More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_10343 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_10343  putative cytidylate kinase  100 
 
 		 232 aa  471  1e-132  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2756  cytidylate kinase  65.62 
 
 		 230 aa  300  1e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1409  cytidylate kinase  54.09 
 
 		 224 aa  242  3e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0393534  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3589  cytidylate kinase  49.56 
 
 		 233 aa  235  4e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.577192  normal  0.0958027 
 
 
-
 
NC_002950  PG0603  cytidylate kinase  51.57 
 
 		 231 aa  233  2.0000000000000002e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.794292 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5748  cytidylate kinase  51.33 
 
 		 236 aa  228  4e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0113044 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6626  cytidylate kinase  50.45 
 
 		 228 aa  226  2e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.422792 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0086  cytidylate kinase  48.23 
 
 		 234 aa  216  2e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0568049 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1190  cytidylate kinase  47.83 
 
 		 225 aa  214  9e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.988165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1090  cytidylate kinase  45.33 
 
 		 226 aa  200  1.9999999999999998e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000570118  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1220  cytidylate kinase  45.18 
 
 		 225 aa  191  9e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000130808  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1325  cytidylate kinase  45.7 
 
 		 226 aa  188  5.999999999999999e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1623  cytidylate kinase  44.2 
 
 		 225 aa  187  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000468562  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2450  cytidylate kinase  44.81 
 
 		 227 aa  187  1e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000180887  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1552  cytidylate kinase  44.64 
 
 		 225 aa  187  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1407  cytidylate kinase  44.2 
 
 		 225 aa  186  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000164884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1379  cytidylate kinase  44.2 
 
 		 225 aa  186  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000311756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1378  cytidylate kinase  44.2 
 
 		 225 aa  186  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000246043  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1420  cytidylate kinase  45.09 
 
 		 225 aa  186  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000147531  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1591  cytidylate kinase  44.2 
 
 		 225 aa  186  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1931099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1518  cytidylate kinase  44.2 
 
 		 225 aa  186  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000739284  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1659  cytidylate kinase  44.2 
 
 		 225 aa  186  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000228259  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1151  cytidylate kinase  45 
 
 		 217 aa  186  2e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3792  cytidylate kinase  44.64 
 
 		 225 aa  186  3e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157235  hitchhiker  0.0000757077 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1152  cytidylate kinase  45.33 
 
 		 222 aa  185  7e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1340  cytidylate kinase  44.55 
 
 		 217 aa  184  9e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0841827  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0348  cytidylate kinase  43.11 
 
 		 237 aa  181  8.000000000000001e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000112286  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2171  cytidylate kinase  42.79 
 
 		 224 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000313487  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1293  cytidylate kinase  42.86 
 
 		 224 aa  180  2e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00871161  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0417  cytidylate kinase  40.69 
 
 		 237 aa  180  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000354402  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0993  cytidylate kinase  41.33 
 
 		 233 aa  178  5.999999999999999e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1860  cytidylate kinase  45.78 
 
 		 220 aa  178  8e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.10096  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1385  cytidylate kinase  45.97 
 
 		 227 aa  177  9e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000116404  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0451  cytidylate kinase  41.67 
 
 		 231 aa  176  4e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.001027  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3387  cytidylate kinase  42.54 
 
 		 232 aa  175  5e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000123016  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1465  cytidylate kinase  41.96 
 
 		 240 aa  175  6e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00293534  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10390  cytidylate kinase  42.47 
 
 		 228 aa  175  6e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000240582  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3257  cytidylate kinase  41.15 
 
 		 233 aa  175  6e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0255416  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0712  cytidylate kinase  43.36 
 
 		 227 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000327752  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0964  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.65 
 
 		 534 aa  174  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955795  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4282  pantoate/beta-alanine ligase  44.55 
 
 		 539 aa  173  1.9999999999999998e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0865  cytidylate kinase  40.71 
 
 		 232 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.054851  normal  0.903587 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1008  cytidylate kinase  43.84 
 
 		 219 aa  171  6.999999999999999e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0695  cytidylate kinase  40.27 
 
 		 223 aa  171  1e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1733  cytidylate kinase  41.05 
 
 		 238 aa  170  2e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000909322  hitchhiker  0.0092352 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1351  cytidylate kinase  45.05 
 
 		 214 aa  169  3e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00022877  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2147  cytidylate kinase  36.96 
 
 		 232 aa  169  3e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0902079  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1622  cytidylate kinase  42.34 
 
