More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_14810 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_14810  cytidylate kinase  100 
 
 		 269 aa  516  1.0000000000000001e-145  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11727  cytidylate kinase  55.46 
 
 		 230 aa  218  1e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.808416  normal  0.551451 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2928  cytidylate kinase  55.98 
 
 		 228 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2943  cytidylate kinase  55.98 
 
 		 228 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.142488 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2972  cytidylate kinase  55.98 
 
 		 228 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3494  cytidylate kinase  55.41 
 
 		 228 aa  209  5e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.121252  normal  0.220697 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2816  cytidylate kinase  57.14 
 
 		 244 aa  205  5e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0539109  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2827  cytidylate kinase  55.41 
 
 		 223 aa  205  7e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300632  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1614  cytidylate kinase  60.26 
 
 		 239 aa  205  8e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3275  cytidylate kinase  59.01 
 
 		 228 aa  199  5e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00480456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2999  cytidylate kinase  52.7 
 
 		 218 aa  197  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.202126  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2370  cytidylate kinase  53.21 
 
 		 230 aa  197  1.0000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0979  cytidylate kinase  52.94 
 
 		 231 aa  194  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1209  cytidylate kinase  52.04 
 
 		 240 aa  193  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4424  cytidylate kinase  51.57 
 
 		 225 aa  193  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1496  cytidylate kinase  56.31 
 
 		 252 aa  192  6e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1456  cytidylate kinase  54.03 
 
 		 268 aa  190  2e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00727375 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1234  cytidylate kinase  50 
 
 		 255 aa  184  9e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1860  cytidylate kinase  45.25 
 
 		 220 aa  180  2e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.10096  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4053  cytidylate kinase  49.13 
 
 		 237 aa  179  4e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.737669  normal  0.51193 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1920  cytidylate kinase  53.12 
 
 		 226 aa  176  3e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011282 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2171  cytidylate kinase  41.63 
 
 		 224 aa  175  6e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000313487  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1465  cytidylate kinase  44.74 
 
 		 240 aa  175  7e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00293534  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1291  cytidylate kinase  50 
 
 		 228 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1640  cytidylate kinase  40.81 
 
 		 231 aa  173  2.9999999999999996e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.302898 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0762  cytidylate kinase  47.71 
 
 		 228 aa  172  5e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000614962  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0695  cytidylate kinase  39.64 
 
 		 223 aa  172  5.999999999999999e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1152  cytidylate kinase  45.66 
 
 		 222 aa  170  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1333  cytidylate kinase  47.3 
 
 		 252 aa  170  3e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.671241 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3257  cytidylate kinase  43.24 
 
 		 233 aa  169  6e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0255416  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3339  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  43.35 
 
 		 529 aa  168  7e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0993  cytidylate kinase  43.69 
 
 		 233 aa  168  7e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1884  cytidylate kinase  42.92 
 
 		 235 aa  168  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000963447  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1348  cytidylate kinase  43.86 
 
 		 233 aa  168  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000802306  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1325  cytidylate kinase  40.55 
 
 		 226 aa  167  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  43.23 
 
 		 527 aa  167  2e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5059  cytidylate kinase  54.03 
 
 		 225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0373389  normal  0.0397379 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3387  cytidylate kinase  43.56 
 
 		 232 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000123016  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1542  cytidylate kinase  43.56 
 
 		 225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.624713  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1385  cytidylate kinase  43.89 
 
 		 227 aa  166  4e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000116404  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3792  cytidylate kinase  41.47 
 
 		 225 aa  166  5e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157235  hitchhiker  0.0000757077 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1552  cytidylate kinase  41.01 
 
 		 225 aa  166  5e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3589  cytidylate kinase  40.18 
 
 		 233 aa  165  5.9999999999999996e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.577192  normal  0.0958027 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0934  cytidylate kinase  38.16 
 
 		 213 aa  165  5.9999999999999996e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09660  cytidylate kinase  46.02 
 
 		 223 aa  165  5.9999999999999996e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1090  cytidylate kinase  40.71 
 
 		 226 aa  165  5.9999999999999996e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000570118  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1407  cytidylate kinase  41.59 
 
 		 225 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000164884  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1518  cytidylate kinase  41.59 
 
 		 225 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000739284  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1623  cytidylate kinase  41.01 
 
