More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3494 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3494  cytidylate kinase  100 
 
 
228 aa  435  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.121252  normal  0.220697 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2972  cytidylate kinase  78.51 
 
 
228 aa  338  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2943  cytidylate kinase  78.51 
 
 
228 aa  338  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.142488 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2928  cytidylate kinase  78.51 
 
 
228 aa  338  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3275  cytidylate kinase  81.14 
 
 
228 aa  321  6e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00480456  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11727  cytidylate kinase  68.58 
 
 
230 aa  292  4e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.808416  normal  0.551451 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2816  cytidylate kinase  61.84 
 
 
244 aa  238  5e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0539109  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2370  cytidylate kinase  61.11 
 
 
230 aa  234  6e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14810  cytidylate kinase  55.41 
 
 
269 aa  219  3.9999999999999997e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2827  cytidylate kinase  54.3 
 
 
223 aa  204  8e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300632  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0979  cytidylate kinase  53.15 
 
 
231 aa  199  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09660  cytidylate kinase  50 
 
 
223 aa  197  1.0000000000000001e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4053  cytidylate kinase  55.02 
 
 
237 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.737669  normal  0.51193 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1496  cytidylate kinase  54.02 
 
 
252 aa  194  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1456  cytidylate kinase  52.04 
 
 
268 aa  192  3e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00727375 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2171  cytidylate kinase  47.56 
 
 
224 aa  192  4e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000313487  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1234  cytidylate kinase  54.19 
 
 
255 aa  191  1e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2999  cytidylate kinase  50.91 
 
 
218 aa  190  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.202126  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1604  cytidylate kinase  46.76 
 
 
221 aa  189  4e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2380  cytidylate kinase  52.7 
 
 
243 aa  188  7e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.042532  normal  0.287603 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0453  cytidylate kinase  49.33 
 
 
224 aa  187  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1333  cytidylate kinase  50.68 
 
 
252 aa  187  2e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.671241 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1152  cytidylate kinase  50 
 
 
222 aa  184  7e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1209  cytidylate kinase  49.34 
 
 
240 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3387  cytidylate kinase  46.82 
 
 
232 aa  180  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000123016  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1351  cytidylate kinase  42.66 
 
 
214 aa  181  1e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00022877  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1920  cytidylate kinase  53.57 
 
 
226 aa  179  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0011282 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1385  cytidylate kinase  45.91 
 
 
227 aa  179  2.9999999999999997e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000116404  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2309  cytidylate kinase  50 
 
 
237 aa  179  4e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.6369 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10390  cytidylate kinase  44.95 
 
 
228 aa  177  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000240582  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1293  cytidylate kinase  44.29 
 
 
224 aa  177  1e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00871161  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0712  cytidylate kinase  45.54 
 
 
227 aa  177  1e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000327752  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2450  cytidylate kinase  42.99 
 
 
227 aa  176  2e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000180887  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2690  cytidylate kinase  37.27 
 
 
218 aa  176  4e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495966  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2982  cytidylate kinase  55.4 
 
 
229 aa  175  5e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1331  cytidylate kinase  47.06 
 
 
229 aa  174  8e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282811  decreased coverage  0.00883322 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0891  cytidylate kinase  43.38 
 
 
230 aa  174  9.999999999999999e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00236441  decreased coverage  0.00000000000000152921 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1884  cytidylate kinase  43.61 
 
 
235 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000963447  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1640  cytidylate kinase  41.82 
 
 
231 aa  173  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.302898 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1090  cytidylate kinase  43.5 
 
 
226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000570118  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1348  cytidylate kinase  47.06 
 
 
233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000802306  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0934  cytidylate kinase  40.44 
 
 
213 aa  173  2.9999999999999996e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2351  cytidylate kinase  48.65 
 
 
251 aa  172  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1409  cytidylate kinase  40.99 
 
 
224 aa  172  3.9999999999999995e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0393534  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1515  cytidylate kinase  48.2 
 
 
250 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3221  cytidylate kinase  45.05 
 
 
227 aa  172  3.9999999999999995e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529092  normal  0.197926 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0725  cytidylate kinase  44.75 
 
 
514 aa  172  5e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0311607  normal  0.0975143 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1340  cytidylate kinase  40.09 
 
