 		 527 aa  166  2.9999999999999998e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2570  cytidylate kinase  42.79 
 
 		 221 aa  165  5e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138254  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3643  cytidylate kinase  42.67 
 
 		 229 aa  164  8e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000551434  normal  0.674927 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1026  cytidylate kinase  42.99 
 
 		 226 aa  164  9e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000434199  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3387  cytidylate kinase  43.38 
 
 		 232 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000123016  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0928  cytidylate kinase  42.25 
 
 		 226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497834  normal  0.452756 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1072  cytidylate kinase  42.25 
 
 		 226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000346962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0712  cytidylate kinase  41.31 
 
 		 227 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000327752  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2002  cytidylate kinase  42.99 
 
 		 225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0311014  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1180  cytidylate kinase  45.33 
 
 		 232 aa  163  2.0000000000000002e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.848672  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1749  cytidylate kinase  41.33 
 
 		 229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00238031  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0955  cytidylate kinase  45.59 
 
 		 225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000242866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2756  cytidylate kinase  41.78 
 
 		 230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1734  cytidylate kinase  42.99 
 
 		 225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000603603  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1853  cytidylate kinase  40.54 
 
 		 221 aa  163  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0179513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1614  cytidylate kinase  54.26 
 
 		 239 aa  162  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0721  cytidylate kinase  43.26 
 
 		 219 aa  162  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0824528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2072  cytidylate kinase  41.04 
 
 		 230 aa  162  3e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000270816  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1378  cytidylate kinase  42.72 
 
 		 228 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.925348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2164  cytidylate kinase  43.84 
 
 		 232 aa  161  6e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00199731  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1293  cytidylate kinase  41.67 
 
 		 224 aa  162  6e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00871161  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1506  cytidylate kinase  42.2 
 
 		 229 aa  161  7e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000236579  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3221  cytidylate kinase  42.54 
 
 		 227 aa  161  7e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529092  normal  0.197926 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2340  cytidylate kinase  41.82 
 
 		 229 aa  161  9e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000158492  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1623  cytidylate kinase  40 
 
 		 225 aa  160  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000468562  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3257  cytidylate kinase  42.73 
 
 		 233 aa  160  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0255416  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4282  pantoate/beta-alanine ligase  42.67 
 
 		 539 aa  160  1e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1379  cytidylate kinase  40 
 
 		 225 aa  159  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000311756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1378  cytidylate kinase  40 
 
 		 225 aa  159  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000246043  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0993  cytidylate kinase  43.75 
 
 		 233 aa  160  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1591  cytidylate kinase  40 
 
 		 225 aa  159  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1931099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1429  cytidylate kinase  39.82 
 
 		 227 aa  160  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000204841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2140  cytidylate kinase  40.91 
 
 		 224 aa  160  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2147  cytidylate kinase  40.62 
 
 		 232 aa  160  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0902079  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1659  cytidylate kinase  40 
 
 		 225 aa  159  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000228259  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0331  cytidylate kinase  43.26 
 
 		 227 aa  159  3e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1708  cytidylate kinase  40.47 
 
 		 229 aa  159  3e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000112654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1752  cytidylate kinase  41.01 
 
 		 227 aa  159  3e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000925539  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2690  cytidylate kinase  37.39 
 
 		 218 aa  159  3e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495966  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2219  cytidylate kinase  40.54 
 
 		 224 aa  159  4e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000392774  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1407  cytidylate kinase  40.19 
 
 		 225 aa  159  4e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000164884  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1021  cytidylate kinase  40.28 
 
 		 216 aa  159  4e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1220  cytidylate kinase  39.07 
 
 		 225 aa  159  4e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000130808  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1518  cytidylate kinase  40.19 
 
 		 225 aa  159  4e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000739284  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1148  cytidylate kinase  45.02 
 
 		 218 aa  159  4e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3339  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.59 
 
 		 529 aa  159  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2299  cytidylate kinase  42.45 
 
 		 230 aa  159  4e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000399193  unclonable  0.0000000000955893 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1232  cytidylate kinase  42.2 
 
 		 219 aa  159  5e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1552  cytidylate kinase  40 
 
 		 225 aa  159  5e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2310  cytidylate kinase  41.98 
 
 		 230 aa  158  5e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000698578  hitchhiker  0.000000443143 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0762  cytidylate kinase  46.58 
 
 		 228 aa  158  5e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000614962  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2124  cytidylate kinase  41.36 
 
 		 229 aa  159  5e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109139  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>