 		 225 aa  165  8e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000468562  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1379  cytidylate kinase  41.59 
 
 		 225 aa  165  8e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000311756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1378  cytidylate kinase  41.59 
 
 		 225 aa  165  8e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000246043  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1659  cytidylate kinase  41.59 
 
 		 225 aa  165  8e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000228259  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1591  cytidylate kinase  41.59 
 
 		 225 aa  165  8e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1931099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0725  cytidylate kinase  43.17 
 
 		 514 aa  165  9e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0311607  normal  0.0975143 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5340  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.29 
 
 		 526 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2605  cytidylate kinase  42.34 
 
 		 233 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0964  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  43.36 
 
 		 534 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10390  cytidylate kinase  41.7 
 
 		 228 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000240582  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1148  cytidylate kinase  46.19 
 
 		 218 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1293  cytidylate kinase  41.7 
 
 		 224 aa  163  2.0000000000000002e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00871161  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2501  cytidylate kinase  50.23 
 
 		 243 aa  163  3e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.837202  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1420  cytidylate kinase  41.12 
 
 		 225 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000147531  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  42.79 
 
 		 511 aa  162  6e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1929  cytidylate kinase  53.12 
 
 		 227 aa  162  6e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.339445  normal  0.343027 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  42.79 
 
 		 511 aa  162  6e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1351  cytidylate kinase  38.81 
 
 		 214 aa  162  6e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00022877  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2982  cytidylate kinase  52 
 
 		 229 aa  161  8.000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0930  cytidylate kinase  44.54 
 
 		 234 aa  161  1e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0453  cytidylate kinase  44.34 
 
 		 224 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2799  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  40.72 
 
 		 528 aa  160  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6626  cytidylate kinase  39.04 
 
 		 228 aa  160  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.422792 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0891  cytidylate kinase  38.82 
 
 		 230 aa  160  3e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00236441  decreased coverage  0.00000000000000152921 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0712  cytidylate kinase  41.63 
 
 		 227 aa  159  4e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000327752  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2690  cytidylate kinase  38.29 
 
 		 218 aa  158  7e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495966  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1008  cytidylate kinase  39.91 
 
 		 219 aa  158  8e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0865  cytidylate kinase  40.54 
 
 		 232 aa  158  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.054851  normal  0.903587 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1220  cytidylate kinase  41.51 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000130808  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1021  cytidylate kinase  42.72 
 
 		 216 aa  157  2e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1180  cytidylate kinase  42.54 
 
 		 232 aa  157  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.848672  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1604  cytidylate kinase  39.04 
 
 		 221 aa  157  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2140  cytidylate kinase  42.48 
 
 		 224 aa  157  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2467  cytidylate kinase  40.97 
 
 		 225 aa  157  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000550284  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1409  cytidylate kinase  39.55 
 
 		 224 aa  157  2e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0393534  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1232  cytidylate kinase  40.09 
 
 		 219 aa  156  3e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19860  cytidylate kinase  44.44 
 
 		 250 aa  156  3e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0928  cytidylate kinase  44.29 
 
 		 226 aa  156  3e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497834  normal  0.452756 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1072  cytidylate kinase  44.29 
 
 		 226 aa  156  3e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000346962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1005  cytidylate kinase  44.24 
 
 		 228 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2147  cytidylate kinase  40.99 
 
 		 232 aa  156  4e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0902079  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0567  cytidylate kinase  44.24 
 
 		 228 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0086  cytidylate kinase  40.09 
 
 		 234 aa  156  4e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0568049 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1046  cytidylate kinase  44.24 
 
 		 228 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1914  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.44 
 
 		 483 aa  155  5.0000000000000005e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.650764  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0594  cytidylate kinase  41.94 
 
 		 213 aa  155  6e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0179  cytidylate kinase  41.01 
 
 		 227 aa  155  8e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000847233  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4159  cytidylate kinase  44.24 
 
 		 228 aa  154  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06850  cytidylate kinase  48.2 
 
 		 223 aa  154  1e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.734775  normal  0.308288 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2309  cytidylate kinase  47.98 
 
 		 237 aa  154  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.6369 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10343  putative cytidylate kinase  39.38 
 
 		 232 aa  154  1e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0745  cytidylate kinase  43.78 
 
 		 228 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.804624  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>