 
217 aa  172  5e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0841827  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1151  cytidylate kinase  40.09 
 
 
217 aa  171  6.999999999999999e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1623  cytidylate kinase  43.18 
 
 
225 aa  171  9e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000468562  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0993  cytidylate kinase  44.29 
 
 
233 aa  171  9e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1325  cytidylate kinase  42.66 
 
 
226 aa  171  1e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4424  cytidylate kinase  47.09 
 
 
225 aa  171  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1220  cytidylate kinase  43.18 
 
 
225 aa  171  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000130808  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2439  cytidylate kinase  48.65 
 
 
251 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1591  cytidylate kinase  43.18 
 
 
225 aa  170  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1931099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1407  cytidylate kinase  43.18 
 
 
225 aa  169  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000164884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1379  cytidylate kinase  43.18 
 
 
225 aa  170  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000311756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1378  cytidylate kinase  43.18 
 
 
225 aa  170  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000246043  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1518  cytidylate kinase  43.18 
 
 
225 aa  169  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000739284  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1552  cytidylate kinase  43.18 
 
 
225 aa  170  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1659  cytidylate kinase  43.18 
 
 
225 aa  170  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000228259  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0695  cytidylate kinase  40 
 
 
223 aa  169  4e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1614  cytidylate kinase  52.91 
 
 
239 aa  169  4e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3257  cytidylate kinase  42.47 
 
 
233 aa  169  4e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0255416  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1929  cytidylate kinase  52.89 
 
 
227 aa  169  4e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.339445  normal  0.343027 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1420  cytidylate kinase  43.64 
 
 
225 aa  169  4e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000147531  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06850  cytidylate kinase  48.2 
 
 
223 aa  169  5e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.734775  normal  0.308288 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2117  cytidylate kinase  43.3 
 
 
225 aa  168  6e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000190032  unclonable  0.00000899897 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2147  cytidylate kinase  40.27 
 
 
232 aa  168  8e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0902079  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2756  cytidylate kinase  43.05 
 
 
230 aa  167  8e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3792  cytidylate kinase  43.18 
 
 
225 aa  167  9e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157235  hitchhiker  0.0000757077 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1008  cytidylate kinase  43.89 
 
 
219 aa  167  1e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2100  cytidylate kinase  42.73 
 
 
229 aa  167  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.578851 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0977  cytidylate kinase  38.64 
 
 
237 aa  166  2e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000004631  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5748  cytidylate kinase  42.48 
 
 
236 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0113044 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1860  cytidylate kinase  41.89 
 
 
220 aa  166  4e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.10096  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4282  pantoate/beta-alanine ligase  44.2 
 
 
539 aa  164  9e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1622  cytidylate kinase  43.12 
 
 
217 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1620  cytidylate kinase  36.2 
 
 
226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.433409  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  43.75 
 
 
511 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  43.75 
 
 
511 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0964  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.49 
 
 
534 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955795  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1465  cytidylate kinase  42.92 
 
 
240 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00293534  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  46.02 
 
 
527 aa  163  2.0000000000000002e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2164  cytidylate kinase  41.74 
 
 
232 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00199731  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1966  cytidylate kinase  44.55 
 
 
229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1232  cytidylate kinase  43.69 
 
 
219 aa  163  3e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1021  cytidylate kinase  43.38 
 
 
216 aa  162  3e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1346  cytidylate kinase  39.45 
 
 
219 aa  162  3e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0048747  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1148  cytidylate kinase  45.41 
 
 
218 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10343  putative cytidylate kinase  41.23 
 
 
232 aa  162  6e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2219  cytidylate kinase  41.63 
 
 
224 aa  161  7e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000392774  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2799  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  40.27 
 
 
528 aa  161  9e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2605  cytidylate kinase  42.99 
 
 
233 aa  160  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1190  cytidylate kinase  40.62 
 
 
225 aa  161  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.988165  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2002  cytidylate kinase  42.38 
 
 
225 aa  160  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0311014  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0928  cytidylate kinase  42.79 
 
 
226 aa  160  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497834  normal  0.452756 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1072  cytidylate kinase  42.79 
 
 
226 aa  160  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000346962  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1734  cytidylate kinase  42.38 
 
 
225 aa  159  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000603603  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>