More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_2309 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_2309  cytidylate kinase  100 
 
 
237 aa  451  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.6369 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2351  cytidylate kinase  83.71 
 
 
251 aa  352  4e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1515  cytidylate kinase  83.78 
 
 
250 aa  351  5e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2439  cytidylate kinase  83.71 
 
 
251 aa  349  2e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2605  cytidylate kinase  55.11 
 
 
233 aa  209  4e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1465  cytidylate kinase  51.98 
 
 
240 aa  208  7e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00293534  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1884  cytidylate kinase  51.36 
 
 
235 aa  207  1e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000963447  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0993  cytidylate kinase  51.57 
 
 
233 aa  206  2e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3257  cytidylate kinase  50.22 
 
 
233 aa  204  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0255416  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2380  cytidylate kinase  54.63 
 
 
243 aa  198  6e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.042532  normal  0.287603 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1982  cytidylate kinase  50.67 
 
 
222 aa  196  3e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000405125  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0865  cytidylate kinase  50.67 
 
 
232 aa  192  3e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.054851  normal  0.903587 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2299  cytidylate kinase  45.29 
 
 
230 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000399193  unclonable  0.0000000000955893 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2147  cytidylate kinase  45.02 
 
 
232 aa  189  4e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0902079  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09660  cytidylate kinase  50.67 
 
 
223 aa  187  9e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23320  cytidylate kinase  47.73 
 
 
229 aa  186  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000301501  normal  0.0247908 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1293  cytidylate kinase  45.78 
 
 
224 aa  186  2e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00871161  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  45.09 
 
 
511 aa  186  3e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  45.09 
 
 
511 aa  184  8e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0977  cytidylate kinase  44.65 
 
 
237 aa  184  9e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000004631  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1966  cytidylate kinase  45.85 
 
 
229 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1953  cytidylate kinase  47.75 
 
 
230 aa  182  3e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000156815  hitchhiker  0.0000548451 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2072  cytidylate kinase  43.3 
 
 
230 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000270816  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1752  cytidylate kinase  44.05 
 
 
227 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000925539  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1749  cytidylate kinase  44.14 
 
 
229 aa  180  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00238031  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2310  cytidylate kinase  44.44 
 
 
230 aa  180  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000698578  hitchhiker  0.000000443143 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1348  cytidylate kinase  48.88 
 
 
233 aa  180  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000802306  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10390  cytidylate kinase  45.83 
 
 
228 aa  179  4e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000240582  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3643  cytidylate kinase  43.69 
 
 
229 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000551434  normal  0.674927 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1026  cytidylate kinase  46.49 
 
 
226 aa  178  4.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000434199  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11727  cytidylate kinase  51.74 
 
 
230 aa  177  9e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.808416  normal  0.551451 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0928  cytidylate kinase  46.98 
 
 
226 aa  178  9e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497834  normal  0.452756 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1072  cytidylate kinase  46.98 
 
 
226 aa  178  9e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000346962  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1148  cytidylate kinase  48.64 
 
 
218 aa  176  3e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1152  cytidylate kinase  48.17 
 
 
222 aa  176  3e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0930  cytidylate kinase  44 
 
 
234 aa  176  3e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1506  cytidylate kinase  44.98 
 
 
229 aa  176  4e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000236579  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2164  cytidylate kinase  47.06 
 
 
232 aa  175  5e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00199731  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4073  cytidylate kinase  44.84 
 
 
229 aa  175  6e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293328  normal  0.11895 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2171  cytidylate kinase  44.34 
 
 
224 aa  174  8e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000313487  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  46.22 
 
 
527 aa  174  9e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1640  cytidylate kinase  38.16 
 
 
231 aa  174  9e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.302898 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1542  cytidylate kinase  46.61 
 
 
225 aa  174  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.624713  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2043  cytidylate kinase  42.86 
 
 
230 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000246913  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3387  cytidylate kinase  47.66 
 
 
232 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000123016  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1622  cytidylate kinase  44.95 
 
 
217 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2069  cytidylate kinase  42.86 
 
 
230 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000019021  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2397  cytidylate kinase  42.86 
 
 
230 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000169082  unclonable  0.00000986897 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2943  cytidylate kinase  52.04 
 
 
228 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.142488 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2972  cytidylate kinase  52.04 
 
 
228 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2280  cytidylate kinase  42.86 
 
