More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2370 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2370  cytidylate kinase  100 
 
 		 230 aa  448  1e-125  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11727  cytidylate kinase  57.08 
 
 		 230 aa  231  8.000000000000001e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.808416  normal  0.551451 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2943  cytidylate kinase  59.28 
 
 		 228 aa  228  6e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.142488 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2928  cytidylate kinase  59.28 
 
 		 228 aa  228  6e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2972  cytidylate kinase  59.28 
 
 		 228 aa  228  6e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2816  cytidylate kinase  58.53 
 
 		 244 aa  218  3.9999999999999997e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0539109  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3494  cytidylate kinase  61.11 
 
 		 228 aa  215  4e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.121252  normal  0.220697 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3275  cytidylate kinase  57.87 
 
 		 228 aa  205  4e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00480456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14810  cytidylate kinase  53.21 
 
 		 269 aa  197  1.0000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2999  cytidylate kinase  55.81 
 
 		 218 aa  197  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.202126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2827  cytidylate kinase  53.7 
 
 		 223 aa  194  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300632  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1209  cytidylate kinase  50.68 
 
 		 240 aa  186  4e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0979  cytidylate kinase  52.05 
 
 		 231 aa  185  5e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1385  cytidylate kinase  44.29 
 
 		 227 aa  180  2e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000116404  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2171  cytidylate kinase  42.99 
 
 		 224 aa  179  4e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000313487  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09660  cytidylate kinase  48.62 
 
 		 223 aa  178  4.999999999999999e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1333  cytidylate kinase  49.09 
 
 		 252 aa  178  5.999999999999999e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.671241 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1152  cytidylate kinase  45.02 
 
 		 222 aa  177  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1496  cytidylate kinase  53.49 
 
 		 252 aa  177  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1021  cytidylate kinase  44.65 
 
 		 216 aa  177  2e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1456  cytidylate kinase  50 
 
 		 268 aa  175  4e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00727375 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1409  cytidylate kinase  42.08 
 
 		 224 aa  174  9e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0393534  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1351  cytidylate kinase  41.55 
 
 		 214 aa  174  9.999999999999999e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00022877  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1614  cytidylate kinase  55.36 
 
 		 239 aa  172  5e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0891  cytidylate kinase  39.38 
 
 		 230 aa  172  5e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00236441  decreased coverage  0.00000000000000152921 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1966  cytidylate kinase  44.8 
 
 		 229 aa  172  5e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2100  cytidylate kinase  42.66 
 
 		 229 aa  172  5e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.578851 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1604  cytidylate kinase  42.59 
 
 		 221 aa  171  7.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1860  cytidylate kinase  41.74 
 
 		 220 aa  170  1e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.10096  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1331  cytidylate kinase  44.24 
 
 		 229 aa  169  2e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282811  decreased coverage  0.00883322 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4053  cytidylate kinase  50.88 
 
 		 237 aa  170  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.737669  normal  0.51193 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23320  cytidylate kinase  44.34 
 
 		 229 aa  169  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000301501  normal  0.0247908 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2117  cytidylate kinase  45 
 
 		 225 aa  169  4e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000190032  unclonable  0.00000899897 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0695  cytidylate kinase  37.56 
 
 		 223 aa  168  6e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4424  cytidylate kinase  46.79 
 
 		 225 aa  167  9e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0928  cytidylate kinase  40.99 
 
 		 226 aa  167  1e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497834  normal  0.452756 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1072  cytidylate kinase  40.99 
 
 		 226 aa  167  1e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000346962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1234  cytidylate kinase  48.64 
 
 		 255 aa  167  1e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2756  cytidylate kinase  43.44 
 
 		 230 aa  167  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2690  cytidylate kinase  41.67 
 
 		 218 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495966  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1090  cytidylate kinase  41.1 
 
 		 226 aa  166  2.9999999999999998e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000570118  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2982  cytidylate kinase  55.61 
 
 		 229 aa  165  4e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1708  cytidylate kinase  42.59 
 
 		 229 aa  165  5e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000112654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2310  cytidylate kinase  41.74 
 
 		 230 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000698578  hitchhiker  0.000000443143 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1506  cytidylate kinase  43.26 
 
 		 229 aa  165  5.9999999999999996e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000236579  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1429  cytidylate kinase  42.59 
 
 		 227 aa  165  5.9999999999999996e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000204841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2072  cytidylate kinase  41.28 
 
 		 230 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000270816  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1420  cytidylate kinase  39.37 
 
 		 225 aa  164  6.9999999999999995e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000147531  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3061  cytidylate kinase  46.64 
 
