More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1733 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1733  cytidylate kinase  100 
 
 
238 aa  471  1e-132  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000909322  hitchhiker  0.0092352 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0417  cytidylate kinase  69.2 
 
 
237 aa  326  2.0000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000354402  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0451  cytidylate kinase  68.53 
 
 
231 aa  313  9.999999999999999e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.001027  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0348  cytidylate kinase  66.81 
 
 
237 aa  308  6.999999999999999e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000112286  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0571  cytidylate kinase  64.86 
 
 
192 aa  230  2e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0086  cytidylate kinase  48.03 
 
 
234 aa  192  3e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0568049 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1090  cytidylate kinase  46.61 
 
 
226 aa  184  8e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000570118  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1291  cytidylate kinase  50.21 
 
 
228 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1407  cytidylate kinase  44.89 
 
 
225 aa  177  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000164884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1379  cytidylate kinase  45.29 
 
 
225 aa  177  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000311756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1378  cytidylate kinase  45.29 
 
 
225 aa  177  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000246043  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1591  cytidylate kinase  45.29 
 
 
225 aa  177  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1931099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1659  cytidylate kinase  45.29 
 
 
225 aa  177  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000228259  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1518  cytidylate kinase  44.89 
 
 
225 aa  177  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000739284  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1325  cytidylate kinase  47.53 
 
 
226 aa  177  1e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5748  cytidylate kinase  45.61 
 
 
236 aa  177  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0113044 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1623  cytidylate kinase  44.84 
 
 
225 aa  175  4e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000468562  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1420  cytidylate kinase  44.84 
 
 
225 aa  175  6e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000147531  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3589  cytidylate kinase  45.7 
 
 
233 aa  174  8e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.577192  normal  0.0958027 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1604  cytidylate kinase  43.58 
 
 
221 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1552  cytidylate kinase  44.39 
 
 
225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1220  cytidylate kinase  44.69 
 
 
225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000130808  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2147  cytidylate kinase  46.12 
 
 
232 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0902079  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0993  cytidylate kinase  44.83 
 
 
233 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3792  cytidylate kinase  44.39 
 
 
225 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157235  hitchhiker  0.0000757077 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1180  cytidylate kinase  44.49 
 
 
232 aa  171  6.999999999999999e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.848672  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1045  cytidylate kinase  42.06 
 
 
215 aa  171  7.999999999999999e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.117203  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2171  cytidylate kinase  44.3 
 
 
224 aa  170  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000313487  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10343  putative cytidylate kinase  41.05 
 
 
232 aa  170  2e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6626  cytidylate kinase  43.24 
 
 
228 aa  169  3e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.422792 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3257  cytidylate kinase  44.4 
 
 
233 aa  169  3e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0255416  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1293  cytidylate kinase  44.39 
 
 
224 aa  169  3e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00871161  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0934  cytidylate kinase  41.89 
 
 
213 aa  169  4e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1465  cytidylate kinase  45.41 
 
 
240 aa  168  9e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00293534  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2799  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  45.54 
 
 
528 aa  167  1e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1021  cytidylate kinase  41.67 
 
 
216 aa  167  2e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0865  cytidylate kinase  43.23 
 
 
232 aa  167  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.054851  normal  0.903587 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0891  cytidylate kinase  40.97 
 
 
230 aa  167  2e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00236441  decreased coverage  0.00000000000000152921 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17111  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  41.63 
 
 
517 aa  166  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1190  cytidylate kinase  42.15 
 
 
225 aa  165  5e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.988165  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1385  cytidylate kinase  42.53 
 
 
227 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000116404  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0453  cytidylate kinase  47.37 
 
 
224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1884  cytidylate kinase  44.05 
 
 
235 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000963447  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0712  cytidylate kinase  43.5 
 
 
227 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000327752  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1409  cytidylate kinase  41.82 
 
 
224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0393534  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1008  cytidylate kinase  42.25 
 
 
219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0603  cytidylate kinase  43.84 
 
 
231 aa  163  2.0000000000000002e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.794292 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1165  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  42.59 
 
 
516 aa  162  3e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.841072  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0179  cytidylate kinase  41.78 
 
 
227 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000847233  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1331  cytidylate kinase  45.12 
 
