More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1456 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1456  cytidylate kinase  100 
 
 		 268 aa  512  1e-144  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00727375 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5059  cytidylate kinase  82.73 
 
 		 225 aa  314  8e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0373389  normal  0.0397379 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2999  cytidylate kinase  55.66 
 
 		 218 aa  218  6e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.202126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2827  cytidylate kinase  54.55 
 
 		 223 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300632  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1209  cytidylate kinase  51.98 
 
 		 240 aa  211  1e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0979  cytidylate kinase  52.86 
 
 		 231 aa  211  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1496  cytidylate kinase  55.51 
 
 		 252 aa  209  3e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14810  cytidylate kinase  54.03 
 
 		 269 aa  190  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1152  cytidylate kinase  45.29 
 
 		 222 aa  189  4e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1234  cytidylate kinase  51.38 
 
 		 255 aa  186  2e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2943  cytidylate kinase  52.8 
 
 		 228 aa  181  9.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.142488 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2928  cytidylate kinase  52.8 
 
 		 228 aa  181  9.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2972  cytidylate kinase  52.8 
 
 		 228 aa  181  9.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1920  cytidylate kinase  56.87 
 
 		 226 aa  179  5.999999999999999e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011282 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3494  cytidylate kinase  52.04 
 
 		 228 aa  177  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.121252  normal  0.220697 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11727  cytidylate kinase  50.22 
 
 		 230 aa  176  4e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.808416  normal  0.551451 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2799  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  45.41 
 
 		 528 aa  175  6e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2370  cytidylate kinase  50 
 
 		 230 aa  175  6e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09660  cytidylate kinase  46.82 
 
 		 223 aa  175  8e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2501  cytidylate kinase  51.12 
 
 		 243 aa  175  8e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.837202  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3339  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  47.49 
 
 		 529 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1604  cytidylate kinase  41.12 
 
 		 221 aa  169  3e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2816  cytidylate kinase  48.58 
 
 		 244 aa  168  7e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0539109  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10390  cytidylate kinase  43.89 
 
 		 228 aa  168  8e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000240582  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  47.06 
 
 		 527 aa  168  9e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3061  cytidylate kinase  53.49 
 
 		 242 aa  168  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  normal  0.04389 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0964  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  46.88 
 
 		 534 aa  167  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1929  cytidylate kinase  55.56 
 
 		 227 aa  167  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.339445  normal  0.343027 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2171  cytidylate kinase  42.52 
 
 		 224 aa  166  4e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000313487  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2100  cytidylate kinase  41.89 
 
 		 229 aa  165  5.9999999999999996e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.578851 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1333  cytidylate kinase  46.36 
 
 		 252 aa  164  2.0000000000000002e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.671241 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5340  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  45.83 
 
 		 526 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1614  cytidylate kinase  50.23 
 
 		 239 aa  161  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1623  cytidylate kinase  40.65 
 
 		 225 aa  160  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000468562  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2690  cytidylate kinase  39.82 
 
 		 218 aa  160  2e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495966  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1407  cytidylate kinase  40.65 
 
 		 225 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000164884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1379  cytidylate kinase  40.65 
 
 		 225 aa  160  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000311756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1378  cytidylate kinase  40.65 
 
 		 225 aa  160  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000246043  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1518  cytidylate kinase  40.65 
 
 		 225 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000739284  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4282  pantoate/beta-alanine ligase  45.13 
 
 		 539 aa  159  3e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1659  cytidylate kinase  40.65 
 
 		 225 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000228259  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1591  cytidylate kinase  40.65 
 
 		 225 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1931099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1860  cytidylate kinase  42.34 
 
 		 220 aa  159  3e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.10096  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2164  cytidylate kinase  44.05 
 
 		 232 aa  159  4e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00199731  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1420  cytidylate kinase  41.12 
 
 		 225 aa  159  5e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000147531  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4424  cytidylate kinase  46.67 
 
 		 225 aa  158  7e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1090  cytidylate kinase  40.18 
 
 		 226 aa  159  7e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000570118  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1220  cytidylate kinase  41.59 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000130808  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1331  cytidylate kinase  46.3 
 
 		 229 aa  158  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282811  decreased coverage  0.00883322 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1552  cytidylate kinase  40.65 
 
 		 225 aa  157  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0712  cytidylate kinase  39.56 
 
 		 227 aa  157  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000327752  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3387  cytidylate kinase  42.66 
 