 		 242 aa  164  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  normal  0.04389 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1954  cytidylate kinase  41.67 
 
 		 230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000903512  normal  0.349566 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2669  cytidylate kinase  41.67 
 
 		 230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000410063  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0934  cytidylate kinase  38.01 
 
 		 213 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3221  cytidylate kinase  43.12 
 
 		 227 aa  164  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529092  normal  0.197926 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2581  cytidylate kinase  41.67 
 
 		 230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000568011  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2299  cytidylate kinase  41.74 
 
 		 230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000399193  unclonable  0.0000000000955893 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1735  cytidylate kinase  42.24 
 
 		 231 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610181  decreased coverage  0.000087686 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1645  cytidylate kinase  42.13 
 
 		 225 aa  162  3e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.170178 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1552  cytidylate kinase  38.91 
 
 		 225 aa  162  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1378  cytidylate kinase  44.5 
 
 		 228 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.925348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2164  cytidylate kinase  43.54 
 
 		 232 aa  163  3e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00199731  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2219  cytidylate kinase  41.67 
 
 		 224 aa  162  3e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000392774  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0930  cytidylate kinase  44.24 
 
 		 234 aa  162  3e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2450  cytidylate kinase  40.44 
 
 		 227 aa  162  3e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000180887  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1623  cytidylate kinase  38.46 
 
 		 225 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000468562  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2243  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  43.84 
 
 		 674 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0086  cytidylate kinase  38.53 
 
 		 234 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0568049 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1220  cytidylate kinase  39.35 
 
 		 225 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000130808  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1536  cytidylate kinase  47.17 
 
 		 237 aa  162  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0931424  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1348  cytidylate kinase  44.6 
 
 		 233 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000802306  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1407  cytidylate kinase  39.81 
 
 		 225 aa  161  6e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000164884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1379  cytidylate kinase  38.46 
 
 		 225 aa  162  6e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000311756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1378  cytidylate kinase  38.46 
 
 		 225 aa  162  6e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000246043  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1518  cytidylate kinase  39.81 
 
 		 225 aa  161  6e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000739284  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1659  cytidylate kinase  38.46 
 
 		 225 aa  162  6e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000228259  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1591  cytidylate kinase  38.46 
 
 		 225 aa  162  6e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1931099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0955  cytidylate kinase  46.08 
 
 		 225 aa  161  7e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000242866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00890  cytidylate kinase  43.11 
 
 		 227 aa  161  8.000000000000001e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.007598  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3792  cytidylate kinase  38.91 
 
 		 225 aa  161  9e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157235  hitchhiker  0.0000757077 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1853  cytidylate kinase  42.58 
 
 		 221 aa  160  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0179513  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10343  putative cytidylate kinase  40.72 
 
 		 232 aa  160  1e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1045  cytidylate kinase  42.13 
 
 		 227 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.185526  normal  0.763998 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1325  cytidylate kinase  38.99 
 
 		 226 aa  160  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1013  cytidylate kinase  42.13 
 
 		 227 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0567176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1093  cytidylate kinase  42.13 
 
 		 227 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0104083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0986  cytidylate kinase  42.13 
 
 		 227 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000706228  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0977  cytidylate kinase  38.12 
 
 		 237 aa  160  2e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000004631  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5340  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  43.52 
 
 		 526 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2124  cytidylate kinase  41.82 
 
 		 229 aa  159  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109139  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1078  cytidylate kinase  42.13 
 
 		 227 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0687941 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00914  cytidylate kinase  41.67 
 
 		 227 aa  159  3e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.42509  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2733  cytidylate kinase  41.67 
 
 		 227 aa  159  3e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000397985  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2309  cytidylate kinase  47.09 
 
 		 237 aa  159  3e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.6369 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2418  cytidylate kinase  41.67 
 
 		 227 aa  159  3e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000459306  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2686  cytidylate kinase  41.67 
 
 		 227 aa  159  3e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000200966  normal  0.762789 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2210  cytidylate kinase  41.67 
 
 		 227 aa  159  3e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000277871  normal  0.370624 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1016  cytidylate kinase  41.67 
 
 		 227 aa  159  3e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000287427  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1007  cytidylate kinase  41.67 
 
 		 227 aa  159  3e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000820305  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1071  cytidylate kinase  41.67 
 
 		 227 aa  159  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000134482  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00921  hypothetical protein  41.67 
 
 		 227 aa  159  3e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.411433  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0712  cytidylate kinase  40.65 
 
 		 227 aa  159  4e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000327752  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>