More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1291 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1291  cytidylate kinase  100 
 
 		 228 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1465  cytidylate kinase  54.67 
 
 		 240 aa  226  2e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00293534  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1884  cytidylate kinase  51.56 
 
 		 235 aa  214  9e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000963447  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2605  cytidylate kinase  51.77 
 
 		 233 aa  208  5e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2171  cytidylate kinase  52.02 
 
 		 224 aa  208  5e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000313487  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0865  cytidylate kinase  50.22 
 
 		 232 aa  206  2e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.054851  normal  0.903587 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1325  cytidylate kinase  50.23 
 
 		 226 aa  204  7e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1348  cytidylate kinase  49.78 
 
 		 233 aa  201  7e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000802306  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2690  cytidylate kinase  46.7 
 
 		 218 aa  200  9.999999999999999e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495966  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3387  cytidylate kinase  52.49 
 
 		 232 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000123016  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1623  cytidylate kinase  48.17 
 
 		 225 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000468562  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1622  cytidylate kinase  47.3 
 
 		 217 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1379  cytidylate kinase  48.17 
 
 		 225 aa  196  3e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000311756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1378  cytidylate kinase  48.17 
 
 		 225 aa  196  3e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000246043  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1659  cytidylate kinase  48.17 
 
 		 225 aa  196  3e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000228259  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1591  cytidylate kinase  48.17 
 
 		 225 aa  196  3e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1931099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2147  cytidylate kinase  46.19 
 
 		 232 aa  196  3e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0902079  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1407  cytidylate kinase  48.17 
 
 		 225 aa  195  4.0000000000000005e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000164884  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1518  cytidylate kinase  48.17 
 
 		 225 aa  195  4.0000000000000005e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000739284  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3257  cytidylate kinase  48.43 
 
 		 233 aa  195  4.0000000000000005e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0255416  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1552  cytidylate kinase  48.17 
 
 		 225 aa  195  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3792  cytidylate kinase  48.17 
 
 		 225 aa  194  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157235  hitchhiker  0.0000757077 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0993  cytidylate kinase  48.43 
 
 		 233 aa  193  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1420  cytidylate kinase  47.25 
 
 		 225 aa  192  4e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000147531  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0712  cytidylate kinase  46.61 
 
 		 227 aa  192  5e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000327752  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2164  cytidylate kinase  49.78 
 
 		 232 aa  191  7e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00199731  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0451  cytidylate kinase  48.71 
 
 		 231 aa  191  8e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.001027  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1220  cytidylate kinase  48.2 
 
 		 225 aa  191  1e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000130808  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2309  cytidylate kinase  51.53 
 
 		 237 aa  190  1e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.6369 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0891  cytidylate kinase  42.11 
 
 		 230 aa  191  1e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00236441  decreased coverage  0.00000000000000152921 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5748  cytidylate kinase  46.22 
 
 		 236 aa  189  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0113044 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1733  cytidylate kinase  50.21 
 
 		 238 aa  190  2e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000909322  hitchhiker  0.0092352 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  47.93 
 
 		 511 aa  189  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1729  cytidylate kinase  48.6 
 
 		 223 aa  189  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1752  cytidylate kinase  45.5 
 
 		 227 aa  189  2e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000925539  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  47.93 
 
 		 511 aa  189  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1515  cytidylate kinase  52.31 
 
 		 250 aa  189  4e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3589  cytidylate kinase  45.65 
 
 		 233 aa  187  8e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.577192  normal  0.0958027 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00914  cytidylate kinase  47.75 
 
 		 227 aa  187  1e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.42509  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2733  cytidylate kinase  47.75 
 
 		 227 aa  187  1e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000397985  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1333  cytidylate kinase  51.57 
 
 		 252 aa  187  1e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.671241 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2686  cytidylate kinase  47.75 
 
 		 227 aa  187  1e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000200966  normal  0.762789 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2210  cytidylate kinase  47.75 
 
 		 227 aa  187  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000277871  normal  0.370624 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1071  cytidylate kinase  47.75 
 
 		 227 aa  187  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000134482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14810  cytidylate kinase  50 
 
 		 269 aa  187  1e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1016  cytidylate kinase  47.75 
 
 		 227 aa  187  1e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000287427  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2418  cytidylate kinase  47.75 
 
 		 227 aa  187  1e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000459306  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00921  hypothetical protein  47.75 
 
 		 227 aa  187  1e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.411433  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1007  cytidylate kinase  47.75 
 
 		 227 aa  187  1e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000820305  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0086  cytidylate kinase  43.44 
 