 
229 aa  162  5.0000000000000005e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282811  decreased coverage  0.00883322 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1622  cytidylate kinase  42.47 
 
 
217 aa  162  6e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20401  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  43.06 
 
 
516 aa  161  8.000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.523642  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1565  cytidylate kinase  40.55 
 
 
219 aa  160  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.464485  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1749  cytidylate kinase  42.13 
 
 
229 aa  160  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00238031  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3643  cytidylate kinase  43.06 
 
 
229 aa  160  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000551434  normal  0.674927 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1534  cytidylate kinase  40.55 
 
 
219 aa  160  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0762  cytidylate kinase  44.13 
 
 
228 aa  160  2e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000614962  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1729  cytidylate kinase  43.46 
 
 
223 aa  160  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1152  cytidylate kinase  45.5 
 
 
222 aa  159  3e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1348  cytidylate kinase  42.67 
 
 
233 aa  159  3e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000802306  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2756  cytidylate kinase  41.44 
 
 
230 aa  159  4e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10390  cytidylate kinase  44.65 
 
 
228 aa  159  5e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000240582  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1232  cytidylate kinase  43.44 
 
 
219 aa  158  6e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0725  cytidylate kinase  39.92 
 
 
514 aa  158  6e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0311607  normal  0.0975143 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  46.92 
 
 
511 aa  158  6e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2450  cytidylate kinase  45.7 
 
 
227 aa  158  7e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000180887  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  46.92 
 
 
511 aa  158  7e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2605  cytidylate kinase  42.61 
 
 
233 aa  157  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0416  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  41.7 
 
 
480 aa  157  1e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130302  normal  0.171776 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3221  cytidylate kinase  40.61 
 
 
227 aa  157  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529092  normal  0.197926 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3387  cytidylate kinase  42.6 
 
 
232 aa  156  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000123016  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1914  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  40.61 
 
 
483 aa  156  3e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.650764  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  45.41 
 
 
527 aa  156  3e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23320  cytidylate kinase  42.13 
 
 
229 aa  156  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000301501  normal  0.0247908 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1966  cytidylate kinase  42.13 
 
 
229 aa  155  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1860  cytidylate kinase  42.99 
 
 
220 aa  155  5.0000000000000005e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.10096  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0964  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.19 
 
 
534 aa  155  6e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955795  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1351  cytidylate kinase  41.4 
 
 
214 aa  155  6e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00022877  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4282  pantoate/beta-alanine ligase  43.72 
 
 
539 aa  155  7e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0564  cytidylate kinase  41.59 
 
 
227 aa  155  8e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1148  cytidylate kinase  44.6 
 
 
218 aa  154  9e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5340  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  42.86 
 
 
526 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2690  cytidylate kinase  39.29 
 
 
218 aa  153  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495966  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1853  cytidylate kinase  40.85 
 
 
221 aa  153  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0179513  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1346  cytidylate kinase  40.45 
 
 
219 aa  152  4e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0048747  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09660  cytidylate kinase  42.22 
 
 
223 aa  152  5.9999999999999996e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1640  cytidylate kinase  38.39 
 
 
231 aa  151  7e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.302898 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1542  cytidylate kinase  40.53 
 
 
225 aa  150  1e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.624713  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1506  cytidylate kinase  42.92 
 
 
229 aa  151  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000236579  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1335  cytidylate kinase  39.73 
 
 
220 aa  150  1e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.059192  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2816  cytidylate kinase  41.28 
 
 
244 aa  150  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0539109  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2972  cytidylate kinase  44.09 
 
 
228 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1615  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  41.63 
 
 
670 aa  150  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2943  cytidylate kinase  44.09 
 
 
228 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.142488 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2928  cytidylate kinase  44.09 
 
 
228 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22471  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  41.52 
 
 
488 aa  149  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2140  cytidylate kinase  40.09 
 
 
224 aa  148  6e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2164  cytidylate kinase  41.59 
 
 
232 aa  148  8e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00199731  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0173  cytidylate kinase  40.18 
 
 
225 aa  148  8e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000480933  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1771  cytidylate kinase  40.28 
 
 
228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00506628  normal  0.0452484 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>