 		 232 aa  156  4e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000123016  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0977  cytidylate kinase  39.38 
 
 		 237 aa  156  4e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000004631  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1536  cytidylate kinase  45.33 
 
 		 237 aa  156  4e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0931424  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1385  cytidylate kinase  42.79 
 
 		 227 aa  155  5.0000000000000005e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000116404  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3221  cytidylate kinase  42.79 
 
 		 227 aa  155  6e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529092  normal  0.197926 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1542  cytidylate kinase  44.64 
 
 		 225 aa  155  6e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.624713  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1640  cytidylate kinase  37.78 
 
 		 231 aa  154  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.302898 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3792  cytidylate kinase  40.65 
 
 		 225 aa  155  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157235  hitchhiker  0.0000757077 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3275  cytidylate kinase  49.32 
 
 		 228 aa  154  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00480456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19860  cytidylate kinase  42.42 
 
 		 250 aa  154  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17111  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  40.83 
 
 		 517 aa  154  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2982  cytidylate kinase  53.52 
 
 		 229 aa  153  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0725  cytidylate kinase  44.34 
 
 		 514 aa  153  2e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0311607  normal  0.0975143 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2124  cytidylate kinase  40.09 
 
 		 229 aa  153  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109139  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06850  cytidylate kinase  46.02 
 
 		 223 aa  153  2e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.734775  normal  0.308288 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2147  cytidylate kinase  41.31 
 
 		 232 aa  154  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0902079  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1351  cytidylate kinase  39.53 
 
 		 214 aa  154  2e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00022877  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3589  cytidylate kinase  34.98 
 
 		 233 aa  153  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.577192  normal  0.0958027 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1409  cytidylate kinase  40 
 
 		 224 aa  152  5.9999999999999996e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0393534  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1752  cytidylate kinase  39.37 
 
 		 227 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000925539  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2450  cytidylate kinase  38.1 
 
 		 227 aa  151  8.999999999999999e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000180887  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  41.52 
 
 		 511 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0453  cytidylate kinase  44.86 
 
 		 224 aa  150  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0891  cytidylate kinase  39.05 
 
 		 230 aa  151  1e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00236441  decreased coverage  0.00000000000000152921 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  41.52 
 
 		 511 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.976092 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00914  cytidylate kinase  40 
 
 		 227 aa  150  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.42509  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2733  cytidylate kinase  40 
 
 		 227 aa  150  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000397985  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2686  cytidylate kinase  40 
 
 		 227 aa  150  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000200966  normal  0.762789 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1071  cytidylate kinase  40 
 
 		 227 aa  150  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000134482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1708  cytidylate kinase  41.4 
 
 		 229 aa  150  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000112654  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00921  hypothetical protein  40 
 
 		 227 aa  150  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.411433  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1016  cytidylate kinase  40 
 
 		 227 aa  150  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000287427  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2418  cytidylate kinase  40 
 
 		 227 aa  150  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000459306  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2210  cytidylate kinase  40 
 
 		 227 aa  150  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000277871  normal  0.370624 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2380  cytidylate kinase  44.39 
 
 		 243 aa  150  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.042532  normal  0.287603 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1007  cytidylate kinase  40 
 
 		 227 aa  150  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000820305  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1966  cytidylate kinase  42.79 
 
 		 229 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1429  cytidylate kinase  39.09 
 
 		 227 aa  149  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000204841  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0695  cytidylate kinase  36.32 
 
 		 223 aa  150  3e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3014  cytidylate kinase  40.62 
 
 		 228 aa  149  4e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000196489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1954  cytidylate kinase  39.07 
 
 		 230 aa  149  5e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000903512  normal  0.349566 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2669  cytidylate kinase  39.07 
 
 		 230 aa  149  5e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000410063  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2581  cytidylate kinase  39.07 
 
 		 230 aa  149  5e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000568011  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003019  cytidylate kinase  40.18 
 
 		 226 aa  149  5e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000338917  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1440  cytidylate kinase  47.49 
 
 		 224 aa  149  6e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00955651  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0594  cytidylate kinase  43.12 
 
 		 213 aa  149  6e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1045  cytidylate kinase  39.55 
 
 		 227 aa  149  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.185526  normal  0.763998 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1013  cytidylate kinase  39.55 
 
 		 227 aa  149  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0567176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1078  cytidylate kinase  39.55 
 
 		 227 aa  149  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0687941 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>