 
230 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000793863  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2928  cytidylate kinase  52.04 
 
 
228 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2065  cytidylate kinase  42.86 
 
 
230 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000105966  unclonable  0.00000000000213103 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1333  cytidylate kinase  49.77 
 
 
252 aa  172  3.9999999999999995e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.671241 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2467  cytidylate kinase  45.79 
 
 
225 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000550284  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1346  cytidylate kinase  40.64 
 
 
219 aa  172  3.9999999999999995e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0048747  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1976  cytidylate kinase  42.29 
 
 
230 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000166074  hitchhiker  0.00000000164919 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0955  cytidylate kinase  50.24 
 
 
225 aa  171  5.999999999999999e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000242866  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1923  cytidylate kinase  42.67 
 
 
230 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000722421  unclonable  0.0000000000403388 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0745  cytidylate kinase  47.19 
 
 
228 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.804624  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0964  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  43.81 
 
 
534 aa  171  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955795  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2219  cytidylate kinase  43.67 
 
 
224 aa  171  1e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000392774  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2055  cytidylate kinase  42.86 
 
 
230 aa  171  1e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000628627  unclonable  0.0000241467 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1291  cytidylate kinase  51.53 
 
 
228 aa  171  1e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1375  cytidylate kinase  41.07 
 
 
230 aa  170  2e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1371  cytidylate kinase  41.07 
 
 
230 aa  170  2e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1378  cytidylate kinase  43.5 
 
 
228 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.925348  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1735  cytidylate kinase  43.67 
 
 
231 aa  170  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610181  decreased coverage  0.000087686 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1853  cytidylate kinase  44 
 
 
221 aa  169  3e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0179513  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2124  cytidylate kinase  41.85 
 
 
229 aa  169  3e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109139  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1771  cytidylate kinase  43.05 
 
 
228 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00506628  normal  0.0452484 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003019  cytidylate kinase  42.61 
 
 
226 aa  169  4e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000338917  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2403  cytidylate kinase  41.78 
 
 
230 aa  169  5e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0331  cytidylate kinase  42.11 
 
 
227 aa  168  6e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1604  cytidylate kinase  41.52 
 
 
221 aa  168  6e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1008  cytidylate kinase  41.36 
 
 
219 aa  168  6e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0712  cytidylate kinase  43.72 
 
 
227 aa  168  6e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000327752  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3943  cytidylate kinase  42.34 
 
 
225 aa  168  7e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.302806  normal  0.232418 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1362  cytidylate kinase  42.34 
 
 
228 aa  168  9e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0105821  normal  0.0198977 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2856  cytidylate kinase  44.7 
 
 
227 aa  167  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000021992  hitchhiker  0.0000000124191 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1429  cytidylate kinase  44.29 
 
 
227 aa  167  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000204841  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1180  cytidylate kinase  48.15 
 
 
232 aa  167  2e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.848672  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0416  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  45.74 
 
 
480 aa  166  2e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130302  normal  0.171776 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3036  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  49.55 
 
 
653 aa  167  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00127659  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3275  cytidylate kinase  50.89 
 
 
228 aa  166  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00480456  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2816  cytidylate kinase  46.4 
 
 
244 aa  166  2.9999999999999998e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0539109  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3494  cytidylate kinase  50 
 
 
228 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.121252  normal  0.220697 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1078  cytidylate kinase  45.21 
 
 
227 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0687941 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1093  cytidylate kinase  45.21 
 
 
227 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0104083  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0986  cytidylate kinase  45.21 
 
 
227 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000706228  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1045  cytidylate kinase  45.21 
 
 
227 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.185526  normal  0.763998 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1914  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  46.43 
 
 
483 aa  166  2.9999999999999998e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.650764  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1013  cytidylate kinase  45.21 
 
 
227 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0567176  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0934  cytidylate kinase  40.55 
 
 
213 aa  166  2.9999999999999998e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1005  cytidylate kinase  45.45 
 
 
228 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0567  cytidylate kinase  45.45 
 
 
228 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1325  cytidylate kinase  42.06 
 
 
226 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1046  cytidylate kinase  45.45 
 
 
228 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00890  cytidylate kinase  45.58 
 
 
227 aa  166  4e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.007598  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2140  cytidylate kinase  44.14 
 
 
224 aa  166  4e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>