 		 217 aa  169  4e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2816  cytidylate kinase  40.99 
 
 		 244 aa  167  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0539109  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2380  cytidylate kinase  39.47 
 
 		 243 aa  167  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.042532  normal  0.287603 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2827  cytidylate kinase  41.33 
 
 		 223 aa  167  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300632  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20401  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  41.38 
 
 		 516 aa  166  2e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.523642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0179  cytidylate kinase  40.79 
 
 		 227 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000847233  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0891  cytidylate kinase  41.26 
 
 		 230 aa  166  4e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00236441  decreased coverage  0.00000000000000152921 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5340  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  41.85 
 
 		 526 aa  165  5e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2605  cytidylate kinase  38.5 
 
 		 233 aa  165  6.9999999999999995e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1534  cytidylate kinase  43.24 
 
 		 219 aa  165  6.9999999999999995e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1165  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  40.95 
 
 		 516 aa  165  6.9999999999999995e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.841072  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1565  cytidylate kinase  43.24 
 
 		 219 aa  165  6.9999999999999995e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.464485  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1333  cytidylate kinase  41.75 
 
 		 252 aa  165  6.9999999999999995e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.671241 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2309  cytidylate kinase  40.26 
 
 		 237 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.6369 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1331  cytidylate kinase  42.2 
 
 		 229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282811  decreased coverage  0.00883322 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1005  cytidylate kinase  39.73 
 
 		 228 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0567  cytidylate kinase  39.73 
 
 		 228 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1046  cytidylate kinase  39.73 
 
 		 228 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1348  cytidylate kinase  38.67 
 
 		 233 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000802306  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1604  cytidylate kinase  39.82 
 
 		 221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1914  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  37.83 
 
 		 483 aa  162  3e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.650764  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0416  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  38.33 
 
 		 480 aa  162  3e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130302  normal  0.171776 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1429  cytidylate kinase  38.57 
 
 		 227 aa  163  3e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000204841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0762  cytidylate kinase  42.92 
 
 		 228 aa  162  3e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000614962  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4159  cytidylate kinase  39.73 
 
 		 228 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3494  cytidylate kinase  41.67 
 
 		 228 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.121252  normal  0.220697 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1729  cytidylate kinase  43.06 
 
 		 223 aa  162  4.0000000000000004e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1884  cytidylate kinase  37.89 
 
 		 235 aa  161  6e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000963447  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1045  cytidylate kinase  44.09 
 
 		 215 aa  161  9e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.117203  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2370  cytidylate kinase  40.72 
 
 		 230 aa  160  1e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1291  cytidylate kinase  39.91 
 
 		 228 aa  160  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0930  cytidylate kinase  36.89 
 
 		 234 aa  160  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2690  cytidylate kinase  40.81 
 
 		 218 aa  159  3e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495966  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1346  cytidylate kinase  40.36 
 
 		 219 aa  159  3e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0048747  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17111  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  39.38 
 
 		 517 aa  159  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  39.62 
 
 		 511 aa  159  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3643  cytidylate kinase  37.9 
 
 		 229 aa  158  5e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000551434  normal  0.674927 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  39.62 
 
 		 511 aa  158  5e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2043  cytidylate kinase  37.28 
 
 		 230 aa  157  9e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000246913  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00914  cytidylate kinase  37.67 
 
 		 227 aa  157  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.42509  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2733  cytidylate kinase  37.67 
 
 		 227 aa  157  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000397985  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2210  cytidylate kinase  37.67 
 
 		 227 aa  157  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000277871  normal  0.370624 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0453  cytidylate kinase  40.17 
 
 		 224 aa  157  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1007  cytidylate kinase  37.67 
 
 		 227 aa  157  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000820305  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00921  hypothetical protein  37.67 
 
 		 227 aa  157  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.411433  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1071  cytidylate kinase  37.67 
 
 		 227 aa  157  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000134482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1016  cytidylate kinase  37.67 
 
 		 227 aa  157  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000287427  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2418  cytidylate kinase  37.67 
 
 		 227 aa  157  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000459306  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2686  cytidylate kinase  37.67 
 
 		 227 aa  157  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000200966  normal  0.762789 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1078  cytidylate kinase  37.22 
 
 		 227 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0687941 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2946  cytidylate kinase  37.27 
 
 		 228 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1093  cytidylate kinase  37.22 
 
 		 227 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0104083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2100  cytidylate kinase  42.41 
 
 		 229 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.578851 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>