 		 234 aa  186  2e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0568049 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1351  cytidylate kinase  43.69 
 
 		 214 aa  186  3e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00022877  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0348  cytidylate kinase  50.88 
 
 		 237 aa  186  3e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000112286  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1232  cytidylate kinase  45.95 
 
 		 219 aa  186  3e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1708  cytidylate kinase  47.51 
 
 		 229 aa  185  5e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000112654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2351  cytidylate kinase  51.39 
 
 		 251 aa  185  6e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2816  cytidylate kinase  47.77 
 
 		 244 aa  185  6e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0539109  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1604  cytidylate kinase  44.75 
 
 		 221 aa  185  6e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2124  cytidylate kinase  45.09 
 
 		 229 aa  184  9e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109139  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2439  cytidylate kinase  51.39 
 
 		 251 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0977  cytidylate kinase  44.09 
 
 		 237 aa  184  1.0000000000000001e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000004631  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1078  cytidylate kinase  47.75 
 
 		 227 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0687941 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0986  cytidylate kinase  47.75 
 
 		 227 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000706228  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1429  cytidylate kinase  46.4 
 
 		 227 aa  183  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000204841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1093  cytidylate kinase  47.75 
 
 		 227 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0104083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09660  cytidylate kinase  48.25 
 
 		 223 aa  183  2.0000000000000003e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1013  cytidylate kinase  47.75 
 
 		 227 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0567176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1045  cytidylate kinase  47.75 
 
 		 227 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.185526  normal  0.763998 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1953  cytidylate kinase  45.54 
 
 		 230 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000156815  hitchhiker  0.0000548451 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0964  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  49.12 
 
 		 534 aa  182  4.0000000000000006e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1735  cytidylate kinase  45.09 
 
 		 231 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610181  decreased coverage  0.000087686 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1180  cytidylate kinase  47.69 
 
 		 232 aa  182  5.0000000000000004e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.848672  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10390  cytidylate kinase  44.1 
 
 		 228 aa  182  5.0000000000000004e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000240582  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2100  cytidylate kinase  47.51 
 
 		 229 aa  181  7e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.578851 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2799  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  43.89 
 
 		 528 aa  181  9.000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0417  cytidylate kinase  50.88 
 
 		 237 aa  181  9.000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000354402  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1148  cytidylate kinase  50.23 
 
 		 218 aa  181  1e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1152  cytidylate kinase  47.47 
 
 		 222 aa  180  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2072  cytidylate kinase  44.81 
 
 		 230 aa  181  1e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000270816  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2450  cytidylate kinase  45.45 
 
 		 227 aa  180  1e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000180887  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  49.56 
 
 		 527 aa  181  1e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06850  cytidylate kinase  50.88 
 
 		 223 aa  181  1e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.734775  normal  0.308288 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0179  cytidylate kinase  45.62 
 
 		 227 aa  180  2e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000847233  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1640  cytidylate kinase  42.48 
 
 		 231 aa  180  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.302898 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3339  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  47.37 
 
 		 529 aa  179  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10343  putative cytidylate kinase  39.91 
 
 		 232 aa  180  2e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1923  cytidylate kinase  44.44 
 
 		 230 aa  180  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000722421  unclonable  0.0000000000403388 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1976  cytidylate kinase  44.44 
 
 		 230 aa  180  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000166074  hitchhiker  0.00000000164919 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2055  cytidylate kinase  44.44 
 
 		 230 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000628627  unclonable  0.0000241467 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2581  cytidylate kinase  46.73 
 
 		 230 aa  179  4e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000568011  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1954  cytidylate kinase  46.73 
 
 		 230 aa  179  4e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000903512  normal  0.349566 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2669  cytidylate kinase  46.73 
 
 		 230 aa  179  4e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000410063  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5340  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  46.85 
 
 		 526 aa  179  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2219  cytidylate kinase  45.09 
 
 		 224 aa  179  4.999999999999999e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000392774  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2140  cytidylate kinase  44.89 
 
 		 224 aa  178  4.999999999999999e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1293  cytidylate kinase  42.08 
 
 		 224 aa  179  4.999999999999999e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00871161  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2043  cytidylate kinase  43.75 
 
 		 230 aa  178  5.999999999999999e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000246913  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1008  cytidylate kinase  40.81 
 
 		 219 aa  178  5.999999999999999e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0254  cytidylate kinase  44.34 
 
 		 225 aa  177  8e-44  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.13077  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1409  cytidylate kinase  40.71 
 
 		 224 aa  177  9e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0393534  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1506  cytidylate kinase  44.14 
 
 		 229 aa  177  9e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000236579  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>